MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanothermobacter marburgensis str. Marburg plasmid pMTBMA4

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014409	ACC	2	6	49	54	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_014409	AGG	2	6	86	91	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014409	AAG	2	6	116	121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315533
4	NC_014409	TAG	2	6	180	185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315533
5	NC_014409	TCA	2	6	225	230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315533
6	NC_014409	TGA	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315533
7	NC_014409	GAT	2	6	347	352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315533
8	NC_014409	TCC	2	6	360	365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304315533
9	NC_014409	ATG	2	6	381	386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315533
10	NC_014409	TCC	2	6	429	434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304315533
11	NC_014409	AGG	2	6	457	462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315533
12	NC_014409	ATG	2	6	534	539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315533
13	NC_014409	TGA	2	6	595	600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315533
14	NC_014409	TAT	2	6	621	626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315533
15	NC_014409	CCA	2	6	664	669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304315533
16	NC_014409	TCC	2	6	804	809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304315533
17	NC_014409	TGA	2	6	835	840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315533
18	NC_014409	ATG	2	6	852	857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315533
19	NC_014409	TCC	2	6	894	899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304315533
20	NC_014409	AGG	2	6	930	935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315533
21	NC_014409	GGA	2	6	1039	1044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315533
22	NC_014409	CAG	2	6	1054	1059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315533
23	NC_014409	AGG	2	6	1083	1088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315533
24	NC_014409	TCA	2	6	1140	1145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315533
25	NC_014409	AGG	3	9	1292	1300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315533
26	NC_014409	ATC	2	6	1337	1342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315533
27	NC_014409	TGA	2	6	1459	1464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315533
28	NC_014409	GAT	2	6	1499	1504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315533
29	NC_014409	CAA	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304315533
30	NC_014409	TTG	2	6	1707	1712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315533
31	NC_014409	ATA	3	9	1905	1913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315533
32	NC_014409	TGT	2	6	1939	1944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315533
33	NC_014409	CCT	2	6	1994	1999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304315533
34	NC_014409	TCC	2	6	2069	2074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304315533
35	NC_014409	TTA	2	6	2197	2202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315533
36	NC_014409	TGA	2	6	2257	2262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315533
37	NC_014409	GAT	2	6	2266	2271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315533
38	NC_014409	GAG	2	6	2318	2323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315533
39	NC_014409	AGG	2	6	2324	2329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315533
40	NC_014409	CTC	2	6	2387	2392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304315533
41	NC_014409	CGG	2	6	2483	2488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304315533
42	NC_014409	CCA	2	6	2647	2652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304315534
43	NC_014409	GAT	2	6	2726	2731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315534
44	NC_014409	GAG	2	6	2762	2767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315534
45	NC_014409	TCA	2	6	2780	2785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315534
46	NC_014409	GAG	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315534
47	NC_014409	AGG	2	6	2852	2857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315534
48	NC_014409	TGG	2	6	2911	2916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304315534
49	NC_014409	TTG	2	6	2941	2946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315535
50	NC_014409	CAA	2	6	2963	2968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304315535
51	NC_014409	TCA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315535
52	NC_014409	TCA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315535
53	NC_014409	TTC	2	6	3156	3161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304315535
54	NC_014409	ATC	2	6	3186	3191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315535
55	NC_014409	TCC	2	6	3216	3221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304315535
56	NC_014409	TAA	2	6	3228	3233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315535
57	NC_014409	ACC	3	9	3258	3266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304315535
58	NC_014409	GAT	2	6	3501	3506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014409	GGA	2	6	3726	3731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014409	CTG	2	6	3785	3790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014409	CCT	2	6	3825	3830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_014409	GGT	2	6	3831	3836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014409	ATA	2	6	3945	3950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014409	AAC	2	6	4013	4018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304315536
65	NC_014409	GTT	2	6	4040	4045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315536
66	NC_014409	CCA	2	6	4077	4082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304315536
67	NC_014409	AGG	2	6	4392	4397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014409	CAG	2	6	4421	4426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.