MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor obsidiansis OB47 chromosome

Total Repeats: 4831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014392	GTT	2	6	43	48	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014392	ATA	2	6	62	67	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014392	TAC	2	6	1635	1640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014392	TGG	2	6	1654	1659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014392	TAA	2	6	1832	1837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014392	AGA	2	6	1907	1912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014392	AAG	2	6	1963	1968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014392	AGA	2	6	1989	1994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014392	GAA	2	6	2233	2238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014392	AGA	2	6	2247	2252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014392	GCA	2	6	2291	2296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014392	TAA	2	6	2320	2325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014392	GCC	2	6	3892	3897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_014392	AAT	2	6	8528	8533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014392	GAA	2	6	8547	8552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014392	GGA	2	6	8977	8982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014392	GAG	2	6	11541	11546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014392	CAG	2	6	12591	12596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014392	TAA	2	6	12638	12643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014392	AAG	2	6	12664	12669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014392	ATT	2	6	13255	13260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014392	ACA	2	6	14413	14418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014392	TAA	2	6	14509	14514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014392	TCT	2	6	15258	15263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014392	TAA	2	6	15931	15936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014392	AAC	2	6	15949	15954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014392	GTT	2	6	15965	15970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014392	TAA	2	6	16618	16623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014392	AAC	2	6	16630	16635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014392	GAT	2	6	16651	16656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014392	TGT	2	6	16932	16937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014392	AGA	2	6	16950	16955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014392	TGA	3	9	17029	17037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014392	AGG	2	6	17085	17090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014392	AAT	2	6	18760	18765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014392	GAA	2	6	18857	18862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014392	TTC	2	6	20358	20363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014392	AAG	2	6	20491	20496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014392	AGC	2	6	20719	20724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014392	AAG	2	6	20834	20839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014392	AGA	2	6	20970	20975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014392	TAA	2	6	21088	21093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014392	GAA	2	6	21152	21157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014392	AAG	2	6	21317	21322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014392	AGA	2	6	21379	21384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014392	AAG	2	6	21411	21416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014392	GCA	2	6	21539	21544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014392	AAT	2	6	21572	21577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014392	ATT	2	6	21602	21607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014392	GAA	2	6	21881	21886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014392	TGA	2	6	21924	21929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014392	CTG	2	6	22041	22046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014392	CTT	2	6	22082	22087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014392	AGA	2	6	22089	22094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014392	GAT	2	6	22141	22146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014392	AGG	2	6	22849	22854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014392	GAA	2	6	22974	22979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014392	GTA	2	6	23026	23031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014392	ACA	2	6	23075	23080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014392	AAC	2	6	23111	23116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014392	CAA	2	6	23123	23128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014392	ATT	2	6	23131	23136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014392	CTT	2	6	23291	23296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014392	ACT	2	6	23325	23330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014392	TGA	3	9	23332	23340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014392	AAG	2	6	23532	23537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014392	CCA	2	6	23571	23576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_014392	TAC	2	6	23867	23872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014392	AAG	2	6	23885	23890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014392	ATG	2	6	23943	23948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014392	AAG	2	6	23966	23971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014392	AAG	2	6	24135	24140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014392	GGT	2	6	24152	24157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014392	AGT	2	6	24172	24177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014392	AAT	2	6	24307	24312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014392	AAG	2	6	24363	24368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014392	AGC	2	6	24457	24462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014392	AAC	2	6	24465	24470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014392	AGC	2	6	24514	24519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014392	TAA	2	6	24726	24731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014392	TAT	2	6	24734	24739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014392	TGT	2	6	24786	24791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014392	TAA	2	6	25017	25022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014392	TAA	2	6	25070	25075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014392	ATA	2	6	25205	25210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014392	GAT	2	6	25277	25282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014392	GGT	2	6	25296	25301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014392	CAA	2	6	27387	27392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014392	ATT	2	6	27435	27440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014392	AAT	2	6	27446	27451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014392	ATA	2	6	27467	27472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014392	GAA	2	6	29578	29583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014392	AAG	2	6	29590	29595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014392	ACA	2	6	29639	29644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014392	TTG	2	6	29656	29661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014392	ATT	2	6	29669	29674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014392	TAA	2	6	29685	29690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014392	ATA	2	6	29695	29700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014392	CAA	2	6	30759	30764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014392	ATT	2	6	30776	30781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014392	ATA	2	6	30816	30821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014392	CAA	2	6	30860	30865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014392	AAT	2	6	31563	31568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014392	AAT	2	6	31604	31609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014392	TAA	2	6	31618	31623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014392	ATA	2	6	31663	31668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014392	ATT	2	6	31698	31703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014392	ATA	2	6	31737	31742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014392	TAA	2	6	31770	31775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014392	GTG	2	6	38517	38522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014392	ATA	2	6	43927	43932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014392	AGG	2	6	49991	49996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014392	TAA	2	6	50134	50139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014392	AGA	2	6	50210	50215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014392	GTT	2	6	50232	50237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014392	AAG	2	6	50266	50271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014392	AGA	2	6	50292	50297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014392	AGG	2	6	50409	50414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014392	GAA	2	6	50536	50541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014392	AGA	2	6	50550	50555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014392	GCA	2	6	50594	50599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014392	TAA	2	6	50623	50628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014392	GCC	2	6	52195	52200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_014392	AAG	2	6	57963	57968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014392	TGT	2	6	58942	58947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014392	ATT	2	6	59004	59009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014392	GTG	2	6	60322	60327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014392	GAT	2	6	61348	61353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014392	CAA	2	6	65495	65500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014392	AGA	2	6	65609	65614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014392	AAG	2	6	65632	65637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014392	AAG	2	6	65851	65856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014392	GAA	2	6	65892	65897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014392	AGA	2	6	65945	65950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014392	ACA	2	6	65977	65982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014392	AAG	2	6	66029	66034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014392	AGA	2	6	66105	66110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014392	AAT	2	6	66138	66143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014392	TAA	3	9	66178	66186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014392	TGC	2	6	66216	66221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_014392	GCA	2	6	66240	66245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014392	GTT	2	6	66260	66265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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