MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Gallionella capsiferriformans ES-2 chromosome

Total Repeats: 41824

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014394	GTT	2	6	297	302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302877246
2	NC_014394	CAC	2	6	358	363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302877246
3	NC_014394	CGC	2	6	494	499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302877246
4	NC_014394	CGG	2	6	554	559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302877246
5	NC_014394	CGT	2	6	668	673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302877246
6	NC_014394	TGA	2	6	743	748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302877246
7	NC_014394	GTC	2	6	880	885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302877246
8	NC_014394	GCC	2	6	926	931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302877246
9	NC_014394	GCC	2	6	969	974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302877246
10	NC_014394	GAT	2	6	993	998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302877246
11	NC_014394	TAT	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302877246
12	NC_014394	AAG	2	6	1120	1125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302877246
13	NC_014394	ATT	2	6	1195	1200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302877246
14	NC_014394	TGA	2	6	1525	1530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014394	ATT	2	6	1584	1589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014394	ATT	3	9	1616	1624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014394	GTT	2	6	1625	1630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014394	CCA	2	6	1901	1906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_014394	TTA	2	6	1929	1934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014394	GTC	2	6	1995	2000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302877247
21	NC_014394	TCG	2	6	2008	2013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302877247
22	NC_014394	CGG	2	6	2162	2167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302877247
23	NC_014394	ATT	2	6	2366	2371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302877247
24	NC_014394	CAG	2	6	2397	2402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302877247
25	NC_014394	TTA	2	6	2411	2416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302877247
26	NC_014394	TTG	2	6	2554	2559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302877247
27	NC_014394	ATT	2	6	2570	2575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302877247
28	NC_014394	GAC	2	6	2583	2588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302877247
29	NC_014394	TCA	2	6	2610	2615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302877247
30	NC_014394	TAC	2	6	2651	2656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302877247
31	NC_014394	ATC	2	6	2713	2718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302877247
32	NC_014394	GCA	2	6	2741	2746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302877247
33	NC_014394	TAT	2	6	2825	2830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302877247
34	NC_014394	CAG	2	6	2831	2836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302877247
35	NC_014394	AGC	2	6	2937	2942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302877247
36	NC_014394	AGT	2	6	2985	2990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302877247
37	NC_014394	TGA	2	6	3008	3013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302877247
38	NC_014394	AAC	2	6	3099	3104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014394	CAG	2	6	3109	3114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014394	ATT	2	6	3306	3311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302877248
41	NC_014394	GAA	2	6	3375	3380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302877248
42	NC_014394	CTG	3	9	3388	3396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302877248
43	NC_014394	TTA	2	6	3400	3405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302877248
44	NC_014394	CGG	2	6	3422	3427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302877248
45	NC_014394	GGT	2	6	3459	3464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302877248
46	NC_014394	GGT	2	6	3485	3490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302877248
47	NC_014394	GTA	2	6	3618	3623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302877248
48	NC_014394	GAA	2	6	3756	3761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302877248
49	NC_014394	CGG	2	6	3776	3781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302877248
50	NC_014394	AAT	2	6	3930	3935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302877248
51	NC_014394	GGA	2	6	3951	3956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302877248
52	NC_014394	GAT	2	6	4056	4061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302877248
53	NC_014394	TTC	2	6	4115	4120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302877248
54	NC_014394	TCT	2	6	4143	4148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302877248
55	NC_014394	GAA	2	6	4167	4172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302877248
56	NC_014394	CAG	2	6	4182	4187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302877248
57	NC_014394	ATT	2	6	4227	4232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302877248
58	NC_014394	GGC	2	6	4250	4255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302877248
59	NC_014394	GGC	2	6	4268	4273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302877248
60	NC_014394	GGT	2	6	4404	4409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302877248
61	NC_014394	ATC	2	6	4599	4604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302877248
62	NC_014394	TGC	2	6	4645	4650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302877248
63	NC_014394	CCA	2	6	4713	4718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302877248
64	NC_014394	GAT	2	6	4761	4766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302877248
65	NC_014394	CTG	2	6	4785	4790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302877248
66	NC_014394	GCA	2	6	4833	4838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302877248
67	NC_014394	GAT	2	6	4971	4976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302877248
68	NC_014394	GAT	2	6	5049	5054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302877248
69	NC_014394	CTA	2	6	5090	5095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302877248
70	NC_014394	ATT	2	6	5101	5106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302877248
71	NC_014394	GCT	2	6	5264	5269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302877248
72	NC_014394	AGA	2	6	5270	5275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302877248
73	NC_014394	ACC	2	6	5346	5351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302877248
74	NC_014394	TGC	2	6	5402	5407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302877248
75	NC_014394	TGA	2	6	5408	5413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302877248
76	NC_014394	CGC	2	6	5451	5456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302877248
77	NC_014394	TGA	2	6	5513	5518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014394	TTG	2	6	5533	5538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014394	TTG	2	6	5624	5629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014394	GCA	2	6	5761	5766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302877249
81	NC_014394	TCG	2	6	5877	5882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302877249
82	NC_014394	GTT	2	6	5988	5993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302877249
83	NC_014394	AAC	2	6	6032	6037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302877249
84	NC_014394	CAG	2	6	6313	6318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302877249
85	NC_014394	TGC	2	6	6323	6328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302877249
86	NC_014394	GCC	2	6	6374	6379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302877249
87	NC_014394	CTG	2	6	6511	6516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302877249
88	NC_014394	GAG	2	6	6680	6685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302877249
89	NC_014394	CAC	2	6	6742	6747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302877250
90	NC_014394	CCA	2	6	6825	6830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302877250
91	NC_014394	CAC	2	6	6912	6917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302877250
92	NC_014394	CGT	2	6	6981	6986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302877250
93	NC_014394	CCG	2	6	7019	7024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302877250
94	NC_014394	TCA	3	9	7056	7064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302877250
95	NC_014394	CGT	2	6	7447	7452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302877250
96	NC_014394	ATC	2	6	7576	7581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302877250
97	NC_014394	GCG	2	6	7695	7700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302877250
98	NC_014394	ATG	2	6	7705	7710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302877250
99	NC_014394	TCC	3	9	7788	7796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302877251
100	NC_014394	AGC	2	6	7824	7829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302877251
101	NC_014394	ACC	2	6	7875	7880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302877251
102	NC_014394	GCA	2	6	7896	7901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302877251
103	NC_014394	ATC	2	6	8001	8006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302877251
104	NC_014394	ATC	2	6	8283	8288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302877251
105	NC_014394	CCG	2	6	8310	8315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302877251
106	NC_014394	TCA	2	6	8415	8420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302877251
107	NC_014394	ACT	2	6	8457	8462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302877251
108	NC_014394	GCC	2	6	8477	8482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302877251
109	NC_014394	ACG	2	6	8499	8504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302877251
110	NC_014394	GCG	2	6	8633	8638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302877251
111	NC_014394	GTT	2	6	8651	8656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302877251
112	NC_014394	ATG	2	6	8658	8663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302877251
113	NC_014394	GCG	2	6	8796	8801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014394	ATC	2	6	8845	8850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302877252
115	NC_014394	GCG	2	6	8966	8971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302877252
116	NC_014394	GAA	2	6	9080	9085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302877252
117	NC_014394	CTT	2	6	9100	9105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302877252
118	NC_014394	GCC	2	6	9116	9121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302877252
119	NC_014394	GCT	2	6	9151	9156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302877252
120	NC_014394	ATC	2	6	9281	9286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302877252
121	NC_014394	GAC	2	6	9313	9318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302877252
122	NC_014394	GAA	2	6	9395	9400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302877252
123	NC_014394	ATC	2	6	9546	9551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302877252
124	NC_014394	ATT	2	6	9552	9557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302877252
125	NC_014394	AAT	2	6	9612	9617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014394	ACG	2	6	9636	9641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302877253
127	NC_014394	GGT	2	6	9651	9656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302877253
128	NC_014394	GGT	2	6	9684	9689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302877253
129	NC_014394	TAT	2	6	9711	9716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302877253
130	NC_014394	CCG	2	6	9717	9722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302877253
131	NC_014394	GGC	2	6	9764	9769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302877253
132	NC_014394	CGC	2	6	9897	9902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302877253
133	NC_014394	GAA	2	6	9945	9950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302877253
134	NC_014394	GCG	2	6	10035	10040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302877253
135	NC_014394	ATC	2	6	10078	10083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302877253
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139	NC_014394	GCG	2	6	10364	10369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302877253
140	NC_014394	GCT	2	6	10565	10570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302877253
141	NC_014394	GCG	2	6	10573	10578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302877253
142	NC_014394	CCG	2	6	10608	10613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302877253
143	NC_014394	AGG	2	6	10759	10764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302877253
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162	NC_014394	ATA	2	6	12397	12402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302877254
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164	NC_014394	TGT	3	9	12550	12558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014394	GCT	2	6	12977	12982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302877255
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171	NC_014394	CAA	2	6	13625	13630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_014394	ACT	2	6	13650	13655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302877256
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247	NC_014394	CAA	2	6	19574	19579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302877259
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249	NC_014394	GAT	2	6	19677	19682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302877259
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253	NC_014394	TTC	2	6	20280	20285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302877260
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255	NC_014394	GCC	2	6	20361	20366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302877260
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257	NC_014394	TTG	2	6	20565	20570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302877260
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279	NC_014394	TTG	2	6	22343	22348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_014394	TTG	2	6	22382	22387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_014394	TTG	2	6	22473	22478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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374	NC_014394	CAC	2	6	28474	28479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302877265
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380	NC_014394	ATG	2	6	28706	28711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302877265
381	NC_014394	GGT	2	6	28755	28760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302877265
382	NC_014394	TCA	2	6	28766	28771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302877265
383	NC_014394	AGG	2	6	28781	28786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302877265
384	NC_014394	GCG	2	6	28787	28792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302877265
385	NC_014394	GGC	2	6	28873	28878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302877265
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401	NC_014394	GAA	2	6	30383	30388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302877267
402	NC_014394	CAG	2	6	30461	30466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302877267
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409	NC_014394	CTG	2	6	30959	30964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302877268
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453	NC_014394	TTG	2	6	33530	33535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302877271
454	NC_014394	TGG	2	6	33540	33545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302877271
455	NC_014394	GTT	2	6	33619	33624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302877271
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457	NC_014394	AGG	2	6	33885	33890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302877271
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460	NC_014394	CGG	2	6	34263	34268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302877271
461	NC_014394	TGA	2	6	34375	34380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302877271
462	NC_014394	CAG	2	6	34454	34459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302877271
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474	NC_014394	GAC	2	6	35362	35367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302877271
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477	NC_014394	AGG	2	6	35496	35501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302877271
478	NC_014394	CTG	2	6	35557	35562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302877272
479	NC_014394	GTT	2	6	35658	35663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302877272
480	NC_014394	GGT	2	6	35739	35744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302877272
481	NC_014394	GAT	2	6	35745	35750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302877272
482	NC_014394	TGG	2	6	35937	35942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302877272
483	NC_014394	TCA	2	6	36125	36130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302877272
484	NC_014394	CTG	2	6	36187	36192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
485	NC_014394	GGA	2	6	36324	36329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
486	NC_014394	CAG	2	6	36342	36347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302877273
487	NC_014394	CCA	2	6	36362	36367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302877273
488	NC_014394	ATG	2	6	36542	36547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302877273
489	NC_014394	CGA	2	6	36613	36618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302877273
490	NC_014394	GGC	2	6	36698	36703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302877273
491	NC_014394	GGC	2	6	36760	36765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302877273
492	NC_014394	CAA	2	6	36772	36777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302877273
493	NC_014394	ATC	2	6	36798	36803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302877273
494	NC_014394	ATG	2	6	36833	36838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302877273
495	NC_014394	GTT	2	6	36995	37000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302877273
496	NC_014394	TGC	2	6	37085	37090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302877273
497	NC_014394	GCA	2	6	37148	37153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302877273
498	NC_014394	GCA	2	6	37222	37227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302877273
499	NC_014394	AAC	2	6	37283	37288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302877273
500	NC_014394	CGC	2	6	37340	37345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302877273

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