MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Butyrivibrio proteoclasticus B316 chromosome 1

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014387	ATGCAA	2	12	59922	59933	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014387	CAAAAA	2	12	97576	97587	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014387	TTATAA	2	12	123652	123663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014387	TAAAAT	2	12	133136	133147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014387	GTCAAA	2	12	137796	137807	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014387	GTTTTT	2	12	144373	144384	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014387	CATAAA	2	12	144772	144783	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014387	TTGGTT	2	12	190398	190409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014387	ACTGAT	2	12	199507	199518	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014387	AAGGGG	2	12	301161	301172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014387	TACATA	2	12	364979	364990	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014387	AGTAAT	2	12	366798	366809	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014387	AGAAAA	2	12	428112	428123	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014387	CAAGAG	2	12	498387	498398	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014387	CAATGA	2	12	610575	610586	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014387	GATATA	2	12	766881	766892	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014387	TTAACA	2	12	771715	771726	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014387	AGATAA	2	12	795054	795065	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014387	TCATTT	2	12	926582	926593	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014387	ATAAAA	2	12	1008874	1008885	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014387	TACATT	2	12	1047198	1047209	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014387	GGGATA	2	12	1076098	1076109	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014387	AGAATT	2	12	1099567	1099578	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014387	AAAGAA	2	12	1101775	1101786	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014387	TGAAAT	2	12	1149148	1149159	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014387	TGAAAT	2	12	1162241	1162252	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014387	TTTTGC	2	12	1200827	1200838	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014387	TAAAAT	2	12	1244289	1244300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014387	GATATC	2	12	1251970	1251981	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014387	TGCGCA	2	12	1305295	1305306	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014387	ATAGGA	2	12	1333675	1333686	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014387	GAATAT	2	12	1363658	1363669	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014387	AGTACT	2	12	1379182	1379193	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014387	AAAAAT	2	12	1454356	1454367	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014387	ATAATT	2	12	1497743	1497754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014387	AAATTA	2	12	1616132	1616143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014387	TTATAT	2	12	1654717	1654728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014387	TTTTCT	2	12	1656034	1656045	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014387	TGTCAC	2	12	1660207	1660218	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014387	AGTAAT	2	12	1757207	1757218	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014387	TATCTA	2	12	1765080	1765091	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014387	TTTGAA	2	12	1799581	1799592	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014387	CATCCT	2	12	1944135	1944146	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014387	CATATA	2	12	1996847	1996858	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014387	GTTTTT	2	12	2054069	2054080	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014387	TTCAAT	2	12	2055099	2055110	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014387	ATATTT	2	12	2065854	2065865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014387	AATCTT	2	12	2081062	2081073	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014387	GTTTAT	2	12	2162856	2162867	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014387	TTTATT	2	12	2231650	2231661	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014387	ATAGTC	2	12	2238256	2238267	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014387	ACCACT	2	12	2266984	2266995	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014387	CTTTTT	2	12	2289410	2289421	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014387	TTATAT	2	12	2327380	2327391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014387	TTTTTC	2	12	2327420	2327431	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014387	GCCTTT	2	12	2342204	2342215	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014387	TTTTTA	2	12	2398976	2398987	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014387	TGTCCG	2	12	2463603	2463614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014387	CCTATA	2	12	2471552	2471563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014387	AATTTT	2	12	2511174	2511185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014387	TAGATT	2	12	2513066	2513077	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014387	TCACTT	2	12	2529666	2529677	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014387	TCATTT	2	12	2544941	2544952	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014387	AATCAA	2	12	2556039	2556050	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014387	TTTGTT	2	12	2602472	2602483	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014387	TTTCTC	2	12	2655224	2655235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014387	GATTTC	2	12	2732906	2732917	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014387	TATGCT	2	12	2788591	2788602	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_014387	GTATCA	2	12	2832231	2832242	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014387	ATTTTT	2	12	2898583	2898594	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014387	CTTTTG	2	12	2898889	2898900	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014387	ATTGTT	2	12	2931737	2931748	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014387	TTTTTA	2	12	2991151	2991162	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014387	ACTATT	2	12	2999519	2999530	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014387	CTATAT	2	12	3005927	3005938	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014387	TATCTT	2	12	3025941	3025952	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014387	TCATTT	2	12	3058426	3058437	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014387	TCATTT	2	12	3074705	3074716	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014387	AAATCA	2	12	3152438	3152449	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014387	AACAGT	2	12	3202738	3202749	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_014387	ATTTGT	2	12	3214436	3214447	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014387	TCCGCA	2	12	3242477	3242488	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014387	ATATAA	2	12	3326869	3326880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014387	TTCATA	2	12	3411672	3411683	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014387	ATGAAA	2	12	3428986	3428997	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014387	TTATAA	2	12	3430649	3430660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014387	CATTTT	2	12	3448356	3448367	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014387	TTCTCT	2	12	3456879	3456890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014387	TATTTA	2	12	3501760	3501771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014387	TTATAA	2	12	3518841	3518852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014387	AAAACT	2	12	3546706	3546717	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014387	ACTAAT	2	12	3551159	3551170	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014387	TATAAT	2	12	3554356	3554367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.