MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium saccharolyticum WM1 chromosome

Total Repeats: 190

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014376	TGAGTT	2	12	20588	20599	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014376	ACCCGC	2	12	20887	20898	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_014376	TCCATC	2	12	24262	24273	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014376	AAAAGG	2	12	64180	64191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014376	ACCCGC	2	12	199114	199125	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_014376	TGACAC	2	12	204983	204994	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014376	TATACA	2	12	219324	219335	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014376	CATTTA	2	12	220867	220878	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014376	ACCGCC	2	12	227824	227835	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_014376	CTGAAA	2	12	250369	250380	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014376	TTTTCT	2	12	253965	253976	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014376	GTCCAT	2	12	260582	260593	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014376	GGTCAG	2	12	358007	358018	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014376	TAAAAT	2	12	363297	363308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014376	ATTTTA	2	12	378243	378254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014376	TGAGTT	2	12	399570	399581	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014376	ACCCGC	2	12	399869	399880	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_014376	GTATGA	2	12	430012	430023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014376	TGACCA	2	12	435311	435322	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014376	TTTTTG	2	12	440590	440601	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014376	AACCAT	2	12	492360	492371	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014376	ATAATG	2	12	533762	533773	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014376	ATTTTA	2	12	537854	537865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014376	AAATTT	2	12	568083	568094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014376	CTTCAA	2	12	603442	603453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014376	TTCAAT	2	12	604139	604150	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014376	ATAAAA	2	12	606407	606418	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014376	CATCAG	2	12	617061	617072	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014376	TTAAAA	2	12	627905	627916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014376	AGGCGG	2	12	656314	656325	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014376	CGGAAA	2	12	679463	679474	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014376	ACCCGC	2	12	706626	706637	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_014376	CACTGA	2	12	709962	709973	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014376	CCGGTT	2	12	720955	720966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014376	AGAGGA	2	12	736715	736726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014376	TAAAAA	2	12	781229	781240	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014376	GTTTAA	2	12	787777	787788	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014376	CCCGCA	2	12	797339	797350	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_014376	CAAATA	2	12	801973	801984	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014376	ATCATA	2	12	808461	808472	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014376	GGAAAA	2	12	812706	812717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014376	TCCTGA	2	12	817244	817255	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014376	GTAAAT	2	12	845493	845504	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014376	GGCAGG	2	12	864466	864477	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014376	CAGAAG	2	12	876949	876960	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014376	AAGCCT	2	12	893453	893464	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014376	AAGGCT	2	12	905839	905850	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014376	AGGTGC	2	12	922561	922572	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014376	AGAGGA	2	12	922909	922920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014376	AAATAA	2	12	928868	928879	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014376	ATAAAA	2	12	934415	934426	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014376	GGCAGG	2	12	1058797	1058808	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014376	AGGAAA	2	12	1085575	1085586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014376	TTCTAT	2	12	1085673	1085684	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014376	GGCTGC	2	12	1113929	1113940	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014376	AAGAAA	2	12	1163857	1163868	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014376	TATGTC	2	12	1221816	1221827	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014376	AAAGGG	2	12	1225932	1225943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014376	TGAGAA	2	12	1245184	1245195	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014376	CATCAA	2	12	1245849	1245860	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014376	ATTTCA	2	12	1280434	1280445	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014376	ATAAAA	2	12	1295188	1295199	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014376	TTTATT	2	12	1303734	1303745	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014376	ATGATC	2	12	1307263	1307274	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014376	CATAAA	2	12	1313745	1313756	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014376	TGCCAT	2	12	1314909	1314920	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014376	ATTTTA	2	12	1348786	1348797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014376	GCCTGA	2	12	1356547	1356558	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014376	TTTTGC	2	12	1372058	1372069	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014376	AAGGAC	2	12	1380630	1380641	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_014376	TATTTA	2	12	1388380	1388391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014376	AAATGA	2	12	1438077	1438088	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014376	ATTAAA	2	12	1517160	1517171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014376	TTTAAT	2	12	1532454	1532465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014376	AATTCC	2	12	1535647	1535658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014376	AATAAC	2	12	1541283	1541294	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014376	TATCAT	2	12	1543125	1543136	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014376	TAAGAT	2	12	1585147	1585158	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014376	TGAGGC	2	12	1601120	1601131	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014376	TAAAAA	2	12	1609603	1609614	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014376	AGTTCT	2	12	1614746	1614757	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_014376	TCCCGG	2	12	1631422	1631433	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014376	TATTTT	2	12	1667845	1667856	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014376	AAGGTT	2	12	1698368	1698379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014376	GAAAAA	2	12	1731032	1731043	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014376	ATTAGC	2	12	1736238	1736249	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014376	TAATGA	2	12	1739793	1739804	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014376	AATTGT	3	18	1739931	1739948	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014376	TTTATT	2	12	1761801	1761812	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014376	AGATGG	2	12	1852136	1852147	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014376	ATGGGG	2	12	1853904	1853915	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014376	GGTACA	2	12	1854615	1854626	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014376	GCGTCC	2	12	1854886	1854897	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014376	TATAAA	2	12	1879069	1879080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014376	GCTTTT	2	12	1898266	1898277	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014376	AATATT	2	12	1910355	1910366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014376	ATTGGT	2	12	1912918	1912929	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014376	GCAATA	2	12	1938200	1938211	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_014376	AAATAA	2	12	1958703	1958714	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014376	TTTTCA	2	12	1975640	1975651	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014376	AAAGAA	2	12	1980432	1980443	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014376	CTTTTT	2	12	2044019	2044030	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_014376	GTATCT	2	12	2166249	2166260	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_014376	AAAATG	2	12	2172705	2172716	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014376	TTATAT	2	12	2184007	2184018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014376	ATTTTT	2	12	2370880	2370891	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014376	ACCTTG	2	12	2371656	2371667	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014376	TCCATA	2	12	2427494	2427505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014376	ATATTT	2	12	2441451	2441462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014376	ATGCTT	2	12	2458075	2458086	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_014376	TATATT	2	12	2465473	2465484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014376	ATGCAA	2	12	2553672	2553683	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014376	GCTTCT	2	12	2584937	2584948	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014376	CTTTCC	2	12	2588857	2588868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014376	TCCAGT	2	12	2604673	2604684	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014376	CCGGTC	2	12	2605917	2605928	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014376	TGTATT	2	12	2658631	2658642	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014376	CTTTCG	2	12	2781256	2781267	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014376	TTTCTG	2	12	2799278	2799289	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_014376	TCCATT	2	12	2799646	2799657	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014376	AAGAAT	2	12	2835128	2835139	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014376	TCGTAA	2	12	2840732	2840743	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_014376	TGTGAT	2	12	2857611	2857622	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014376	TCTTAT	2	12	2861773	2861784	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_014376	GTTCAT	2	12	2873870	2873881	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_014376	ACCTTA	2	12	2876353	2876364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014376	GATTGA	2	12	2892250	2892261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014376	AGTTGA	2	12	2900645	2900656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014376	TACTGT	2	12	2923081	2923092	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_014376	GAAATT	2	12	2932525	2932536	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014376	TAAGTT	2	12	2934331	2934342	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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133	NC_014376	TTTATA	2	12	2950917	2950928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.