MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Ignisphaera aggregans DSM 17230 chromosome

Total Repeats: 253

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014471	AATAC	2	10	489	498	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014471	TAAGA	2	10	7865	7874	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014471	CATAT	2	10	7960	7969	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014471	ACATA	2	10	13480	13489	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014471	ACTAT	2	10	15707	15716	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014471	CAATA	2	10	21521	21530	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014471	TCCTT	2	10	46918	46927	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_014471	ACACC	2	10	49025	49034	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_014471	ATGAC	2	10	53189	53198	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014471	ATTAA	2	10	62187	62196	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014471	GTATA	2	10	65655	65664	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014471	CTTTA	2	10	71652	71661	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014471	AATAT	2	10	73628	73637	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014471	AACAA	2	10	78266	78275	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014471	TAGAA	2	10	80775	80784	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014471	CTAAT	2	10	82676	82685	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014471	ATAGA	2	10	97914	97923	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014471	TCTTT	2	10	98191	98200	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_014471	TAGCT	2	10	107104	107113	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014471	TATAA	2	10	113720	113729	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014471	ATTAC	2	10	113751	113760	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014471	TAATA	2	10	121231	121240	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014471	TTTAA	2	10	131859	131868	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014471	TATTT	2	10	131946	131955	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014471	GCTAT	2	10	150400	150409	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014471	TCTCC	2	10	153955	153964	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
27	NC_014471	AGTCT	2	10	154184	154193	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014471	GTGAA	2	10	154570	154579	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014471	AAATG	2	10	157732	157741	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014471	AATAT	2	10	160526	160535	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014471	TATTC	2	10	172547	172556	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014471	CCTAT	2	10	182559	182568	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_014471	ATATA	2	10	182720	182729	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014471	TCTAT	2	10	191061	191070	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014471	ATAGA	2	10	194101	194110	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014471	TTCTC	2	10	221489	221498	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_014471	GTATA	2	10	221612	221621	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014471	ATATC	2	10	248268	248277	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014471	TAATA	2	10	251766	251775	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014471	AAAGA	2	10	259460	259469	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014471	TATTG	2	10	269146	269155	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014471	ATAGA	2	10	281694	281703	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014471	TAAAT	2	10	283849	283858	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014471	CTAAT	2	10	285251	285260	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014471	GTATT	2	10	296914	296923	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014471	TTTTC	2	10	305308	305317	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_014471	AAATA	2	10	306378	306387	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014471	GAAGA	2	10	320060	320069	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014471	TCAAA	2	10	329012	329021	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014471	ATCTC	2	10	330715	330724	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_014471	ATAGA	2	10	344916	344925	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014471	GATAT	2	10	356997	357006	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014471	AGCTA	2	10	358274	358283	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014471	TGTAT	2	10	359424	359433	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014471	CTATC	2	10	360746	360755	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_014471	ATCTT	2	10	361015	361024	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014471	ATCTT	2	10	361035	361044	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014471	AATTA	2	10	363074	363083	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014471	TATAA	2	10	363189	363198	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014471	GCAAT	2	10	371090	371099	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014471	ATTGT	2	10	379569	379578	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014471	AACTG	2	10	384366	384375	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014471	CACTA	2	10	390200	390209	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_014471	ATTCT	2	10	418247	418256	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014471	GAAAT	2	10	444122	444131	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014471	TATCT	2	10	450347	450356	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014471	AATAA	2	10	451363	451372	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014471	AATTA	2	10	454865	454874	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014471	ACATC	2	10	466383	466392	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_014471	ATAAA	2	10	470083	470092	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014471	TAGCT	2	10	485234	485243	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014471	ATTTA	2	10	488958	488967	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014471	ATTGA	2	10	493097	493106	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014471	TAGCT	2	10	494890	494899	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_014471	CCGAT	2	10	505547	505556	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_014471	ATATT	2	10	505658	505667	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014471	TATTT	2	10	506042	506051	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014471	AACCT	2	10	511855	511864	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_014471	ATTGA	2	10	511985	511994	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014471	TTCTT	2	10	536983	536992	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014471	GAAAG	2	10	537314	537323	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014471	AAGAA	2	10	546630	546639	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014471	TCTTA	2	10	564059	564068	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014471	ACAAA	2	10	566224	566233	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014471	AAAAC	2	10	566312	566321	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014471	AGAAA	2	10	566334	566343	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014471	AAGAA	2	10	566662	566671	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014471	ACAGC	2	10	567549	567558	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_014471	AGTAC	2	10	568124	568133	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_014471	GTATA	2	10	568451	568460	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014471	ATTCA	2	10	575822	575831	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_014471	ATGCT	2	10	586229	586238	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_014471	GATAG	2	10	593023	593032	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014471	CATTA	2	10	594962	594971	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014471	CAAAG	2	10	595110	595119	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014471	AGAAT	2	10	595157	595166	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014471	AATAT	2	10	613373	613382	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014471	ATACA	2	10	613516	613525	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_014471	ACACC	2	10	614632	614641	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
100	NC_014471	AGAAA	2	10	630126	630135	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014471	ATTAG	2	10	638811	638820	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014471	ATTGA	2	10	642320	642329	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014471	ATGGG	2	10	647342	647351	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014471	CACAG	2	10	649586	649595	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_014471	AAATT	2	10	655402	655411	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014471	TATCC	2	10	693822	693831	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_014471	AATAT	2	10	694255	694264	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014471	TTGAT	2	10	699818	699827	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014471	ATAGA	2	10	704079	704088	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014471	ATGCT	2	10	711454	711463	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014471	AGTAT	2	10	714525	714534	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014471	AAAAT	2	10	719796	719805	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014471	ATGTT	2	10	720316	720325	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014471	TATTC	2	10	724546	724555	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014471	TTCAA	2	10	730498	730507	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_014471	CTAGG	2	10	744718	744727	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014471	GCAAC	2	10	746329	746338	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_014471	ATACA	2	10	747542	747551	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014471	AAAGT	2	10	751660	751669	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014471	AACAA	2	10	751830	751839	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_014471	GCTTT	2	10	780234	780243	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014471	TACTA	2	10	787426	787435	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_014471	AATCT	2	10	788499	788508	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014471	AATCA	2	10	789339	789348	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_014471	CAATA	2	10	791645	791654	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_014471	TGTTT	2	10	798992	799001	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014471	CTATA	2	10	803507	803516	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_014471	ATCTA	2	10	828032	828041	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014471	TCTGT	2	10	834435	834444	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_014471	TACCC	2	10	854986	854995	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
131	NC_014471	TTCAT	2	10	855110	855119	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014471	ATATA	2	10	870588	870597	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014471	TAAAA	2	10	873169	873178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014471	TGTGT	2	10	888735	888744	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014471	CACAA	2	10	901006	901015	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_014471	ATTCT	2	10	902739	902748	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014471	GTTTT	2	10	911383	911392	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014471	AGTAT	2	10	933499	933508	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014471	AACAC	2	10	941369	941378	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_014471	AGACT	2	10	954123	954132	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_014471	AGATA	2	10	956425	956434	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014471	TACTA	2	10	956640	956649	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_014471	CTAAT	2	10	959572	959581	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_014471	TATTC	2	10	979340	979349	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_014471	CTATT	2	10	998155	998164	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014471	ATTGT	2	10	1006719	1006728	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014471	ATATC	2	10	1013538	1013547	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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249	NC_014471	GAAAG	2	10	1867090	1867099	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
250	NC_014471	TATAT	2	10	1868117	1868126	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_014471	ATCCC	2	10	1869264	1869273	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.