MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Butyrivibrio proteoclasticus B316 plasmid pCY186

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014390	ACAAGA	2	12	1959	1970	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	302668501
2	NC_014390	AAATGC	2	12	2461	2472	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302668501
3	NC_014390	AAAAAG	2	12	3703	3714	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	302668504
4	NC_014390	AGCTGG	2	12	7613	7624	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	302668505
5	NC_014390	ACATCA	2	12	12172	12183	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	302668508
6	NC_014390	GCCTAT	2	12	12864	12875	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302668508
7	NC_014390	AGCAGT	2	12	19679	19690	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302668513
8	NC_014390	GATATT	2	12	20386	20397	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302668514
9	NC_014390	ATTGAT	2	12	23988	23999	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302668518
10	NC_014390	ATATTT	2	12	25362	25373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302668520
11	NC_014390	GTATCA	2	12	32564	32575	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302668526
12	NC_014390	CTTAAG	2	12	40539	40550	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302668533
13	NC_014390	ACACTT	2	12	42404	42415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302668534
14	NC_014390	GGTGCT	2	12	43982	43993	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	302668535
15	NC_014390	ATAACA	2	12	44416	44427	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	302668536
16	NC_014390	TAACAA	2	12	48042	48053	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	302668541
17	NC_014390	ACAAGA	2	12	49193	49204	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	302668541
18	NC_014390	TGATAA	2	12	67434	67445	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302668566
19	NC_014390	CAAGCA	2	12	74714	74725	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	302668575
20	NC_014390	TCTAGT	2	12	79187	79198	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302668582
21	NC_014390	GAGGAA	2	12	81926	81937	50 %	0 %	50 %	0 %	302668585
22	NC_014390	AAAGAT	2	12	87461	87472	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	302668595
23	NC_014390	AGACAA	2	12	92424	92435	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	302668599
24	NC_014390	TGATAA	2	12	95103	95114	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302668601
25	NC_014390	AAATTC	2	12	97261	97272	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	302668601
26	NC_014390	TAAAAG	2	12	98852	98863	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	302668602
27	NC_014390	ATAGAT	2	12	99013	99024	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302668602
28	NC_014390	CTTGGT	2	12	103600	103611	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	302668606
29	NC_014390	ATGATA	2	12	107031	107042	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302668610
30	NC_014390	ATCAAA	2	12	112523	112534	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	302668615
31	NC_014390	TCGATA	2	12	122780	122791	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302668622
32	NC_014390	TATATG	2	12	133709	133720	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302668633
33	NC_014390	TCAGTT	2	12	137239	137250	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302668638
34	NC_014390	TTATCC	2	12	145640	145651	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	302668647
35	NC_014390	TCAATC	2	12	147154	147165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302668649
36	NC_014390	AGTGAG	2	12	148732	148743	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	302668650
37	NC_014390	TCATTA	2	12	150003	150014	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302668651
38	NC_014390	TTCCTA	2	12	158540	158551	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	302668664
39	NC_014390	GCTTTA	2	12	160147	160158	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302668666
40	NC_014390	ATAGCA	2	12	163164	163175	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302668672
41	NC_014390	ATCACT	2	12	163188	163199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302668672
42	NC_014390	ACCAGT	2	12	165105	165116	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	302668677
43	NC_014390	TGAACC	2	12	167148	167159	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	302668681
44	NC_014390	GACAAG	2	12	173010	173021	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	302668686
45	NC_014390	AAGAAA	2	12	173995	174006	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	302668687
46	NC_014390	CATTTC	2	12	175114	175125	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	302668689
47	NC_014390	CTTTTT	2	12	176039	176050	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	302668690
48	NC_014390	TGGCCT	2	12	177715	177726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302668691
49	NC_014390	ACGAAG	2	12	178852	178863	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	302668692
50	NC_014390	ATTTGT	2	12	179396	179407	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	302668693
51	NC_014390	CAAGAA	2	12	185025	185036	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	302668697

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.