MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetohalobium arabaticum DSM 5501 chromosome

Total Repeats: 437

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014378	TAAAA	2	10	243	252	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014378	ATTGA	2	10	7560	7569	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014378	CAAGT	2	10	11241	11250	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014378	AAGAG	2	10	11307	11316	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014378	TCGTG	2	10	11721	11730	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014378	GGGAG	2	10	13047	13056	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014378	CAGAG	2	10	15241	15250	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014378	GATAA	2	10	15268	15277	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014378	TAGTT	2	10	15822	15831	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014378	AAAGC	2	10	16429	16438	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014378	AGTTT	2	10	20934	20943	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014378	ATATT	2	10	24257	24266	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014378	TATTC	2	10	26791	26800	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014378	GATTT	2	10	57100	57109	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014378	TAAAT	2	10	57116	57125	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014378	TCTAT	2	10	68207	68216	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014378	ATTTT	2	10	70907	70916	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014378	TTAGT	2	10	71621	71630	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014378	ATATA	2	10	77842	77851	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014378	TGAGG	2	10	78208	78217	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014378	ACTAT	2	10	80838	80847	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014378	TGAAA	2	10	95522	95531	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014378	GGAAT	2	10	95834	95843	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014378	TAAGA	2	10	100257	100266	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014378	AAAAT	2	10	112626	112635	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014378	TCTGT	2	10	112975	112984	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014378	TAAAA	2	10	122319	122328	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014378	CAAGT	2	10	138426	138435	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014378	AAGAG	2	10	138492	138501	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014378	TCGTG	2	10	138906	138915	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014378	GGGAG	2	10	140232	140241	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014378	CAGAG	2	10	142426	142435	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014378	GATAA	2	10	142453	142462	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014378	TTAAG	2	10	143159	143168	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014378	CCTGA	2	10	143928	143937	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_014378	ATATT	2	10	144105	144114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014378	GATTT	2	10	157055	157064	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014378	GTTAT	2	10	167194	167203	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014378	ATATA	2	10	195064	195073	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014378	TCTGT	2	10	199695	199704	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014378	TATAA	2	10	235820	235829	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014378	TTCTA	2	10	236173	236182	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014378	CCTTC	2	10	237073	237082	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
44	NC_014378	AATTA	2	10	241104	241113	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014378	ATAAA	2	10	256651	256660	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014378	TGCAA	2	10	275591	275600	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_014378	TATAA	2	10	280489	280498	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014378	TTAAT	2	10	280851	280860	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014378	AAAAT	2	10	285990	285999	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014378	ATTAA	2	10	286238	286247	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014378	TAGGA	2	10	306346	306355	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014378	TATAA	2	10	308138	308147	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014378	GGGAG	2	10	321018	321027	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014378	TATCT	2	10	321481	321490	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014378	GAATT	2	10	321516	321525	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014378	GTTCT	2	10	333253	333262	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014378	GTCCA	2	10	333292	333301	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_014378	TCTGT	2	10	341049	341058	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014378	GATAT	2	10	341367	341376	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014378	AGATT	2	10	347393	347402	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014378	GAATT	2	10	362515	362524	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014378	TATAA	2	10	362562	362571	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014378	AATTA	2	10	363453	363462	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014378	TAACA	2	10	363633	363642	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014378	CGAGG	2	10	366673	366682	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014378	TAATA	2	10	376140	376149	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014378	TAAAA	2	10	385029	385038	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014378	ATAAA	2	10	395168	395177	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014378	ATAGG	2	10	400932	400941	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014378	TGATT	2	10	411885	411894	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014378	TTACT	2	10	423337	423346	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014378	CAAGT	2	10	434255	434264	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014378	AAGAG	2	10	434321	434330	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014378	TCGTG	2	10	434735	434744	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_014378	GGGAG	2	10	435864	435873	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014378	CAGAG	2	10	438058	438067	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_014378	GATAA	2	10	438085	438094	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014378	TTTAA	2	10	438710	438719	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014378	ATAAA	2	10	448376	448385	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014378	TAAAA	2	10	448405	448414	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014378	ATTTT	2	10	448458	448467	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014378	TATAA	2	10	458888	458897	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014378	TTCTA	2	10	463429	463438	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014378	ATTTT	2	10	463970	463979	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014378	CTTTC	2	10	465314	465323	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_014378	TATAA	2	10	467665	467674	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014378	GAATT	2	10	469867	469876	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014378	AATAA	2	10	473490	473499	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014378	ATTAA	2	10	476480	476489	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014378	TTAAG	2	10	477583	477592	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014378	ATTTA	2	10	479744	479753	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014378	ATTTA	2	10	479783	479792	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014378	AAAAG	2	10	507528	507537	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014378	ATTAA	2	10	514382	514391	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014378	TTTTA	2	10	516500	516509	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014378	TTAAA	2	10	516540	516549	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014378	CATAA	2	10	523177	523186	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_014378	TAATT	2	10	531776	531785	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014378	TAATT	2	10	535797	535806	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014378	TTAAA	2	10	535971	535980	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014378	AAAAT	2	10	562056	562065	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014378	AGTAA	2	10	566786	566795	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014378	AATTT	2	10	573330	573339	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014378	TAATT	2	10	578527	578536	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014378	ACTTA	2	10	579738	579747	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_014378	AGTTA	2	10	610742	610751	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014378	AAATT	2	10	628896	628905	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014378	ACAGA	2	10	640940	640949	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_014378	ATTTT	2	10	642139	642148	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014378	ATTAT	2	10	642174	642183	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014378	AAATC	2	10	650609	650618	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014378	GTAAG	2	10	650638	650647	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014378	TTTTA	2	10	675805	675814	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014378	ACTTA	2	10	675837	675846	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014378	AATTA	2	10	678018	678027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014378	ATATT	2	10	678139	678148	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014378	AAAGT	2	10	695753	695762	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014378	TCCTC	2	10	696304	696313	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
119	NC_014378	ATTAT	2	10	696349	696358	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014378	ATTTT	2	10	699447	699456	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014378	AATTT	2	10	712881	712890	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014378	GTTTA	2	10	712982	712991	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014378	TAAAA	2	10	714735	714744	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014378	TAATT	2	10	730951	730960	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014378	TCTAA	2	10	734602	734611	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_014378	TAAAG	2	10	740235	740244	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014378	TGTGT	2	10	746283	746292	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014378	TCTGT	2	10	767188	767197	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014378	ATATA	2	10	771566	771575	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014378	GGGAA	2	10	784372	784381	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014378	AAGTT	2	10	795374	795383	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014378	TCTGC	2	10	795696	795705	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_014378	CAAGT	2	10	796326	796335	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_014378	AAGAG	2	10	796392	796401	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014378	TCGTG	2	10	796806	796815	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_014378	GGGAG	2	10	797935	797944	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014378	CAGAG	2	10	800130	800139	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_014378	GATAA	2	10	800157	800166	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014378	CTTTT	2	10	801679	801688	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_014378	GATAA	2	10	805084	805093	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014378	TAAAT	2	10	817141	817150	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014378	AAAAT	2	10	825374	825383	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014378	TAAGG	2	10	831509	831518	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014378	GCTTA	2	10	834291	834300	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_014378	TTTGG	2	10	834327	834336	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014378	AGGTA	2	10	834593	834602	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014378	AGTTA	2	10	837199	837208	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014378	AGTAA	2	10	858658	858667	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_014378	TCCCT	2	10	2321879	2321888	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
430	NC_014378	CAAAT	2	10	2339296	2339305	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
431	NC_014378	GAGCA	2	10	2397209	2397218	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
432	NC_014378	TTCTA	2	10	2397242	2397251	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
433	NC_014378	TCTTT	2	10	2409722	2409731	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
434	NC_014378	ACTAA	2	10	2421695	2421704	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
435	NC_014378	TAATA	2	10	2444078	2444087	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_014378	TTTAA	2	10	2445952	2445961	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NC_014378	CTAAA	2	10	2451610	2451619	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.