MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Butyrivibrio proteoclasticus B316 plasmid pCY360

Total Repeats: 210

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014389	TACTA	2	10	84	93	40 %	40 %	0 %	20 %	302668699
2	NC_014389	TTTTA	2	10	1572	1581	20 %	80 %	0 %	0 %	302668701
3	NC_014389	CTTTT	2	10	3284	3293	0 %	80 %	0 %	20 %	302668703
4	NC_014389	TATAA	2	10	5229	5238	60 %	40 %	0 %	0 %	302668705
5	NC_014389	AGCAT	2	10	5368	5377	40 %	20 %	20 %	20 %	302668705
6	NC_014389	GCCAA	2	10	7206	7215	40 %	0 %	20 %	40 %	302668708
7	NC_014389	ATCTT	2	10	19665	19674	20 %	60 %	0 %	20 %	302668722
8	NC_014389	CTGCC	2	10	21644	21653	0 %	20 %	20 %	60 %	302668726
9	NC_014389	TCTTT	2	10	21705	21714	0 %	80 %	0 %	20 %	302668726
10	NC_014389	GCATT	2	10	22509	22518	20 %	40 %	20 %	20 %	302668728
11	NC_014389	CTCTT	2	10	22953	22962	0 %	60 %	0 %	40 %	302668730
12	NC_014389	TCGCT	2	10	28314	28323	0 %	40 %	20 %	40 %	302668740
13	NC_014389	ATTTC	2	10	29133	29142	20 %	60 %	0 %	20 %	302668741
14	NC_014389	AAATC	2	10	29161	29170	60 %	20 %	0 %	20 %	302668742
15	NC_014389	AAAGC	2	10	31823	31832	60 %	0 %	20 %	20 %	302668746
16	NC_014389	GTCTG	2	10	34655	34664	0 %	40 %	40 %	20 %	302668750
17	NC_014389	GAGCT	2	10	35383	35392	20 %	20 %	40 %	20 %	302668750
18	NC_014389	TTTTC	2	10	37730	37739	0 %	80 %	0 %	20 %	302668753
19	NC_014389	TTATC	2	10	40983	40992	20 %	60 %	0 %	20 %	302668757
20	NC_014389	TTCCT	2	10	41256	41265	0 %	60 %	0 %	40 %	302668758
21	NC_014389	TAAAA	2	10	41421	41430	80 %	20 %	0 %	0 %	302668758
22	NC_014389	TAAGA	2	10	41781	41790	60 %	20 %	20 %	0 %	302668759
23	NC_014389	CTCTT	2	10	42607	42616	0 %	60 %	0 %	40 %	302668759
24	NC_014389	ATTTT	2	10	43868	43877	20 %	80 %	0 %	0 %	302668761
25	NC_014389	TTTTC	2	10	48987	48996	0 %	80 %	0 %	20 %	302668771
26	NC_014389	TCCTT	2	10	52358	52367	0 %	60 %	0 %	40 %	302668777
27	NC_014389	GATAA	2	10	54149	54158	60 %	20 %	20 %	0 %	302668781
28	NC_014389	ATCGC	2	10	56040	56049	20 %	20 %	20 %	40 %	302668782
29	NC_014389	TTAAA	2	10	56106	56115	60 %	40 %	0 %	0 %	302668782
30	NC_014389	AAAAG	2	10	56172	56181	80 %	0 %	20 %	0 %	302668782
31	NC_014389	AAGGA	2	10	57613	57622	60 %	0 %	40 %	0 %	302668783
32	NC_014389	AAGAA	2	10	58190	58199	80 %	0 %	20 %	0 %	302668783
33	NC_014389	ATCTC	2	10	60263	60272	20 %	40 %	0 %	40 %	302668786
34	NC_014389	CTTTT	2	10	60513	60522	0 %	80 %	0 %	20 %	302668786
35	NC_014389	ATCTT	2	10	60775	60784	20 %	60 %	0 %	20 %	302668787
36	NC_014389	TGCTT	2	10	71003	71012	0 %	60 %	20 %	20 %	302668799
37	NC_014389	TTTCA	2	10	71425	71434	20 %	60 %	0 %	20 %	302668800
38	NC_014389	TCTTT	2	10	71452	71461	0 %	80 %	0 %	20 %	302668800
39	NC_014389	TGCCA	2	10	73703	73712	20 %	20 %	20 %	40 %	302668805
40	NC_014389	TTATC	2	10	74257	74266	20 %	60 %	0 %	20 %	302668806
41	NC_014389	CATGA	2	10	74959	74968	40 %	20 %	20 %	20 %	302668807
42	NC_014389	CTTCT	2	10	77817	77826	0 %	60 %	0 %	40 %	302668813
43	NC_014389	CATCT	2	10	81958	81967	20 %	40 %	0 %	40 %	302668817
44	NC_014389	TGTCT	2	10	82720	82729	0 %	60 %	20 %	20 %	302668819
45	NC_014389	GAATG	2	10	82740	82749	40 %	20 %	40 %	0 %	302668819
46	NC_014389	TTTCT	2	10	84239	84248	0 %	80 %	0 %	20 %	302668822
47	NC_014389	TCTTT	2	10	84507	84516	0 %	80 %	0 %	20 %	302668823
48	NC_014389	ATAGC	2	10	85492	85501	40 %	20 %	20 %	20 %	302668825
49	NC_014389	AGGAT	2	10	86853	86862	40 %	20 %	40 %	0 %	302668829
50	NC_014389	CATCT	2	10	88016	88025	20 %	40 %	0 %	40 %	302668831
51	NC_014389	ATTTT	2	10	89228	89237	20 %	80 %	0 %	0 %	302668834
52	NC_014389	CAAAA	2	10	89535	89544	80 %	0 %	0 %	20 %	302668834
53	NC_014389	CTTAT	2	10	89614	89623	20 %	60 %	0 %	20 %	302668835
54	NC_014389	TTTGG	2	10	89723	89732	0 %	60 %	40 %	0 %	302668835
55	NC_014389	TAAAA	2	10	90087	90096	80 %	20 %	0 %	0 %	302668837
56	NC_014389	AAAAC	2	10	90258	90267	80 %	0 %	0 %	20 %	302668837
57	NC_014389	ATGGT	2	10	91180	91189	20 %	40 %	40 %	0 %	302668841
58	NC_014389	CACAC	2	10	94193	94202	40 %	0 %	0 %	60 %	302668846
59	NC_014389	TAATT	2	10	95498	95507	40 %	60 %	0 %	0 %	302668848
60	NC_014389	TCGAT	2	10	101191	101200	20 %	40 %	20 %	20 %	302668858
61	NC_014389	GCGCT	2	10	103339	103348	0 %	20 %	40 %	40 %	302668859
62	NC_014389	CCATG	2	10	103452	103461	20 %	20 %	20 %	40 %	302668859
63	NC_014389	GGAAC	2	10	103690	103699	40 %	0 %	40 %	20 %	302668859
64	NC_014389	GCAAA	2	10	105519	105528	60 %	0 %	20 %	20 %	302668862
65	NC_014389	AAGCA	2	10	107398	107407	60 %	0 %	20 %	20 %	302668866
66	NC_014389	TTATC	2	10	109680	109689	20 %	60 %	0 %	20 %	302668870
67	NC_014389	AAAGA	2	10	113087	113096	80 %	0 %	20 %	0 %	302668875
68	NC_014389	AGATA	2	10	114387	114396	60 %	20 %	20 %	0 %	302668877
69	NC_014389	CATAC	2	10	116927	116936	40 %	20 %	0 %	40 %	302668880
70	NC_014389	AAAAG	2	10	121062	121071	80 %	0 %	20 %	0 %	302668886
71	NC_014389	CCTTC	2	10	124338	124347	0 %	40 %	0 %	60 %	302668890
72	NC_014389	TTTTG	2	10	124523	124532	0 %	80 %	20 %	0 %	302668890
73	NC_014389	CTTTC	2	10	126120	126129	0 %	60 %	0 %	40 %	302668890
74	NC_014389	GCTCT	2	10	128026	128035	0 %	40 %	20 %	40 %	302668892
75	NC_014389	TCATT	2	10	128411	128420	20 %	60 %	0 %	20 %	302668892
76	NC_014389	AGGCA	2	10	129986	129995	40 %	0 %	40 %	20 %	302668893
77	NC_014389	AAAGT	2	10	131396	131405	60 %	20 %	20 %	0 %	302668895
78	NC_014389	TGGAT	2	10	131750	131759	20 %	40 %	40 %	0 %	302668896
79	NC_014389	ATTTA	2	10	135738	135747	40 %	60 %	0 %	0 %	302668900
80	NC_014389	GTCTG	2	10	139217	139226	0 %	40 %	40 %	20 %	302668905
81	NC_014389	TCATA	2	10	144919	144928	40 %	40 %	0 %	20 %	302668909
82	NC_014389	TCTTT	2	10	148195	148204	0 %	80 %	0 %	20 %	302668911
83	NC_014389	AAAAG	2	10	149539	149548	80 %	0 %	20 %	0 %	302668913
84	NC_014389	TTTCT	2	10	158295	158304	0 %	80 %	0 %	20 %	302668925
85	NC_014389	CCTTA	2	10	159138	159147	20 %	40 %	0 %	40 %	302668926
86	NC_014389	GGAAA	2	10	159369	159378	60 %	0 %	40 %	0 %	302668926
87	NC_014389	GGAAG	2	10	160231	160240	40 %	0 %	60 %	0 %	302668926
88	NC_014389	TTTAG	2	10	162882	162891	20 %	60 %	20 %	0 %	302668929
89	NC_014389	ATCTC	2	10	169081	169090	20 %	40 %	0 %	40 %	302668933
90	NC_014389	TGTCC	2	10	170033	170042	0 %	40 %	20 %	40 %	302668933
91	NC_014389	AGAAT	2	10	170138	170147	60 %	20 %	20 %	0 %	302668933
92	NC_014389	TCTGC	2	10	170192	170201	0 %	40 %	20 %	40 %	302668933
93	NC_014389	TCCTT	2	10	171450	171459	0 %	60 %	0 %	40 %	302668935
94	NC_014389	TGAAA	2	10	173740	173749	60 %	20 %	20 %	0 %	302668937
95	NC_014389	TAAGA	2	10	174271	174280	60 %	20 %	20 %	0 %	302668938
96	NC_014389	TTTTC	2	10	175349	175358	0 %	80 %	0 %	20 %	302668939
97	NC_014389	TGTAT	2	10	176879	176888	20 %	60 %	20 %	0 %	302668940
98	NC_014389	GATCA	2	10	179855	179864	40 %	20 %	20 %	20 %	302668942
99	NC_014389	AATAA	2	10	180310	180319	80 %	20 %	0 %	0 %	302668943
100	NC_014389	ATATT	2	10	182173	182182	40 %	60 %	0 %	0 %	302668945
101	NC_014389	ATTTC	2	10	187628	187637	20 %	60 %	0 %	20 %	302668948
102	NC_014389	CTGCC	2	10	191967	191976	0 %	20 %	20 %	60 %	302668953
103	NC_014389	ACAAT	2	10	193079	193088	60 %	20 %	0 %	20 %	302668954
104	NC_014389	CAGTG	2	10	193491	193500	20 %	20 %	40 %	20 %	302668955
105	NC_014389	TTTCT	2	10	193909	193918	0 %	80 %	0 %	20 %	302668955
106	NC_014389	CATAT	2	10	195254	195263	40 %	40 %	0 %	20 %	302668958
107	NC_014389	TGTAA	2	10	197684	197693	40 %	40 %	20 %	0 %	302668958
108	NC_014389	GAGTT	2	10	198546	198555	20 %	40 %	40 %	0 %	302668959
109	NC_014389	TTACT	2	10	199174	199183	20 %	60 %	0 %	20 %	302668959
110	NC_014389	TGATA	2	10	204258	204267	40 %	40 %	20 %	0 %	302668962
111	NC_014389	TCCCA	2	10	204912	204921	20 %	20 %	0 %	60 %	302668963
112	NC_014389	AAAAG	2	10	204989	204998	80 %	0 %	20 %	0 %	302668963
113	NC_014389	CAAGC	2	10	205519	205528	40 %	0 %	20 %	40 %	302668964
114	NC_014389	CCAAA	2	10	208326	208335	60 %	0 %	0 %	40 %	302668965
115	NC_014389	TAAAA	2	10	208471	208480	80 %	20 %	0 %	0 %	302668965
116	NC_014389	TTTCA	2	10	210549	210558	20 %	60 %	0 %	20 %	302668968
117	NC_014389	CTCTT	2	10	210729	210738	0 %	60 %	0 %	40 %	302668968
118	NC_014389	TGTCT	2	10	211687	211696	0 %	60 %	20 %	20 %	302668970
119	NC_014389	GAATG	2	10	212258	212267	40 %	20 %	40 %	0 %	302668971
120	NC_014389	TCTCT	2	10	212327	212336	0 %	60 %	0 %	40 %	302668971
121	NC_014389	TGTTT	2	10	214136	214145	0 %	80 %	20 %	0 %	302668971
122	NC_014389	TTGAT	2	10	215893	215902	20 %	60 %	20 %	0 %	302668972
123	NC_014389	CTTCT	2	10	219941	219950	0 %	60 %	0 %	40 %	302668976
124	NC_014389	TTCTT	2	10	220005	220014	0 %	80 %	0 %	20 %	302668976
125	NC_014389	TTGCC	2	10	220669	220678	0 %	40 %	20 %	40 %	302668976
126	NC_014389	GTTAC	2	10	221307	221316	20 %	40 %	20 %	20 %	302668976
127	NC_014389	TCCAG	2	10	221801	221810	20 %	20 %	20 %	40 %	302668977
128	NC_014389	TCTTT	2	10	222195	222204	0 %	80 %	0 %	20 %	302668977
129	NC_014389	TTCTT	2	10	223296	223305	0 %	80 %	0 %	20 %	302668980
130	NC_014389	TCCTT	2	10	225178	225187	0 %	60 %	0 %	40 %	302668982
131	NC_014389	ATGTT	2	10	226373	226382	20 %	60 %	20 %	0 %	302668983
132	NC_014389	GCCCT	2	10	239850	239859	0 %	20 %	20 %	60 %	302668993
133	NC_014389	GATCT	2	10	240400	240409	20 %	40 %	20 %	20 %	302668993
134	NC_014389	ATCTC	2	10	240637	240646	20 %	40 %	0 %	40 %	302668993
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.