MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyorhinis HUB-1 chromosome

Total Repeats: 475

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014448	TAAT	2	8	1342	1349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014448	CAAA	6	24	6988	7011	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014448	GTTG	2	8	7119	7126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014448	ATTA	2	8	7310	7317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014448	ATTT	2	8	7400	7407	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014448	TAAA	2	8	7492	7499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014448	ACAA	2	8	7554	7561	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014448	ATAA	2	8	7609	7616	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014448	ATTT	2	8	9409	9416	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014448	CGCT	2	8	18332	18339	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014448	CATG	2	8	18352	18359	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014448	TTAT	2	8	18470	18477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014448	TTAG	2	8	18538	18545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014448	TAAG	2	8	20092	20099	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014448	GCGA	2	8	20335	20342	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014448	GAAC	2	8	21726	21733	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014448	GCGA	2	8	21761	21768	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014448	ATCT	2	8	38713	38720	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014448	AGAA	2	8	41306	41313	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014448	TCCC	2	8	42465	42472	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_014448	TGCT	2	8	42595	42602	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014448	TAAA	2	8	48083	48090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014448	ATGA	2	8	48433	48440	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014448	AAAG	2	8	48695	48702	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014448	ATTA	2	8	48828	48835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014448	CTTC	2	8	48985	48992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014448	ACTA	2	8	49198	49205	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014448	TTAC	2	8	49282	49289	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014448	TAAA	2	8	49352	49359	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014448	AAAT	2	8	49421	49428	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014448	ATTT	2	8	49628	49635	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014448	ATAA	2	8	49782	49789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014448	AATA	2	8	49862	49869	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014448	AGTA	2	8	50177	50184	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014448	TAAA	2	8	50272	50279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014448	TATT	2	8	50757	50764	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014448	TAAT	2	8	50929	50936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014448	AAAT	2	8	58492	58499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014448	ATTA	2	8	58696	58703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014448	ATAC	2	8	59333	59340	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014448	AAAC	2	8	59371	59378	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014448	ACTT	2	8	59417	59424	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014448	AATT	2	8	59456	59463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014448	ATTA	2	8	64859	64866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014448	ATAA	2	8	64948	64955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014448	AATT	2	8	89438	89445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014448	ATAA	2	8	91632	91639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014448	CAAA	2	8	91650	91657	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014448	AAAG	2	8	92092	92099	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014448	TAAA	2	8	104684	104691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014448	AAAT	2	8	107247	107254	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014448	ATTT	2	8	108512	108519	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014448	ATTA	2	8	108948	108955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014448	AAAG	2	8	110080	110087	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014448	TTTA	2	8	111220	111227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014448	CAAA	2	8	115077	115084	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014448	CAAA	2	8	117024	117031	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014448	ATCA	2	8	117502	117509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014448	AAAT	2	8	132480	132487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014448	TAAA	2	8	145823	145830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014448	ATTA	2	8	145876	145883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014448	ATAA	2	8	147042	147049	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014448	TCTT	2	8	147104	147111	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014448	GTTT	2	8	151143	151150	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014448	TGAT	2	8	160135	160142	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014448	TTAA	2	8	160681	160688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014448	TAAA	2	8	163838	163845	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014448	TTTC	2	8	164430	164437	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014448	TTTG	2	8	167631	167638	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014448	AATT	2	8	169648	169655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014448	ATTA	2	8	170101	170108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014448	ATTT	2	8	170117	170124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014448	CAAA	2	8	170155	170162	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014448	CAAA	2	8	171767	171774	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014448	AGTA	2	8	171947	171954	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014448	TGAT	2	8	172264	172271	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014448	AATC	2	8	172317	172324	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014448	ATAA	2	8	179794	179801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014448	CTGT	2	8	179910	179917	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014448	AATA	2	8	180115	180122	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014448	TATT	2	8	184687	184694	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014448	GTTT	3	12	186336	186347	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014448	TAAA	2	8	202499	202506	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014448	TATT	2	8	208237	208244	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014448	ATAG	2	8	208322	208329	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014448	CATA	2	8	208373	208380	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014448	CATA	2	8	208390	208397	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014448	ACAT	2	8	208632	208639	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014448	TAAA	2	8	208848	208855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014448	TCTT	2	8	208879	208886	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014448	TAAA	3	12	208998	209009	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014448	TAAA	2	8	210479	210486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014448	ATTA	2	8	210500	210507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014448	ATTT	2	8	210546	210553	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014448	ATTA	2	8	210556	210563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014448	TTAA	3	12	210885	210896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014448	ATTT	2	8	211054	211061	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014448	TTAA	2	8	211147	211154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014448	TAAT	2	8	213702	213709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014448	AATG	2	8	213720	213727	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014448	CATT	2	8	213750	213757	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014448	AATA	2	8	213791	213798	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014448	GTTG	2	8	214070	214077	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014448	AATT	2	8	216795	216802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014448	TAAA	2	8	216852	216859	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014448	AAGT	2	8	223277	223284	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014448	AAAT	2	8	223408	223415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014448	AATT	2	8	223966	223973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014448	TCAA	2	8	224127	224134	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014448	TATT	2	8	224390	224397	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014448	ATTT	2	8	224408	224415	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014448	ATCA	2	8	224549	224556	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014448	ATAA	2	8	224669	224676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014448	ATTT	2	8	224838	224845	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014448	AAAT	2	8	224918	224925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014448	CAAA	2	8	226751	226758	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014448	GTTT	2	8	227402	227409	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014448	TACT	2	8	227420	227427	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_014448	TAAA	2	8	227514	227521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014448	CTTT	2	8	227982	227989	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014448	TCTT	2	8	228018	228025	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014448	TATT	2	8	228061	228068	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014448	ATTT	2	8	228137	228144	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014448	TTGA	2	8	239485	239492	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014448	ATCT	2	8	240365	240372	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014448	GTTT	3	12	240541	240552	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014448	AATT	2	8	240587	240594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014448	AAAT	2	8	241179	241186	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014448	ATCT	2	8	241496	241503	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014448	TTTG	2	8	242036	242043	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014448	TTTA	2	8	242448	242455	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014448	TTTG	2	8	242486	242493	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014448	TGTT	2	8	242510	242517	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014448	TAAA	2	8	243195	243202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014448	ATTT	2	8	243204	243211	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014448	TTTG	2	8	243462	243469	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014448	CAAA	2	8	268893	268900	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014448	ATTT	2	8	270198	270205	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014448	TTAA	2	8	273404	273411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014448	TAAA	2	8	276187	276194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014448	TAAA	2	8	278223	278230	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014448	CTTT	2	8	278340	278347	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014448	AGAA	2	8	278501	278508	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014448	AATT	2	8	282105	282112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014448	AGTG	2	8	282163	282170	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014448	TAAA	2	8	291899	291906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014448	ATTT	2	8	293695	293702	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014448	GATA	2	8	293797	293804	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014448	CTTG	2	8	294389	294396	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014448	AATT	2	8	294567	294574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014448	CTTT	2	8	298358	298365	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_014448	TTTA	2	8	298366	298373	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014448	AAAT	2	8	300854	300861	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.