MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Butyrivibrio proteoclasticus B316 plasmid pCY360

Total Repeats: 211

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014389	TAAA	2	8	7348	7355	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014389	TTAC	2	8	7373	7380	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014389	TTTG	2	8	9013	9020	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014389	GGAA	2	8	11114	11121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014389	TTAT	2	8	11671	11678	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014389	TTTA	2	8	13548	13555	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014389	TTAT	2	8	13612	13619	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014389	TAAG	2	8	13954	13961	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014389	TATC	2	8	14148	14155	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014389	TTTC	2	8	19076	19083	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014389	TTAT	2	8	19106	19113	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014389	AAGT	2	8	19175	19182	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014389	TACT	2	8	19189	19196	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014389	TCCT	2	8	21776	21783	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014389	AAAT	2	8	21831	21838	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014389	ATAA	2	8	27390	27397	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014389	TTTA	2	8	33186	33193	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014389	TGCC	2	8	36463	36470	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014389	CTTT	2	8	37750	37757	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014389	GAAA	2	8	39788	39795	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014389	CAAA	2	8	39890	39897	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014389	ATAA	2	8	40408	40415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014389	GGAT	2	8	40452	40459	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014389	AAAT	2	8	42725	42732	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014389	TATT	2	8	46367	46374	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014389	CCTT	3	12	46521	46532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014389	CTTT	2	8	48664	48671	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014389	TAAG	2	8	48722	48729	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014389	AAAT	2	8	53069	53076	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014389	ATTT	2	8	55630	55637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014389	TAAC	2	8	56687	56694	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014389	ATTT	2	8	56740	56747	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014389	TCTG	2	8	56762	56769	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014389	AAAG	2	8	61990	61997	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014389	GAAA	2	8	63061	63068	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014389	GAAG	2	8	63337	63344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014389	TAAA	2	8	63681	63688	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014389	TAAA	2	8	65461	65468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014389	CTTA	2	8	70600	70607	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014389	CTTT	2	8	73743	73750	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014389	GTTT	2	8	76314	76321	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014389	CTTT	2	8	78232	78239	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014389	AATA	2	8	78260	78267	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014389	AATA	2	8	80663	80670	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014389	AAAT	2	8	82273	82280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014389	TTTA	2	8	82568	82575	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014389	TAAA	2	8	83492	83499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014389	CTTT	2	8	84791	84798	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014389	ACAT	2	8	84987	84994	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014389	ATCA	2	8	85725	85732	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014389	ATTT	2	8	87477	87484	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014389	CTTT	2	8	87737	87744	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014389	GCAA	2	8	87847	87854	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014389	CTTT	2	8	88683	88690	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014389	TCTT	2	8	91085	91092	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014389	ATCT	2	8	91642	91649	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014389	AAAG	2	8	92743	92750	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014389	TTTA	2	8	95512	95519	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014389	TTTG	2	8	95532	95539	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014389	TTTC	2	8	96678	96685	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014389	CTTT	2	8	98322	98329	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014389	AATA	2	8	98372	98379	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014389	TACA	2	8	98975	98982	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014389	ATCA	2	8	99036	99043	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014389	CTTA	2	8	99045	99052	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014389	TTCC	2	8	99098	99105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014389	TAAA	2	8	99532	99539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014389	TAAG	2	8	104552	104559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014389	TGAA	2	8	105674	105681	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014389	TGTA	2	8	105819	105826	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014389	TTTA	2	8	106781	106788	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014389	CATC	2	8	109873	109880	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014389	ACAA	2	8	109959	109966	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014389	TTAG	2	8	110333	110340	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014389	CAAA	2	8	110371	110378	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014389	TTAT	2	8	112495	112502	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014389	CTTA	2	8	112882	112889	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014389	TTTC	2	8	114073	114080	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014389	TTAT	2	8	116193	116200	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014389	GTAC	2	8	117171	117178	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014389	CTTT	2	8	119053	119060	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014389	AGAT	2	8	120329	120336	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014389	GAAC	2	8	120465	120472	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014389	AAAT	2	8	120485	120492	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014389	GATA	2	8	129145	129152	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014389	TATT	2	8	129263	129270	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014389	ATGT	2	8	130839	130846	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014389	ATGA	2	8	131002	131009	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014389	CTTT	2	8	131572	131579	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014389	ATAA	2	8	132811	132818	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014389	TTTA	2	8	134736	134743	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014389	CTTA	2	8	136871	136878	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014389	TACT	2	8	137223	137230	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014389	TTTC	2	8	137354	137361	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014389	ATGT	2	8	137868	137875	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014389	GATA	2	8	138236	138243	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014389	CCTT	2	8	140996	141003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014389	TAAA	2	8	142632	142639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014389	TTTG	2	8	142709	142716	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014389	GTAC	2	8	143671	143678	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014389	CAAT	2	8	144105	144112	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014389	AAAT	2	8	145141	145148	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014389	CCTT	2	8	148219	148226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014389	ATTG	2	8	148570	148577	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014389	AACA	2	8	148598	148605	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014389	CTTT	2	8	150124	150131	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014389	ATTT	2	8	150160	150167	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014389	ACTA	2	8	150209	150216	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014389	ATAA	2	8	151692	151699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014389	TATC	2	8	151708	151715	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014389	CAAA	2	8	154732	154739	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014389	TGTT	2	8	156481	156488	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014389	AATA	2	8	164333	164340	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014389	TTTG	2	8	164355	164362	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014389	GCAT	2	8	164516	164523	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014389	AGAT	2	8	164952	164959	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014389	AAAT	2	8	168949	168956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014389	CCAT	2	8	168964	168971	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014389	TATC	2	8	171536	171543	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014389	TAAA	2	8	178482	178489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014389	AAAG	2	8	188340	188347	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014389	ATAA	2	8	188480	188487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014389	ACAA	2	8	189392	189399	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014389	GAAG	2	8	189448	189455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014389	CAAT	2	8	192685	192692	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014389	TTTA	2	8	193315	193322	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014389	TTCC	2	8	194295	194302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_014389	TGCG	2	8	194360	194367	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014389	ATGG	2	8	194398	194405	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014389	CTTT	2	8	195100	195107	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014389	CTTT	2	8	198115	198122	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014389	AAAG	2	8	198213	198220	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014389	ATTT	2	8	199781	199788	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014389	ATCA	2	8	201194	201201	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014389	GTCT	2	8	201209	201216	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014389	TACT	2	8	201377	201384	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014389	ATTT	2	8	201407	201414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014389	TTAT	2	8	208773	208780	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014389	CTTT	2	8	209010	209017	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014389	TAGA	2	8	212084	212091	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014389	ACAA	2	8	219418	219425	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014389	AAAT	2	8	222482	222489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014389	ATTA	2	8	223697	223704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014389	TTAT	2	8	234350	234357	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014389	CTAT	2	8	241083	241090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014389	AGCG	2	8	241527	241534	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_014389	AAAG	2	8	246539	246546	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014389	TTTA	2	8	246586	246593	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014389	TTAC	2	8	247026	247033	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014389	GTTT	2	8	247051	247058	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014389	GGTT	2	8	247562	247569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014389	TCCA	2	8	247765	247772	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_014389	TTTG	2	8	253451	253458	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.