MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acetohalobium arabaticum DSM 5501 chromosome

Total Repeats: 38067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014378	AAG	2	6	382	387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390798
2	NC_014378	CTA	2	6	598	603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390798
3	NC_014378	AGA	2	6	608	613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390798
4	NC_014378	GAT	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390798
5	NC_014378	CTT	2	6	682	687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390798
6	NC_014378	GTA	3	9	724	732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390798
7	NC_014378	TGC	2	6	746	751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302390798
8	NC_014378	AGT	2	6	884	889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390798
9	NC_014378	TAA	2	6	962	967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390798
10	NC_014378	GAT	2	6	996	1001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390798
11	NC_014378	AAG	2	6	1033	1038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390798
12	NC_014378	ATA	2	6	1083	1088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390798
13	NC_014378	CCT	2	6	1104	1109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302390798
14	NC_014378	AGT	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390798
15	NC_014378	AAG	2	6	1372	1377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390798
16	NC_014378	ATT	2	6	1389	1394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390798
17	NC_014378	CTA	2	6	1396	1401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390798
18	NC_014378	CAA	2	6	1434	1439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302390798
19	NC_014378	TAG	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390798
20	NC_014378	AGA	2	6	1469	1474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390798
21	NC_014378	TTC	2	6	1553	1558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390798
22	NC_014378	GGA	2	6	1584	1589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302390798
23	NC_014378	ACA	2	6	1599	1604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302390798
24	NC_014378	GAA	2	6	1641	1646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390798
25	NC_014378	AAT	2	6	1692	1697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390798
26	NC_014378	ATG	2	6	1997	2002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390799
27	NC_014378	ATA	2	6	2243	2248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390799
28	NC_014378	TGA	2	6	2301	2306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390799
29	NC_014378	ATT	2	6	2313	2318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390799
30	NC_014378	GAT	2	6	2404	2409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390799
31	NC_014378	TTA	2	6	2437	2442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390799
32	NC_014378	ATT	2	6	2542	2547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390799
33	NC_014378	AGA	2	6	2589	2594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390799
34	NC_014378	TAT	2	6	2652	2657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390799
35	NC_014378	CTA	2	6	2756	2761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390799
36	NC_014378	ATT	2	6	2797	2802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390799
37	NC_014378	TGA	2	6	2895	2900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390799
38	NC_014378	ATT	2	6	2924	2929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390799
39	NC_014378	GAA	2	6	2959	2964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390799
40	NC_014378	AAG	2	6	3008	3013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390799
41	NC_014378	AGG	2	6	3063	3068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302390799
42	NC_014378	TGG	2	6	3149	3154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302390800
43	NC_014378	GAA	2	6	3261	3266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390800
44	NC_014378	TAA	2	6	3274	3279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390800
45	NC_014378	TAA	2	6	3282	3287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390800
46	NC_014378	ATA	2	6	3603	3608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390801
47	NC_014378	AGA	2	6	3622	3627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390801
48	NC_014378	GAA	2	6	3702	3707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390801
49	NC_014378	TTA	2	6	3711	3716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390801
50	NC_014378	TTA	3	9	3742	3750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390801
51	NC_014378	TAA	2	6	3790	3795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390801
52	NC_014378	CTA	2	6	3797	3802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390801
53	NC_014378	AAT	2	6	3880	3885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390801
54	NC_014378	CTA	2	6	4014	4019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390801
55	NC_014378	AGA	2	6	4021	4026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390801
56	NC_014378	GAG	2	6	4083	4088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302390801
57	NC_014378	GAT	2	6	4112	4117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390801
58	NC_014378	CAG	2	6	4169	4174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302390801
59	NC_014378	CTG	2	6	4179	4184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302390801
60	NC_014378	TAT	2	6	4248	4253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390801
61	NC_014378	GAT	2	6	4256	4261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390801
62	NC_014378	ATA	2	6	4278	4283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390801
63	NC_014378	CAA	2	6	4289	4294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302390801
64	NC_014378	TAA	2	6	4442	4447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390802
65	NC_014378	TAA	2	6	4598	4603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390802
66	NC_014378	TCA	2	6	4616	4621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390802
67	NC_014378	AGA	2	6	4637	4642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390802
68	NC_014378	AGA	2	6	4787	4792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390802
69	NC_014378	AAG	2	6	4900	4905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390802
70	NC_014378	ATT	2	6	4921	4926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390802
71	NC_014378	AGA	2	6	5003	5008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390802
72	NC_014378	GAA	2	6	5040	5045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390802
73	NC_014378	CTT	2	6	5054	5059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390802
74	NC_014378	CAA	2	6	5153	5158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302390802
75	NC_014378	AAT	2	6	5163	5168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390802
76	NC_014378	AAG	2	6	5222	5227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390802
77	NC_014378	AAG	2	6	5263	5268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390802
78	NC_014378	TGT	2	6	5326	5331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302390803
79	NC_014378	CTA	2	6	5359	5364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390803
80	NC_014378	TGA	2	6	5374	5379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390803
81	NC_014378	AGA	2	6	5438	5443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390803
82	NC_014378	TTA	2	6	5449	5454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390803
83	NC_014378	ATT	2	6	5575	5580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390803
84	NC_014378	ATG	2	6	5662	5667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390804
85	NC_014378	CAT	2	6	5754	5759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390804
86	NC_014378	ATA	2	6	5815	5820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390804
87	NC_014378	TTA	2	6	5827	5832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390804
88	NC_014378	GTA	2	6	5847	5852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390804
89	NC_014378	GAT	2	6	5862	5867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390804
90	NC_014378	TCT	2	6	5886	5891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390804
91	NC_014378	CAG	2	6	5911	5916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302390804
92	NC_014378	GGA	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302390804
93	NC_014378	GTT	2	6	6009	6014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302390804
94	NC_014378	ATA	2	6	6055	6060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390804
95	NC_014378	ATC	2	6	6067	6072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390804
96	NC_014378	GAA	2	6	6081	6086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390804
97	NC_014378	ATG	2	6	6301	6306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390804
98	NC_014378	GAA	3	9	6384	6392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390804
99	NC_014378	ATA	2	6	6439	6444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390804
100	NC_014378	TAA	2	6	6458	6463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390804
101	NC_014378	AGG	2	6	6479	6484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302390804
102	NC_014378	GAC	2	6	6541	6546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302390804
103	NC_014378	AGA	2	6	6560	6565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390804
104	NC_014378	GAT	2	6	6585	6590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390804
105	NC_014378	TAG	2	6	6604	6609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390804
106	NC_014378	AGT	2	6	6701	6706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390804
107	NC_014378	AGA	3	9	6731	6739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390804
108	NC_014378	AAT	2	6	6755	6760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390804
109	NC_014378	AGC	2	6	6779	6784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302390804
110	NC_014378	AGC	2	6	6797	6802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302390804
111	NC_014378	AAG	2	6	6824	6829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390804
112	NC_014378	TTC	2	6	6878	6883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390804
113	NC_014378	ATA	2	6	7036	7041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390804
114	NC_014378	ATT	2	6	7122	7127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390804
115	NC_014378	ATT	2	6	7169	7174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390804
116	NC_014378	CTT	2	6	7181	7186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390804
117	NC_014378	ATT	2	6	7205	7210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390804
118	NC_014378	TAA	2	6	7256	7261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390804
119	NC_014378	GAA	2	6	7264	7269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390804
120	NC_014378	TAT	2	6	7275	7280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390804
121	NC_014378	AGA	2	6	7301	7306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390804
122	NC_014378	TGA	2	6	7454	7459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390804
123	NC_014378	TAC	2	6	7466	7471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390804
124	NC_014378	CTC	2	6	7492	7497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302390804
125	NC_014378	GAA	2	6	7498	7503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390804
126	NC_014378	AAG	2	6	7525	7530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390804
127	NC_014378	TAA	2	6	7764	7769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390805
128	NC_014378	TAG	2	6	7892	7897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390805
129	NC_014378	CTG	3	9	7934	7942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302390805
130	NC_014378	TGA	2	6	8034	8039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390805
131	NC_014378	TCT	2	6	8098	8103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390805
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