MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Acetohalobium arabaticum DSM 5501 chromosome

Total Repeats: 1164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014378	CAGAAG	2	12	1402	1413	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	302390798
2	NC_014378	AGAATT	2	12	2217	2228	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302390799
3	NC_014378	AATTTA	2	12	4470	4481	50 %	50 %	0 %	0 %	302390802
4	NC_014378	GGAGTA	2	12	5994	6005	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	302390804
5	NC_014378	TAGAAG	2	12	6034	6045	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302390804
6	NC_014378	CTGATG	2	12	7135	7146	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302390804
7	NC_014378	CAAAGT	2	12	8301	8312	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302390805
8	NC_014378	AGGCTA	2	12	8843	8854	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302390805
9	NC_014378	TGAAGA	2	12	9996	10007	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302390805
10	NC_014378	CTGGAG	2	12	15057	15068	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014378	AAAGTA	2	12	16186	16197	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	302390806
12	NC_014378	TGTAAA	2	12	16203	16214	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302390806
13	NC_014378	TCTAAA	2	12	17162	17173	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	302390807
14	NC_014378	AATACT	2	12	17801	17812	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014378	GCTTCT	2	12	20590	20601	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	302390811
16	NC_014378	ACTATT	2	12	23558	23569	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014378	TTCAAA	2	12	24109	24120	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	302390814
18	NC_014378	TCAGAA	2	12	24362	24373	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302390815
19	NC_014378	ATCTTT	2	12	25692	25703	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	302390819
20	NC_014378	AGTATG	2	12	27913	27924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390823
21	NC_014378	TGTAGA	2	12	28263	28274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390823
22	NC_014378	TTGGAG	2	12	29886	29897	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	302390824
23	NC_014378	TGAAGA	2	12	37765	37776	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302390832
24	NC_014378	ACTGCT	2	12	38137	38148	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302390833
25	NC_014378	TTCATC	2	12	40144	40155	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	302390835
26	NC_014378	AGCTGA	2	12	46445	46456	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302390841
27	NC_014378	TTTGCT	2	12	48332	48343	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	302390844
28	NC_014378	ATTATA	2	12	48990	49001	50 %	50 %	0 %	0 %	302390844
29	NC_014378	TGAAGA	2	12	49914	49925	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302390846
30	NC_014378	TTCTGG	2	12	52670	52681	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	302390849
31	NC_014378	GCTGAA	2	12	55929	55940	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302390850
32	NC_014378	TCTGGT	2	12	61790	61801	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	302390857
33	NC_014378	CGGCCG	2	12	64457	64468	0 %	0 %	50 %	50 %	302390859
34	NC_014378	CGTGAT	2	12	65323	65334	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302390860
35	NC_014378	AATCTT	2	12	66574	66585	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302390862
36	NC_014378	ATTGAT	2	12	66667	66678	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302390862
37	NC_014378	TATAGA	2	12	68190	68201	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014378	TGCTGG	2	12	70732	70743	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	302390864
39	NC_014378	AATTCC	2	12	76368	76379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390869
40	NC_014378	ATCCAC	2	12	77143	77154	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	302390869
41	NC_014378	CCTTCA	2	12	77266	77277	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	302390869
42	NC_014378	TCACAA	2	12	77609	77620	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014378	TTAAGA	2	12	79159	79170	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302390871
44	NC_014378	CTTCAG	2	12	80658	80669	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302390873
45	NC_014378	GTTAGT	2	12	81267	81278	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	302390874
46	NC_014378	ACCTTT	2	12	81726	81737	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	302390874
47	NC_014378	TAATGT	2	12	82004	82015	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302390874
48	NC_014378	CTACTT	2	12	84685	84696	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	302390876
49	NC_014378	TTTAAA	2	12	85072	85083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014378	GGAAAA	2	12	89807	89818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390881
51	NC_014378	TGATAA	2	12	92299	92310	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302390883
52	NC_014378	CTTGAT	2	12	94707	94718	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302390885
53	NC_014378	GATGAA	2	12	94722	94733	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302390885
54	NC_014378	TGAAAT	2	12	95708	95719	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302390887
55	NC_014378	TTGATT	2	12	96292	96303	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	302390888
56	NC_014378	GCTTAT	2	12	98679	98690	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302390888
57	NC_014378	CCAGAA	2	12	101893	101904	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	302390891
58	NC_014378	TTATTT	2	12	115460	115471	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014378	GCTTTA	2	12	116176	116187	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302390904
60	NC_014378	AGATTT	2	12	118908	118919	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302390905
61	NC_014378	CTTTAG	2	12	121749	121760	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302390907
62	NC_014378	TGAAAT	2	12	122520	122531	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302390908
63	NC_014378	TTGATG	2	12	124076	124087	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	302390908
64	NC_014378	AATACT	2	12	128434	128445	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	302390914
65	NC_014378	GATTAT	2	12	134892	134903	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302390919
66	NC_014378	TTCAAA	2	12	136161	136172	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	302390921
67	NC_014378	CTGGAG	2	12	142242	142253	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014378	AACTTA	2	12	143078	143089	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_014378	TATTTT	2	12	143956	143967	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014378	AGAAGG	2	12	146474	146485	50 %	0 %	50 %	0 %	302390927
71	NC_014378	TTAGAG	2	12	148512	148523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390927
72	NC_014378	AGAAAA	2	12	149066	149077	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	302390928
73	NC_014378	AATTTC	2	12	150674	150685	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302390929
74	NC_014378	AAGATA	2	12	151930	151941	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	302390930
75	NC_014378	AATTAT	2	12	153205	153216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014378	TATAAT	2	12	153519	153530	50 %	50 %	0 %	0 %	302390932
77	NC_014378	CTGATG	2	12	154104	154115	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302390933
78	NC_014378	ATGGCT	2	12	154956	154967	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302390934
79	NC_014378	TATGTT	2	12	156170	156181	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	302390935
80	NC_014378	ATTGAA	2	12	158090	158101	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302390937
81	NC_014378	AATTCC	2	12	159551	159562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390938
82	NC_014378	ATTTAG	2	12	161674	161685	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302390941
83	NC_014378	TTTAAG	2	12	162210	162221	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302390941
84	NC_014378	TTTATT	2	12	163570	163581	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014378	AGGTTA	2	12	165562	165573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390946
86	NC_014378	GTCGGG	2	12	172854	172865	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	302390952
87	NC_014378	TTTGAA	2	12	175106	175117	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302390952
88	NC_014378	AATTAC	2	12	176735	176746	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	302390955
89	NC_014378	ATTGAA	2	12	178083	178094	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302390955
90	NC_014378	TAAAGG	2	12	180649	180660	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302390958
91	NC_014378	CAGATT	2	12	183728	183739	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302390964
92	NC_014378	GGTTAT	2	12	185516	185527	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	302390969
93	NC_014378	TACCAT	2	12	187207	187218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390973
94	NC_014378	GAATTG	2	12	187319	187330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390973
95	NC_014378	GAACCT	2	12	187520	187531	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	302390973
96	NC_014378	GAATTA	2	12	188034	188045	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302390975
97	NC_014378	TTTAGT	2	12	188103	188114	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	302390975
98	NC_014378	AAACGT	2	12	188596	188607	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302390976
99	NC_014378	TGAAGT	2	12	193407	193418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390984
100	NC_014378	TAATAT	2	12	198490	198501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014378	TAGCTG	2	12	205954	205965	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302390998
102	NC_014378	AAATAG	2	12	206324	206335	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	302390998
103	NC_014378	TTAAAA	2	12	206559	206570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014378	GGCCCA	2	12	209798	209809	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	302391000
105	NC_014378	AGAACA	2	12	212923	212934	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	302391001
106	NC_014378	TAGATG	2	12	215344	215355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391004
107	NC_014378	AGTAGC	2	12	220244	220255	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302391008
108	NC_014378	CTGAAG	2	12	220362	220373	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302391008
109	NC_014378	GAAGGA	2	12	220905	220916	50 %	0 %	50 %	0 %	302391008
110	NC_014378	TTGGAG	2	12	221825	221836	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	302391009
111	NC_014378	GTTTTA	2	12	222161	222172	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	302391009
112	NC_014378	TTTTTA	2	12	224322	224333	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	302391011
113	NC_014378	AATTTT	2	12	225063	225074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391012
114	NC_014378	ATTTAC	2	12	228688	228699	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302391015
115	NC_014378	TATGAG	2	12	231701	231712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391017
116	NC_014378	TTTTAA	2	12	231917	231928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391018
117	NC_014378	CTTGGC	2	12	232650	232661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302391018
118	NC_014378	TTATAA	2	12	234723	234734	50 %	50 %	0 %	0 %	302391021
119	NC_014378	AAGGCC	2	12	236413	236424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014378	TAATCT	2	12	236661	236672	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_014378	TAGAAG	2	12	237723	237734	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302391022
122	NC_014378	AGTAGC	2	12	241843	241854	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302391025
123	NC_014378	AGTGGA	2	12	242213	242224	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	302391026
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142	NC_014378	GTAAAG	2	12	285718	285729	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014378	TTAAAA	2	12	286123	286134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014378	TGATTA	2	12	286682	286693	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302391062
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150	NC_014378	TCTTTT	2	12	291742	291753	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_014378	TAGGAT	2	12	292119	292130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391067
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224	NC_014378	TTAATA	2	12	449845	449856	50 %	50 %	0 %	0 %	302391199
225	NC_014378	TGTGAT	2	12	453133	453144	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	302391203
226	NC_014378	AGAAGG	2	12	453693	453704	50 %	0 %	50 %	0 %	302391203
227	NC_014378	GCAACA	2	12	457602	457613	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	302391205
228	NC_014378	CTTTAT	2	12	461484	461495	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	302391210
229	NC_014378	CCGCAT	2	12	462903	462914	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	302391211
230	NC_014378	GGTAAT	2	12	466424	466435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391215
231	NC_014378	GATAGA	2	12	468964	468975	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302391218
232	NC_014378	CTGGAA	2	12	479951	479962	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302391232
233	NC_014378	TCTAAT	2	12	480022	480033	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302391232
234	NC_014378	ATTGAT	2	12	481084	481095	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302391232
235	NC_014378	ATAAAA	2	12	481931	481942	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
236	NC_014378	TCAGGT	2	12	483841	483852	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302391234
237	NC_014378	TAGCTG	2	12	484523	484534	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302391234
238	NC_014378	AATAGG	2	12	491233	491244	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302391240
239	NC_014378	ATAATC	2	12	492324	492335	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
240	NC_014378	TAGTAT	2	12	493733	493744	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302391241
241	NC_014378	GATAAC	2	12	494679	494690	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302391242
242	NC_014378	AGTAGC	2	12	495255	495266	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302391243
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247	NC_014378	ATTTTA	2	12	507795	507806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391256
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266	NC_014378	AGGTTG	2	12	541200	541211	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	302391289
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337	NC_014378	TTAATA	2	12	689753	689764	50 %	50 %	0 %	0 %	302391424
338	NC_014378	TTAAGG	2	12	689936	689947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391424
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348	NC_014378	TACTGA	2	12	707207	707218	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302391435
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350	NC_014378	TACATA	2	12	708671	708682	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	302391437
351	NC_014378	AAGGAA	2	12	708925	708936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302391437
352	NC_014378	AAAGTT	2	12	710399	710410	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302391438
353	NC_014378	AAAGAA	2	12	711206	711217	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	302391438
354	NC_014378	AAATTA	2	12	712422	712433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302391439
355	NC_014378	TTAAGA	2	12	712530	712541	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302391439
356	NC_014378	TTATGA	2	12	714596	714607	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
357	NC_014378	TTTAAA	2	12	714642	714653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
358	NC_014378	TGCTAG	2	12	714885	714896	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302391441
359	NC_014378	AATCAA	2	12	715480	715491	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	302391441
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361	NC_014378	ACTTTA	2	12	722098	722109	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302391448
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363	NC_014378	AATCAG	2	12	726102	726113	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302391451
364	NC_014378	TGTCTT	2	12	727448	727459	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	302391454
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371	NC_014378	AATTGG	2	12	748468	748479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391472
372	NC_014378	CTTTTT	2	12	751574	751585	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
373	NC_014378	GATCGG	2	12	752397	752408	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	302391475
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376	NC_014378	AATTGA	2	12	759502	759513	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302391481
377	NC_014378	GATATA	2	12	761171	761182	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302391483
378	NC_014378	ACCTGA	2	12	762274	762285	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	302391483
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380	NC_014378	AGAAGT	2	12	763974	763985	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302391485
381	NC_014378	TGATAT	2	12	767062	767073	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
382	NC_014378	TGCCGC	2	12	767888	767899	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	302391490
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399	NC_014378	ATCTTA	2	12	804854	804865	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
400	NC_014378	GAAATT	2	12	807196	807207	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302391524
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419	NC_014378	ATCCTG	2	12	829379	829390	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302391543
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422	NC_014378	GGATAG	2	12	837014	837025	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
423	NC_014378	TTAAAT	2	12	842536	842547	50 %	50 %	0 %	0 %	302391555
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441	NC_014378	GCTACA	2	12	885585	885596	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	302391597
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451	NC_014378	CGCTAC	2	12	911633	911644	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	302391622
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453	NC_014378	CATTAA	2	12	914779	914790	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	302391625
454	NC_014378	CTGTAA	2	12	914960	914971	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302391626
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462	NC_014378	TGATAT	2	12	942072	942083	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302391650
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464	NC_014378	TAACTT	2	12	946982	946993	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302391653
465	NC_014378	CGCGGC	2	12	951192	951203	0 %	0 %	50 %	50 %	302391658
466	NC_014378	GTTAAA	2	12	952209	952220	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302391660
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468	NC_014378	CTATTG	2	12	965422	965433	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302391674
469	NC_014378	ATACCA	2	12	966689	966700	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	302391675
470	NC_014378	GATAAG	2	12	972102	972113	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302391678
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472	NC_014378	TAACAT	2	12	980946	980957	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
473	NC_014378	GTTTTA	2	12	980961	980972	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
474	NC_014378	GGATAG	2	12	984778	984789	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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479	NC_014378	TTAAAT	2	12	992091	992102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
480	NC_014378	TGCTGT	2	12	996275	996286	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	302391699
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489	NC_014378	TAAAGA	2	12	1027273	1027284	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	302391730
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497	NC_014378	CTATAC	2	12	1045737	1045748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302391744
498	NC_014378	AGCTGA	2	12	1049119	1049130	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302391745
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