MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Thermosediminibacter oceani DSM 16646 chromosome

Total Repeats: 1472

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014377	AAGGC	2	10	2909	2918	40 %	0 %	40 %	20 %	302388602
2	NC_014377	GGTAT	2	10	6454	6463	20 %	40 %	40 %	0 %	302388606
3	NC_014377	TTTAC	2	10	13565	13574	20 %	60 %	0 %	20 %	302388614
4	NC_014377	AAATA	2	10	14904	14913	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014377	GCCCT	2	10	17527	17536	0 %	20 %	20 %	60 %	302388618
6	NC_014377	CTGGA	2	10	17628	17637	20 %	20 %	40 %	20 %	302388618
7	NC_014377	GGGAA	2	10	18053	18062	40 %	0 %	60 %	0 %	302388619
8	NC_014377	CTTCA	2	10	20033	20042	20 %	40 %	0 %	40 %	302388621
9	NC_014377	ATTTT	2	10	20325	20334	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014377	CGGGA	2	10	21775	21784	20 %	0 %	60 %	20 %	302388623
11	NC_014377	AGAGA	2	10	22234	22243	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014377	TTATC	2	10	22381	22390	20 %	60 %	0 %	20 %	302388624
13	NC_014377	AAGGA	2	10	23738	23747	60 %	0 %	40 %	0 %	302388626
14	NC_014377	TGAAA	2	10	25676	25685	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014377	TTACA	2	10	25863	25872	40 %	40 %	0 %	20 %	302388627
16	NC_014377	CACGG	2	10	26287	26296	20 %	0 %	40 %	40 %	302388627
17	NC_014377	CGGTG	2	10	26847	26856	0 %	20 %	60 %	20 %	302388627
18	NC_014377	GGACC	2	10	26986	26995	20 %	0 %	40 %	40 %	302388627
19	NC_014377	TATTT	2	10	33627	33636	20 %	80 %	0 %	0 %	302388634
20	NC_014377	GTTGC	2	10	40226	40235	0 %	40 %	40 %	20 %	302388641
21	NC_014377	CGAGG	2	10	45408	45417	20 %	0 %	60 %	20 %	302388645
22	NC_014377	ACGCC	2	10	46362	46371	20 %	0 %	20 %	60 %	302388647
23	NC_014377	TCCGG	2	10	48036	48045	0 %	20 %	40 %	40 %	302388648
24	NC_014377	CTTTT	2	10	48937	48946	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014377	CGGTA	2	10	51919	51928	20 %	20 %	40 %	20 %	302388652
26	NC_014377	GACCC	2	10	53497	53506	20 %	0 %	20 %	60 %	302388652
27	NC_014377	GAAAA	2	10	53615	53624	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014377	AAAGA	2	10	53836	53845	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014377	GAAAT	2	10	56405	56414	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014377	CCTTT	2	10	56503	56512	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_014377	TGAAG	2	10	63489	63498	40 %	20 %	40 %	0 %	302388662
32	NC_014377	TTTTC	2	10	63715	63724	0 %	80 %	0 %	20 %	302388663
33	NC_014377	TGGGA	2	10	64933	64942	20 %	20 %	60 %	0 %	302388664
34	NC_014377	TGCCA	2	10	68364	68373	20 %	20 %	20 %	40 %	302388666
35	NC_014377	TATCT	2	10	69164	69173	20 %	60 %	0 %	20 %	302388667
36	NC_014377	GCACA	2	10	70158	70167	40 %	0 %	20 %	40 %	302388667
37	NC_014377	TTATA	2	10	70385	70394	40 %	60 %	0 %	0 %	302388667
38	NC_014377	AAGAT	2	10	71902	71911	60 %	20 %	20 %	0 %	302388668
39	NC_014377	AAAAG	2	10	72044	72053	80 %	0 %	20 %	0 %	302388669
40	NC_014377	CTACC	2	10	74395	74404	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
41	NC_014377	TAGTT	2	10	77706	77715	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014377	ATTTT	2	10	81527	81536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014377	AATTG	2	10	82587	82596	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014377	ATGCT	2	10	82743	82752	20 %	40 %	20 %	20 %	302388674
45	NC_014377	TAATT	2	10	82777	82786	40 %	60 %	0 %	0 %	302388674
46	NC_014377	TGCTC	2	10	83560	83569	0 %	40 %	20 %	40 %	302388675
47	NC_014377	TAAAA	2	10	84942	84951	80 %	20 %	0 %	0 %	302388676
48	NC_014377	TTCCA	2	10	85475	85484	20 %	40 %	0 %	40 %	302388677
49	NC_014377	TGGGG	2	10	86671	86680	0 %	20 %	80 %	0 %	302388678
50	NC_014377	GGGAA	2	10	88735	88744	40 %	0 %	60 %	0 %	302388680
51	NC_014377	AATAT	2	10	93020	93029	60 %	40 %	0 %	0 %	302388684
52	NC_014377	TTTTG	2	10	96350	96359	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014377	TGCGA	2	10	100819	100828	20 %	20 %	40 %	20 %	302388689
54	NC_014377	TACTT	2	10	105759	105768	20 %	60 %	0 %	20 %	302388692
55	NC_014377	CCGTC	2	10	108081	108090	0 %	20 %	20 %	60 %	302388694
56	NC_014377	GGGCT	2	10	108263	108272	0 %	20 %	60 %	20 %	302388694
57	NC_014377	TCGTC	2	10	110368	110377	0 %	40 %	20 %	40 %	302388695
58	NC_014377	AAAAG	2	10	112589	112598	80 %	0 %	20 %	0 %	302388698
59	NC_014377	GGCCC	2	10	113416	113425	0 %	0 %	40 %	60 %	302388700
60	NC_014377	AATTT	2	10	114551	114560	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014377	GAAAA	2	10	115403	115412	80 %	0 %	20 %	0 %	302388703
62	NC_014377	AAGGA	2	10	115744	115753	60 %	0 %	40 %	0 %	302388704
63	NC_014377	GACCA	2	10	117109	117118	40 %	0 %	20 %	40 %	302388704
64	NC_014377	TTCCT	2	10	117572	117581	0 %	60 %	0 %	40 %	302388704
65	NC_014377	CCGGG	2	10	118182	118191	0 %	0 %	60 %	40 %	302388704
66	NC_014377	GGGCC	2	10	120756	120765	0 %	0 %	60 %	40 %	302388705
67	NC_014377	TCTCC	2	10	121007	121016	0 %	40 %	0 %	60 %	302388705
68	NC_014377	GATGA	2	10	121981	121990	40 %	20 %	40 %	0 %	302388705
69	NC_014377	CGGAG	2	10	126244	126253	20 %	0 %	60 %	20 %	302388709
70	NC_014377	CAGGG	2	10	126325	126334	20 %	0 %	60 %	20 %	302388709
71	NC_014377	GCAAA	2	10	126431	126440	60 %	0 %	20 %	20 %	302388710
72	NC_014377	TGAGA	2	10	130147	130156	40 %	20 %	40 %	0 %	302388715
73	NC_014377	GAGGG	2	10	132694	132703	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014377	TGCCC	2	10	133757	133766	0 %	20 %	20 %	60 %	302388724
75	NC_014377	AAAAG	2	10	136494	136503	80 %	0 %	20 %	0 %	302388730
76	NC_014377	AAGGG	2	10	144630	144639	40 %	0 %	60 %	0 %	302388744
77	NC_014377	GATAA	2	10	144888	144897	60 %	20 %	20 %	0 %	302388744
78	NC_014377	CAGGC	2	10	146631	146640	20 %	0 %	40 %	40 %	302388747
79	NC_014377	GCCGG	2	10	146940	146949	0 %	0 %	60 %	40 %	302388748
80	NC_014377	GGCGG	2	10	147081	147090	0 %	0 %	80 %	20 %	302388748
81	NC_014377	GGCGG	2	10	150175	150184	0 %	0 %	80 %	20 %	302388750
82	NC_014377	TGATC	2	10	153118	153127	20 %	40 %	20 %	20 %	302388753
83	NC_014377	AGTAG	2	10	153318	153327	40 %	20 %	40 %	0 %	302388753
84	NC_014377	AGTAG	2	10	154827	154836	40 %	20 %	40 %	0 %	302388754
85	NC_014377	ATATT	2	10	156490	156499	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014377	AGGTA	2	10	157195	157204	40 %	20 %	40 %	0 %	302388756
87	NC_014377	GAGAG	2	10	159677	159686	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014377	TCGTG	2	10	160095	160104	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014377	AGGCG	2	10	161007	161016	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
90	NC_014377	GGGAG	2	10	161226	161235	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014377	AGGGG	2	10	162580	162589	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014377	CTGGC	2	10	164257	164266	0 %	20 %	40 %	40 %	302388758
93	NC_014377	GAGAG	2	10	166839	166848	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014377	TCGTG	2	10	167257	167266	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014377	AGGCG	2	10	168169	168178	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014377	GGGAG	2	10	168388	168397	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014377	AGGGG	2	10	169742	169751	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014377	CGTGC	2	10	173844	173853	0 %	20 %	40 %	40 %	302388762
99	NC_014377	GTTAT	2	10	176297	176306	20 %	60 %	20 %	0 %	302388767
100	NC_014377	TGAAG	2	10	176340	176349	40 %	20 %	40 %	0 %	302388768
101	NC_014377	CATGC	2	10	177946	177955	20 %	20 %	20 %	40 %	302388769
102	NC_014377	GCCTG	2	10	180786	180795	0 %	20 %	40 %	40 %	302388771
103	NC_014377	TAGTC	2	10	181229	181238	20 %	40 %	20 %	20 %	302388771
104	NC_014377	TAGTT	2	10	183152	183161	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014377	TCCTG	2	10	183725	183734	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_014377	GAAAA	2	10	184884	184893	80 %	0 %	20 %	0 %	302388774
107	NC_014377	GAAAA	2	10	188127	188136	80 %	0 %	20 %	0 %	302388778
108	NC_014377	CCAGC	2	10	188797	188806	20 %	0 %	20 %	60 %	302388779
109	NC_014377	TTGTA	2	10	189456	189465	20 %	60 %	20 %	0 %	302388780
110	NC_014377	ATTTT	2	10	191033	191042	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014377	GGACG	2	10	192159	192168	20 %	0 %	60 %	20 %	302388782
112	NC_014377	CAATC	2	10	193661	193670	40 %	20 %	0 %	40 %	302388783
113	NC_014377	GGGTC	2	10	194938	194947	0 %	20 %	60 %	20 %	302388785
114	NC_014377	TCTTT	2	10	198278	198287	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014377	ACGGG	2	10	199583	199592	20 %	0 %	60 %	20 %	302388790
116	NC_014377	TTAAT	2	10	202732	202741	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014377	CACCC	2	10	203548	203557	20 %	0 %	0 %	80 %	302388795
118	NC_014377	TTCGG	2	10	204091	204100	0 %	40 %	40 %	20 %	302388795
119	NC_014377	CCAGG	2	10	206111	206120	20 %	0 %	40 %	40 %	302388797
120	NC_014377	GCGGG	2	10	208411	208420	0 %	0 %	80 %	20 %	302388800
121	NC_014377	AACCC	2	10	211090	211099	40 %	0 %	0 %	60 %	302388804
122	NC_014377	TAAGA	2	10	213136	213145	60 %	20 %	20 %	0 %	302388805
123	NC_014377	CACGG	2	10	213900	213909	20 %	0 %	40 %	40 %	302388807
124	NC_014377	GAGCC	2	10	215380	215389	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
125	NC_014377	ATTTT	2	10	216144	216153	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014377	TTCAT	2	10	216363	216372	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014377	GTGCC	2	10	217471	217480	0 %	20 %	40 %	40 %	302388810
128	NC_014377	CCGGC	2	10	218001	218010	0 %	0 %	40 %	60 %	302388812
129	NC_014377	GCAGA	2	10	218475	218484	40 %	0 %	40 %	20 %	302388813
130	NC_014377	CTTGC	2	10	218813	218822	0 %	40 %	20 %	40 %	302388813
131	NC_014377	ACATG	2	10	219914	219923	40 %	20 %	20 %	20 %	302388814
132	NC_014377	AATTT	2	10	221002	221011	40 %	60 %	0 %	0 %	302388815
133	NC_014377	ATAAA	2	10	221117	221126	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014377	CCAAA	2	10	221464	221473	60 %	0 %	0 %	40 %	302388816
135	NC_014377	TAAAA	2	10	222714	222723	80 %	20 %	0 %	0 %	302388817
136	NC_014377	CATGC	2	10	223564	223573	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_014377	TGGAA	2	10	225066	225075	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014377	ATAAA	2	10	225149	225158	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_014377	ATAAA	2	10	228856	228865	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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267	NC_014377	AGACC	2	10	403731	403740	40 %	0 %	20 %	40 %	302388985
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