MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor obsidiansis OB47 chromosome

Total Repeats: 1089

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014392	CAAT	2	8	14432	14439	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014392	AAAT	2	8	14477	14484	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014392	ATTC	2	8	15290	15297	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014392	ATTA	2	8	15922	15929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014392	GCAA	2	8	18750	18757	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014392	AGCA	2	8	20680	20687	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014392	GGAA	2	8	21039	21046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014392	TTTA	2	8	21176	21183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014392	ATGA	2	8	21371	21378	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014392	GAAA	2	8	21845	21852	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014392	AGGG	2	8	22760	22767	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014392	AATA	2	8	23003	23010	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014392	AGAC	2	8	23659	23666	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014392	TCAG	2	8	23932	23939	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014392	CCAT	2	8	24315	24322	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014392	GAGC	2	8	24659	24666	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014392	ATTG	2	8	24981	24988	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014392	AGAT	2	8	25151	25158	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014392	ATTA	2	8	25258	25265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014392	ATTT	2	8	27425	27432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014392	AATG	2	8	29613	29620	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014392	TAAG	2	8	30793	30800	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014392	AAGA	2	8	31577	31584	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014392	CAAA	2	8	31626	31633	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014392	ATAA	2	8	31757	31764	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014392	GAAT	2	8	43972	43979	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014392	GATG	2	8	45380	45387	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014392	TTAA	2	8	49938	49945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014392	AAAG	2	8	55115	55122	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014392	AAAG	2	8	56719	56726	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014392	AAGA	2	8	60314	60321	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014392	TTTA	2	8	61331	61338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014392	AAGG	2	8	61356	61363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014392	AAGA	2	8	66007	66014	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014392	AAAT	2	8	80640	80647	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014392	GAAG	2	8	80684	80691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014392	TTAA	2	8	103088	103095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014392	TAAA	2	8	103566	103573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014392	GAGT	2	8	103638	103645	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014392	AAGC	2	8	106534	106541	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014392	ACCA	2	8	106615	106622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014392	CATA	2	8	107067	107074	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014392	GAAC	2	8	107596	107603	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014392	GAAT	2	8	107731	107738	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014392	ATTT	2	8	109226	109233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014392	AAAT	2	8	109617	109624	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014392	CCTC	2	8	115630	115637	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
48	NC_014392	CAAA	2	8	115797	115804	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014392	TGAT	2	8	120310	120317	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014392	TTAC	2	8	120783	120790	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014392	AAAT	2	8	121207	121214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014392	TAAT	2	8	121366	121373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014392	GCGA	2	8	121473	121480	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014392	CAAA	2	8	121554	121561	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014392	TAAA	2	8	121693	121700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014392	TTAT	2	8	121955	121962	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014392	AAAT	2	8	127169	127176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014392	CAAG	2	8	128365	128372	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014392	TTTA	2	8	135969	135976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014392	TTTC	2	8	146697	146704	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014392	ATCT	2	8	146852	146859	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014392	CCTT	2	8	147313	147320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014392	CTTT	2	8	148005	148012	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014392	ACTT	2	8	148532	148539	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014392	GTTT	2	8	148962	148969	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014392	CTTT	2	8	149261	149268	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014392	TTGT	2	8	149808	149815	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014392	ATGT	2	8	150737	150744	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014392	ATGA	2	8	151564	151571	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014392	CTTT	2	8	151899	151906	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014392	CTTT	2	8	152097	152104	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014392	TTCT	2	8	153824	153831	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014392	ACTT	2	8	154065	154072	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014392	AACA	2	8	154551	154558	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014392	AAAC	2	8	155178	155185	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014392	TCTG	2	8	157806	157813	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014392	CTGG	2	8	158698	158705	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014392	AAGA	2	8	160048	160055	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014392	TGAT	2	8	160252	160259	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014392	GTAA	2	8	160422	160429	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014392	TCAA	2	8	160660	160667	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014392	AAGC	2	8	160771	160778	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014392	TTTG	2	8	161079	161086	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014392	ATTC	2	8	161541	161548	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014392	ATAA	2	8	161823	161830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014392	AAGA	2	8	161871	161878	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014392	ATAA	2	8	162162	162169	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014392	ACAA	2	8	162175	162182	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014392	TAGA	2	8	162239	162246	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014392	TAAA	2	8	162961	162968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014392	TGGT	2	8	163148	163155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014392	GCAA	2	8	163374	163381	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014392	GCAA	2	8	163716	163723	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014392	GAAA	2	8	163724	163731	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014392	AGGA	2	8	164481	164488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014392	GGAA	2	8	164801	164808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014392	TGGA	2	8	164868	164875	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014392	GACA	2	8	164925	164932	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014392	AATT	2	8	165083	165090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014392	TGGT	2	8	165124	165131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014392	AAAG	2	8	165342	165349	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014392	GACA	2	8	174058	174065	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_014392	AAGA	2	8	174066	174073	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014392	AAAT	2	8	174100	174107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014392	TCTT	2	8	175596	175603	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014392	TAAT	2	8	175748	175755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014392	GAAA	2	8	175804	175811	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014392	GAAG	2	8	177915	177922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014392	ATTA	2	8	178048	178055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014392	ATGT	2	8	181850	181857	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014392	CAAA	2	8	181864	181871	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014392	ATTC	2	8	181970	181977	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014392	GTTT	2	8	183981	183988	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014392	TCTT	2	8	200123	200130	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014392	TACT	2	8	204975	204982	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014392	ACGA	2	8	205048	205055	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014392	ATTT	2	8	205229	205236	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014392	ATCA	2	8	206965	206972	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_014392	TCAA	2	8	210287	210294	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014392	TGAG	2	8	210656	210663	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014392	GTAA	2	8	210825	210832	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014392	AAGC	2	8	211172	211179	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014392	TTTG	2	8	211475	211482	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014392	ATTC	2	8	211934	211941	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014392	TTTA	2	8	214776	214783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014392	TCTT	2	8	220530	220537	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014392	CTTT	2	8	222496	222503	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014392	GAAA	2	8	222758	222765	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014392	ATAA	2	8	229170	229177	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014392	GGTG	2	8	231026	231033	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014392	AAAG	2	8	240469	240476	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014392	ATGA	2	8	240732	240739	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014392	GAAA	2	8	240767	240774	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014392	ATTA	2	8	243492	243499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014392	GTAA	2	8	249046	249053	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014392	GAAA	2	8	249148	249155	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014392	TACC	2	8	249218	249225	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014392	ACAT	2	8	249471	249478	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014392	GTAA	2	8	249550	249557	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014392	CTGT	2	8	249916	249923	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014392	TCTT	2	8	249957	249964	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014392	AAAT	2	8	251392	251399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014392	TAGC	2	8	254458	254465	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014392	AAAG	2	8	273083	273090	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014392	AAAG	2	8	275120	275127	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014392	TTGT	2	8	279733	279740	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014392	ATGA	2	8	283722	283729	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014392	AGGG	2	8	287951	287958	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014392	GTAA	2	8	304113	304120	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014392	AATT	2	8	308204	308211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014392	AAAT	2	8	309038	309045	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014392	ATTA	2	8	310088	310095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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