MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Spirochaeta thermophila DSM 6192 chromosome

Total Repeats: 43883

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014484	ACT	2	6	204	209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717718
2	NC_014484	ACG	2	6	210	215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717718
3	NC_014484	GGA	2	6	220	225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717718
4	NC_014484	AGC	2	6	273	278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717718
5	NC_014484	AGA	2	6	295	300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307717718
6	NC_014484	CTC	2	6	314	319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717718
7	NC_014484	TCC	2	6	389	394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717718
8	NC_014484	AAC	2	6	479	484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307717718
9	NC_014484	GCA	2	6	500	505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717718
10	NC_014484	GGA	2	6	557	562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717718
11	NC_014484	CTC	2	6	584	589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717718
12	NC_014484	GGT	2	6	634	639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717718
13	NC_014484	CTC	2	6	737	742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717718
14	NC_014484	CGA	2	6	745	750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717718
15	NC_014484	CTT	2	6	757	762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717718
16	NC_014484	AGG	2	6	783	788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717718
17	NC_014484	CAA	2	6	823	828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307717718
18	NC_014484	GAA	2	6	868	873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307717718
19	NC_014484	CCT	2	6	929	934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717718
20	NC_014484	CGA	2	6	997	1002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717718
21	NC_014484	TCA	2	6	1005	1010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717718
22	NC_014484	CAC	2	6	1030	1035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717718
23	NC_014484	ACT	2	6	1200	1205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717718
24	NC_014484	AAG	2	6	1235	1240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307717718
25	NC_014484	GGT	2	6	1252	1257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717718
26	NC_014484	CAC	2	6	1348	1353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717718
27	NC_014484	AGA	2	6	1371	1376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307717718
28	NC_014484	CAT	2	6	1414	1419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717718
29	NC_014484	TCA	2	6	1428	1433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717718
30	NC_014484	AGG	2	6	1443	1448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717718
31	NC_014484	CAT	2	6	1708	1713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717719
32	NC_014484	TCC	2	6	1749	1754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717719
33	NC_014484	AGC	2	6	1817	1822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717719
34	NC_014484	CCA	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717719
35	NC_014484	TCT	2	6	1857	1862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717719
36	NC_014484	ACT	2	6	1870	1875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717719
37	NC_014484	AAG	2	6	1958	1963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307717719
38	NC_014484	GAT	2	6	2093	2098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717719
39	NC_014484	TGG	2	6	2157	2162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717719
40	NC_014484	TGG	2	6	2206	2211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717719
41	NC_014484	ATC	2	6	2234	2239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717719
42	NC_014484	CCG	2	6	2240	2245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307717719
43	NC_014484	TCC	2	6	2250	2255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717719
44	NC_014484	CTC	2	6	2270	2275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717719
45	NC_014484	CAG	2	6	2402	2407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717719
46	NC_014484	CTC	2	6	2465	2470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717719
47	NC_014484	GTG	2	6	2522	2527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717719
48	NC_014484	GAG	2	6	2534	2539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717719
49	NC_014484	CGA	2	6	2584	2589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717719
50	NC_014484	TTC	2	6	2720	2725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717719
51	NC_014484	AGG	2	6	2940	2945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717720
52	NC_014484	TAC	2	6	2998	3003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717720
53	NC_014484	GAA	2	6	3053	3058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307717720
54	NC_014484	ACG	2	6	3112	3117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717720
55	NC_014484	CGC	2	6	3139	3144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307717720
56	NC_014484	TCC	2	6	3145	3150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717720
57	NC_014484	TGG	2	6	3181	3186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717720
58	NC_014484	ACA	2	6	3217	3222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307717720
59	NC_014484	GGA	2	6	3263	3268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717720
60	NC_014484	ACG	2	6	3283	3288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717720
61	NC_014484	TCA	2	6	3308	3313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717720
62	NC_014484	ATG	2	6	3336	3341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717720
63	NC_014484	TTC	2	6	3350	3355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717720
64	NC_014484	GAG	2	6	3375	3380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717720
65	NC_014484	TGG	2	6	3490	3495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717720
66	NC_014484	GAT	2	6	3666	3671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717720
67	NC_014484	CTC	2	6	3675	3680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717720
68	NC_014484	GAT	2	6	3716	3721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717720
69	NC_014484	TTC	2	6	3741	3746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717720
70	NC_014484	TCC	2	6	3769	3774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717720
71	NC_014484	GGA	3	9	3783	3791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717720
72	NC_014484	TCT	2	6	3864	3869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717721
73	NC_014484	GTC	3	9	3994	4002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717721
74	NC_014484	CGC	2	6	4090	4095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307717721
75	NC_014484	TCC	2	6	4159	4164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717721
76	NC_014484	GAG	2	6	4189	4194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717721
77	NC_014484	GGA	2	6	4452	4457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717722
78	NC_014484	CCT	2	6	4491	4496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717722
79	NC_014484	GAC	2	6	4523	4528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717722
80	NC_014484	TAC	2	6	4564	4569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717722
81	NC_014484	GAG	2	6	4621	4626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717722
82	NC_014484	CGG	2	6	4650	4655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307717722
83	NC_014484	AGG	2	6	4661	4666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717722
84	NC_014484	AGC	2	6	4709	4714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717722
85	NC_014484	TCC	2	6	4715	4720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717722
86	NC_014484	GAG	2	6	4831	4836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717722
87	NC_014484	GGC	2	6	4853	4858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307717722
88	NC_014484	AGG	2	6	4958	4963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717722
89	NC_014484	GAG	2	6	5005	5010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717722
90	NC_014484	TGG	3	9	5072	5080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717722
91	NC_014484	GAA	2	6	5133	5138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307717722
92	NC_014484	CTC	2	6	5182	5187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717722
93	NC_014484	GCG	2	6	5229	5234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307717722
94	NC_014484	GGC	2	6	5265	5270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307717722
95	NC_014484	AGG	3	9	5279	5287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717722
96	NC_014484	GTG	2	6	5527	5532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717722
97	NC_014484	CTC	2	6	5597	5602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717722
98	NC_014484	CAG	2	6	5730	5735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717723
99	NC_014484	GAA	2	6	5822	5827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307717723
100	NC_014484	AAG	2	6	5851	5856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307717723
101	NC_014484	TGG	2	6	6177	6182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717724
102	NC_014484	TCA	2	6	6223	6228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717724
103	NC_014484	TGG	2	6	6386	6391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717724
104	NC_014484	CCG	2	6	6463	6468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307717725
105	NC_014484	CCT	2	6	6583	6588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717725
106	NC_014484	GTC	2	6	6599	6604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307717725
107	NC_014484	CTC	2	6	6648	6653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717725
108	NC_014484	GGA	2	6	6659	6664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717725
109	NC_014484	GGT	2	6	6671	6676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717725
110	NC_014484	GGT	2	6	6698	6703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717725
111	NC_014484	CTC	2	6	6741	6746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717725
112	NC_014484	GGA	2	6	6761	6766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717725
113	NC_014484	TCC	2	6	6838	6843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717725
114	NC_014484	GAG	2	6	6863	6868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717725
115	NC_014484	TCC	2	6	6920	6925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717725
116	NC_014484	GAG	2	6	6960	6965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717725
117	NC_014484	TCC	2	6	7070	7075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717725
118	NC_014484	CGC	2	6	7079	7084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307717725
119	NC_014484	TTC	2	6	7113	7118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717725
120	NC_014484	GAG	2	6	7179	7184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717725
121	NC_014484	ATG	2	6	7255	7260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717725
122	NC_014484	CGG	2	6	7324	7329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307717725
123	NC_014484	GAG	2	6	7331	7336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717725
124	NC_014484	ACA	2	6	7402	7407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307717725
125	NC_014484	AGA	2	6	7408	7413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307717725
126	NC_014484	GGT	2	6	7454	7459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717725
127	NC_014484	TTC	2	6	7500	7505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717725
128	NC_014484	TTC	2	6	7515	7520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307717725
129	NC_014484	ATC	2	6	7524	7529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717725
130	NC_014484	CAT	2	6	7547	7552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717725
131	NC_014484	TCC	2	6	7576	7581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717725
132	NC_014484	GCA	2	6	7625	7630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307717725
133	NC_014484	GGA	2	6	7646	7651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717725
134	NC_014484	GAT	2	6	7671	7676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717725
135	NC_014484	CTC	2	6	7704	7709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717725
136	NC_014484	CTC	3	9	7752	7760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307717725
137	NC_014484	ATC	2	6	7950	7955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307717725
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139	NC_014484	GGT	2	6	8021	8026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717725
140	NC_014484	TGA	2	6	8125	8130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307717725
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143	NC_014484	GTG	2	6	8297	8302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717726
144	NC_014484	TGG	2	6	8388	8393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717726
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146	NC_014484	AAG	2	6	8513	8518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307717726
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154	NC_014484	GTG	2	6	8984	8989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717727
155	NC_014484	GTG	2	6	9014	9019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717727
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158	NC_014484	GGA	2	6	9175	9180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307717727
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162	NC_014484	CAC	2	6	9310	9315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307717728
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167	NC_014484	TGG	3	9	9612	9620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307717728
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