MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ignisphaera aggregans DSM 17230 chromosome

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014471	AACTTC	2	12	21223	21234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014471	GCTCTA	2	12	34697	34708	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014471	CTATAG	2	12	35225	35236	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014471	GCTTCG	2	12	53748	53759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014471	CCCGGC	2	12	62309	62320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_014471	TATATC	2	12	77201	77212	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014471	ATGTCT	2	12	113808	113819	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014471	TATCCC	2	12	138598	138609	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014471	CTAAAT	2	12	175183	175194	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014471	TATGTA	2	12	178045	178056	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014471	AATATT	2	12	249004	249015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014471	TAGCAA	2	12	264530	264541	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014471	CTATAT	2	12	293052	293063	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014471	GTGGCT	2	12	296416	296427	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014471	GATTAA	2	12	307061	307072	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014471	CAATAT	2	12	335551	335562	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014471	TATACA	2	12	341653	341664	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014471	TTGGGG	2	12	344541	344552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014471	TCAATC	2	12	357087	357098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014471	AATACT	2	12	371251	371262	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014471	TATAGT	2	12	409527	409538	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014471	CAAAGA	2	12	417501	417512	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014471	AAGGAA	2	12	444953	444964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014471	TTGATA	2	12	450637	450648	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014471	TATAAA	2	12	494008	494019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014471	AGCACT	2	12	534319	534330	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014471	AGATAT	2	12	573823	573834	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014471	ATTAGG	2	12	585418	585429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014471	ATATAC	2	12	596448	596459	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014471	AATTTT	2	12	607975	607986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014471	TGTATG	2	12	614470	614481	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014471	ATAGAT	2	12	614609	614620	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014471	TATAGC	2	12	616613	616624	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014471	CAAGAC	2	12	617515	617526	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014471	TCTTAC	2	12	624971	624982	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014471	TATCCA	2	12	625025	625036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014471	AAATTT	2	12	625514	625525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014471	CTATAG	2	12	712593	712604	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014471	CATATA	2	12	721489	721500	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014471	TGGCTA	2	12	729044	729055	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014471	ATATAG	2	12	734191	734202	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014471	AGATCC	2	12	748187	748198	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014471	AAATTT	2	12	757213	757224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014471	CTGCTC	2	12	791166	791177	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014471	TACTAG	2	12	804217	804228	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014471	TTTAAT	2	12	842027	842038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014471	GGCGGT	2	12	870151	870162	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014471	TAGATG	2	12	870377	870388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014471	TCTGTT	2	12	876861	876872	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014471	TGATAG	2	12	888603	888614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014471	CTATAT	2	12	902672	902683	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014471	TATTCT	2	12	980415	980426	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014471	ATATCT	2	12	1036502	1036513	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014471	ATATAG	2	12	1070942	1070953	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014471	CAAATT	2	12	1074743	1074754	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014471	CCATAT	2	12	1078241	1078252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014471	CACTAC	2	12	1177921	1177932	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014471	TTTTTA	2	12	1182380	1182391	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014471	ATGTCT	2	12	1203133	1203144	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014471	ATACCT	2	12	1203174	1203185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014471	TAAGGC	2	12	1203636	1203647	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014471	CTAAAT	2	12	1206794	1206805	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014471	ATATTT	2	12	1224933	1224944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014471	TATATT	2	12	1230762	1230773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014471	TCTATA	2	12	1235705	1235716	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014471	TATCTA	2	12	1240118	1240129	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014471	TATAGC	2	12	1240702	1240713	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014471	GATAGA	2	12	1243018	1243029	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014471	AATTTA	2	12	1262470	1262481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014471	ATTTGT	2	12	1275177	1275188	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014471	AAAGGG	2	12	1282386	1282397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014471	TCTAAA	2	12	1305162	1305173	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014471	CAATAA	2	12	1320327	1320338	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014471	TAAGTT	2	12	1322279	1322290	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014471	AATGTG	2	12	1324124	1324135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014471	TGAAAT	2	12	1388741	1388752	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014471	TAGAAG	2	12	1403943	1403954	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014471	TAAAAA	2	12	1417518	1417529	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014471	AGCTCA	2	12	1436024	1436035	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014471	AAATAG	2	12	1488179	1488190	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014471	TAATTA	2	12	1488764	1488775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014471	TCTAAT	2	12	1492460	1492471	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014471	GATATA	2	12	1505719	1505730	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014471	TTAATA	2	12	1509340	1509351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014471	CCACAA	2	12	1563795	1563806	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014471	CTAATT	2	12	1601918	1601929	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014471	TCTCTA	2	12	1642567	1642578	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014471	TTTACA	2	12	1678666	1678677	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014471	TTCTAG	2	12	1699689	1699700	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014471	CTAGAT	2	12	1721186	1721197	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014471	ATCTAG	2	12	1733109	1733120	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014471	ATCCTA	2	12	1746547	1746558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014471	ATGTAT	2	12	1754132	1754143	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014471	TGTTAC	2	12	1754187	1754198	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014471	ATTTTG	2	12	1768022	1768033	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014471	ATAGAT	2	12	1839332	1839343	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014471	CATATT	2	12	1840407	1840418	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_014471	GTTCTA	2	12	1861391	1861402	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_014471	CACGCC	2	12	1861437	1861448	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_014471	TGTTTT	2	12	1861526	1861537	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014471	CTTTCC	2	12	1870802	1870813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014471	CTATGA	2	12	1871495	1871506	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.