MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Caldicellulosiruptor obsidiansis OB47 chromosome

Total Repeats: 1215

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014392	AAAACC	2	12	1913	1924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014392	ATGCAA	2	12	4088	4099	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302870734
3	NC_014392	CTTGAA	2	12	5716	5727	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302870735
4	NC_014392	GGAAAA	2	12	9699	9710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870740
5	NC_014392	GATGCA	2	12	9918	9929	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302870740
6	NC_014392	GATGAG	2	12	11259	11270	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	302870740
7	NC_014392	TTATAT	2	12	11716	11727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302870741
8	NC_014392	GGGATA	2	12	12473	12484	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	302870741
9	NC_014392	TCAATG	2	12	13714	13725	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302870743
10	NC_014392	TTCAAA	2	12	13855	13866	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	302870743
11	NC_014392	TCTGTA	2	12	13994	14005	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302870743
12	NC_014392	AATTTC	2	12	14130	14141	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302870743
13	NC_014392	ATTAGA	2	12	15629	15640	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302870745
14	NC_014392	ATATCT	2	12	17231	17242	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302870749
15	NC_014392	TTTTTA	2	12	17637	17648	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	302870749
16	NC_014392	TTTTAG	2	12	18894	18905	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	302870750
17	NC_014392	GATACA	2	12	20612	20623	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014392	GAAGAG	2	12	20843	20854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014392	TATAAA	2	12	22981	22992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014392	TTTCTT	2	12	26540	26551	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	302870754
21	NC_014392	ATTTTT	2	12	27242	27253	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	302870755
22	NC_014392	AGGAAA	2	12	28695	28706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870757
23	NC_014392	AAATTA	2	12	30684	30695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014392	AAAAGA	2	12	35437	35448	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	302870763
25	NC_014392	CCAAAA	2	12	36709	36720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302870764
26	NC_014392	AGCAAG	2	12	37051	37062	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	302870764
27	NC_014392	ATATTT	2	12	39034	39045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302870766
28	NC_014392	CCAAAA	2	12	40007	40018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302870767
29	NC_014392	GAAAAA	2	12	41763	41774	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	302870768
30	NC_014392	TAAAAA	2	12	45272	45283	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014392	AAAACC	2	12	50216	50227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014392	GTGAAA	2	12	52949	52960	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302870775
33	NC_014392	TTGACT	2	12	54332	54343	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302870775
34	NC_014392	ATAGGC	2	12	55611	55622	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302870776
35	NC_014392	ATATAG	2	12	58714	58725	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302870780
36	NC_014392	TTGGTT	2	12	60856	60867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302870782
37	NC_014392	GGAAAA	2	12	62176	62187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302870783
38	NC_014392	TCAAAA	2	12	64583	64594	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	302870786
39	NC_014392	GAAATG	2	12	65574	65585	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014392	ACATTT	2	12	69840	69851	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302870789
41	NC_014392	CGAAAG	2	12	70112	70123	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	302870789
42	NC_014392	TATGCA	2	12	72006	72017	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302870789
43	NC_014392	GAAAAA	2	12	73929	73940	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	302870790
44	NC_014392	TCTTCG	2	12	74727	74738	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	302870791
45	NC_014392	CTTTGA	2	12	75812	75823	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302870792
46	NC_014392	AAAAGC	2	12	76852	76863	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	302870793
47	NC_014392	TTTTAA	2	12	78797	78808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302870795
48	NC_014392	GGCAAT	2	12	80794	80805	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302870797
49	NC_014392	AAATGA	2	12	82938	82949	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	302870799
50	NC_014392	TTAATT	2	12	85425	85436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302870800
51	NC_014392	GAAAAA	2	12	86091	86102	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	302870800
52	NC_014392	ACTATT	2	12	87634	87645	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302870801
53	NC_014392	TAACTA	2	12	87942	87953	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014392	AACCAG	2	12	89531	89542	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	302870802
55	NC_014392	GATTAA	2	12	95734	95745	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302870803
56	NC_014392	TCTGAC	2	12	99374	99385	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302870806
57	NC_014392	AGCTGC	2	12	100234	100245	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302870806
58	NC_014392	ATTTTT	2	12	102922	102933	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014392	GAATAA	2	12	104149	104160	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	302870809
60	NC_014392	AAAATT	2	12	107127	107138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014392	TGTGAC	2	12	107398	107409	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014392	AAGACA	2	12	109544	109555	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014392	CTTTTG	2	12	109912	109923	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	302870813
64	NC_014392	AATATT	2	12	111230	111241	50 %	50 %	0 %	0 %	302870814
65	NC_014392	TCGTTT	2	12	111282	111293	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	302870814
66	NC_014392	ATTAAA	2	12	111827	111838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302870815
67	NC_014392	CAAATT	2	12	112867	112878	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	302870815
68	NC_014392	AAAATT	2	12	114973	114984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302870817
69	NC_014392	GCAAAA	2	12	115919	115930	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	302870818
70	NC_014392	ATACCT	2	12	124716	124727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302870823
71	NC_014392	ATTTCT	2	12	125241	125252	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	302870823
72	NC_014392	AATAAA	2	12	126238	126249	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	302870824
73	NC_014392	CTTCAA	2	12	126447	126458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302870824
74	NC_014392	CTTGTT	2	12	127322	127333	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	302870825
75	NC_014392	ATTTTG	2	12	128402	128413	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014392	TTTTCA	2	12	131160	131171	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	302870828
77	NC_014392	TTTTAA	2	12	133407	133418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302870830
78	NC_014392	TAGCAA	2	12	133786	133797	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302870830
79	NC_014392	AGATGA	2	12	133930	133941	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302870831
80	NC_014392	ATTTTT	2	12	136120	136131	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	302870834
81	NC_014392	TTGAAA	2	12	139246	139257	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302870836
82	NC_014392	AATCCA	2	12	139714	139725	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	302870837
83	NC_014392	CAGTAT	2	12	140395	140406	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302870838
84	NC_014392	GATTTT	2	12	141400	141411	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	302870839
85	NC_014392	ATTTTA	2	12	147366	147377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014392	TAAGAA	2	12	148817	148828	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014392	GAGCAG	2	12	152638	152649	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014392	GAGCAG	2	12	152968	152979	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014392	CAAATT	2	12	157604	157615	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014392	AGGGCG	2	12	159216	159227	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014392	TGTCAT	2	12	161366	161377	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014392	CAGGGA	2	12	161902	161913	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014392	GCAATA	2	12	161925	161936	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_014392	GATAAT	2	12	162361	162372	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014392	AAAATC	2	12	162802	162813	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014392	ATTTTT	2	12	166945	166956	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	302870843
97	NC_014392	TACCAA	2	12	167705	167716	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	302870845
98	NC_014392	AGGCAA	2	12	168859	168870	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	302870846
99	NC_014392	TTTTTC	2	12	169705	169716	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	302870846
100	NC_014392	AATTTG	2	12	170052	170063	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302870847
101	NC_014392	TCAATA	2	12	170506	170517	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	302870847
102	NC_014392	TTCAAA	2	12	171009	171020	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	302870847
103	NC_014392	GTAAAA	2	12	175812	175823	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014392	ATTCAG	2	12	177387	177398	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302870850
105	NC_014392	GGCAGA	2	12	177461	177472	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	302870850
106	NC_014392	ACTTGA	2	12	178448	178459	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302870851
107	NC_014392	TAAAAT	2	12	180201	180212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014392	CATAAT	2	12	180720	180731	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	302870852
109	NC_014392	TGACAA	2	12	180818	180829	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302870852
110	NC_014392	TTTTCC	2	12	181162	181173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302870853
111	NC_014392	GTTTTT	2	12	181570	181581	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	302870853
112	NC_014392	AACAAA	2	12	182444	182455	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	302870854
113	NC_014392	TTGATT	2	12	183016	183027	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	302870855
114	NC_014392	CAGGTG	2	12	183535	183546	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	302870855
115	NC_014392	CAAAAA	2	12	183780	183791	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_014392	AGGTAT	2	12	183897	183908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014392	AGAGAT	2	12	184407	184418	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302870856
118	NC_014392	TTCTGT	2	12	186156	186167	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	302870857
119	NC_014392	ATAAAA	2	12	186266	186277	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	302870857
120	NC_014392	AAACAT	2	12	186872	186883	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	302870858
121	NC_014392	GGATAA	2	12	189687	189698	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014392	CAAAGG	2	12	189721	189732	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	302870861
123	NC_014392	GATTAT	2	12	191896	191907	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302870861
124	NC_014392	GGTTAA	2	12	193224	193235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870861
125	NC_014392	GTCCAT	2	12	202213	202224	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302870870
126	NC_014392	TAAAAA	2	12	204920	204931	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	302870872
127	NC_014392	GCAATG	2	12	206190	206201	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302870874
128	NC_014392	AAAAGA	2	12	208429	208440	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	302870877
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130	NC_014392	AGAACA	2	12	212167	212178	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	302870879
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137	NC_014392	TTGCAC	2	12	224018	224029	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302870885
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143	NC_014392	TTCAAG	2	12	236114	236125	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302870892
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155	NC_014392	TTCAAG	2	12	266681	266692	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302870919
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161	NC_014392	GTATTT	2	12	280287	280298	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	302870929
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173	NC_014392	AATTGG	2	12	312244	312255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302870955
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175	NC_014392	ATGATA	2	12	313541	313552	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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234	NC_014392	AAAACC	2	12	486772	486783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
235	NC_014392	TTATTG	2	12	489753	489764	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	302871093
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351	NC_014392	AAAATA	2	12	731722	731733	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
352	NC_014392	TTGTAA	2	12	732896	732907	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302871292
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355	NC_014392	ATACAA	2	12	736001	736012	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
356	NC_014392	TAAAAA	2	12	736054	736065	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
357	NC_014392	GAAAAA	2	12	737583	737594	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	302871296
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359	NC_014392	GATTTC	2	12	738622	738633	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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473	NC_014392	TCAGGG	2	12	982858	982869	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	302871517
474	NC_014392	ATGCTG	2	12	984735	984746	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302871519
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482	NC_014392	ATAATT	2	12	1004772	1004783	50 %	50 %	0 %	0 %	302871539
483	NC_014392	TCCATA	2	12	1004901	1004912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302871539
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