MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Spirochaeta thermophila DSM 6192 chromosome

Total Repeats: 1767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014484	GATCA	2	10	263	272	40 %	20 %	20 %	20 %	307717718
2	NC_014484	CCGAG	2	10	2673	2682	20 %	0 %	40 %	40 %	307717719
3	NC_014484	ACGCG	2	10	3501	3510	20 %	0 %	40 %	40 %	307717720
4	NC_014484	ACGGT	2	10	6723	6732	20 %	20 %	40 %	20 %	307717725
5	NC_014484	TGCGG	2	10	13723	13732	0 %	20 %	60 %	20 %	307717731
6	NC_014484	TCCCT	2	10	15116	15125	0 %	40 %	0 %	60 %	307717732
7	NC_014484	ACGGC	2	10	17077	17086	20 %	0 %	40 %	40 %	307717734
8	NC_014484	GCCAT	2	10	17582	17591	20 %	20 %	20 %	40 %	307717734
9	NC_014484	GCTCC	2	10	17613	17622	0 %	20 %	20 %	60 %	307717734
10	NC_014484	GAAGG	2	10	18843	18852	40 %	0 %	60 %	0 %	307717735
11	NC_014484	GAAGT	2	10	18916	18925	40 %	20 %	40 %	0 %	307717736
12	NC_014484	GGAGC	2	10	19666	19675	20 %	0 %	60 %	20 %	307717737
13	NC_014484	CGAGG	2	10	22877	22886	20 %	0 %	60 %	20 %	307717739
14	NC_014484	CCTTC	2	10	23962	23971	0 %	40 %	0 %	60 %	307717740
15	NC_014484	TCCTC	2	10	24517	24526	0 %	40 %	0 %	60 %	307717740
16	NC_014484	GCCTC	2	10	26406	26415	0 %	20 %	20 %	60 %	307717742
17	NC_014484	GGGAT	2	10	27318	27327	20 %	20 %	60 %	0 %	307717743
18	NC_014484	CACGG	2	10	29139	29148	20 %	0 %	40 %	40 %	307717746
19	NC_014484	TCCTC	2	10	29453	29462	0 %	40 %	0 %	60 %	307717746
20	NC_014484	TTCCT	2	10	29523	29532	0 %	60 %	0 %	40 %	307717746
21	NC_014484	TCTCC	2	10	30433	30442	0 %	40 %	0 %	60 %	307717747
22	NC_014484	GTCCC	2	10	30510	30519	0 %	20 %	20 %	60 %	307717747
23	NC_014484	GAAGG	2	10	32493	32502	40 %	0 %	60 %	0 %	307717748
24	NC_014484	GTGCG	2	10	35514	35523	0 %	20 %	60 %	20 %	307717751
25	NC_014484	GATCT	2	10	37308	37317	20 %	40 %	20 %	20 %	307717753
26	NC_014484	GGTCT	2	10	37897	37906	0 %	40 %	40 %	20 %	307717753
27	NC_014484	ATCCC	2	10	37935	37944	20 %	20 %	0 %	60 %	307717753
28	NC_014484	GAGGG	2	10	38068	38077	20 %	0 %	80 %	0 %	307717753
29	NC_014484	GAGGG	2	10	38457	38466	20 %	0 %	80 %	0 %	307717753
30	NC_014484	TCTCC	2	10	39323	39332	0 %	40 %	0 %	60 %	307717753
31	NC_014484	TGTCC	2	10	39338	39347	0 %	40 %	20 %	40 %	307717753
32	NC_014484	GCGAT	2	10	40221	40230	20 %	20 %	40 %	20 %	307717754
33	NC_014484	GGGGA	2	10	42554	42563	20 %	0 %	80 %	0 %	307717756
34	NC_014484	GTGTG	2	10	44999	45008	0 %	40 %	60 %	0 %	307717759
35	NC_014484	GCCCG	2	10	45179	45188	0 %	0 %	40 %	60 %	307717759
36	NC_014484	CGAGG	2	10	45279	45288	20 %	0 %	60 %	20 %	307717759
37	NC_014484	GCCGG	2	10	46126	46135	0 %	0 %	60 %	40 %	307717761
38	NC_014484	TCAAT	2	10	47283	47292	40 %	40 %	0 %	20 %	307717763
39	NC_014484	CAGGA	2	10	47620	47629	40 %	0 %	40 %	20 %	307717763
40	NC_014484	TCCCT	2	10	48083	48092	0 %	40 %	0 %	60 %	307717764
41	NC_014484	TCTCT	2	10	49246	49255	0 %	60 %	0 %	40 %	307717765
42	NC_014484	GATGG	2	10	49610	49619	20 %	20 %	60 %	0 %	307717766
43	NC_014484	GGGAG	2	10	50839	50848	20 %	0 %	80 %	0 %	307717766
44	NC_014484	CTCTC	2	10	54954	54963	0 %	40 %	0 %	60 %	307717770
45	NC_014484	CCTCC	2	10	57317	57326	0 %	20 %	0 %	80 %	307717771
46	NC_014484	TGGGT	2	10	59138	59147	0 %	40 %	60 %	0 %	307717773
47	NC_014484	GTGTG	2	10	59582	59591	0 %	40 %	60 %	0 %	307717773
48	NC_014484	GGGAG	2	10	60233	60242	20 %	0 %	80 %	0 %	307717773
49	NC_014484	GGGAG	2	10	60748	60757	20 %	0 %	80 %	0 %	307717774
50	NC_014484	AAGCA	2	10	62118	62127	60 %	0 %	20 %	20 %	307717776
51	NC_014484	GGGTG	2	10	62530	62539	0 %	20 %	80 %	0 %	307717777
52	NC_014484	TGAGG	2	10	63049	63058	20 %	20 %	60 %	0 %	307717778
53	NC_014484	TGAGG	2	10	63445	63454	20 %	20 %	60 %	0 %	307717778
54	NC_014484	TGGGG	2	10	63459	63468	0 %	20 %	80 %	0 %	307717778
55	NC_014484	TGGGG	2	10	64141	64150	0 %	20 %	80 %	0 %	307717778
56	NC_014484	TGAGG	2	10	64624	64633	20 %	20 %	60 %	0 %	307717778
57	NC_014484	GAGGT	2	10	65102	65111	20 %	20 %	60 %	0 %	307717778
58	NC_014484	GGAGA	2	10	65276	65285	40 %	0 %	60 %	0 %	307717778
59	NC_014484	TGGGA	2	10	65744	65753	20 %	20 %	60 %	0 %	307717779
60	NC_014484	GAGGT	2	10	66100	66109	20 %	20 %	60 %	0 %	307717779
61	NC_014484	GAGGG	2	10	66744	66753	20 %	0 %	80 %	0 %	307717779
62	NC_014484	AGGGG	2	10	66990	66999	20 %	0 %	80 %	0 %	307717779
63	NC_014484	TGAGG	2	10	68007	68016	20 %	20 %	60 %	0 %	307717779
64	NC_014484	GAGGT	2	10	68050	68059	20 %	20 %	60 %	0 %	307717779
65	NC_014484	AGGGA	2	10	68668	68677	40 %	0 %	60 %	0 %	307717779
66	NC_014484	CGGTA	2	10	69323	69332	20 %	20 %	40 %	20 %	307717779
67	NC_014484	TGAGG	2	10	70389	70398	20 %	20 %	60 %	0 %	307717779
68	NC_014484	GGAGG	2	10	70626	70635	20 %	0 %	80 %	0 %	307717779
69	NC_014484	CAGTC	2	10	72609	72618	20 %	20 %	20 %	40 %	307717781
70	NC_014484	GGGAG	2	10	73238	73247	20 %	0 %	80 %	0 %	307717781
71	NC_014484	GTTAC	2	10	75999	76008	20 %	40 %	20 %	20 %	307717785
72	NC_014484	AGAGG	2	10	76374	76383	40 %	0 %	60 %	0 %	307717785
73	NC_014484	ATTGA	2	10	77536	77545	40 %	40 %	20 %	0 %	307717787
74	NC_014484	TCTCT	2	10	78256	78265	0 %	60 %	0 %	40 %	307717788
75	NC_014484	GGGAG	2	10	82279	82288	20 %	0 %	80 %	0 %	307717792
76	NC_014484	GCGGA	2	10	82409	82418	20 %	0 %	60 %	20 %	307717792
77	NC_014484	CTGCC	2	10	82667	82676	0 %	20 %	20 %	60 %	307717793
78	NC_014484	CGTCC	2	10	82988	82997	0 %	20 %	20 %	60 %	307717793
79	NC_014484	TGTCC	2	10	85053	85062	0 %	40 %	20 %	40 %	307717795
80	NC_014484	TCTCG	2	10	85351	85360	0 %	40 %	20 %	40 %	307717795
81	NC_014484	GGAGG	2	10	87813	87822	20 %	0 %	80 %	0 %	307717797
82	NC_014484	TGCGG	2	10	89204	89213	0 %	20 %	60 %	20 %	307717797
83	NC_014484	CAAGG	2	10	89361	89370	40 %	0 %	40 %	20 %	307717798
84	NC_014484	GAGGG	2	10	90282	90291	20 %	0 %	80 %	0 %	307717798
85	NC_014484	GGGCG	2	10	90987	90996	0 %	0 %	80 %	20 %	307717799
86	NC_014484	GGGGT	2	10	91535	91544	0 %	20 %	80 %	0 %	307717799
87	NC_014484	TGGGG	2	10	94108	94117	0 %	20 %	80 %	0 %	307717800
88	NC_014484	GGGGA	2	10	95494	95503	20 %	0 %	80 %	0 %	307717800
89	NC_014484	TGCGG	2	10	95509	95518	0 %	20 %	60 %	20 %	307717800
90	NC_014484	AGGGG	2	10	95599	95608	20 %	0 %	80 %	0 %	307717800
91	NC_014484	GGAGC	2	10	97104	97113	20 %	0 %	60 %	20 %	307717801
92	NC_014484	TCCTC	2	10	98528	98537	0 %	40 %	0 %	60 %	307717802
93	NC_014484	GCGTT	2	10	99361	99370	0 %	40 %	40 %	20 %	307717802
94	NC_014484	TCCTC	2	10	100067	100076	0 %	40 %	0 %	60 %	307717802
95	NC_014484	GGAAG	2	10	100422	100431	40 %	0 %	60 %	0 %	307717802
96	NC_014484	TCTCG	2	10	101685	101694	0 %	40 %	20 %	40 %	307717802
97	NC_014484	GGCGT	2	10	102396	102405	0 %	20 %	60 %	20 %	307717802
98	NC_014484	AGAGG	2	10	102873	102882	40 %	0 %	60 %	0 %	307717802
99	NC_014484	CCCCT	2	10	104087	104096	0 %	20 %	0 %	80 %	307717803
100	NC_014484	CGGTG	2	10	105454	105463	0 %	20 %	60 %	20 %	307717803
101	NC_014484	TCCCC	2	10	105987	105996	0 %	20 %	0 %	80 %	307717804
102	NC_014484	GGGGC	2	10	106612	106621	0 %	0 %	80 %	20 %	307717804
103	NC_014484	CAGGA	2	10	108190	108199	40 %	0 %	40 %	20 %	307717805
104	NC_014484	AGGTG	2	10	110325	110334	20 %	20 %	60 %	0 %	307717808
105	NC_014484	TGGGC	2	10	112784	112793	0 %	20 %	60 %	20 %	307717810
106	NC_014484	CCTCC	2	10	113346	113355	0 %	20 %	0 %	80 %	307717810
107	NC_014484	CTCCC	2	10	115097	115106	0 %	20 %	0 %	80 %	307717812
108	NC_014484	ACGGC	2	10	117412	117421	20 %	0 %	40 %	40 %	307717813
109	NC_014484	GGGGA	2	10	119719	119728	20 %	0 %	80 %	0 %	307717813
110	NC_014484	CCGGG	2	10	120143	120152	0 %	0 %	60 %	40 %	307717813
111	NC_014484	ATGCG	2	10	122398	122407	20 %	20 %	40 %	20 %	307717813
112	NC_014484	CCCAA	2	10	122719	122728	40 %	0 %	0 %	60 %	307717813
113	NC_014484	CGTGG	2	10	123107	123116	0 %	20 %	60 %	20 %	307717813
114	NC_014484	CCCGT	2	10	124216	124225	0 %	20 %	20 %	60 %	307717814
115	NC_014484	GCCCC	2	10	125151	125160	0 %	0 %	20 %	80 %	307717816
116	NC_014484	CGGAC	2	10	125293	125302	20 %	0 %	40 %	40 %	307717816
117	NC_014484	TCTCC	2	10	127084	127093	0 %	40 %	0 %	60 %	307717817
118	NC_014484	TGAGC	2	10	128939	128948	20 %	20 %	40 %	20 %	307717819
119	NC_014484	ACGCC	2	10	131100	131109	20 %	0 %	20 %	60 %	307717821
120	NC_014484	AGGAG	2	10	131251	131260	40 %	0 %	60 %	0 %	307717821
121	NC_014484	AGACG	2	10	132923	132932	40 %	0 %	40 %	20 %	307717823
122	NC_014484	GAGGG	2	10	133406	133415	20 %	0 %	80 %	0 %	307717823
123	NC_014484	GTGAA	2	10	136213	136222	40 %	20 %	40 %	0 %	307717824
124	NC_014484	GGAAG	2	10	137783	137792	40 %	0 %	60 %	0 %	307717826
125	NC_014484	CCTCT	2	10	138028	138037	0 %	40 %	0 %	60 %	307717826
126	NC_014484	CCCTT	2	10	138061	138070	0 %	40 %	0 %	60 %	307717826
127	NC_014484	AGGTG	2	10	139715	139724	20 %	20 %	60 %	0 %	307717828
128	NC_014484	TCGAG	2	10	140859	140868	20 %	20 %	40 %	20 %	307717829
129	NC_014484	GGTGT	2	10	143153	143162	0 %	40 %	60 %	0 %	307717830
130	NC_014484	AGGAG	2	10	150616	150625	40 %	0 %	60 %	0 %	307717833
131	NC_014484	GGAGA	2	10	153714	153723	40 %	0 %	60 %	0 %	307717837
132	NC_014484	GGATC	2	10	155697	155706	20 %	20 %	40 %	20 %	307717839
133	NC_014484	TAGGA	2	10	157203	157212	40 %	20 %	40 %	0 %	307717840
134	NC_014484	CCTCG	2	10	158328	158337	0 %	20 %	20 %	60 %	307717842
135	NC_014484	TCACC	2	10	158387	158396	20 %	20 %	0 %	60 %	307717842
136	NC_014484	AGGCG	2	10	159914	159923	20 %	0 %	60 %	20 %	307717843
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