MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetohalobium arabaticum DSM 5501 chromosome

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014378	CTGGAG	2	12	15057	15068	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014378	AATACT	2	12	17801	17812	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014378	ACTATT	2	12	23558	23569	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014378	TATAGA	2	12	68190	68201	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014378	TCACAA	2	12	77609	77620	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014378	TTTAAA	2	12	85072	85083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014378	TTATTT	2	12	115460	115471	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014378	CTGGAG	2	12	142242	142253	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014378	AACTTA	2	12	143078	143089	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014378	TATTTT	2	12	143956	143967	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014378	AATTAT	2	12	153205	153216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014378	TTTATT	2	12	163570	163581	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014378	TAATAT	2	12	198490	198501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014378	TTAAAA	2	12	206559	206570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014378	AAGGCC	2	12	236413	236424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014378	TAATCT	2	12	236661	236672	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014378	GTAAAG	2	12	285718	285729	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014378	TTAAAA	2	12	286123	286134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014378	TATAAT	2	12	290857	290868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014378	TCTTTT	2	12	291742	291753	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014378	GATTTT	2	12	328451	328462	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014378	TATTTT	2	12	347310	347321	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014378	TTTCTG	2	12	413892	413903	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014378	CTGGAG	2	12	437874	437885	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014378	ATAAAA	2	12	481931	481942	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014378	ATAATC	2	12	492324	492335	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014378	CCTTTC	2	12	507593	507604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014378	AATTAA	2	12	516612	516623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014378	GATAAT	2	12	520114	520125	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014378	TAATGA	2	12	540446	540457	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014378	TAAAAT	2	12	571878	571889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014378	ATCTAG	2	12	576858	576869	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014378	TGCTAG	2	12	578802	578813	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014378	ATGGTA	2	12	580194	580205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014378	TAAAAA	2	12	642263	642274	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014378	AGTCAA	2	12	654467	654478	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014378	TTTGGC	2	12	654485	654496	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014378	AAAGAT	2	12	677961	677972	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014378	TTATGA	2	12	714596	714607	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014378	TTTAAA	2	12	714642	714653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014378	CTTTTT	2	12	751574	751585	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014378	ATATTT	2	12	757123	757134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014378	TGATAT	2	12	767062	767073	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014378	TAATTT	2	12	792985	792996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014378	CTGGAG	2	12	799945	799956	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014378	ATCTTA	2	12	804854	804865	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014378	GGATAG	2	12	837014	837025	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014378	TGAATT	2	12	846797	846808	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014378	TTTTTA	2	12	850977	850988	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014378	ATTTGA	2	12	880531	880542	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014378	TAACAT	2	12	980946	980957	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014378	GTTTTA	2	12	980961	980972	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014378	GGATAG	2	12	984778	984789	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014378	TTAAAT	2	12	992091	992102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014378	TGCTAG	2	12	1074841	1074852	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014378	TTTGAA	2	12	1081781	1081792	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014378	TAAATT	2	12	1085101	1085112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014378	ATGATT	2	12	1103284	1103295	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014378	TTTGGA	2	12	1200573	1200584	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014378	ACTAAA	2	12	1212644	1212655	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014378	AATTTA	2	12	1233916	1233927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014378	TTCTTT	2	12	1235957	1235968	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014378	TAAAAA	2	12	1264022	1264033	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014378	AATAAA	2	12	1266132	1266143	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014378	TCATTA	2	12	1288062	1288073	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014378	CAAAAA	2	12	1288262	1288273	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014378	ATAATG	2	12	1298989	1299000	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014378	TTTATA	2	12	1308124	1308135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014378	AGGAAT	2	12	1351064	1351075	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014378	AAAATT	2	12	1356870	1356881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014378	AAAGGA	2	12	1364106	1364117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014378	ATATTT	2	12	1395009	1395020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014378	TATTTT	2	12	1417405	1417416	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014378	GCTCCA	2	12	1420948	1420959	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014378	TTCAAA	2	12	1432623	1432634	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014378	TCCCCT	2	12	1440178	1440189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_014378	TTAAAA	2	12	1440724	1440735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014378	TCAGTT	2	12	1471778	1471789	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014378	AATATA	2	12	1558555	1558566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014378	TTAATT	2	12	1573302	1573313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014378	AATTTT	2	12	1614543	1614554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014378	ACAAAA	2	12	1621591	1621602	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014378	CCCTTC	2	12	1623786	1623797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_014378	TATACT	2	12	1626955	1626966	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014378	ATTATA	2	12	1652405	1652416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014378	CCATTA	2	12	1728670	1728681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014378	TTCTAG	2	12	1744829	1744840	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014378	CTTTAG	2	12	1756847	1756858	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014378	TGAATA	2	12	1809491	1809502	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014378	TTTTAT	2	12	1821664	1821675	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014378	AATATA	2	12	1863658	1863669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014378	ATTTTT	2	12	1888174	1888185	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014378	TAAAAA	2	12	1889263	1889274	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014378	AAGAAA	2	12	1902520	1902531	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014378	TTAAAG	2	12	1903866	1903877	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014378	GTGTTA	2	12	1918833	1918844	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014378	AAAGTA	2	12	1930414	1930425	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014378	GAAAAA	2	12	2005716	2005727	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014378	TCTTAA	2	12	2011557	2011568	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014378	AAAGAA	2	12	2013146	2013157	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014378	AATTAA	2	12	2021515	2021526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014378	AATATA	2	12	2032420	2032431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014378	CTAGCA	2	12	2079192	2079203	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014378	TAATAC	2	12	2092589	2092600	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014378	TGCTAG	2	12	2137086	2137097	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_014378	TTTAGC	2	12	2138479	2138490	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014378	TTTTAA	2	12	2147558	2147569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014378	TTAAAA	2	12	2162889	2162900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014378	TTACTA	2	12	2204594	2204605	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_014378	AGTTAA	2	12	2211394	2211405	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014378	TTAAGA	2	12	2222504	2222515	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014378	TGCATC	2	12	2258616	2258627	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014378	CATATT	2	12	2258638	2258649	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_014378	CAATAT	2	12	2259055	2259066	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014378	TACTAT	2	12	2339161	2339172	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_014378	CTTTTA	2	12	2371531	2371542	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_014378	TTCAAA	2	12	2377712	2377723	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014378	AATACA	2	12	2393355	2393366	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_014378	CTTTTT	2	12	2410037	2410048	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.