MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Butyrivibrio proteoclasticus B316 plasmid pCY360

Total Repeats: 287

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014389	TACTA	2	10	84	93	40 %	40 %	0 %	20 %	302668699
2	NC_014389	TTTTA	2	10	1572	1581	20 %	80 %	0 %	0 %	302668701
3	NC_014389	CTTTT	2	10	3284	3293	0 %	80 %	0 %	20 %	302668703
4	NC_014389	TAAAA	2	10	3914	3923	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014389	TATAA	2	10	5229	5238	60 %	40 %	0 %	0 %	302668705
6	NC_014389	AGCAT	2	10	5368	5377	40 %	20 %	20 %	20 %	302668705
7	NC_014389	GCCAA	2	10	7206	7215	40 %	0 %	20 %	40 %	302668708
8	NC_014389	TTCTT	2	10	11259	11268	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014389	CTTGT	2	10	11763	11772	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014389	ATTTT	2	10	13999	14008	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014389	ATAAA	2	10	18096	18105	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014389	ATCTT	2	10	19665	19674	20 %	60 %	0 %	20 %	302668722
13	NC_014389	CTGCC	2	10	21644	21653	0 %	20 %	20 %	60 %	302668726
14	NC_014389	TCTTT	2	10	21705	21714	0 %	80 %	0 %	20 %	302668726
15	NC_014389	GCATT	2	10	22509	22518	20 %	40 %	20 %	20 %	302668728
16	NC_014389	CTCTT	2	10	22953	22962	0 %	60 %	0 %	40 %	302668730
17	NC_014389	TCGCT	2	10	28314	28323	0 %	40 %	20 %	40 %	302668740
18	NC_014389	ATTTC	2	10	29133	29142	20 %	60 %	0 %	20 %	302668741
19	NC_014389	AAATC	2	10	29161	29170	60 %	20 %	0 %	20 %	302668742
20	NC_014389	TTTTA	2	10	30267	30276	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014389	TAAAT	2	10	30673	30682	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014389	AAAGC	2	10	31823	31832	60 %	0 %	20 %	20 %	302668746
23	NC_014389	TTTTA	2	10	33095	33104	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014389	CTTAT	2	10	33729	33738	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014389	GTCTG	2	10	34655	34664	0 %	40 %	40 %	20 %	302668750
26	NC_014389	GAGCT	2	10	35383	35392	20 %	20 %	40 %	20 %	302668750
27	NC_014389	TAATA	2	10	36684	36693	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014389	TTTTC	2	10	37730	37739	0 %	80 %	0 %	20 %	302668753
29	NC_014389	AAATA	2	10	37800	37809	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014389	CATCT	2	10	39143	39152	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_014389	GTATA	2	10	39840	39849	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014389	TTATC	2	10	40983	40992	20 %	60 %	0 %	20 %	302668757
33	NC_014389	TTCCT	2	10	41256	41265	0 %	60 %	0 %	40 %	302668758
34	NC_014389	TAAAA	2	10	41421	41430	80 %	20 %	0 %	0 %	302668758
35	NC_014389	TAAGA	2	10	41781	41790	60 %	20 %	20 %	0 %	302668759
36	NC_014389	CTCTT	2	10	42607	42616	0 %	60 %	0 %	40 %	302668759
37	NC_014389	ATAAA	2	10	43665	43674	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014389	ATTTT	2	10	43868	43877	20 %	80 %	0 %	0 %	302668761
39	NC_014389	CTTTA	2	10	43992	44001	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014389	TAAAA	2	10	48712	48721	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014389	TTTTC	2	10	48987	48996	0 %	80 %	0 %	20 %	302668771
42	NC_014389	TCCTT	2	10	52358	52367	0 %	60 %	0 %	40 %	302668777
43	NC_014389	GATAA	2	10	54149	54158	60 %	20 %	20 %	0 %	302668781
44	NC_014389	ATCGC	2	10	56040	56049	20 %	20 %	20 %	40 %	302668782
45	NC_014389	TTAAA	2	10	56106	56115	60 %	40 %	0 %	0 %	302668782
46	NC_014389	AAAAG	2	10	56172	56181	80 %	0 %	20 %	0 %	302668782
47	NC_014389	AAGGA	2	10	57613	57622	60 %	0 %	40 %	0 %	302668783
48	NC_014389	AAGAA	2	10	58190	58199	80 %	0 %	20 %	0 %	302668783
49	NC_014389	ATCTC	2	10	60263	60272	20 %	40 %	0 %	40 %	302668786
50	NC_014389	CTTTT	2	10	60513	60522	0 %	80 %	0 %	20 %	302668786
51	NC_014389	ATCTT	2	10	60775	60784	20 %	60 %	0 %	20 %	302668787
52	NC_014389	TATGC	2	10	61912	61921	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014389	CACTA	2	10	68564	68573	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_014389	TGCTT	2	10	71003	71012	0 %	60 %	20 %	20 %	302668799
55	NC_014389	TTTCA	2	10	71425	71434	20 %	60 %	0 %	20 %	302668800
56	NC_014389	TCTTT	2	10	71452	71461	0 %	80 %	0 %	20 %	302668800
57	NC_014389	TGCCA	2	10	73703	73712	20 %	20 %	20 %	40 %	302668805
58	NC_014389	TTATC	2	10	74257	74266	20 %	60 %	0 %	20 %	302668806
59	NC_014389	AAAAG	2	10	74663	74672	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014389	CATGA	2	10	74959	74968	40 %	20 %	20 %	20 %	302668807
61	NC_014389	GATAA	2	10	74986	74995	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014389	AAAAT	2	10	75090	75099	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014389	CTTCT	2	10	77817	77826	0 %	60 %	0 %	40 %	302668813
64	NC_014389	CATCT	2	10	81958	81967	20 %	40 %	0 %	40 %	302668817
65	NC_014389	TGTCT	2	10	82720	82729	0 %	60 %	20 %	20 %	302668819
66	NC_014389	GAATG	2	10	82740	82749	40 %	20 %	40 %	0 %	302668819
67	NC_014389	TTTCT	2	10	84239	84248	0 %	80 %	0 %	20 %	302668822
68	NC_014389	TCTTT	2	10	84507	84516	0 %	80 %	0 %	20 %	302668823
69	NC_014389	AATCA	2	10	84956	84965	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014389	ATAGC	2	10	85492	85501	40 %	20 %	20 %	20 %	302668825
71	NC_014389	AGGAT	2	10	86853	86862	40 %	20 %	40 %	0 %	302668829
72	NC_014389	TAAAT	2	10	87786	87795	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014389	CATCT	2	10	88016	88025	20 %	40 %	0 %	40 %	302668831
74	NC_014389	ATTTT	2	10	89228	89237	20 %	80 %	0 %	0 %	302668834
75	NC_014389	CAAAA	2	10	89535	89544	80 %	0 %	0 %	20 %	302668834
76	NC_014389	CTTAT	2	10	89614	89623	20 %	60 %	0 %	20 %	302668835
77	NC_014389	TTTGG	2	10	89723	89732	0 %	60 %	40 %	0 %	302668835
78	NC_014389	CTTTC	2	10	90013	90022	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_014389	TAAAA	2	10	90087	90096	80 %	20 %	0 %	0 %	302668837
80	NC_014389	AAAAC	2	10	90258	90267	80 %	0 %	0 %	20 %	302668837
81	NC_014389	ATGGT	2	10	91180	91189	20 %	40 %	40 %	0 %	302668841
82	NC_014389	CACAC	2	10	94193	94202	40 %	0 %	0 %	60 %	302668846
83	NC_014389	TAATT	2	10	95498	95507	40 %	60 %	0 %	0 %	302668848
84	NC_014389	TAAAA	2	10	98408	98417	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014389	CAGCG	2	10	99011	99020	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_014389	ATAAA	2	10	100362	100371	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014389	TCGAT	2	10	101191	101200	20 %	40 %	20 %	20 %	302668858
88	NC_014389	AAAAT	2	10	102710	102719	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014389	GCGCT	2	10	103339	103348	0 %	20 %	40 %	40 %	302668859
90	NC_014389	CCATG	2	10	103452	103461	20 %	20 %	20 %	40 %	302668859
91	NC_014389	GGAAC	2	10	103690	103699	40 %	0 %	40 %	20 %	302668859
92	NC_014389	TGCAT	2	10	104976	104985	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_014389	ATTGC	2	10	104987	104996	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014389	GCAAA	2	10	105519	105528	60 %	0 %	20 %	20 %	302668862
95	NC_014389	TTAAG	2	10	107095	107104	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014389	AAGCA	2	10	107398	107407	60 %	0 %	20 %	20 %	302668866
97	NC_014389	TTATC	2	10	109680	109689	20 %	60 %	0 %	20 %	302668870
98	NC_014389	AAAGA	2	10	111393	111402	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014389	TTTTG	2	10	112442	112451	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014389	AAAGA	2	10	113087	113096	80 %	0 %	20 %	0 %	302668875
101	NC_014389	AGATA	2	10	114387	114396	60 %	20 %	20 %	0 %	302668877
102	NC_014389	CATAC	2	10	116927	116936	40 %	20 %	0 %	40 %	302668880
103	NC_014389	AAAAG	2	10	121062	121071	80 %	0 %	20 %	0 %	302668886
104	NC_014389	AGCAA	2	10	121219	121228	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_014389	CCTTC	2	10	124338	124347	0 %	40 %	0 %	60 %	302668890
106	NC_014389	TTTTG	2	10	124523	124532	0 %	80 %	20 %	0 %	302668890
107	NC_014389	CTTTC	2	10	126120	126129	0 %	60 %	0 %	40 %	302668890
108	NC_014389	GCTCT	2	10	128026	128035	0 %	40 %	20 %	40 %	302668892
109	NC_014389	TCATT	2	10	128411	128420	20 %	60 %	0 %	20 %	302668892
110	NC_014389	AGGCA	2	10	129986	129995	40 %	0 %	40 %	20 %	302668893
111	NC_014389	TACGT	2	10	130821	130830	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014389	AAAGT	2	10	131396	131405	60 %	20 %	20 %	0 %	302668895
113	NC_014389	TGGAT	2	10	131750	131759	20 %	40 %	40 %	0 %	302668896
114	NC_014389	ATTTT	2	10	134747	134756	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014389	AGTGG	2	10	134999	135008	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014389	ATTTA	2	10	135738	135747	40 %	60 %	0 %	0 %	302668900
117	NC_014389	TAAAA	2	10	136883	136892	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014389	GTCTG	2	10	139217	139226	0 %	40 %	40 %	20 %	302668905
119	NC_014389	CATAT	2	10	141605	141614	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014389	TCATA	2	10	144919	144928	40 %	40 %	0 %	20 %	302668909
121	NC_014389	TCTTT	2	10	148195	148204	0 %	80 %	0 %	20 %	302668911
122	NC_014389	AAAAG	2	10	149539	149548	80 %	0 %	20 %	0 %	302668913
123	NC_014389	TAATT	2	10	154157	154166	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014389	AAAAT	2	10	156563	156572	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014389	TAAAA	2	10	156592	156601	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014389	TTTCT	2	10	158295	158304	0 %	80 %	0 %	20 %	302668925
127	NC_014389	CCTTA	2	10	159138	159147	20 %	40 %	0 %	40 %	302668926
128	NC_014389	GGAAA	2	10	159369	159378	60 %	0 %	40 %	0 %	302668926
129	NC_014389	GGAAG	2	10	160231	160240	40 %	0 %	60 %	0 %	302668926
130	NC_014389	TTTAG	2	10	162882	162891	20 %	60 %	20 %	0 %	302668929
131	NC_014389	CTTTC	2	10	166012	166021	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_014389	AAGCT	2	10	169000	169009	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014389	ATCTC	2	10	169081	169090	20 %	40 %	0 %	40 %	302668933
134	NC_014389	TGTCC	2	10	170033	170042	0 %	40 %	20 %	40 %	302668933
135	NC_014389	AGAAT	2	10	170138	170147	60 %	20 %	20 %	0 %	302668933
136	NC_014389	TCTGC	2	10	170192	170201	0 %	40 %	20 %	40 %	302668933
137	NC_014389	TCCTT	2	10	171450	171459	0 %	60 %	0 %	40 %	302668935
138	NC_014389	TGTCT	2	10	171564	171573	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_014389	TGAAA	2	10	173740	173749	60 %	20 %	20 %	0 %	302668937
140	NC_014389	TAAGA	2	10	174271	174280	60 %	20 %	20 %	0 %	302668938
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142	NC_014389	TGTAT	2	10	176879	176888	20 %	60 %	20 %	0 %	302668940
143	NC_014389	ATTAA	2	10	178383	178392	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014389	TTTTG	2	10	179147	179156	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_014389	TTCTT	2	10	223296	223305	0 %	80 %	0 %	20 %	302668980
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201	NC_014389	ATATT	2	10	258874	258883	40 %	60 %	0 %	0 %	302669014
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.