MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571 chromosome

Total Repeats: 7265

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014410	ATAA	2	8	109	116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014410	ATGC	2	8	634	641	25 %	25 %	25 %	25 %	304315538
3	NC_014410	ATGT	2	8	685	692	25 %	50 %	25 %	0 %	304315538
4	NC_014410	AAAT	2	8	759	766	75 %	25 %	0 %	0 %	304315538
5	NC_014410	CAAA	2	8	1193	1200	75 %	0 %	0 %	25 %	304315538
6	NC_014410	TAAA	2	8	1448	1455	75 %	25 %	0 %	0 %	304315538
7	NC_014410	TAAA	2	8	1758	1765	75 %	25 %	0 %	0 %	304315539
8	NC_014410	GAAA	2	8	2083	2090	75 %	0 %	25 %	0 %	304315539
9	NC_014410	TGGA	2	8	2229	2236	25 %	25 %	50 %	0 %	304315539
10	NC_014410	ATAG	2	8	2525	2532	50 %	25 %	25 %	0 %	304315539
11	NC_014410	TTAT	2	8	2791	2798	25 %	75 %	0 %	0 %	304315539
12	NC_014410	TACT	2	8	3451	3458	25 %	50 %	0 %	25 %	304315541
13	NC_014410	TAAA	2	8	4099	4106	75 %	25 %	0 %	0 %	304315541
14	NC_014410	ACCA	2	8	4780	4787	50 %	0 %	0 %	50 %	304315543
15	NC_014410	GTTT	2	8	5543	5550	0 %	75 %	25 %	0 %	304315544
16	NC_014410	TTTA	2	8	6264	6271	25 %	75 %	0 %	0 %	304315544
17	NC_014410	CACT	2	8	7062	7069	25 %	25 %	0 %	50 %	304315545
18	NC_014410	TAAA	2	8	7368	7375	75 %	25 %	0 %	0 %	304315545
19	NC_014410	AGTG	2	8	8693	8700	25 %	25 %	50 %	0 %	304315546
20	NC_014410	GGAT	2	8	8822	8829	25 %	25 %	50 %	0 %	304315546
21	NC_014410	AATG	2	8	8861	8868	50 %	25 %	25 %	0 %	304315546
22	NC_014410	TAAA	2	8	9652	9659	75 %	25 %	0 %	0 %	304315546
23	NC_014410	GAAA	2	8	10146	10153	75 %	0 %	25 %	0 %	304315546
24	NC_014410	AGAT	2	8	10471	10478	50 %	25 %	25 %	0 %	304315546
25	NC_014410	AAGT	2	8	10489	10496	50 %	25 %	25 %	0 %	304315546
26	NC_014410	CAAG	2	8	10749	10756	50 %	0 %	25 %	25 %	304315546
27	NC_014410	AGAT	2	8	11113	11120	50 %	25 %	25 %	0 %	304315546
28	NC_014410	TTTA	2	8	12282	12289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014410	GAAG	2	8	13293	13300	50 %	0 %	50 %	0 %	304315550
30	NC_014410	ACAT	2	8	13480	13487	50 %	25 %	0 %	25 %	304315550
31	NC_014410	AATA	2	8	14903	14910	75 %	25 %	0 %	0 %	304315551
32	NC_014410	AGAT	2	8	15417	15424	50 %	25 %	25 %	0 %	304315552
33	NC_014410	AGAT	2	8	16209	16216	50 %	25 %	25 %	0 %	304315552
34	NC_014410	AGGA	2	8	16495	16502	50 %	0 %	50 %	0 %	304315552
35	NC_014410	GGAA	2	8	16603	16610	50 %	0 %	50 %	0 %	304315553
36	NC_014410	TTTG	2	8	17206	17213	0 %	75 %	25 %	0 %	304315554
37	NC_014410	AGAT	2	8	17532	17539	50 %	25 %	25 %	0 %	304315554
38	NC_014410	AGAA	2	8	17587	17594	75 %	0 %	25 %	0 %	304315554
39	NC_014410	AGAA	2	8	17627	17634	75 %	0 %	25 %	0 %	304315554
40	NC_014410	TTTG	2	8	17812	17819	0 %	75 %	25 %	0 %	304315554
41	NC_014410	AAAG	2	8	18176	18183	75 %	0 %	25 %	0 %	304315555
42	NC_014410	TGCT	2	8	18592	18599	0 %	50 %	25 %	25 %	304315555
43	NC_014410	ATGG	2	8	19608	19615	25 %	25 %	50 %	0 %	304315555
44	NC_014410	GTAT	2	8	20059	20066	25 %	50 %	25 %	0 %	304315556
45	NC_014410	AGGA	2	8	20300	20307	50 %	0 %	50 %	0 %	304315556
46	NC_014410	AATG	2	8	20860	20867	50 %	25 %	25 %	0 %	304315556
47	NC_014410	AAAT	2	8	21891	21898	75 %	25 %	0 %	0 %	304315557
48	NC_014410	AAAT	2	8	22134	22141	75 %	25 %	0 %	0 %	304315557
49	NC_014410	GAAG	2	8	24087	24094	50 %	0 %	50 %	0 %	304315559
50	NC_014410	TTCA	2	8	24246	24253	25 %	50 %	0 %	25 %	304315559
51	NC_014410	TAAA	2	8	25441	25448	75 %	25 %	0 %	0 %	304315561
52	NC_014410	ACAA	2	8	26210	26217	75 %	0 %	0 %	25 %	304315561
53	NC_014410	CAAT	2	8	26350	26357	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014410	TATT	2	8	26384	26391	25 %	75 %	0 %	0 %	304315562
55	NC_014410	AAAT	2	8	27147	27154	75 %	25 %	0 %	0 %	304315563
56	NC_014410	ATTT	2	8	27268	27275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014410	AAAG	2	8	27545	27552	75 %	0 %	25 %	0 %	304315564
58	NC_014410	GTAT	2	8	28111	28118	25 %	50 %	25 %	0 %	304315564
59	NC_014410	ATTA	2	8	28322	28329	50 %	50 %	0 %	0 %	304315564
60	NC_014410	CATA	2	8	29071	29078	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014410	AGGA	2	8	29822	29829	50 %	0 %	50 %	0 %	304315566
62	NC_014410	TTTG	2	8	30355	30362	0 %	75 %	25 %	0 %	304315566
63	NC_014410	TATT	2	8	30542	30549	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014410	TTTA	2	8	30744	30751	25 %	75 %	0 %	0 %	304315567
65	NC_014410	TTTA	2	8	30905	30912	25 %	75 %	0 %	0 %	304315567
66	NC_014410	TATT	2	8	31031	31038	25 %	75 %	0 %	0 %	304315567
67	NC_014410	CAGG	2	8	31896	31903	25 %	0 %	50 %	25 %	304315567
68	NC_014410	ATAC	2	8	32129	32136	50 %	25 %	0 %	25 %	304315567
69	NC_014410	ACAA	2	8	32185	32192	75 %	0 %	0 %	25 %	304315567
70	NC_014410	TGAT	2	8	32987	32994	25 %	50 %	25 %	0 %	304315567
71	NC_014410	TAAA	2	8	33212	33219	75 %	25 %	0 %	0 %	304315567
72	NC_014410	AAAG	2	8	33294	33301	75 %	0 %	25 %	0 %	304315567
73	NC_014410	ATAA	2	8	34098	34105	75 %	25 %	0 %	0 %	304315568
74	NC_014410	AGCA	2	8	34481	34488	50 %	0 %	25 %	25 %	304315569
75	NC_014410	AAAT	2	8	35545	35552	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014410	TCTT	2	8	35721	35728	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014410	AATT	2	8	35759	35766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014410	TGAT	2	8	36012	36019	25 %	50 %	25 %	0 %	304315570
79	NC_014410	AAAT	2	8	36105	36112	75 %	25 %	0 %	0 %	304315570
80	NC_014410	CAGT	2	8	36159	36166	25 %	25 %	25 %	25 %	304315570
81	NC_014410	AAAT	2	8	36388	36395	75 %	25 %	0 %	0 %	304315570
82	NC_014410	TTAA	2	8	36769	36776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014410	TTTG	2	8	37248	37255	0 %	75 %	25 %	0 %	304315571
84	NC_014410	ACAA	2	8	37358	37365	75 %	0 %	0 %	25 %	304315571
85	NC_014410	TAAT	2	8	37561	37568	50 %	50 %	0 %	0 %	304315571
86	NC_014410	GATA	2	8	37662	37669	50 %	25 %	25 %	0 %	304315571
87	NC_014410	GTAA	2	8	38001	38008	50 %	25 %	25 %	0 %	304315571
88	NC_014410	AATT	2	8	38422	38429	50 %	50 %	0 %	0 %	304315572
89	NC_014410	TTAA	2	8	38904	38911	50 %	50 %	0 %	0 %	304315572
90	NC_014410	GGGT	2	8	39251	39258	0 %	25 %	75 %	0 %	304315572
91	NC_014410	TAAT	2	8	39343	39350	50 %	50 %	0 %	0 %	304315572
92	NC_014410	TAAA	2	8	39448	39455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014410	AACA	2	8	39521	39528	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014410	GAAA	2	8	39552	39559	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014410	GTTT	2	8	40427	40434	0 %	75 %	25 %	0 %	304315573
96	NC_014410	ATAG	2	8	40747	40754	50 %	25 %	25 %	0 %	304315573
97	NC_014410	TTGC	2	8	41020	41027	0 %	50 %	25 %	25 %	304315573
98	NC_014410	GAAA	2	8	41102	41109	75 %	0 %	25 %	0 %	304315573
99	NC_014410	AATT	3	12	41463	41474	50 %	50 %	0 %	0 %	304315573
100	NC_014410	TTAA	2	8	41512	41519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014410	ACAA	2	8	42123	42130	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014410	AGAA	2	8	42578	42585	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014410	GATA	2	8	42776	42783	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014410	GAAG	2	8	43267	43274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014410	AAGG	2	8	43547	43554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014410	TCAA	2	8	43639	43646	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014410	GGAA	2	8	43889	43896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014410	AGAC	2	8	43979	43986	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014410	ATTA	2	8	44247	44254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014410	CTTT	2	8	44618	44625	0 %	75 %	0 %	25 %	304315575
111	NC_014410	AATT	2	8	44658	44665	50 %	50 %	0 %	0 %	304315575
112	NC_014410	TAAT	2	8	44859	44866	50 %	50 %	0 %	0 %	304315575
113	NC_014410	TTGT	2	8	45444	45451	0 %	75 %	25 %	0 %	304315576
114	NC_014410	GATT	2	8	46291	46298	25 %	50 %	25 %	0 %	304315576
115	NC_014410	GATA	2	8	47170	47177	50 %	25 %	25 %	0 %	304315577
116	NC_014410	TAAT	2	8	47445	47452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014410	ATTA	2	8	47519	47526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014410	GTTT	2	8	47915	47922	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014410	AAGC	2	8	48400	48407	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014410	AATA	2	8	48616	48623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014410	TGTA	2	8	48830	48837	25 %	50 %	25 %	0 %	304315578
122	NC_014410	TCAA	2	8	49283	49290	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014410	GTAA	2	8	49472	49479	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014410	GGAA	2	8	49535	49542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014410	GTCA	2	8	51221	51228	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014410	AATA	2	8	51608	51615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014410	TGAG	2	8	51664	51671	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014410	GAGG	2	8	51698	51705	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014410	AATG	2	8	51903	51910	50 %	25 %	25 %	0 %	304315580
130	NC_014410	TTAA	2	8	52056	52063	50 %	50 %	0 %	0 %	304315580
131	NC_014410	ATAA	2	8	52230	52237	75 %	25 %	0 %	0 %	304315580
132	NC_014410	AAAT	2	8	52345	52352	75 %	25 %	0 %	0 %	304315580
133	NC_014410	ATTG	2	8	53381	53388	25 %	50 %	25 %	0 %	304315580
134	NC_014410	CTAA	2	8	53593	53600	50 %	25 %	0 %	25 %	304315580
135	NC_014410	AGAT	2	8	54452	54459	50 %	25 %	25 %	0 %	304315581
136	NC_014410	TTGA	2	8	55210	55217	25 %	50 %	25 %	0 %	304315581
137	NC_014410	AATT	2	8	55674	55681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014410	AAAT	2	8	56308	56315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014410	GAAA	2	8	56382	56389	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014410	CAAA	2	8	57054	57061	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014410	AAAT	2	8	57195	57202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014410	ATTT	2	8	57628	57635	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014410	TTAT	2	8	58195	58202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_014410	TTGG	2	8	58552	58559	0 %	50 %	50 %	0 %	304315584
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