MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Gallionella capsiferriformans ES-2 chromosome

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014394	AAAATG	2	12	388367	388378	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014394	CACCGC	2	12	571263	571274	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_014394	CATCCG	2	12	646262	646273	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014394	TTGCTT	2	12	667382	667393	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014394	AGCTAT	2	12	810304	810315	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014394	CCTGCA	2	12	834152	834163	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014394	TATATG	2	12	902592	902603	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014394	CGCGAC	2	12	905448	905459	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014394	TCAGCC	2	12	912287	912298	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014394	ATGTAA	2	12	1023650	1023661	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014394	GTTGAC	2	12	1033211	1033222	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014394	AAAAAT	2	12	1038174	1038185	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014394	ATTGTC	2	12	1075903	1075914	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014394	GCATCG	2	12	1146629	1146640	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014394	TGAGCG	2	12	1214493	1214504	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014394	AGTTAA	2	12	1360558	1360569	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014394	GGTCAA	2	12	1374933	1374944	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014394	GCGTTG	3	18	1399403	1399420	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014394	TGCCAC	2	12	1486563	1486574	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014394	TTCAGC	2	12	1546696	1546707	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014394	CCTAAA	2	12	1548687	1548698	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014394	AACTTC	2	12	1583197	1583208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014394	ATCGTC	2	12	1634437	1634448	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014394	GTTTTC	2	12	1669904	1669915	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014394	CTAAAT	2	12	1805664	1805675	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014394	CCGGCA	2	12	1833657	1833668	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014394	TCGCTG	2	12	1878314	1878325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014394	TTTTTG	2	12	1878974	1878985	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014394	ATTAAA	2	12	1894732	1894743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014394	GCTGGC	2	12	1956726	1956737	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014394	ATATCA	2	12	2004539	2004550	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014394	AATTTA	2	12	2048571	2048582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014394	TATTGC	2	12	2064161	2064172	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014394	GACAAA	2	12	2111177	2111188	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014394	GACAGC	2	12	2317585	2317596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014394	AATAGC	2	12	2579664	2579675	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014394	AGTATT	2	12	2602322	2602333	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014394	CAGCGC	2	12	2625721	2625732	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014394	GTATAT	2	12	2699700	2699711	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014394	ATTTAT	2	12	2772130	2772141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014394	CAATAA	2	12	2774277	2774288	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014394	CAATAA	2	12	2774291	2774302	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014394	ATAGCC	2	12	2791776	2791787	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014394	CGCCTG	2	12	2854922	2854933	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014394	ACTCAC	2	12	3086651	3086662	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.