MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Butyrivibrio proteoclasticus B316 chromosome 2

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014388	AACTCT	2	12	351	362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302669124
2	NC_014388	TGATAA	2	12	3674	3685	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302669128
3	NC_014388	CCGGCA	2	12	4065	4076	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	302669128
4	NC_014388	TGTTTC	2	12	7040	7051	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	302669130
5	NC_014388	AAGATA	2	12	10739	10750	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	302669133
6	NC_014388	GAATAG	2	12	11247	11258	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302669133
7	NC_014388	GCTGAT	2	12	13907	13918	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302669136
8	NC_014388	AGGCTG	2	12	13938	13949	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	302669136
9	NC_014388	GAAGCT	2	12	14123	14134	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302669136
10	NC_014388	ATACAC	2	12	26079	26090	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	302669144
11	NC_014388	CCTTCA	2	12	26220	26231	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	302669144
12	NC_014388	GGATGA	2	12	36185	36196	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	302669153
13	NC_014388	TATTCA	2	12	37364	37375	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302669154
14	NC_014388	CATTTT	2	12	40186	40197	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	302669156
15	NC_014388	CTTTTT	2	12	46092	46103	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	302669160
16	NC_014388	ATTGAT	2	12	46548	46559	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302669160
17	NC_014388	TTGTGG	2	12	48323	48334	0 %	50 %	50 %	0 %	302669163
18	NC_014388	ATACAG	2	12	50619	50630	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302669164
19	NC_014388	AAAAAG	2	12	53181	53192	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	302669167
20	NC_014388	GAGGTG	2	12	54498	54509	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	302669167
21	NC_014388	GATTTA	2	12	58099	58110	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302669172
22	NC_014388	GCTGAA	2	12	59154	59165	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302669172
23	NC_014388	AGAAAA	2	12	62744	62755	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	302669174
24	NC_014388	TTGGAG	2	12	72749	72760	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	302669180
25	NC_014388	GAAAAA	2	12	79017	79028	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014388	AGATGC	2	12	82529	82540	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302669182
27	NC_014388	GCCTCC	2	12	86499	86510	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	302669184
28	NC_014388	GAAAAA	2	12	89295	89306	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	302669186
29	NC_014388	ATGGAT	2	12	89823	89834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302669186
30	NC_014388	ATTTTG	2	12	90295	90306	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	302669186
31	NC_014388	TTGCTC	2	12	95081	95092	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	302669190
32	NC_014388	GACCAA	2	12	97111	97122	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	302669192
33	NC_014388	AAACCA	2	12	101026	101037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302669198
34	NC_014388	ATGTAG	2	12	101964	101975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302669198
35	NC_014388	TGTGAG	2	12	106203	106214	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	302669206
36	NC_014388	TTTCTT	2	12	117532	117543	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	302669217
37	NC_014388	CGGGTA	2	12	120519	120530	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	302669219
38	NC_014388	GCTATG	2	12	121490	121501	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302669219
39	NC_014388	TAAATA	2	12	123475	123486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302669220
40	NC_014388	GAAACA	2	12	135080	135091	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	302669231
41	NC_014388	TTCCAG	2	12	136468	136479	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302669232
42	NC_014388	GCATTC	2	12	139534	139545	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302669234
43	NC_014388	TTGCTT	2	12	144427	144438	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014388	CAGAGG	2	12	147040	147051	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	302669243
45	NC_014388	ATGTAG	2	12	149357	149368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302669244
46	NC_014388	AAGTTA	2	12	165948	165959	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014388	GCAAAA	2	12	166492	166503	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	302669261
48	NC_014388	TCTGAA	2	12	166837	166848	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302669262
49	NC_014388	TCATAG	2	12	168275	168286	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302669265
50	NC_014388	CATTTT	2	12	168759	168770	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	302669265
51	NC_014388	GTGTCG	2	12	172525	172536	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	302669269
52	NC_014388	GCATAA	2	12	174471	174482	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302669270
53	NC_014388	AAAAGC	2	12	183701	183712	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014388	GCAATC	2	12	184041	184052	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	302669277
55	NC_014388	GTAATC	2	12	184283	184294	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302669277
56	NC_014388	GCTTTT	2	12	185894	185905	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	302669278
57	NC_014388	TTAAGA	2	12	186277	186288	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302669278
58	NC_014388	GACATA	2	12	191099	191110	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302669280
59	NC_014388	ATTAAT	2	12	192434	192445	50 %	50 %	0 %	0 %	302669281
60	NC_014388	ATTGTC	2	12	194435	194446	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302669282
61	NC_014388	TTCATA	2	12	198574	198585	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302669286
62	NC_014388	AATTGC	2	12	201636	201647	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302669290
63	NC_014388	AGATTC	2	12	204261	204272	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302669292
64	NC_014388	CAGATC	2	12	204515	204526	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	302669292
65	NC_014388	AAGAAA	2	12	205288	205299	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	302669293
66	NC_014388	TTTGTT	2	12	206818	206829	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014388	AATATT	2	12	213528	213539	50 %	50 %	0 %	0 %	302669307
68	NC_014388	TGTTCT	2	12	226263	226274	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	302669320
69	NC_014388	TCACAG	2	12	232225	232236	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	302669324
70	NC_014388	TTTTCT	2	12	233690	233701	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	302669325
71	NC_014388	GATGCA	2	12	236094	236105	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302669326
72	NC_014388	TCAGAA	2	12	239451	239462	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302669328
73	NC_014388	TTTTCT	2	12	240143	240154	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	302669329
74	NC_014388	ATTACC	2	12	241058	241069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302669329
75	NC_014388	TCATGA	2	12	244332	244343	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302669333
76	NC_014388	CGCAGA	2	12	246256	246267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302669334
77	NC_014388	TCCTGA	2	12	247618	247629	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302669334
78	NC_014388	TGTTTT	2	12	259769	259780	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	302669344
79	NC_014388	GCTTCA	2	12	261339	261350	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302669346
80	NC_014388	TCCGCT	2	12	263599	263610	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	302669349
81	NC_014388	AAATGT	2	12	264819	264830	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302669350
82	NC_014388	CAGTAA	2	12	270767	270778	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302669355
83	NC_014388	TAATGA	2	12	272201	272212	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302669356
84	NC_014388	TGATTG	2	12	275438	275449	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	302669360
85	NC_014388	GAAGTT	2	12	283104	283115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302669365
86	NC_014388	TATAGA	2	12	283288	283299	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302669365
87	NC_014388	TGTAGA	2	12	283625	283636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302669365
88	NC_014388	GCTAAG	2	12	283751	283762	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302669365
89	NC_014388	CAGTTG	2	12	283804	283815	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302669365
90	NC_014388	ATTTTT	2	12	284756	284767	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	302669365
91	NC_014388	TGTTAT	2	12	290826	290837	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014388	GGTGTT	2	12	291131	291142	0 %	50 %	50 %	0 %	302669369
93	NC_014388	AGATAT	2	12	294932	294943	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302669371
94	NC_014388	ATAGCC	2	12	295383	295394	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	302669371
95	NC_014388	TCTGCA	2	12	297584	297595	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302669372
96	NC_014388	GGATCA	2	12	298728	298739	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302669373
97	NC_014388	AAATAA	2	12	300322	300333	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014388	TCAAAA	2	12	300627	300638	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_014388	GATAAA	2	12	301569	301580	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.