MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acetohalobium arabaticum DSM 5501 chromosome

Total Repeats: 1045

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014378	CAGAAG	2	12	1402	1413	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	302390798
2	NC_014378	AGAATT	2	12	2217	2228	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302390799
3	NC_014378	AATTTA	2	12	4470	4481	50 %	50 %	0 %	0 %	302390802
4	NC_014378	GGAGTA	2	12	5994	6005	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	302390804
5	NC_014378	TAGAAG	2	12	6034	6045	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302390804
6	NC_014378	CTGATG	2	12	7135	7146	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302390804
7	NC_014378	CAAAGT	2	12	8301	8312	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302390805
8	NC_014378	AGGCTA	2	12	8843	8854	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302390805
9	NC_014378	TGAAGA	2	12	9996	10007	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302390805
10	NC_014378	AAAGTA	2	12	16186	16197	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	302390806
11	NC_014378	TGTAAA	2	12	16203	16214	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302390806
12	NC_014378	TCTAAA	2	12	17162	17173	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	302390807
13	NC_014378	GCTTCT	2	12	20590	20601	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	302390811
14	NC_014378	TTCAAA	2	12	24109	24120	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	302390814
15	NC_014378	TCAGAA	2	12	24362	24373	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302390815
16	NC_014378	ATCTTT	2	12	25692	25703	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	302390819
17	NC_014378	AGTATG	2	12	27913	27924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390823
18	NC_014378	TGTAGA	2	12	28263	28274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390823
19	NC_014378	TTGGAG	2	12	29886	29897	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	302390824
20	NC_014378	TGAAGA	2	12	37765	37776	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302390832
21	NC_014378	ACTGCT	2	12	38137	38148	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302390833
22	NC_014378	TTCATC	2	12	40144	40155	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	302390835
23	NC_014378	AGCTGA	2	12	46445	46456	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302390841
24	NC_014378	TTTGCT	2	12	48332	48343	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	302390844
25	NC_014378	ATTATA	2	12	48990	49001	50 %	50 %	0 %	0 %	302390844
26	NC_014378	TGAAGA	2	12	49914	49925	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302390846
27	NC_014378	TTCTGG	2	12	52670	52681	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	302390849
28	NC_014378	GCTGAA	2	12	55929	55940	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302390850
29	NC_014378	TCTGGT	2	12	61790	61801	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	302390857
30	NC_014378	CGGCCG	2	12	64457	64468	0 %	0 %	50 %	50 %	302390859
31	NC_014378	CGTGAT	2	12	65323	65334	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302390860
32	NC_014378	AATCTT	2	12	66574	66585	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302390862
33	NC_014378	ATTGAT	2	12	66667	66678	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302390862
34	NC_014378	TGCTGG	2	12	70732	70743	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	302390864
35	NC_014378	AATTCC	2	12	76368	76379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390869
36	NC_014378	ATCCAC	2	12	77143	77154	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	302390869
37	NC_014378	CCTTCA	2	12	77266	77277	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	302390869
38	NC_014378	TTAAGA	2	12	79159	79170	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302390871
39	NC_014378	CTTCAG	2	12	80658	80669	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302390873
40	NC_014378	GTTAGT	2	12	81267	81278	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	302390874
41	NC_014378	ACCTTT	2	12	81726	81737	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	302390874
42	NC_014378	TAATGT	2	12	82004	82015	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302390874
43	NC_014378	CTACTT	2	12	84685	84696	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	302390876
44	NC_014378	GGAAAA	2	12	89807	89818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390881
45	NC_014378	TGATAA	2	12	92299	92310	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302390883
46	NC_014378	CTTGAT	2	12	94707	94718	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302390885
47	NC_014378	GATGAA	2	12	94722	94733	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302390885
48	NC_014378	TGAAAT	2	12	95708	95719	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302390887
49	NC_014378	TTGATT	2	12	96292	96303	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	302390888
50	NC_014378	GCTTAT	2	12	98679	98690	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302390888
51	NC_014378	CCAGAA	2	12	101893	101904	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	302390891
52	NC_014378	GCTTTA	2	12	116176	116187	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302390904
53	NC_014378	AGATTT	2	12	118908	118919	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302390905
54	NC_014378	CTTTAG	2	12	121749	121760	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302390907
55	NC_014378	TGAAAT	2	12	122520	122531	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302390908
56	NC_014378	TTGATG	2	12	124076	124087	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	302390908
57	NC_014378	AATACT	2	12	128434	128445	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	302390914
58	NC_014378	GATTAT	2	12	134892	134903	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302390919
59	NC_014378	TTCAAA	2	12	136161	136172	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	302390921
60	NC_014378	AGAAGG	2	12	146474	146485	50 %	0 %	50 %	0 %	302390927
61	NC_014378	TTAGAG	2	12	148512	148523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390927
62	NC_014378	AGAAAA	2	12	149066	149077	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	302390928
63	NC_014378	AATTTC	2	12	150674	150685	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302390929
64	NC_014378	AAGATA	2	12	151930	151941	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	302390930
65	NC_014378	TATAAT	2	12	153519	153530	50 %	50 %	0 %	0 %	302390932
66	NC_014378	CTGATG	2	12	154104	154115	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302390933
67	NC_014378	ATGGCT	2	12	154956	154967	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302390934
68	NC_014378	TATGTT	2	12	156170	156181	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	302390935
69	NC_014378	ATTGAA	2	12	158090	158101	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302390937
70	NC_014378	AATTCC	2	12	159551	159562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390938
71	NC_014378	ATTTAG	2	12	161674	161685	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302390941
72	NC_014378	TTTAAG	2	12	162210	162221	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302390941
73	NC_014378	AGGTTA	2	12	165562	165573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390946
74	NC_014378	GTCGGG	2	12	172854	172865	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	302390952
75	NC_014378	TTTGAA	2	12	175106	175117	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302390952
76	NC_014378	AATTAC	2	12	176735	176746	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	302390955
77	NC_014378	ATTGAA	2	12	178083	178094	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302390955
78	NC_014378	TAAAGG	2	12	180649	180660	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302390958
79	NC_014378	CAGATT	2	12	183728	183739	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302390964
80	NC_014378	GGTTAT	2	12	185516	185527	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	302390969
81	NC_014378	TACCAT	2	12	187207	187218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390973
82	NC_014378	GAATTG	2	12	187319	187330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390973
83	NC_014378	GAACCT	2	12	187520	187531	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	302390973
84	NC_014378	GAATTA	2	12	188034	188045	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302390975
85	NC_014378	TTTAGT	2	12	188103	188114	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	302390975
86	NC_014378	AAACGT	2	12	188596	188607	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302390976
87	NC_014378	TGAAGT	2	12	193407	193418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390984
88	NC_014378	TAGCTG	2	12	205954	205965	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302390998
89	NC_014378	AAATAG	2	12	206324	206335	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	302390998
90	NC_014378	GGCCCA	2	12	209798	209809	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	302391000
91	NC_014378	AGAACA	2	12	212923	212934	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	302391001
92	NC_014378	TAGATG	2	12	215344	215355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391004
93	NC_014378	AGTAGC	2	12	220244	220255	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302391008
94	NC_014378	CTGAAG	2	12	220362	220373	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302391008
95	NC_014378	GAAGGA	2	12	220905	220916	50 %	0 %	50 %	0 %	302391008
96	NC_014378	TTGGAG	2	12	221825	221836	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	302391009
97	NC_014378	GTTTTA	2	12	222161	222172	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	302391009
98	NC_014378	TTTTTA	2	12	224322	224333	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	302391011
99	NC_014378	AATTTT	2	12	225063	225074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391012
100	NC_014378	ATTTAC	2	12	228688	228699	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302391015
101	NC_014378	TATGAG	2	12	231701	231712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391017
102	NC_014378	TTTTAA	2	12	231917	231928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391018
103	NC_014378	CTTGGC	2	12	232650	232661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302391018
104	NC_014378	TTATAA	2	12	234723	234734	50 %	50 %	0 %	0 %	302391021
105	NC_014378	TAGAAG	2	12	237723	237734	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302391022
106	NC_014378	AGTAGC	2	12	241843	241854	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302391025
107	NC_014378	AGTGGA	2	12	242213	242224	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	302391026
108	NC_014378	GAAGGT	2	12	243769	243780	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	302391028
109	NC_014378	GATGGA	2	12	245325	245336	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	302391029
110	NC_014378	TTGATC	2	12	245929	245940	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302391030
111	NC_014378	ACAATT	2	12	247207	247218	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	302391031
112	NC_014378	GATTAA	2	12	248770	248781	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302391032
113	NC_014378	TAGCTG	2	12	249037	249048	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302391033
114	NC_014378	GCTTTA	2	12	259786	259797	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302391042
115	NC_014378	GGATGA	2	12	261056	261067	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	302391044
116	NC_014378	GATATT	2	12	263492	263503	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302391047
117	NC_014378	TACTGT	2	12	265291	265302	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302391048
118	NC_014378	AATTAA	2	12	266814	266825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302391049
119	NC_014378	AGAAAA	2	12	271588	271599	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	302391051
120	NC_014378	GATTAT	2	12	275402	275413	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302391056
121	NC_014378	AGATTG	2	12	276402	276413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391057
122	NC_014378	ACTTTA	2	12	276429	276440	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302391057
123	NC_014378	TGATTC	2	12	276943	276954	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302391057
124	NC_014378	AAGATA	2	12	277407	277418	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	302391057
125	NC_014378	GAATCT	2	12	280217	280228	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302391057
126	NC_014378	TGATTA	2	12	286682	286693	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302391062
127	NC_014378	GGTTAT	2	12	287417	287428	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	302391064
128	NC_014378	ACGCGG	2	12	287741	287752	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	302391064
129	NC_014378	GAAGTT	2	12	289129	289140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391065
130	NC_014378	TGAAGA	2	12	289251	289262	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302391065
131	NC_014378	TAGGAT	2	12	292119	292130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391067
132	NC_014378	TTGATA	2	12	294856	294867	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302391070
133	NC_014378	TCCTTG	2	12	296573	296584	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	302391070
134	NC_014378	GATAGA	2	12	303331	303342	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302391077
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137	NC_014378	GATAGA	2	12	312195	312206	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302391082
138	NC_014378	TTCCGG	2	12	312767	312778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302391082
139	NC_014378	TAGGCT	2	12	313288	313299	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302391082
140	NC_014378	GTTATT	2	12	313494	313505	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	302391082
141	NC_014378	GTTGAT	2	12	314233	314244	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	302391083
142	NC_014378	AGATTG	2	12	314639	314650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391083
143	NC_014378	TTAAGA	2	12	314978	314989	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302391083
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145	NC_014378	ATTGGA	2	12	320362	320373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391089
146	NC_014378	AATTAA	2	12	321003	321014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302391090
147	NC_014378	TAGAAG	2	12	321140	321151	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302391091
148	NC_014378	AGTAGC	2	12	322267	322278	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302391092
149	NC_014378	TATCTG	2	12	326592	326603	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302391096
150	NC_014378	TGAGTT	2	12	328652	328663	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	302391098
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152	NC_014378	CAGATT	2	12	342954	342965	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302391111
153	NC_014378	AAGATG	2	12	345887	345898	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302391114
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200	NC_014378	TTAATA	2	12	449845	449856	50 %	50 %	0 %	0 %	302391199
201	NC_014378	TGTGAT	2	12	453133	453144	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	302391203
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213	NC_014378	AATAGG	2	12	491233	491244	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302391240
214	NC_014378	TAGTAT	2	12	493733	493744	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302391241
215	NC_014378	GATAAC	2	12	494679	494690	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302391242
216	NC_014378	AGTAGC	2	12	495255	495266	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302391243
217	NC_014378	CTTATG	2	12	496975	496986	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302391245
218	NC_014378	TAAAAG	2	12	501112	501123	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	302391249
219	NC_014378	GATATT	2	12	503349	503360	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302391251
220	NC_014378	ATTTTA	2	12	507795	507806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391256
221	NC_014378	TAGTTT	2	12	510758	510769	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	302391260
222	NC_014378	CTATTT	2	12	512216	512227	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	302391261
223	NC_014378	AGTTGT	2	12	515352	515363	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	302391266
224	NC_014378	TTGATA	2	12	515756	515767	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302391266
225	NC_014378	GATGCT	2	12	516971	516982	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302391268
226	NC_014378	TGAAGA	2	12	522279	522290	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302391272
227	NC_014378	TCTATC	2	12	524939	524950	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	302391274
228	NC_014378	AACAGG	2	12	525103	525114	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	302391274
229	NC_014378	TAGAAG	2	12	527038	527049	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302391276
230	NC_014378	ATTGGA	2	12	530583	530594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391279
231	NC_014378	TAAGTT	2	12	531245	531256	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	302391279
232	NC_014378	AAATAA	2	12	534481	534492	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	302391282
233	NC_014378	AGAGAT	2	12	537910	537921	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302391286
234	NC_014378	TTACTA	2	12	537935	537946	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302391286
235	NC_014378	TTAAAG	2	12	539393	539404	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302391288
236	NC_014378	AGGTTG	2	12	541200	541211	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	302391289
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239	NC_014378	GCAGAG	2	12	550039	550050	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	302391296
240	NC_014378	TATCTT	2	12	551512	551523	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	302391297
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270	NC_014378	TTTTTC	2	12	636324	636335	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	302391373
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336	NC_014378	ACCTGA	2	12	762274	762285	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	302391483
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338	NC_014378	AGAAGT	2	12	763974	763985	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302391485
339	NC_014378	TGCCGC	2	12	767888	767899	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	302391490
340	NC_014378	TGGTAC	2	12	772697	772708	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302391495
341	NC_014378	TAGAAT	2	12	774105	774116	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302391497
342	NC_014378	AGGCTG	2	12	774871	774882	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	302391499
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344	NC_014378	TTAATT	2	12	779917	779928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391501
345	NC_014378	GTCTTT	2	12	782194	782205	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	302391503
346	NC_014378	GGATTT	2	12	783429	783440	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	302391504
347	NC_014378	AGAAAT	2	12	787261	787272	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	302391508
348	NC_014378	AGATGA	2	12	787693	787704	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302391508
349	NC_014378	GATGAA	2	12	788273	788284	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302391508
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444	NC_014378	AGCTGA	2	12	1049119	1049130	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302391745
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448	NC_014378	CAGAAG	2	12	1051281	1051292	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	302391745
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450	NC_014378	TCTTTT	2	12	1053350	1053361	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	302391747
451	NC_014378	TGGCTG	2	12	1057333	1057344	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	302391750
452	NC_014378	AATTAA	2	12	1060800	1060811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302391753
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455	NC_014378	ATATTA	2	12	1064944	1064955	50 %	50 %	0 %	0 %	302391756
456	NC_014378	AGATGA	2	12	1065848	1065859	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302391756
457	NC_014378	ATGAAG	2	12	1069784	1069795	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302391760
458	NC_014378	TTATAT	2	12	1071166	1071177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302391762
459	NC_014378	AAAGTA	2	12	1073298	1073309	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	302391764
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461	NC_014378	AGATAG	2	12	1073596	1073607	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302391764
462	NC_014378	AACAGA	2	12	1077476	1077487	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	302391768
463	NC_014378	TGAAGT	2	12	1077659	1077670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302391768
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