MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanothermobacter marburgensis str. Marburg chromosome

Total Repeats: 405

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014408	ATTT	2	8	5135	5142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014408	TTAT	2	8	13929	13936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014408	AGGG	2	8	15079	15086	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014408	ATTT	2	8	17920	17927	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014408	ATTT	2	8	18719	18726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014408	TCAG	2	8	18734	18741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014408	AAAT	2	8	24818	24825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014408	AACA	2	8	36690	36697	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014408	AATT	2	8	41842	41849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014408	TAAA	2	8	41963	41970	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014408	CATC	2	8	42072	42079	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014408	TAAA	2	8	42799	42806	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014408	CATG	2	8	55868	55875	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014408	ATTA	3	12	73180	73191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014408	TAAC	2	8	76845	76852	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014408	TCCA	2	8	77942	77949	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014408	AGTA	2	8	94172	94179	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014408	TAAA	2	8	96653	96660	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014408	CTGA	2	8	101097	101104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014408	ATCA	2	8	108274	108281	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014408	ATCA	2	8	108331	108338	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014408	ATCA	2	8	108388	108395	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014408	TCAA	2	8	116685	116692	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014408	TATC	2	8	124083	124090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014408	CTTT	2	8	126645	126652	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014408	CTTT	2	8	129236	129243	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014408	AGTA	2	8	130465	130472	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014408	TCAT	2	8	135265	135272	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014408	TAAT	2	8	138771	138778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014408	GCTG	2	8	145532	145539	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014408	TGAT	2	8	151898	151905	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014408	AGGG	2	8	163521	163528	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014408	TATG	2	8	165748	165755	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014408	GTGG	2	8	165823	165830	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014408	AACC	2	8	174068	174075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014408	ACCT	2	8	184287	184294	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014408	TTCA	2	8	189476	189483	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014408	AAAT	2	8	189520	189527	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014408	ATTG	2	8	191018	191025	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014408	TTTC	2	8	191134	191141	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014408	TCCA	2	8	191943	191950	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014408	GAGG	2	8	217830	217837	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014408	CCAG	2	8	223793	223800	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014408	ATGA	2	8	224354	224361	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014408	TTAT	2	8	226414	226421	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014408	AAGT	2	8	228774	228781	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014408	GCAT	2	8	230659	230666	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014408	CAGA	2	8	232961	232968	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014408	ATTA	2	8	239008	239015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014408	TAAA	2	8	246778	246785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014408	TAAT	2	8	249239	249246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014408	TAAC	2	8	257876	257883	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014408	TTAA	2	8	265241	265248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014408	CCAC	2	8	266380	266387	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_014408	GTTT	2	8	270141	270148	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014408	TTCA	2	8	271664	271671	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014408	TAAA	2	8	273512	273519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014408	AATA	2	8	273567	273574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014408	TCCA	2	8	273970	273977	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014408	GACA	2	8	294369	294376	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014408	AAAT	2	8	295608	295615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014408	TTAA	2	8	299285	299292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014408	CAGC	2	8	304574	304581	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014408	ATTT	2	8	319591	319598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014408	CGAA	2	8	319747	319754	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014408	GAAC	2	8	320374	320381	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014408	CGAG	2	8	320733	320740	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014408	TGTT	2	8	321356	321363	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014408	GGAA	2	8	322102	322109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014408	GCCA	2	8	323386	323393	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014408	CTAG	2	8	323452	323459	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014408	GGTT	2	8	324241	324248	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014408	TGTT	2	8	324449	324456	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014408	GCCA	2	8	324927	324934	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014408	CTGC	2	8	325065	325072	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014408	GGGA	2	8	325088	325095	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014408	TTCT	2	8	342870	342877	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014408	CCCG	2	8	342893	342900	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_014408	TTAT	2	8	344124	344131	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014408	TATT	2	8	346986	346993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014408	CAAG	2	8	347988	347995	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014408	AAAT	2	8	347996	348003	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014408	ATGG	2	8	348067	348074	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014408	GCAG	2	8	359230	359237	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014408	TTCT	2	8	361083	361090	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014408	AATC	2	8	365471	365478	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014408	GTTG	2	8	376383	376390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014408	ACTA	2	8	378201	378208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014408	ATTT	2	8	380634	380641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014408	AATA	2	8	381163	381170	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014408	AGGG	2	8	382297	382304	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014408	ATCT	2	8	383297	383304	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014408	ATTA	2	8	390406	390413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014408	ACTA	2	8	390424	390431	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014408	ATTT	2	8	393861	393868	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014408	CTAT	2	8	395456	395463	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014408	CAGG	2	8	400711	400718	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014408	TTTC	2	8	407510	407517	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014408	TTTA	2	8	409439	409446	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014408	ATCA	2	8	413260	413267	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014408	TATT	2	8	413305	413312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014408	ATTA	2	8	428695	428702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014408	CCCA	2	8	433016	433023	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
104	NC_014408	AATG	2	8	433456	433463	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014408	CGAA	2	8	433583	433590	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014408	GAAC	2	8	434210	434217	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014408	CGAG	2	8	434569	434576	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014408	TGTT	2	8	435192	435199	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014408	GGAA	2	8	435938	435945	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014408	GCCA	2	8	437222	437229	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014408	CTAG	2	8	437288	437295	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014408	GGTT	2	8	438077	438084	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014408	TGTT	2	8	438285	438292	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014408	ATCC	2	8	438642	438649	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014408	CATT	2	8	448657	448664	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014408	TTTA	2	8	449469	449476	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014408	AAGG	2	8	461249	461256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014408	TCAT	2	8	491590	491597	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_014408	ACCT	2	8	497796	497803	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014408	GATG	2	8	499151	499158	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014408	AAAT	2	8	503850	503857	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014408	TAAT	2	8	504346	504353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014408	ATTT	2	8	504389	504396	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014408	AATG	2	8	504451	504458	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014408	AAAG	2	8	508492	508499	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014408	AAAT	2	8	512254	512261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014408	ACGA	2	8	519855	519862	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014408	ATTA	2	8	523074	523081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014408	CATG	2	8	524133	524140	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014408	GCTG	2	8	525702	525709	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014408	AAAG	2	8	534612	534619	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014408	ACCA	2	8	537763	537770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_014408	ATGA	2	8	537862	537869	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014408	CCTT	2	8	545093	545100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_014408	TTAT	2	8	545394	545401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014408	ATTT	2	8	548095	548102	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014408	ATTT	2	8	551623	551630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014408	AAAG	2	8	561884	561891	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014408	ATTT	2	8	563096	563103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014408	AACC	2	8	563104	563111	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_014408	GATT	2	8	565283	565290	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014408	TATT	2	8	576003	576010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014408	CTTA	2	8	578971	578978	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014408	AATT	2	8	593502	593509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014408	CAGA	2	8	594179	594186	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014408	TTTA	2	8	595762	595769	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014408	GAAT	2	8	603969	603976	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014408	ATAA	2	8	606720	606727	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014408	TAAA	2	8	608418	608425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014408	GAAA	2	8	608510	608517	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014408	TGGC	2	8	610237	610244	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.