MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Butyrivibrio proteoclasticus B316 chromosome 2

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014388	TTCTT	2	10	9060	9069	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014388	GTATT	2	10	11578	11587	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014388	ATAAA	2	10	26783	26792	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014388	CTGAA	2	10	34177	34186	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014388	TATAT	2	10	60040	60049	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014388	TCGTG	2	10	65024	65033	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014388	GGGAG	2	10	66459	66468	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014388	CCGTA	2	10	67527	67536	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_014388	AGAGG	2	10	67753	67762	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014388	TCGTG	2	10	74431	74440	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014388	GGGAG	2	10	75866	75875	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014388	CCGTA	2	10	76934	76943	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_014388	AGAGG	2	10	77160	77169	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014388	ATTAT	2	10	78988	78997	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014388	GAAGA	2	10	79071	79080	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014388	AAAGT	2	10	99769	99778	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014388	CTTTT	2	10	100583	100592	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014388	AAAAG	2	10	105809	105818	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014388	GAAAA	2	10	120367	120376	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014388	TGACA	2	10	137552	137561	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014388	ATGCC	2	10	137812	137821	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_014388	AGAAA	2	10	138688	138697	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014388	ATTTT	2	10	138917	138926	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014388	AAAAT	2	10	143005	143014	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014388	TCAAT	2	10	144884	144893	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014388	CTTTT	2	10	147976	147985	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014388	CAAAG	2	10	152760	152769	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014388	CTTTT	2	10	162130	162139	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014388	TCCAT	2	10	173318	173327	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_014388	ATTTT	2	10	180360	180369	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014388	CGCAG	2	10	193569	193578	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_014388	AAAAC	2	10	193593	193602	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014388	TATAA	2	10	198964	198973	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014388	TTCTC	2	10	199703	199712	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_014388	TGAAT	2	10	212804	212813	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014388	ATTCC	2	10	213952	213961	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_014388	TTTAT	2	10	216029	216038	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014388	AATCA	2	10	217450	217459	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014388	AGGGG	2	10	242796	242805	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014388	ACTAT	2	10	245215	245224	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014388	TATAA	2	10	259426	259435	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014388	TAGCG	2	10	264523	264532	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014388	ATAAG	2	10	271603	271612	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014388	AAATA	2	10	272725	272734	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014388	GCGGT	2	10	277480	277489	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014388	ATATT	2	10	300080	300089	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014388	AATAT	2	10	302227	302236	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.