MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Micromonospora aurantiaca ATCC 27029 chromosome

Total Repeats: 1112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014391	GGGCG	2	10	2396	2405	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014391	TGGGC	2	10	26533	26542	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014391	GCAGG	2	10	26543	26552	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014391	GAAAC	2	10	26620	26629	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014391	CGCCC	2	10	27088	27097	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
6	NC_014391	AGTGA	2	10	27117	27126	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014391	TGATC	2	10	29810	29819	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014391	CGGCG	2	10	40581	40590	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_014391	GCACC	2	10	60970	60979	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_014391	GGCGG	2	10	81859	81868	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014391	ACGGT	2	10	81914	81923	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014391	CGGCC	2	10	83462	83471	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13	NC_014391	CGGCG	2	10	85048	85057	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14	NC_014391	GCGCG	2	10	85801	85810	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15	NC_014391	GTCGC	2	10	101867	101876	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_014391	GTGGC	2	10	101964	101973	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014391	AGCGT	2	10	103795	103804	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014391	GCCGG	2	10	106151	106160	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_014391	GGCGG	2	10	106304	106313	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014391	CACGC	2	10	107847	107856	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_014391	CCGGG	2	10	128546	128555	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_014391	CGAGC	2	10	149486	149495	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_014391	GCGGT	2	10	150767	150776	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014391	GCGGT	2	10	151043	151052	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014391	GGTCG	2	10	161358	161367	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014391	GCCGG	2	10	161957	161966	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
27	NC_014391	CCGGC	2	10	161985	161994	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_014391	GGCCC	2	10	167503	167512	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
29	NC_014391	CCGGC	2	10	176056	176065	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
30	NC_014391	CCGAC	2	10	177173	177182	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_014391	GGTCC	2	10	182627	182636	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_014391	CGGTC	2	10	182743	182752	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_014391	GTGGA	2	10	192427	192436	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014391	GGGGT	3	15	193484	193498	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014391	CGGGC	2	10	198036	198045	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_014391	CGGCG	2	10	212480	212489	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
37	NC_014391	GGCCG	2	10	212495	212504	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
38	NC_014391	CGGGC	2	10	213605	213614	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
39	NC_014391	GCCAG	2	10	221221	221230	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_014391	TCCGC	2	10	230302	230311	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_014391	GGCCC	2	10	234046	234055	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
42	NC_014391	TTCCG	2	10	235364	235373	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_014391	CGGTG	2	10	249320	249329	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014391	CCGTC	2	10	261897	261906	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_014391	GGCCG	2	10	283123	283132	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
46	NC_014391	GCTGC	2	10	287476	287485	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_014391	CGGCC	2	10	303156	303165	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
48	NC_014391	CCCCG	2	10	303201	303210	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
49	NC_014391	GTCGG	2	10	303331	303340	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014391	GACGG	7	35	303516	303550	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014391	GGCCC	2	10	326977	326986	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_014391	GCCCG	2	10	327004	327013	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
53	NC_014391	CGGGG	3	15	327400	327414	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014391	GAGCG	2	10	329646	329655	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014391	CCGGG	2	10	352485	352494	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
56	NC_014391	CACCC	2	10	369896	369905	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
57	NC_014391	CCCGC	2	10	375151	375160	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
58	NC_014391	AGCGG	2	10	384798	384807	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014391	CGACG	2	10	410897	410906	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_014391	GGCCG	2	10	438925	438934	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
61	NC_014391	GCCGA	2	10	444566	444575	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_014391	GCCGG	2	10	445034	445043	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_014391	CGCCA	2	10	449856	449865	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
64	NC_014391	TCCCG	2	10	449899	449908	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
65	NC_014391	GGGGC	2	10	456735	456744	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014391	ACCGG	2	10	466288	466297	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_014391	GGCGA	2	10	466415	466424	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014391	CCGCG	2	10	469523	469532	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
69	NC_014391	GGAGA	2	10	482046	482055	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014391	GGGGC	2	10	491945	491954	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014391	CGCGC	2	10	497786	497795	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
72	NC_014391	TCGGC	2	10	525882	525891	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_014391	GCCTG	2	10	529635	529644	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_014391	CGCGC	2	10	532411	532420	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
75	NC_014391	GGGGC	2	10	532893	532902	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014391	CCCGG	2	10	534581	534590	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
77	NC_014391	CGGGG	2	10	554551	554560	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014391	AGCCG	2	10	558554	558563	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_014391	CGGCG	2	10	560173	560182	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
80	NC_014391	GGGGA	2	10	566328	566337	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014391	CCGGT	2	10	570329	570338	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_014391	GCTCC	2	10	573001	573010	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
83	NC_014391	CGGGG	2	10	574718	574727	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014391	CAGGA	2	10	592120	592129	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014391	AGGGA	2	10	603739	603748	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014391	AAGAG	2	10	630736	630745	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014391	CCGCG	2	10	634908	634917	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
88	NC_014391	TCGCC	2	10	635249	635258	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
89	NC_014391	CCAGC	2	10	635446	635455	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
90	NC_014391	GCGAC	2	10	635645	635654	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_014391	GCATC	2	10	638694	638703	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_014391	ACGAG	2	10	638845	638854	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_014391	CGGCC	2	10	642121	642130	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
94	NC_014391	CCGTT	2	10	643588	643597	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_014391	CCGGC	2	10	648919	648928	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
96	NC_014391	GGGGT	2	10	664908	664917	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014391	CGGCG	2	10	676833	676842	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
98	NC_014391	TGATG	2	10	676974	676983	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014391	ATGTG	2	10	680466	680475	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014391	GCCCC	2	10	682587	682596	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
101	NC_014391	CGACC	2	10	686390	686399	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
102	NC_014391	ACGGC	2	10	689307	689316	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_014391	GAACG	2	10	694655	694664	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_014391	CGGCG	2	10	701137	701146	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
105	NC_014391	CCCCA	2	10	712386	712395	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
106	NC_014391	ACGGC	2	10	714538	714547	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_014391	CGCTG	2	10	719083	719092	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_014391	GCCGC	2	10	725281	725290	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
109	NC_014391	CTGGT	2	10	738008	738017	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014391	CGGTC	2	10	740628	740637	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_014391	CAGCC	2	10	752549	752558	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_014391	CCGGC	2	10	770050	770059	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
113	NC_014391	CCAGC	2	10	782275	782284	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
114	NC_014391	GCCCG	2	10	786230	786239	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
115	NC_014391	CGAGT	2	10	798464	798473	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_014391	GGACG	2	10	812424	812433	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014391	GGTCG	2	10	814672	814681	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
118	NC_014391	CGGGG	2	10	815674	815683	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014391	GCCCC	2	10	837133	837142	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
120	NC_014391	GGAAA	2	10	840638	840647	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014391	CGCGC	2	10	843184	843193	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
122	NC_014391	CGGGG	2	10	852561	852570	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
123	NC_014391	GTCCC	2	10	855978	855987	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
124	NC_014391	GACCC	2	10	859472	859481	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
125	NC_014391	GCCCC	2	10	870706	870715	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
126	NC_014391	GGGCA	2	10	874076	874085	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014391	GCCGG	2	10	888157	888166	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
128	NC_014391	GACGG	2	10	895956	895965	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014391	CCCCG	2	10	908087	908096	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
130	NC_014391	CCGGG	2	10	936815	936824	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
131	NC_014391	CGGCC	2	10	936835	936844	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
132	NC_014391	GGGCC	2	10	938936	938945	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
133	NC_014391	CCGGC	2	10	938957	938966	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
134	NC_014391	ACCGT	2	10	949563	949572	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_014391	TGGGG	2	10	950280	950289	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014391	CCGCC	2	10	952420	952429	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
137	NC_014391	GGGGA	2	10	952519	952528	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014391	GCCCG	2	10	953313	953322	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
139	NC_014391	CGCGG	2	10	955712	955721	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
140	NC_014391	GCCCG	2	10	964483	964492	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
141	NC_014391	GGAGA	2	10	986465	986474	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014391	TCCGG	2	10	1003076	1003085	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
143	NC_014391	ACCCG	2	10	1004059	1004068	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
144	NC_014391	GGCCG	2	10	1007999	1008008	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
145	NC_014391	GGGCG	2	10	1020242	1020251	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014391	GGTGG	5	25	1031844	1031868	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014391	GGGCC	2	10	1050931	1050940	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
148	NC_014391	CGGCC	2	10	1050952	1050961	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
149	NC_014391	CCGGA	2	10	1055332	1055341	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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280	NC_014391	CGGCA	2	10	1913091	1913100	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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283	NC_014391	ACGGC	2	10	1921972	1921981	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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467	NC_014391	CCGGG	2	10	3219123	3219132	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
468	NC_014391	CAGCG	2	10	3219277	3219286	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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488	NC_014391	CCTGC	2	10	3326778	3326787	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
489	NC_014391	ACCGT	2	10	3332768	3332777	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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496	NC_014391	GTTCG	2	10	3387024	3387033	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
497	NC_014391	TCCCG	2	10	3392194	3392203	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
498	NC_014391	CGGCG	2	10	3395212	3395221	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
499	NC_014391	GGGGC	3	15	3399711	3399725	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
500	NC_014391	GCCTT	2	10	3403484	3403493	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding

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