MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Butyrivibrio proteoclasticus B316 plasmid pCY360

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014389	ATCCTC	2	12	5211	5222	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	302668705
2	NC_014389	GTTTTT	2	12	13010	13021	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	302668715
3	NC_014389	TGCATA	2	12	16173	16184	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302668718
4	NC_014389	TGATAT	2	12	17182	17193	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302668719
5	NC_014389	TTATAA	2	12	20531	20542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014389	GTCACA	2	12	24546	24557	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	302668734
7	NC_014389	GCTGTG	2	12	34766	34777	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	302668750
8	NC_014389	CAAGTG	2	12	36360	36371	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302668750
9	NC_014389	CATCCA	2	12	37469	37480	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	302668753
10	NC_014389	TTCTTT	2	12	40174	40185	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	302668756
11	NC_014389	TTTTTG	2	12	42782	42793	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	302668760
12	NC_014389	TCTTTT	2	12	43841	43852	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	302668761
13	NC_014389	CCTTTA	2	12	44114	44125	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	302668762
14	NC_014389	TACATT	2	12	46291	46302	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014389	GGAACA	2	12	54300	54311	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	302668781
16	NC_014389	ATTTTT	2	12	55934	55945	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014389	ACAGAT	2	12	56136	56147	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302668782
18	NC_014389	GTATTA	2	12	58621	58632	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302668784
19	NC_014389	CTTATT	2	12	60631	60642	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	302668786
20	NC_014389	TGGAAA	2	12	67678	67689	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302668794
21	NC_014389	AGCCAT	2	12	68256	68267	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	302668795
22	NC_014389	TAAAAA	2	12	68980	68991	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014389	CCTTAT	2	12	76621	76632	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	302668810
24	NC_014389	CGCCTT	2	12	79916	79927	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	302668816
25	NC_014389	TGCGAT	2	12	80773	80784	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014389	ATCAGG	2	12	81290	81301	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302668817
27	NC_014389	TAAAAA	2	12	82591	82602	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014389	AGCTAA	2	12	91594	91605	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014389	TAAATG	2	12	93281	93292	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302668844
30	NC_014389	TATGTC	2	12	93445	93456	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302668844
31	NC_014389	TGCGTC	2	12	109032	109043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302668869
32	NC_014389	TCTTCG	2	12	110673	110684	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	302668871
33	NC_014389	GCCGGT	2	12	111429	111440	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014389	TAGATG	2	12	112547	112558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014389	CTCCTT	2	12	115655	115666	0 %	50 %	0 %	50 %	302668878
36	NC_014389	TCCTTA	2	12	119418	119429	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	302668884
37	NC_014389	TTTTGT	2	12	121735	121746	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	302668887
38	NC_014389	TGTCTT	2	12	126849	126860	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	302668890
39	NC_014389	AATATG	2	12	128229	128240	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302668892
40	NC_014389	GTCATC	2	12	131810	131821	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302668896
41	NC_014389	TATGCT	2	12	133243	133254	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302668898
42	NC_014389	TTTTTA	2	12	134096	134107	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	302668899
43	NC_014389	ATGCAA	2	12	136353	136364	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302668901
44	NC_014389	GCTGTG	2	12	139328	139339	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	302668905
45	NC_014389	CCTCTG	2	12	139824	139835	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	302668905
46	NC_014389	ACATTC	2	12	143613	143624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014389	TTTATC	2	12	145993	146004	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	302668911
48	NC_014389	GCAGCT	2	12	148156	148167	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302668911
49	NC_014389	TTGCAG	2	12	149936	149947	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302668914
50	NC_014389	CAAAAA	2	12	150170	150181	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014389	ATTGCT	2	12	154204	154215	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302668922
52	NC_014389	TTCCCG	2	12	157637	157648	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	302668925
53	NC_014389	GAATAG	2	12	165522	165533	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302668931
54	NC_014389	CTCCTG	2	12	166974	166985	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	302668932
55	NC_014389	ATTTGC	2	12	169185	169196	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302668933
56	NC_014389	AAGAAA	2	12	172226	172237	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	302668936
57	NC_014389	ATCTTG	2	12	176064	176075	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302668940
58	NC_014389	CTCTGG	2	12	183249	183260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302668945
59	NC_014389	AGATAT	2	12	184782	184793	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302668946
60	NC_014389	CTCTGG	2	12	185426	185437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302668946
61	NC_014389	TGTAAT	2	12	186349	186360	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302668947
62	NC_014389	ATATCC	2	12	186410	186421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302668947
63	NC_014389	ATTCCT	2	12	191418	191429	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	302668952
64	NC_014389	ACCGAT	2	12	197732	197743	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	302668958
65	NC_014389	CATACA	2	12	198347	198358	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	302668959
66	NC_014389	GTCATT	2	12	200499	200510	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302668960
67	NC_014389	AAGGTC	2	12	202319	202330	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302668961
68	NC_014389	ACCGGA	2	12	202493	202504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302668961
69	NC_014389	GTTATA	2	12	202523	202534	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302668961
70	NC_014389	AGCTGC	2	12	205739	205750	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302668964
71	NC_014389	GAAGCC	2	12	208939	208950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302668966
72	NC_014389	CAAGCG	2	12	210845	210856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302668968
73	NC_014389	TCATAT	2	12	210970	210981	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302668969
74	NC_014389	TTATAT	2	12	215325	215336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302668972
75	NC_014389	CAGATA	2	12	216149	216160	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302668972
76	NC_014389	ATTCTT	2	12	216332	216343	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	302668973
77	NC_014389	TCTTAT	2	12	217090	217101	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	302668973
78	NC_014389	ATAATC	2	12	217464	217475	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	302668973
79	NC_014389	TTTTAT	2	12	223171	223182	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014389	CCATTT	2	12	224262	224273	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	302668981
81	NC_014389	CTTCTG	2	12	225371	225382	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	302668983
82	NC_014389	CATTGC	2	12	227326	227337	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302668983
83	NC_014389	AAGGCT	2	12	230599	230610	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302668983
84	NC_014389	AGCAGA	2	12	232036	232047	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014389	ATGCCA	2	12	238371	238382	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	302668992
86	NC_014389	ATCCTT	2	12	241806	241817	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	302668995
87	NC_014389	ATTTGC	2	12	244433	244444	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302668998
88	NC_014389	CATCTA	2	12	251070	251081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302669006
89	NC_014389	CAAGAA	2	12	251190	251201	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	302669006
90	NC_014389	ATTTCT	2	12	255345	255356	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	302669010
91	NC_014389	ATTCCA	2	12	256280	256291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302669011
92	NC_014389	TCTGTT	2	12	256417	256428	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	302669011
93	NC_014389	GCCATT	2	12	261955	261966	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302669015
94	NC_014389	TTCCGC	2	12	262623	262634	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	302669015
95	NC_014389	CAAGTT	2	12	262908	262919	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302669015
96	NC_014389	TTCTTT	2	12	264569	264580	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	302669016
97	NC_014389	TTCCTG	2	12	271785	271796	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	302669023
98	NC_014389	CGTCCA	2	12	272018	272029	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	302669023
99	NC_014389	TGAGCC	2	12	274964	274975	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302669024
100	NC_014389	GTTATT	2	12	276257	276268	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	302669024
101	NC_014389	TTTTTG	2	12	276935	276946	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	302669025
102	NC_014389	CAAGTA	2	12	277095	277106	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302669025
103	NC_014389	TCATAA	2	12	280638	280649	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	302669031
104	NC_014389	CTGCAA	2	12	287214	287225	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	302669037
105	NC_014389	TTTATC	2	12	288243	288254	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	302669040
106	NC_014389	CTTCAT	2	12	288622	288633	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	302669040
107	NC_014389	TTTCCT	2	12	290362	290373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014389	ATTCAT	2	12	291045	291056	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302669044
109	NC_014389	GTCCAT	2	12	295667	295678	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302669053
110	NC_014389	ATCAGT	2	12	296805	296816	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_014389	TAAGAA	2	12	297647	297658	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	302669055
112	NC_014389	TTGTTT	2	12	301168	301179	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	302669059
113	NC_014389	GGGTAC	2	12	304179	304190	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_014389	TTATCA	2	12	307420	307431	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302669068
115	NC_014389	TGTAAA	2	12	310324	310335	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302669069
116	NC_014389	CAAAAT	2	12	311677	311688	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	302669070
117	NC_014389	TCGGGC	2	12	311947	311958	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	302669070
118	NC_014389	TTACGA	2	12	313804	313815	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302669072
119	NC_014389	TTGGAT	2	12	316789	316800	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014389	TGTATT	2	12	318794	318805	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	302669079
121	NC_014389	TTTATT	2	12	319215	319226	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014389	TTTTCT	2	12	321354	321365	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	302669084
123	NC_014389	AGGATG	2	12	325013	325024	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014389	GTTGCT	2	12	326582	326593	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	302669090
125	NC_014389	TTCATC	2	12	326827	326838	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	302669090
126	NC_014389	CTGCCA	2	12	328581	328592	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	302669092
127	NC_014389	CTTTAG	2	12	328837	328848	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302669092
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131	NC_014389	TTCTTT	2	12	334030	334041	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	302669097
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134	NC_014389	ATTTTT	2	12	341647	341658	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014389	AAAAGC	2	12	353004	353015	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_014389	TATGGC	2	12	354329	354340	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302669117
137	NC_014389	TTTATA	2	12	358637	358648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.