MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium saccharolyticum WM1 chromosome

Total Repeats: 3589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014376	AGGGA	2	10	2048	2057	40 %	0 %	60 %	0 %	302384446
2	NC_014376	GGAAA	2	10	3791	3800	60 %	0 %	40 %	0 %	302384448
3	NC_014376	AGATA	2	10	4264	4273	60 %	20 %	20 %	0 %	302384448
4	NC_014376	AGGCT	2	10	5734	5743	20 %	20 %	40 %	20 %	302384449
5	NC_014376	GGTAT	2	10	5993	6002	20 %	40 %	40 %	0 %	302384449
6	NC_014376	GCTTT	2	10	12680	12689	0 %	60 %	20 %	20 %	302384453
7	NC_014376	GGAAG	2	10	13151	13160	40 %	0 %	60 %	0 %	302384454
8	NC_014376	CCTCT	2	10	15841	15850	0 %	40 %	0 %	60 %	302384458
9	NC_014376	AACAG	2	10	17293	17302	60 %	0 %	20 %	20 %	302384460
10	NC_014376	TAAAA	2	10	18142	18151	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014376	ACAGA	2	10	18161	18170	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014376	CCTTC	2	10	19570	19579	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
13	NC_014376	TCGTG	2	10	19618	19627	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014376	GGGAG	2	10	21436	21445	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014376	CCGTA	2	10	22537	22546	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_014376	ATATA	2	10	24303	24312	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014376	ACCAG	2	10	24884	24893	40 %	0 %	20 %	40 %	302384461
18	NC_014376	ATTAT	2	10	24951	24960	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014376	AAAGG	2	10	25068	25077	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014376	AGAAA	2	10	27109	27118	80 %	0 %	20 %	0 %	302384463
21	NC_014376	AGAGG	2	10	27129	27138	40 %	0 %	60 %	0 %	302384463
22	NC_014376	TTACT	2	10	27168	27177	20 %	60 %	0 %	20 %	302384463
23	NC_014376	TGTTC	2	10	30833	30842	0 %	60 %	20 %	20 %	302384466
24	NC_014376	TAATA	2	10	31529	31538	60 %	40 %	0 %	0 %	302384467
25	NC_014376	AAGAT	2	10	34444	34453	60 %	20 %	20 %	0 %	302384469
26	NC_014376	CTGTA	2	10	34542	34551	20 %	40 %	20 %	20 %	302384469
27	NC_014376	TTTTA	2	10	37022	37031	20 %	80 %	0 %	0 %	302384471
28	NC_014376	GATGA	2	10	40258	40267	40 %	20 %	40 %	0 %	302384474
29	NC_014376	CCAGG	2	10	41636	41645	20 %	0 %	40 %	40 %	302384477
30	NC_014376	CTTTG	2	10	41750	41759	0 %	60 %	20 %	20 %	302384477
31	NC_014376	AATGT	2	10	42803	42812	40 %	40 %	20 %	0 %	302384478
32	NC_014376	CATCT	2	10	43038	43047	20 %	40 %	0 %	40 %	302384478
33	NC_014376	CAGGC	2	10	43070	43079	20 %	0 %	40 %	40 %	302384478
34	NC_014376	GAAGA	2	10	43499	43508	60 %	0 %	40 %	0 %	302384479
35	NC_014376	CCATT	2	10	43997	44006	20 %	40 %	0 %	40 %	302384479
36	NC_014376	TGACC	2	10	44793	44802	20 %	20 %	20 %	40 %	302384480
37	NC_014376	TGCGG	2	10	45761	45770	0 %	20 %	60 %	20 %	302384482
38	NC_014376	GCCAT	2	10	46717	46726	20 %	20 %	20 %	40 %	302384482
39	NC_014376	TTACC	2	10	48757	48766	20 %	40 %	0 %	40 %	302384483
40	NC_014376	GTATG	2	10	51153	51162	20 %	40 %	40 %	0 %	302384485
41	NC_014376	TGGAC	2	10	51351	51360	20 %	20 %	40 %	20 %	302384485
42	NC_014376	CCAAT	2	10	52093	52102	40 %	20 %	0 %	40 %	302384486
43	NC_014376	GTGCC	2	10	52972	52981	0 %	20 %	40 %	40 %	302384488
44	NC_014376	TTGCA	2	10	53582	53591	20 %	40 %	20 %	20 %	302384488
45	NC_014376	ATTAT	2	10	55588	55597	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014376	ACCAT	2	10	58491	58500	40 %	20 %	0 %	40 %	302384493
47	NC_014376	AGGAG	2	10	58736	58745	40 %	0 %	60 %	0 %	302384493
48	NC_014376	CCATT	2	10	59206	59215	20 %	40 %	0 %	40 %	302384494
49	NC_014376	AAAGT	2	10	59605	59614	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014376	CAATA	2	10	59618	59627	60 %	20 %	0 %	20 %	302384495
51	NC_014376	AGGAA	2	10	62344	62353	60 %	0 %	40 %	0 %	302384499
52	NC_014376	TTAAG	2	10	62926	62935	40 %	40 %	20 %	0 %	302384499
53	NC_014376	AAGGA	2	10	65078	65087	60 %	0 %	40 %	0 %	302384501
54	NC_014376	GTATA	3	15	65688	65702	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014376	TTTAA	2	10	68982	68991	40 %	60 %	0 %	0 %	302384504
56	NC_014376	AATTT	2	10	69642	69651	40 %	60 %	0 %	0 %	302384505
57	NC_014376	AGACC	2	10	70208	70217	40 %	0 %	20 %	40 %	302384506
58	NC_014376	GGTCA	2	10	72609	72618	20 %	20 %	40 %	20 %	302384506
59	NC_014376	TAAAG	2	10	73073	73082	60 %	20 %	20 %	0 %	302384506
60	NC_014376	GGAGT	2	10	73912	73921	20 %	20 %	60 %	0 %	302384507
61	NC_014376	AAGAA	2	10	74877	74886	80 %	0 %	20 %	0 %	302384507
62	NC_014376	AAGGG	2	10	75246	75255	40 %	0 %	60 %	0 %	302384507
63	NC_014376	AGAAA	2	10	76621	76630	80 %	0 %	20 %	0 %	302384509
64	NC_014376	GACGA	2	10	77258	77267	40 %	0 %	40 %	20 %	302384510
65	NC_014376	TTATC	2	10	83507	83516	20 %	60 %	0 %	20 %	302384516
66	NC_014376	TGGCC	2	10	86147	86156	0 %	20 %	40 %	40 %	302384517
67	NC_014376	TGCAG	2	10	87553	87562	20 %	20 %	40 %	20 %	302384518
68	NC_014376	GATTC	2	10	88423	88432	20 %	40 %	20 %	20 %	302384519
69	NC_014376	TGTTC	2	10	89103	89112	0 %	60 %	20 %	20 %	302384520
70	NC_014376	TTCCT	2	10	89152	89161	0 %	60 %	0 %	40 %	302384520
71	NC_014376	CGCCA	2	10	97066	97075	20 %	0 %	20 %	60 %	302384527
72	NC_014376	CCTGT	2	10	97368	97377	0 %	40 %	20 %	40 %	302384527
73	NC_014376	GTACC	2	10	97944	97953	20 %	20 %	20 %	40 %	302384527
74	NC_014376	GCCGG	2	10	99636	99645	0 %	0 %	60 %	40 %	302384529
75	NC_014376	CATGG	2	10	100966	100975	20 %	20 %	40 %	20 %	302384529
76	NC_014376	ACGGA	2	10	103248	103257	40 %	0 %	40 %	20 %	302384532
77	NC_014376	ACCGA	2	10	107689	107698	40 %	0 %	20 %	40 %	302384534
78	NC_014376	AATCA	2	10	108219	108228	60 %	20 %	0 %	20 %	302384534
79	NC_014376	AGAGG	2	10	109933	109942	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014376	GTTTT	2	10	109990	109999	0 %	80 %	20 %	0 %	302384537
81	NC_014376	GAACA	2	10	110019	110028	60 %	0 %	20 %	20 %	302384537
82	NC_014376	ATGAA	2	10	110115	110124	60 %	20 %	20 %	0 %	302384538
83	NC_014376	AAATG	2	10	111083	111092	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014376	ATTTT	2	10	111449	111458	20 %	80 %	0 %	0 %	302384539
85	NC_014376	GATGA	2	10	114579	114588	40 %	20 %	40 %	0 %	302384542
86	NC_014376	GATTG	2	10	114960	114969	20 %	40 %	40 %	0 %	302384542
87	NC_014376	AGATC	2	10	115118	115127	40 %	20 %	20 %	20 %	302384542
88	NC_014376	CTTTC	2	10	116024	116033	0 %	60 %	0 %	40 %	302384543
89	NC_014376	ATTGG	2	10	116231	116240	20 %	40 %	40 %	0 %	302384543
90	NC_014376	AAGCA	2	10	116834	116843	60 %	0 %	20 %	20 %	302384545
91	NC_014376	AATGA	2	10	120735	120744	60 %	20 %	20 %	0 %	302384548
92	NC_014376	CATTC	2	10	123322	123331	20 %	40 %	0 %	40 %	302384550
93	NC_014376	ACAAA	2	10	124166	124175	80 %	0 %	0 %	20 %	302384552
94	NC_014376	GGCGG	2	10	124265	124274	0 %	0 %	80 %	20 %	302384552
95	NC_014376	AAAAC	2	10	125144	125153	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014376	TGCCA	2	10	127830	127839	20 %	20 %	20 %	40 %	302384555
97	NC_014376	ATTTG	2	10	128035	128044	20 %	60 %	20 %	0 %	302384555
98	NC_014376	TTTTA	2	10	128416	128425	20 %	80 %	0 %	0 %	302384555
99	NC_014376	ACAGA	2	10	129948	129957	60 %	0 %	20 %	20 %	302384556
100	NC_014376	TGAAA	2	10	130377	130386	60 %	20 %	20 %	0 %	302384557
101	NC_014376	AACCG	2	10	130489	130498	40 %	0 %	20 %	40 %	302384557
102	NC_014376	GGAAC	2	10	130789	130798	40 %	0 %	40 %	20 %	302384557
103	NC_014376	TTTTG	2	10	132160	132169	0 %	80 %	20 %	0 %	302384558
104	NC_014376	TTGAT	2	10	132334	132343	20 %	60 %	20 %	0 %	302384558
105	NC_014376	CCATT	2	10	133611	133620	20 %	40 %	0 %	40 %	302384559
106	NC_014376	CAATC	2	10	133831	133840	40 %	20 %	0 %	40 %	302384559
107	NC_014376	GTTTT	2	10	136214	136223	0 %	80 %	20 %	0 %	302384561
108	NC_014376	GTCCA	2	10	136824	136833	20 %	20 %	20 %	40 %	302384561
109	NC_014376	GAGAT	2	10	137171	137180	40 %	20 %	40 %	0 %	302384561
110	NC_014376	AAGGT	2	10	137743	137752	40 %	20 %	40 %	0 %	302384561
111	NC_014376	ATTGT	2	10	142908	142917	20 %	60 %	20 %	0 %	302384565
112	NC_014376	TCCGG	2	10	144234	144243	0 %	20 %	40 %	40 %	302384567
113	NC_014376	ATCTT	2	10	145408	145417	20 %	60 %	0 %	20 %	302384569
114	NC_014376	CCCAT	2	10	145957	145966	20 %	20 %	0 %	60 %	302384570
115	NC_014376	ACGGA	2	10	145976	145985	40 %	0 %	40 %	20 %	302384570
116	NC_014376	CTGAC	2	10	147632	147641	20 %	20 %	20 %	40 %	302384570
117	NC_014376	TTTCA	2	10	149386	149395	20 %	60 %	0 %	20 %	302384572
118	NC_014376	GATAT	2	10	152789	152798	40 %	40 %	20 %	0 %	302384576
119	NC_014376	ACAGA	2	10	154220	154229	60 %	0 %	20 %	20 %	302384578
120	NC_014376	GAAGG	2	10	154904	154913	40 %	0 %	60 %	0 %	302384578
121	NC_014376	TGGAT	2	10	155193	155202	20 %	40 %	40 %	0 %	302384579
122	NC_014376	AGATC	2	10	155206	155215	40 %	20 %	20 %	20 %	302384579
123	NC_014376	AATGA	2	10	159037	159046	60 %	20 %	20 %	0 %	302384583
124	NC_014376	CATAT	2	10	160922	160931	40 %	40 %	0 %	20 %	302384585
125	NC_014376	TCCCG	2	10	161942	161951	0 %	20 %	20 %	60 %	302384587
126	NC_014376	AAAAT	2	10	163705	163714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014376	CTTTT	2	10	164128	164137	0 %	80 %	0 %	20 %	302384590
128	NC_014376	AAAAT	2	10	168436	168445	80 %	20 %	0 %	0 %	302384596
129	NC_014376	TTTTC	2	10	168473	168482	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_014376	ATCCC	2	10	170574	170583	20 %	20 %	0 %	60 %	302384600
131	NC_014376	AGGAG	2	10	170738	170747	40 %	0 %	60 %	0 %	302384600
132	NC_014376	TGAAA	2	10	171884	171893	60 %	20 %	20 %	0 %	302384600
133	NC_014376	GTCGG	2	10	176991	177000	0 %	20 %	60 %	20 %	302384604
134	NC_014376	GGAGA	2	10	179662	179671	40 %	0 %	60 %	0 %	302384607
135	NC_014376	GCCGG	2	10	181563	181572	0 %	0 %	60 %	40 %	302384608
136	NC_014376	TCCGT	2	10	184165	184174	0 %	40 %	20 %	40 %	302384613
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402	NC_014376	CCGTG	2	10	504710	504719	0 %	20 %	40 %	40 %	302384882
403	NC_014376	TGAGG	2	10	504882	504891	20 %	20 %	60 %	0 %	302384882
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432	NC_014376	TCGGC	2	10	546708	546717	0 %	20 %	40 %	40 %	302384919
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434	NC_014376	GAAAG	2	10	547334	547343	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_014376	TCTTA	2	10	549819	549828	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
439	NC_014376	GACTT	2	10	552805	552814	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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