MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Butyrivibrio proteoclasticus B316 chromosome 2

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014388	GGTT	2	8	2981	2988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014388	TAAA	2	8	9040	9047	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014388	ATTT	2	8	12845	12852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014388	AAAG	2	8	12971	12978	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014388	ATAA	2	8	14519	14526	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014388	CAAT	2	8	40783	40790	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014388	TGCA	2	8	41002	41009	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014388	AAAT	2	8	47248	47255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014388	TCAT	2	8	47330	47337	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014388	TGAA	2	8	54851	54858	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014388	AATA	2	8	55878	55885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014388	GTGA	2	8	64369	64376	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014388	CAAG	2	8	64544	64551	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014388	GCTT	2	8	64583	64590	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014388	AGTA	2	8	64823	64830	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014388	CTGA	2	8	65928	65935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014388	AAGG	2	8	66111	66118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014388	GCTT	2	8	66219	66226	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014388	GCCA	2	8	66282	66289	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014388	GAAG	2	8	67434	67441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014388	GGAC	2	8	68574	68581	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014388	AAGA	2	8	68815	68822	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014388	GTGA	2	8	73776	73783	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014388	CAAG	2	8	73951	73958	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014388	GCTT	2	8	73990	73997	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014388	AGTA	2	8	74230	74237	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014388	CTGA	2	8	75335	75342	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014388	AAGG	2	8	75518	75525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014388	GCTT	2	8	75626	75633	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014388	GCCA	2	8	75689	75696	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014388	GAAG	2	8	76841	76848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014388	GGAC	2	8	77981	77988	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014388	AAGA	2	8	78222	78229	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014388	TCTT	2	8	78604	78611	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014388	AAGA	2	8	79087	79094	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014388	TTAA	2	8	80835	80842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014388	CAAA	2	8	86953	86960	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014388	CTTT	2	8	91481	91488	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014388	GAAT	2	8	91556	91563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014388	GGCA	2	8	93284	93291	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014388	ATGA	2	8	93428	93435	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014388	GAAA	2	8	93494	93501	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014388	TCGT	2	8	95705	95712	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014388	CAGG	2	8	97737	97744	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014388	TGCT	2	8	100463	100470	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014388	TTAC	2	8	106513	106520	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014388	CCAA	2	8	106527	106534	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014388	TTTG	2	8	115540	115547	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014388	TTTA	3	12	116428	116439	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014388	CAAA	2	8	121675	121682	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014388	TTTG	2	8	121709	121716	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014388	GAAA	2	8	121727	121734	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014388	GAAA	2	8	121736	121743	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014388	TTTG	2	8	121848	121855	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014388	GATA	2	8	121862	121869	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014388	ATAA	2	8	131084	131091	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014388	AAAC	2	8	131092	131099	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014388	AGAA	2	8	131953	131960	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014388	ATTT	2	8	137676	137683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014388	TGGA	2	8	138078	138085	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014388	AAAG	2	8	138656	138663	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014388	AATT	2	8	141775	141782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014388	GAAT	2	8	144401	144408	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014388	ACAA	2	8	144451	144458	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014388	TTGA	2	8	144713	144720	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014388	CTTT	2	8	148185	148192	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014388	TTGA	2	8	151810	151817	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014388	ACAA	2	8	153834	153841	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014388	AGGA	2	8	159796	159803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014388	TTAT	2	8	162420	162427	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014388	AACA	2	8	162486	162493	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014388	CTAT	2	8	164821	164828	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014388	GCCT	2	8	169877	169884	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014388	GAAA	2	8	180375	180382	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014388	AAAT	2	8	181443	181450	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014388	CATT	2	8	191155	191162	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014388	AGCA	2	8	193585	193592	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014388	GATC	2	8	199762	199769	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014388	ATTT	2	8	200054	200061	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014388	AGAA	2	8	200518	200525	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014388	TATT	2	8	200759	200766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014388	ATTG	2	8	200998	201005	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014388	TGTC	2	8	203934	203941	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014388	TCAT	2	8	206097	206104	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014388	TTGT	2	8	208606	208613	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014388	TTCT	2	8	216299	216306	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014388	ATTA	2	8	227871	227878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014388	ATTA	2	8	231574	231581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014388	TAAA	2	8	238949	238956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014388	TTCT	2	8	242312	242319	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014388	TTGC	2	8	243596	243603	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_014388	CATT	2	8	244974	244981	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014388	TCCC	2	8	253193	253200	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
94	NC_014388	AATT	2	8	259464	259471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014388	AATT	2	8	264441	264448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014388	CTGT	2	8	264696	264703	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014388	GAAA	2	8	264747	264754	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014388	TTAG	2	8	278645	278652	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014388	AATT	2	8	286704	286711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014388	TTTA	2	8	286799	286806	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014388	TGCA	2	8	289781	289788	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014388	GAGG	2	8	292421	292428	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014388	CAAA	2	8	292739	292746	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014388	TGTT	2	8	292762	292769	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014388	TTTC	2	8	292888	292895	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014388	ATTA	2	8	292906	292913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014388	TATT	2	8	298965	298972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014388	TAAT	2	8	299163	299170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014388	TTAT	2	8	299342	299349	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014388	TATT	2	8	299756	299763	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014388	ATTA	2	8	300093	300100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014388	TAAA	2	8	300131	300138	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014388	TAAT	2	8	300365	300372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014388	GTTT	2	8	300409	300416	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014388	GAAT	2	8	300521	300528	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014388	TAAT	2	8	300603	300610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014388	AAAT	2	8	300645	300652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014388	AATT	2	8	300707	300714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014388	TAAT	2	8	300891	300898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014388	AATT	2	8	300942	300949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014388	ACAT	2	8	300988	300995	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014388	TAAA	2	8	301006	301013	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014388	ATAA	2	8	301140	301147	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014388	AATA	2	8	301514	301521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014388	GAAA	2	8	301678	301685	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014388	ATAA	2	8	301787	301794	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014388	TAAA	2	8	302245	302252	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.