MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Butyrivibrio proteoclasticus B316 plasmid pCY186

Total Repeats: 400

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014390	AAGA	2	8	779	786	75 %	0 %	25 %	0 %	302668500
2	NC_014390	AGAA	2	8	839	846	75 %	0 %	25 %	0 %	302668500
3	NC_014390	TTTA	2	8	953	960	25 %	75 %	0 %	0 %	302668500
4	NC_014390	GCAA	2	8	1640	1647	50 %	0 %	25 %	25 %	302668501
5	NC_014390	AGAA	2	8	1708	1715	75 %	0 %	25 %	0 %	302668501
6	NC_014390	CAGC	2	8	2425	2432	25 %	0 %	25 %	50 %	302668501
7	NC_014390	AAGG	2	8	2502	2509	50 %	0 %	50 %	0 %	302668501
8	NC_014390	ATTG	2	8	3880	3887	25 %	50 %	25 %	0 %	302668504
9	NC_014390	AGGA	2	8	4226	4233	50 %	0 %	50 %	0 %	302668504
10	NC_014390	GCGA	2	8	5374	5381	25 %	0 %	50 %	25 %	302668504
11	NC_014390	CCAG	2	8	5512	5519	25 %	0 %	25 %	50 %	302668504
12	NC_014390	AACG	2	8	7270	7277	50 %	0 %	25 %	25 %	302668504
13	NC_014390	CCAT	2	8	8249	8256	25 %	25 %	0 %	50 %	302668505
14	NC_014390	GAAG	2	8	8528	8535	50 %	0 %	50 %	0 %	302668505
15	NC_014390	TGGC	2	8	9065	9072	0 %	25 %	50 %	25 %	302668505
16	NC_014390	CATA	2	8	10098	10105	50 %	25 %	0 %	25 %	302668506
17	NC_014390	CAGG	2	8	10383	10390	25 %	0 %	50 %	25 %	302668506
18	NC_014390	CGAA	2	8	10411	10418	50 %	0 %	25 %	25 %	302668506
19	NC_014390	AGCT	2	8	11366	11373	25 %	25 %	25 %	25 %	302668508
20	NC_014390	CATG	2	8	11593	11600	25 %	25 %	25 %	25 %	302668508
21	NC_014390	CAAG	2	8	11750	11757	50 %	0 %	25 %	25 %	302668508
22	NC_014390	GATG	2	8	11778	11785	25 %	25 %	50 %	0 %	302668508
23	NC_014390	ATGT	2	8	12226	12233	25 %	50 %	25 %	0 %	302668508
24	NC_014390	TTCA	2	8	12372	12379	25 %	50 %	0 %	25 %	302668508
25	NC_014390	TTGA	2	8	13447	13454	25 %	50 %	25 %	0 %	302668508
26	NC_014390	CAAT	2	8	14805	14812	50 %	25 %	0 %	25 %	302668509
27	NC_014390	TGGT	2	8	14868	14875	0 %	50 %	50 %	0 %	302668509
28	NC_014390	TCAA	2	8	16357	16364	50 %	25 %	0 %	25 %	302668511
29	NC_014390	AAAG	2	8	16918	16925	75 %	0 %	25 %	0 %	302668511
30	NC_014390	TATG	2	8	17170	17177	25 %	50 %	25 %	0 %	302668511
31	NC_014390	AAGA	2	8	18096	18103	75 %	0 %	25 %	0 %	302668513
32	NC_014390	AGTA	2	8	18134	18141	50 %	25 %	25 %	0 %	302668513
33	NC_014390	CAGA	2	8	18171	18178	50 %	0 %	25 %	25 %	302668513
34	NC_014390	TCCT	2	8	18922	18929	0 %	50 %	0 %	50 %	302668513
35	NC_014390	TCAC	2	8	19044	19051	25 %	25 %	0 %	50 %	302668513
36	NC_014390	AAGA	2	8	19157	19164	75 %	0 %	25 %	0 %	302668513
37	NC_014390	AGTA	2	8	19515	19522	50 %	25 %	25 %	0 %	302668513
38	NC_014390	GAAA	2	8	19630	19637	75 %	0 %	25 %	0 %	302668513
39	NC_014390	TAAA	2	8	19657	19664	75 %	25 %	0 %	0 %	302668513
40	NC_014390	CATA	2	8	20267	20274	50 %	25 %	0 %	25 %	302668514
41	NC_014390	GGAA	2	8	20336	20343	50 %	0 %	50 %	0 %	302668514
42	NC_014390	GTAA	2	8	20782	20789	50 %	25 %	25 %	0 %	302668514
43	NC_014390	TGTT	2	8	20978	20985	0 %	75 %	25 %	0 %	302668514
44	NC_014390	ATCT	2	8	21584	21591	25 %	50 %	0 %	25 %	302668515
45	NC_014390	ATGA	2	8	22517	22524	50 %	25 %	25 %	0 %	302668516
46	NC_014390	ATGG	2	8	23546	23553	25 %	25 %	50 %	0 %	302668517
47	NC_014390	GTAT	2	8	23798	23805	25 %	50 %	25 %	0 %	302668518
48	NC_014390	AGAA	2	8	24176	24183	75 %	0 %	25 %	0 %	302668518
49	NC_014390	AATG	2	8	24665	24672	50 %	25 %	25 %	0 %	302668519
50	NC_014390	AGAA	2	8	25108	25115	75 %	0 %	25 %	0 %	302668519
51	NC_014390	TAAA	2	8	25334	25341	75 %	25 %	0 %	0 %	302668520
52	NC_014390	TTCA	2	8	25668	25675	25 %	50 %	0 %	25 %	302668520
53	NC_014390	GCAT	2	8	27162	27169	25 %	25 %	25 %	25 %	302668523
54	NC_014390	TTAT	2	8	28644	28651	25 %	75 %	0 %	0 %	302668524
55	NC_014390	TTAT	2	8	28667	28674	25 %	75 %	0 %	0 %	302668524
56	NC_014390	ATTA	2	8	29205	29212	50 %	50 %	0 %	0 %	302668524
57	NC_014390	GAAG	2	8	30086	30093	50 %	0 %	50 %	0 %	302668524
58	NC_014390	GGAA	2	8	30373	30380	50 %	0 %	50 %	0 %	302668524
59	NC_014390	ACGA	2	8	30454	30461	50 %	0 %	25 %	25 %	302668524
60	NC_014390	CTTT	2	8	30823	30830	0 %	75 %	0 %	25 %	302668525
61	NC_014390	AGAA	2	8	31012	31019	75 %	0 %	25 %	0 %	302668525
62	NC_014390	GAAA	2	8	31058	31065	75 %	0 %	25 %	0 %	302668525
63	NC_014390	AAAG	2	8	31478	31485	75 %	0 %	25 %	0 %	302668526
64	NC_014390	ATAC	2	8	31860	31867	50 %	25 %	0 %	25 %	302668526
65	NC_014390	TTGT	2	8	32186	32193	0 %	75 %	25 %	0 %	302668526
66	NC_014390	AGGC	2	8	32202	32209	25 %	0 %	50 %	25 %	302668526
67	NC_014390	AAGG	2	8	32399	32406	50 %	0 %	50 %	0 %	302668526
68	NC_014390	GTAT	2	8	32461	32468	25 %	50 %	25 %	0 %	302668526
69	NC_014390	AACA	2	8	32746	32753	75 %	0 %	0 %	25 %	302668526
70	NC_014390	CAAG	2	8	33117	33124	50 %	0 %	25 %	25 %	302668526
71	NC_014390	AGTA	2	8	33919	33926	50 %	25 %	25 %	0 %	302668527
72	NC_014390	CAGT	2	8	34208	34215	25 %	25 %	25 %	25 %	302668527
73	NC_014390	GATA	2	8	34462	34469	50 %	25 %	25 %	0 %	302668527
74	NC_014390	AAGA	2	8	34636	34643	75 %	0 %	25 %	0 %	302668527
75	NC_014390	ACAT	2	8	34796	34803	50 %	25 %	0 %	25 %	302668527
76	NC_014390	AGTA	2	8	34879	34886	50 %	25 %	25 %	0 %	302668527
77	NC_014390	TGAA	2	8	35787	35794	50 %	25 %	25 %	0 %	302668529
78	NC_014390	GATC	2	8	35839	35846	25 %	25 %	25 %	25 %	302668529
79	NC_014390	TGTA	2	8	36787	36794	25 %	50 %	25 %	0 %	302668529
80	NC_014390	CATC	2	8	36797	36804	25 %	25 %	0 %	50 %	302668529
81	NC_014390	ACAT	2	8	37554	37561	50 %	25 %	0 %	25 %	302668530
82	NC_014390	CAGA	2	8	37593	37600	50 %	0 %	25 %	25 %	302668530
83	NC_014390	TGCA	2	8	37989	37996	25 %	25 %	25 %	25 %	302668531
84	NC_014390	CAGT	2	8	38077	38084	25 %	25 %	25 %	25 %	302668531
85	NC_014390	TCAT	2	8	38203	38210	25 %	50 %	0 %	25 %	302668531
86	NC_014390	AAAG	2	8	38893	38900	75 %	0 %	25 %	0 %	302668532
87	NC_014390	TCCT	2	8	39033	39040	0 %	50 %	0 %	50 %	302668532
88	NC_014390	GAAA	2	8	39075	39082	75 %	0 %	25 %	0 %	302668532
89	NC_014390	AAAG	2	8	39187	39194	75 %	0 %	25 %	0 %	302668532
90	NC_014390	AGAA	2	8	39528	39535	75 %	0 %	25 %	0 %	302668532
91	NC_014390	AAAG	2	8	39637	39644	75 %	0 %	25 %	0 %	302668532
92	NC_014390	AGGA	2	8	41011	41018	50 %	0 %	50 %	0 %	302668533
93	NC_014390	AGGT	2	8	41110	41117	25 %	25 %	50 %	0 %	302668533
94	NC_014390	CCTT	2	8	41820	41827	0 %	50 %	0 %	50 %	302668534
95	NC_014390	AAAG	2	8	41862	41869	75 %	0 %	25 %	0 %	302668534
96	NC_014390	ACAG	2	8	42951	42958	50 %	0 %	25 %	25 %	302668534
97	NC_014390	TGGA	2	8	43215	43222	25 %	25 %	50 %	0 %	302668534
98	NC_014390	CAAG	2	8	43317	43324	50 %	0 %	25 %	25 %	302668534
99	NC_014390	GATG	2	8	43825	43832	25 %	25 %	50 %	0 %	302668535
100	NC_014390	CAAA	2	8	45268	45275	75 %	0 %	0 %	25 %	302668538
101	NC_014390	AGGA	2	8	45675	45682	50 %	0 %	50 %	0 %	302668538
102	NC_014390	GATG	2	8	45746	45753	25 %	25 %	50 %	0 %	302668538
103	NC_014390	CAGA	2	8	46194	46201	50 %	0 %	25 %	25 %	302668538
104	NC_014390	ATTG	2	8	47000	47007	25 %	50 %	25 %	0 %	302668540
105	NC_014390	CAAA	2	8	48029	48036	75 %	0 %	0 %	25 %	302668541
106	NC_014390	GAAA	2	8	48143	48150	75 %	0 %	25 %	0 %	302668541
107	NC_014390	AGTA	2	8	48694	48701	50 %	25 %	25 %	0 %	302668541
108	NC_014390	ACCA	2	8	49291	49298	50 %	0 %	0 %	50 %	302668541
109	NC_014390	TTGT	2	8	49657	49664	0 %	75 %	25 %	0 %	302668542
110	NC_014390	AGTA	2	8	49867	49874	50 %	25 %	25 %	0 %	302668542
111	NC_014390	GGAT	2	8	50242	50249	25 %	25 %	50 %	0 %	302668542
112	NC_014390	ACGG	2	8	50452	50459	25 %	0 %	50 %	25 %	302668542
113	NC_014390	AGAT	2	8	51081	51088	50 %	25 %	25 %	0 %	302668542
114	NC_014390	ACAT	2	8	51184	51191	50 %	25 %	0 %	25 %	302668542
115	NC_014390	TTTG	2	8	52237	52244	0 %	75 %	25 %	0 %	302668545
116	NC_014390	GATT	2	8	52802	52809	25 %	50 %	25 %	0 %	302668546
117	NC_014390	AAAG	2	8	53800	53807	75 %	0 %	25 %	0 %	302668547
118	NC_014390	AAGG	2	8	54041	54048	50 %	0 %	50 %	0 %	302668547
119	NC_014390	GGAT	2	8	56066	56073	25 %	25 %	50 %	0 %	302668550
120	NC_014390	CAGT	2	8	56132	56139	25 %	25 %	25 %	25 %	302668550
121	NC_014390	GGAT	2	8	56816	56823	25 %	25 %	50 %	0 %	302668552
122	NC_014390	TAAG	2	8	56863	56870	50 %	25 %	25 %	0 %	302668552
123	NC_014390	GAAA	2	8	57534	57541	75 %	0 %	25 %	0 %	302668553
124	NC_014390	TTCC	2	8	57706	57713	0 %	50 %	0 %	50 %	302668553
125	NC_014390	AAGG	2	8	58082	58089	50 %	0 %	50 %	0 %	302668554
126	NC_014390	AGTC	2	8	58253	58260	25 %	25 %	25 %	25 %	302668554
127	NC_014390	CTGA	2	8	59145	59152	25 %	25 %	25 %	25 %	302668557
128	NC_014390	GATT	2	8	59659	59666	25 %	50 %	25 %	0 %	302668558
129	NC_014390	TTAC	2	8	59675	59682	25 %	50 %	0 %	25 %	302668558
130	NC_014390	TACA	2	8	59747	59754	50 %	25 %	0 %	25 %	302668558
131	NC_014390	TAGA	2	8	59871	59878	50 %	25 %	25 %	0 %	302668558
132	NC_014390	ATAA	2	8	60306	60313	75 %	25 %	0 %	0 %	302668558
133	NC_014390	AGAA	2	8	60701	60708	75 %	0 %	25 %	0 %	302668559
134	NC_014390	AAGA	2	8	61630	61637	75 %	0 %	25 %	0 %	302668561
135	NC_014390	AAGA	2	8	61666	61673	75 %	0 %	25 %	0 %	302668561
136	NC_014390	AAGA	2	8	62205	62212	75 %	0 %	25 %	0 %	302668561
137	NC_014390	GTTC	2	8	62411	62418	0 %	50 %	25 %	25 %	302668561
138	NC_014390	GAAA	2	8	62644	62651	75 %	0 %	25 %	0 %	302668561
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.