MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyorhinis HUB-1 chromosome

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014448	ATAAA	2	10	1332	1341	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014448	AAATA	2	10	7046	7055	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014448	AAAAT	2	10	7507	7516	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014448	TCCAA	2	10	7544	7553	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_014448	AAAAC	2	10	18270	18279	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014448	ACCTA	2	10	18410	18419	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_014448	TCGTG	2	10	19354	19363	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014448	TTAAG	2	10	19418	19427	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014448	GCTAC	2	10	19643	19652	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_014448	TAAAT	2	10	19993	20002	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014448	GAAAA	2	10	20301	20310	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014448	AAATT	2	10	23102	23111	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014448	TAATT	2	10	25682	25691	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014448	ATTAA	2	10	32621	32630	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014448	TTTTA	2	10	42521	42530	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014448	AAAAC	2	10	48377	48386	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014448	TTCTT	2	10	48450	48459	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014448	TATCT	2	10	49434	49443	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_014448	TTTTG	2	10	49804	49813	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014448	ATTTT	2	10	50093	50102	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014448	TAAAA	2	10	56850	56859	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014448	ATTTA	2	10	58509	58518	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014448	ATTTA	2	10	58612	58621	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014448	AAAAG	2	10	58791	58800	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014448	TTTAA	2	10	65138	65147	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014448	AATTT	2	10	65822	65831	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014448	ATTTT	2	10	77183	77192	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014448	AATTA	2	10	92022	92031	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014448	ATTTT	2	10	94136	94145	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014448	TATAA	2	10	102863	102872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014448	CTTAC	2	10	104905	104914	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_014448	ATTTT	2	10	109171	109180	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014448	TTCAA	2	10	109416	109425	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014448	TCCAA	2	10	109869	109878	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_014448	AAAAT	2	10	111066	111075	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014448	ATTAA	2	10	118573	118582	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014448	TTGAA	2	10	132456	132465	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014448	ATTAT	2	10	134248	134257	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014448	TTTAA	2	10	136978	136987	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014448	TAATA	2	10	138948	138957	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014448	CATTT	2	10	146862	146871	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014448	TAAAT	2	10	150617	150626	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014448	ATATA	2	10	151094	151103	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014448	ATTTT	2	10	160603	160612	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014448	AAAAT	2	10	164124	164133	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014448	TAATT	2	10	164379	164388	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014448	TTTAA	2	10	164768	164777	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014448	ATATA	2	10	180070	180079	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014448	ATTTA	2	10	208459	208468	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014448	AATCA	2	10	208730	208739	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014448	AACTA	2	10	210601	210610	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014448	ATTTT	2	10	210665	210674	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014448	AATTA	2	10	210735	210744	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014448	TTTTC	2	10	213916	213925	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014448	ACTAA	2	10	215416	215425	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014448	ATTAA	2	10	216825	216834	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014448	GTTTT	2	10	222416	222425	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014448	CAAAA	2	10	223264	223273	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014448	AAAAT	2	10	227273	227282	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014448	AAAAT	2	10	227472	227481	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014448	TTCAA	2	10	228849	228858	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014448	TAAAA	2	10	228917	228926	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014448	TTTAA	2	10	236336	236345	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014448	TTTAA	2	10	238096	238105	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014448	ATTAA	2	10	240165	240174	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014448	TCATC	2	10	240283	240292	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_014448	TTTCT	2	10	241889	241898	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014448	AATTA	2	10	243480	243489	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014448	AAATT	2	10	268928	268937	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014448	ATTTT	2	10	270084	270093	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014448	TTTTA	2	10	288699	288708	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014448	CAAAT	2	10	288763	288772	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014448	TAAAA	2	10	291850	291859	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014448	AATTA	2	10	311876	311885	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014448	AATTT	2	10	312246	312255	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014448	AAAAT	2	10	313041	313050	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014448	TTTAT	2	10	324938	324947	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014448	ATTTT	2	10	333365	333374	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014448	TATTT	2	10	336288	336297	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014448	ATTTT	2	10	336400	336409	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014448	TTCTT	2	10	340291	340300	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014448	TAAAA	2	10	341719	341728	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014448	CAATT	2	10	353416	353425	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014448	AATTA	2	10	353430	353439	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014448	ATTAA	2	10	357568	357577	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014448	ATTTT	2	10	372149	372158	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014448	ATTTT	2	10	378949	378958	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014448	GAAAT	2	10	390268	390277	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014448	GAAAA	2	10	400292	400301	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014448	TTTTA	2	10	402037	402046	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014448	ATAAA	2	10	402234	402243	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014448	ATTTT	2	10	403680	403689	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014448	TAATA	2	10	419379	419388	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014448	TTTGA	2	10	427681	427690	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014448	TTTGT	2	10	429489	429498	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014448	AAACC	2	10	433269	433278	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_014448	TTTTA	2	10	433576	433585	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014448	TTTTA	2	10	434380	434389	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014448	TTTTA	2	10	435322	435331	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014448	TTTTA	2	10	437485	437494	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014448	TCACC	2	10	441240	441249	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
102	NC_014448	TTTTG	2	10	473446	473455	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014448	TAATT	2	10	474055	474064	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014448	TTTTG	2	10	474127	474136	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014448	ATTTA	2	10	476011	476020	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014448	TAAAA	2	10	476400	476409	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014448	ATTTT	2	10	477658	477667	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014448	AATTT	2	10	477683	477692	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014448	TTAAA	2	10	478076	478085	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014448	AATTT	2	10	480494	480503	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014448	TTATC	2	10	480712	480721	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014448	TTTGT	2	10	494549	494558	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014448	AATTA	2	10	500765	500774	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014448	GGATT	2	10	505693	505702	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014448	TTTTG	2	10	512281	512290	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014448	TCAAA	2	10	515566	515575	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014448	AAATT	2	10	516092	516101	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014448	AAGCA	2	10	516929	516938	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014448	ACAAG	2	10	517628	517637	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014448	TTGAT	2	10	517939	517948	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014448	TAAAA	2	10	518415	518424	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014448	TAAAA	2	10	519816	519825	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014448	TAAAT	2	10	528893	528902	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014448	CTTTC	2	10	545025	545034	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_014448	ATAAA	2	10	554373	554382	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014448	TTGAA	2	10	557020	557029	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014448	TAAAT	2	10	557625	557634	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014448	TGAAA	2	10	558452	558461	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014448	ATAAA	2	10	562341	562350	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014448	GGAAA	2	10	567424	567433	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014448	ATTTT	2	10	567656	567665	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014448	ATAAA	2	10	579246	579255	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014448	AACAA	2	10	581828	581837	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_014448	AACTG	2	10	582595	582604	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_014448	TAAAA	2	10	582689	582698	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014448	TAAAT	2	10	586348	586357	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014448	TTTTC	2	10	588641	588650	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_014448	GTTAT	2	10	589601	589610	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014448	AAAAT	2	10	593729	593738	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014448	AAAAG	2	10	617621	617630	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014448	AAAAT	2	10	636294	636303	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014448	CAAAA	2	10	637845	637854	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_014448	AATTT	2	10	638076	638085	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014448	AAAAT	2	10	646142	646151	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014448	TTTCC	2	10	650720	650729	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_014448	TAAAA	2	10	650751	650760	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014448	ATTTT	2	10	656550	656559	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014448	GTTTT	2	10	660863	660872	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014448	ATTAT	2	10	667565	667574	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_014448	ACTAA	2	10	817315	817324	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
197	NC_014448	TAAAA	2	10	821601	821610	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_014448	AGTTG	2	10	832133	832142	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
199	NC_014448	AAGAA	2	10	836872	836881	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.