MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyorhinis HUB-1 chromosome

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014448	ATTTTT	2	12	18059	18070	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014448	CTGGAG	2	12	22609	22620	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014448	AAGTGT	2	12	22916	22927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014448	ATATTT	2	12	25748	25759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014448	AATTAA	2	12	46591	46602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014448	CTTATT	2	12	48158	48169	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014448	ATTAAT	2	12	48270	48281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014448	AATGAA	2	12	49075	49086	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014448	AAATTT	2	12	49098	49109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014448	TTTTGA	2	12	50128	50139	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014448	GATAGA	2	12	51041	51052	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014448	TTTGTT	2	12	78296	78307	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014448	TCAAAA	2	12	108543	108554	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014448	TAAAAT	2	12	108966	108977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014448	TACAAA	2	12	109444	109455	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014448	TTGGAG	2	12	110048	110059	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014448	TAAAAA	2	12	138875	138886	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014448	TTGCAT	2	12	169892	169903	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014448	AAATTC	2	12	172401	172412	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014448	ATTTGA	2	12	208334	208345	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014448	TGTAAT	2	12	213779	213790	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014448	TCAAAT	2	12	215168	215179	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014448	AATTTT	2	12	223709	223720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014448	ATTTAA	2	12	224014	224025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014448	GTTTTT	2	12	224594	224605	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014448	TAAAGC	2	12	227586	227597	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014448	AAAAAT	2	12	228115	228126	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014448	TTTTAC	2	12	240444	240455	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014448	TCAATT	2	12	240565	240576	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014448	TAAAGC	2	12	242983	242994	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014448	TTTCAT	2	12	263815	263826	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014448	TTTTAG	2	12	276169	276180	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014448	GTATTT	2	12	281818	281829	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014448	AGTTGC	2	12	281973	281984	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014448	ATAAAG	2	12	288808	288819	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014448	TAAAAT	2	12	291809	291820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014448	CTTTTG	2	12	291963	291974	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014448	TAAAAA	2	12	298454	298465	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014448	TATAAA	2	12	322445	322456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014448	TTTATT	2	12	333382	333393	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014448	TGAAAT	2	12	336465	336476	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014448	GTAATT	2	12	340173	340184	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014448	TTTTGC	2	12	340482	340493	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014448	AATTAA	2	12	351657	351668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014448	TAACAC	2	12	367484	367495	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014448	TTTTTA	2	12	390288	390299	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014448	GAATTT	2	12	427012	427023	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014448	GTTAAA	2	12	427772	427783	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014448	ATATAA	2	12	429310	429321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014448	TTTTCA	2	12	437311	437322	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014448	AAAATA	2	12	438388	438399	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014448	ATTTAA	2	12	439685	439696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014448	ATTTAT	2	12	447244	447255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014448	ATTTTT	2	12	448679	448690	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014448	TTTTGT	2	12	448732	448743	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014448	ATTTTT	2	12	472464	472475	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014448	ATTTTT	3	18	476025	476042	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014448	CTTTAA	2	12	476169	476180	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014448	TAAATT	2	12	478308	478319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014448	TAGAAT	2	12	478870	478881	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014448	TTAAAT	2	12	479936	479947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014448	ACTGAT	2	12	484965	484976	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014448	TGTTTT	2	12	516798	516809	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014448	ATTTTA	2	12	517003	517014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014448	TAAAAA	2	12	519787	519798	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014448	ATTTTT	2	12	539625	539636	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014448	TATTAA	2	12	549795	549806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014448	ATCTAA	2	12	554220	554231	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_014448	AAAATT	2	12	555248	555259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014448	CTAAAT	2	12	555808	555819	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_014448	AGCCAA	2	12	562364	562375	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014448	TTTTAA	2	12	563187	563198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014448	TAAAAA	3	18	575986	576003	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014448	ATTACA	2	12	579222	579233	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014448	AATAAA	2	12	582834	582845	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014448	AATAAA	2	12	586159	586170	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014448	TAATTT	2	12	586269	586280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014448	TTTAAA	2	12	608741	608752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014448	AAATAA	2	12	616047	616058	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014448	ATTTTT	2	12	617595	617606	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014448	CTGGAG	2	12	625941	625952	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_014448	TATAAA	2	12	658256	658267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014448	AAATAA	2	12	667532	667543	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014448	ATCAAA	2	12	673537	673548	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014448	GAAATT	2	12	686915	686926	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014448	TTTTAA	2	12	688411	688422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014448	TTATAA	2	12	700189	700200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014448	TATTTT	2	12	707400	707411	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014448	AAGAAA	2	12	710135	710146	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014448	TGCTTA	2	12	711185	711196	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014448	ATGCAG	2	12	713188	713199	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014448	AAAATA	2	12	713256	713267	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014448	TAAAAA	2	12	713281	713292	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014448	TAAAAT	2	12	713359	713370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014448	ATATCT	2	12	715438	715449	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014448	CAAAAA	2	12	721109	721120	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014448	TTAAAT	2	12	747118	747129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014448	ATAAAA	2	12	747230	747241	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014448	ATTTAA	2	12	753470	753481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014448	AACATT	2	12	758581	758592	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014448	TTTTCT	2	12	760143	760154	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014448	ATAAGA	2	12	760199	760210	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014448	ATTACA	2	12	764364	764375	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_014448	CAAAAA	2	12	774512	774523	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014448	TCATAA	2	12	786504	786515	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_014448	AAACAA	2	12	828861	828872	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014448	ATGTAG	2	12	828878	828889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014448	TATAAT	2	12	839385	839396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.