MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Caldicellulosiruptor obsidiansis OB47 chromosome

Total Repeats: 2214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014392	AGGCG	2	10	1346	1355	20 %	0 %	60 %	20 %	302870732
2	NC_014392	AAAGC	2	10	4145	4154	60 %	0 %	20 %	20 %	302870734
3	NC_014392	ATAAA	2	10	5138	5147	80 %	20 %	0 %	0 %	302870735
4	NC_014392	CTTCT	2	10	5180	5189	0 %	60 %	0 %	40 %	302870735
5	NC_014392	CAGGA	2	10	6282	6291	40 %	0 %	40 %	20 %	302870736
6	NC_014392	TGCAG	2	10	7262	7271	20 %	20 %	40 %	20 %	302870737
7	NC_014392	AAGAG	2	10	8869	8878	60 %	0 %	40 %	0 %	302870739
8	NC_014392	TGGAA	2	10	11087	11096	40 %	20 %	40 %	0 %	302870740
9	NC_014392	AGACA	2	10	11219	11228	60 %	0 %	20 %	20 %	302870740
10	NC_014392	TTTAA	2	10	11468	11477	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014392	AGTGA	2	10	11687	11696	40 %	20 %	40 %	0 %	302870741
12	NC_014392	TTTCC	2	10	14009	14018	0 %	60 %	0 %	40 %	302870743
13	NC_014392	ATTTT	2	10	14057	14066	20 %	80 %	0 %	0 %	302870743
14	NC_014392	ATTAC	2	10	15340	15349	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014392	AATTA	2	10	15401	15410	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014392	AGAAT	2	10	16038	16047	60 %	20 %	20 %	0 %	302870747
17	NC_014392	ATTTA	2	10	16355	16364	40 %	60 %	0 %	0 %	302870747
18	NC_014392	TTTAC	2	10	16428	16437	20 %	60 %	0 %	20 %	302870747
19	NC_014392	TTATG	2	10	16762	16771	20 %	60 %	20 %	0 %	302870748
20	NC_014392	CAAAA	2	10	17294	17303	80 %	0 %	0 %	20 %	302870749
21	NC_014392	CAAGC	2	10	19389	19398	40 %	0 %	20 %	40 %	302870750
22	NC_014392	GAGAA	2	10	20661	20670	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014392	AAAAT	2	10	22611	22620	80 %	20 %	0 %	0 %	302870752
24	NC_014392	TTGTT	2	10	22627	22636	0 %	80 %	20 %	0 %	302870752
25	NC_014392	ACAAA	2	10	22903	22912	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014392	AAAGA	2	10	25081	25090	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014392	TGCTC	2	10	25744	25753	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_014392	AGAAA	2	10	26056	26065	80 %	0 %	20 %	0 %	302870754
29	NC_014392	AGAAA	2	10	27626	27635	80 %	0 %	20 %	0 %	302870756
30	NC_014392	TAAAC	2	10	30492	30501	60 %	20 %	0 %	20 %	302870759
31	NC_014392	TTGGT	2	10	30668	30677	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014392	TATGT	2	10	31852	31861	20 %	60 %	20 %	0 %	302870761
33	NC_014392	TCTTT	2	10	32257	32266	0 %	80 %	0 %	20 %	302870761
34	NC_014392	GACAA	2	10	34035	34044	60 %	0 %	20 %	20 %	302870761
35	NC_014392	TCAAA	2	10	36846	36855	60 %	20 %	0 %	20 %	302870764
36	NC_014392	AAGAA	2	10	40054	40063	80 %	0 %	20 %	0 %	302870767
37	NC_014392	CAAAA	2	10	40305	40314	80 %	0 %	0 %	20 %	302870767
38	NC_014392	TTTTG	2	10	41219	41228	0 %	80 %	20 %	0 %	302870768
39	NC_014392	GAAAA	2	10	43270	43279	80 %	0 %	20 %	0 %	302870768
40	NC_014392	AGATG	2	10	44832	44841	40 %	20 %	40 %	0 %	302870769
41	NC_014392	GAAAA	2	10	46079	46088	80 %	0 %	20 %	0 %	302870770
42	NC_014392	AACAG	2	10	47506	47515	60 %	0 %	20 %	20 %	302870771
43	NC_014392	ATTTT	2	10	49254	49263	20 %	80 %	0 %	0 %	302870772
44	NC_014392	CTTTT	2	10	49371	49380	0 %	80 %	0 %	20 %	302870772
45	NC_014392	ATAAA	2	10	49597	49606	80 %	20 %	0 %	0 %	302870772
46	NC_014392	TTGAA	2	10	51202	51211	40 %	40 %	20 %	0 %	302870773
47	NC_014392	GCTTG	2	10	51737	51746	0 %	40 %	40 %	20 %	302870773
48	NC_014392	TAAAA	2	10	52473	52482	80 %	20 %	0 %	0 %	302870774
49	NC_014392	AGGCA	2	10	53307	53316	40 %	0 %	40 %	20 %	302870775
50	NC_014392	TGGCA	2	10	53421	53430	20 %	20 %	40 %	20 %	302870775
51	NC_014392	TTGGG	2	10	53442	53451	0 %	40 %	60 %	0 %	302870775
52	NC_014392	TTGGA	2	10	56950	56959	20 %	40 %	40 %	0 %	302870778
53	NC_014392	AGAGG	2	10	57474	57483	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014392	TATAA	2	10	59750	59759	60 %	40 %	0 %	0 %	302870781
55	NC_014392	TTTAT	2	10	62128	62137	20 %	80 %	0 %	0 %	302870783
56	NC_014392	ACAGT	2	10	62488	62497	40 %	20 %	20 %	20 %	302870784
57	NC_014392	AAAAG	2	10	62690	62699	80 %	0 %	20 %	0 %	302870784
58	NC_014392	AGATA	2	10	63782	63791	60 %	20 %	20 %	0 %	302870785
59	NC_014392	GGAAA	2	10	64085	64094	60 %	0 %	40 %	0 %	302870785
60	NC_014392	ACTTT	2	10	64457	64466	20 %	60 %	0 %	20 %	302870786
61	NC_014392	TAATT	2	10	64572	64581	40 %	60 %	0 %	0 %	302870786
62	NC_014392	AGAGA	2	10	65681	65690	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014392	CGACA	2	10	66118	66127	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_014392	GCAAG	2	10	66576	66585	40 %	0 %	40 %	20 %	302870787
65	NC_014392	AAGAG	2	10	67922	67931	60 %	0 %	40 %	0 %	302870789
66	NC_014392	CAAAA	2	10	74949	74958	80 %	0 %	0 %	20 %	302870791
67	NC_014392	GAAAA	2	10	75377	75386	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014392	CAAGG	2	10	77669	77678	40 %	0 %	40 %	20 %	302870793
69	NC_014392	AATAA	2	10	79719	79728	80 %	20 %	0 %	0 %	302870795
70	NC_014392	GCAGG	2	10	80506	80515	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014392	AAATC	2	10	81710	81719	60 %	20 %	0 %	20 %	302870798
72	NC_014392	AAAAT	2	10	82648	82657	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014392	TTAAA	2	10	84505	84514	60 %	40 %	0 %	0 %	302870800
74	NC_014392	TCCTG	2	10	85331	85340	0 %	40 %	20 %	40 %	302870800
75	NC_014392	TTTTA	2	10	85457	85466	20 %	80 %	0 %	0 %	302870800
76	NC_014392	GGAAG	2	10	88396	88405	40 %	0 %	60 %	0 %	302870802
77	NC_014392	CAGAC	2	10	89511	89520	40 %	0 %	20 %	40 %	302870802
78	NC_014392	AAGAA	2	10	89731	89740	80 %	0 %	20 %	0 %	302870802
79	NC_014392	CAAGG	2	10	92443	92452	40 %	0 %	40 %	20 %	302870802
80	NC_014392	AAGAA	2	10	95044	95053	80 %	0 %	20 %	0 %	302870803
81	NC_014392	AGAAA	2	10	95823	95832	80 %	0 %	20 %	0 %	302870803
82	NC_014392	GTAGT	2	10	96616	96625	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014392	TTTTC	2	10	97537	97546	0 %	80 %	0 %	20 %	302870805
84	NC_014392	GTTTT	2	10	97561	97570	0 %	80 %	20 %	0 %	302870805
85	NC_014392	AAGAT	2	10	97993	98002	60 %	20 %	20 %	0 %	302870805
86	NC_014392	AAATT	2	10	99199	99208	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014392	TGTTT	2	10	101094	101103	0 %	80 %	20 %	0 %	302870807
88	NC_014392	TGCCC	2	10	101993	102002	0 %	20 %	20 %	60 %	302870808
89	NC_014392	GAGCT	2	10	102259	102268	20 %	20 %	40 %	20 %	302870808
90	NC_014392	AGAGG	2	10	104112	104121	40 %	0 %	60 %	0 %	302870809
91	NC_014392	GATAT	2	10	104939	104948	40 %	40 %	20 %	0 %	302870810
92	NC_014392	AAAAC	2	10	105347	105356	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_014392	TAAAC	2	10	105736	105745	60 %	20 %	0 %	20 %	302870811
94	NC_014392	ATATT	2	10	106182	106191	40 %	60 %	0 %	0 %	302870811
95	NC_014392	ATTAG	2	10	106355	106364	40 %	40 %	20 %	0 %	302870811
96	NC_014392	GTGCG	2	10	106417	106426	0 %	20 %	60 %	20 %	302870811
97	NC_014392	AAAGA	2	10	109580	109589	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014392	TTTCC	2	10	110035	110044	0 %	60 %	0 %	40 %	302870813
99	NC_014392	TTTGC	2	10	110427	110436	0 %	60 %	20 %	20 %	302870813
100	NC_014392	TCCTG	2	10	110751	110760	0 %	40 %	20 %	40 %	302870814
101	NC_014392	CTTTG	2	10	111944	111953	0 %	60 %	20 %	20 %	302870815
102	NC_014392	TGGGT	2	10	112188	112197	0 %	40 %	60 %	0 %	302870815
103	NC_014392	ATATG	2	10	112992	113001	40 %	40 %	20 %	0 %	302870815
104	NC_014392	GTTAT	2	10	113633	113642	20 %	60 %	20 %	0 %	302870816
105	NC_014392	TTTGC	2	10	113691	113700	0 %	60 %	20 %	20 %	302870816
106	NC_014392	GAAAA	2	10	113743	113752	80 %	0 %	20 %	0 %	302870816
107	NC_014392	GTATA	2	10	114314	114323	40 %	40 %	20 %	0 %	302870816
108	NC_014392	ATTGA	2	10	114377	114386	40 %	40 %	20 %	0 %	302870816
109	NC_014392	TTATA	2	10	115521	115530	40 %	60 %	0 %	0 %	302870817
110	NC_014392	GGGGA	2	10	116920	116929	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014392	AATTT	2	10	116950	116959	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014392	AAACA	2	10	117518	117527	80 %	0 %	0 %	20 %	302870819
113	NC_014392	AGAAA	2	10	117804	117813	80 %	0 %	20 %	0 %	302870819
114	NC_014392	ATGGC	2	10	118755	118764	20 %	20 %	40 %	20 %	302870820
115	NC_014392	TACTA	2	10	119199	119208	40 %	40 %	0 %	20 %	302870820
116	NC_014392	GACTG	2	10	120708	120717	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014392	TAAAA	2	10	126002	126011	80 %	20 %	0 %	0 %	302870823
118	NC_014392	CATTT	2	10	126850	126859	20 %	60 %	0 %	20 %	302870824
119	NC_014392	TAAAA	2	10	126976	126985	80 %	20 %	0 %	0 %	302870824
120	NC_014392	AAAGC	2	10	127475	127484	60 %	0 %	20 %	20 %	302870825
121	NC_014392	AGAAC	2	10	129350	129359	60 %	0 %	20 %	20 %	302870826
122	NC_014392	ATTGC	2	10	129464	129473	20 %	40 %	20 %	20 %	302870826
123	NC_014392	TATTT	2	10	130044	130053	20 %	80 %	0 %	0 %	302870827
124	NC_014392	TTTTA	2	10	132050	132059	20 %	80 %	0 %	0 %	302870828
125	NC_014392	TCTTT	2	10	133174	133183	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_014392	AAATT	2	10	134047	134056	60 %	40 %	0 %	0 %	302870831
127	NC_014392	AAAAG	2	10	136052	136061	80 %	0 %	20 %	0 %	302870834
128	NC_014392	AAACC	2	10	136478	136487	60 %	0 %	0 %	40 %	302870834
129	NC_014392	CAAAA	2	10	138688	138697	80 %	0 %	0 %	20 %	302870836
130	NC_014392	AAAGA	2	10	140714	140723	80 %	0 %	20 %	0 %	302870838
131	NC_014392	GGCAA	2	10	141193	141202	40 %	0 %	40 %	20 %	302870839
132	NC_014392	TCAAC	2	10	142618	142627	40 %	20 %	0 %	40 %	302870839
133	NC_014392	AAGTA	2	10	143558	143567	60 %	20 %	20 %	0 %	302870840
134	NC_014392	TTGTT	2	10	144151	144160	0 %	80 %	20 %	0 %	302870841
135	NC_014392	CTTTA	2	10	146049	146058	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_014392	AAAAC	2	10	149219	149228	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014392	GTTTT	2	10	150406	150415	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014392	CCCAT	2	10	154673	154682	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
139	NC_014392	TTAAT	2	10	155005	155014	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014392	CTTTT	2	10	157531	157540	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_014392	TGAGA	2	10	158623	158632	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014392	CAAGA	2	10	158936	158945	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_014392	ACTTT	2	10	161021	161030	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_014392	ATTTT	2	10	161601	161610	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_014392	GCAAG	2	10	163466	163475	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_014392	TAAAA	2	10	163580	163589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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