MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium saccharolyticum WM1 chromosome

Total Repeats: 2889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014376	AGGGA	2	10	2048	2057	40 %	0 %	60 %	0 %	302384446
2	NC_014376	GGAAA	2	10	3791	3800	60 %	0 %	40 %	0 %	302384448
3	NC_014376	AGATA	2	10	4264	4273	60 %	20 %	20 %	0 %	302384448
4	NC_014376	AGGCT	2	10	5734	5743	20 %	20 %	40 %	20 %	302384449
5	NC_014376	GGTAT	2	10	5993	6002	20 %	40 %	40 %	0 %	302384449
6	NC_014376	GCTTT	2	10	12680	12689	0 %	60 %	20 %	20 %	302384453
7	NC_014376	GGAAG	2	10	13151	13160	40 %	0 %	60 %	0 %	302384454
8	NC_014376	CCTCT	2	10	15841	15850	0 %	40 %	0 %	60 %	302384458
9	NC_014376	AACAG	2	10	17293	17302	60 %	0 %	20 %	20 %	302384460
10	NC_014376	ACCAG	2	10	24884	24893	40 %	0 %	20 %	40 %	302384461
11	NC_014376	AGAAA	2	10	27109	27118	80 %	0 %	20 %	0 %	302384463
12	NC_014376	AGAGG	2	10	27129	27138	40 %	0 %	60 %	0 %	302384463
13	NC_014376	TTACT	2	10	27168	27177	20 %	60 %	0 %	20 %	302384463
14	NC_014376	TGTTC	2	10	30833	30842	0 %	60 %	20 %	20 %	302384466
15	NC_014376	TAATA	2	10	31529	31538	60 %	40 %	0 %	0 %	302384467
16	NC_014376	AAGAT	2	10	34444	34453	60 %	20 %	20 %	0 %	302384469
17	NC_014376	CTGTA	2	10	34542	34551	20 %	40 %	20 %	20 %	302384469
18	NC_014376	TTTTA	2	10	37022	37031	20 %	80 %	0 %	0 %	302384471
19	NC_014376	GATGA	2	10	40258	40267	40 %	20 %	40 %	0 %	302384474
20	NC_014376	CCAGG	2	10	41636	41645	20 %	0 %	40 %	40 %	302384477
21	NC_014376	CTTTG	2	10	41750	41759	0 %	60 %	20 %	20 %	302384477
22	NC_014376	AATGT	2	10	42803	42812	40 %	40 %	20 %	0 %	302384478
23	NC_014376	CATCT	2	10	43038	43047	20 %	40 %	0 %	40 %	302384478
24	NC_014376	CAGGC	2	10	43070	43079	20 %	0 %	40 %	40 %	302384478
25	NC_014376	GAAGA	2	10	43499	43508	60 %	0 %	40 %	0 %	302384479
26	NC_014376	CCATT	2	10	43997	44006	20 %	40 %	0 %	40 %	302384479
27	NC_014376	TGACC	2	10	44793	44802	20 %	20 %	20 %	40 %	302384480
28	NC_014376	TGCGG	2	10	45761	45770	0 %	20 %	60 %	20 %	302384482
29	NC_014376	GCCAT	2	10	46717	46726	20 %	20 %	20 %	40 %	302384482
30	NC_014376	TTACC	2	10	48757	48766	20 %	40 %	0 %	40 %	302384483
31	NC_014376	GTATG	2	10	51153	51162	20 %	40 %	40 %	0 %	302384485
32	NC_014376	TGGAC	2	10	51351	51360	20 %	20 %	40 %	20 %	302384485
33	NC_014376	CCAAT	2	10	52093	52102	40 %	20 %	0 %	40 %	302384486
34	NC_014376	GTGCC	2	10	52972	52981	0 %	20 %	40 %	40 %	302384488
35	NC_014376	TTGCA	2	10	53582	53591	20 %	40 %	20 %	20 %	302384488
36	NC_014376	ACCAT	2	10	58491	58500	40 %	20 %	0 %	40 %	302384493
37	NC_014376	AGGAG	2	10	58736	58745	40 %	0 %	60 %	0 %	302384493
38	NC_014376	CCATT	2	10	59206	59215	20 %	40 %	0 %	40 %	302384494
39	NC_014376	CAATA	2	10	59618	59627	60 %	20 %	0 %	20 %	302384495
40	NC_014376	AGGAA	2	10	62344	62353	60 %	0 %	40 %	0 %	302384499
41	NC_014376	TTAAG	2	10	62926	62935	40 %	40 %	20 %	0 %	302384499
42	NC_014376	AAGGA	2	10	65078	65087	60 %	0 %	40 %	0 %	302384501
43	NC_014376	TTTAA	2	10	68982	68991	40 %	60 %	0 %	0 %	302384504
44	NC_014376	AATTT	2	10	69642	69651	40 %	60 %	0 %	0 %	302384505
45	NC_014376	AGACC	2	10	70208	70217	40 %	0 %	20 %	40 %	302384506
46	NC_014376	GGTCA	2	10	72609	72618	20 %	20 %	40 %	20 %	302384506
47	NC_014376	TAAAG	2	10	73073	73082	60 %	20 %	20 %	0 %	302384506
48	NC_014376	GGAGT	2	10	73912	73921	20 %	20 %	60 %	0 %	302384507
49	NC_014376	AAGAA	2	10	74877	74886	80 %	0 %	20 %	0 %	302384507
50	NC_014376	AAGGG	2	10	75246	75255	40 %	0 %	60 %	0 %	302384507
51	NC_014376	AGAAA	2	10	76621	76630	80 %	0 %	20 %	0 %	302384509
52	NC_014376	GACGA	2	10	77258	77267	40 %	0 %	40 %	20 %	302384510
53	NC_014376	TTATC	2	10	83507	83516	20 %	60 %	0 %	20 %	302384516
54	NC_014376	TGGCC	2	10	86147	86156	0 %	20 %	40 %	40 %	302384517
55	NC_014376	TGCAG	2	10	87553	87562	20 %	20 %	40 %	20 %	302384518
56	NC_014376	GATTC	2	10	88423	88432	20 %	40 %	20 %	20 %	302384519
57	NC_014376	TGTTC	2	10	89103	89112	0 %	60 %	20 %	20 %	302384520
58	NC_014376	TTCCT	2	10	89152	89161	0 %	60 %	0 %	40 %	302384520
59	NC_014376	CGCCA	2	10	97066	97075	20 %	0 %	20 %	60 %	302384527
60	NC_014376	CCTGT	2	10	97368	97377	0 %	40 %	20 %	40 %	302384527
61	NC_014376	GTACC	2	10	97944	97953	20 %	20 %	20 %	40 %	302384527
62	NC_014376	GCCGG	2	10	99636	99645	0 %	0 %	60 %	40 %	302384529
63	NC_014376	CATGG	2	10	100966	100975	20 %	20 %	40 %	20 %	302384529
64	NC_014376	ACGGA	2	10	103248	103257	40 %	0 %	40 %	20 %	302384532
65	NC_014376	ACCGA	2	10	107689	107698	40 %	0 %	20 %	40 %	302384534
66	NC_014376	AATCA	2	10	108219	108228	60 %	20 %	0 %	20 %	302384534
67	NC_014376	GTTTT	2	10	109990	109999	0 %	80 %	20 %	0 %	302384537
68	NC_014376	GAACA	2	10	110019	110028	60 %	0 %	20 %	20 %	302384537
69	NC_014376	ATGAA	2	10	110115	110124	60 %	20 %	20 %	0 %	302384538
70	NC_014376	ATTTT	2	10	111449	111458	20 %	80 %	0 %	0 %	302384539
71	NC_014376	GATGA	2	10	114579	114588	40 %	20 %	40 %	0 %	302384542
72	NC_014376	GATTG	2	10	114960	114969	20 %	40 %	40 %	0 %	302384542
73	NC_014376	AGATC	2	10	115118	115127	40 %	20 %	20 %	20 %	302384542
74	NC_014376	CTTTC	2	10	116024	116033	0 %	60 %	0 %	40 %	302384543
75	NC_014376	ATTGG	2	10	116231	116240	20 %	40 %	40 %	0 %	302384543
76	NC_014376	AAGCA	2	10	116834	116843	60 %	0 %	20 %	20 %	302384545
77	NC_014376	AATGA	2	10	120735	120744	60 %	20 %	20 %	0 %	302384548
78	NC_014376	CATTC	2	10	123322	123331	20 %	40 %	0 %	40 %	302384550
79	NC_014376	ACAAA	2	10	124166	124175	80 %	0 %	0 %	20 %	302384552
80	NC_014376	GGCGG	2	10	124265	124274	0 %	0 %	80 %	20 %	302384552
81	NC_014376	TGCCA	2	10	127830	127839	20 %	20 %	20 %	40 %	302384555
82	NC_014376	ATTTG	2	10	128035	128044	20 %	60 %	20 %	0 %	302384555
83	NC_014376	TTTTA	2	10	128416	128425	20 %	80 %	0 %	0 %	302384555
84	NC_014376	ACAGA	2	10	129948	129957	60 %	0 %	20 %	20 %	302384556
85	NC_014376	TGAAA	2	10	130377	130386	60 %	20 %	20 %	0 %	302384557
86	NC_014376	AACCG	2	10	130489	130498	40 %	0 %	20 %	40 %	302384557
87	NC_014376	GGAAC	2	10	130789	130798	40 %	0 %	40 %	20 %	302384557
88	NC_014376	TTTTG	2	10	132160	132169	0 %	80 %	20 %	0 %	302384558
89	NC_014376	TTGAT	2	10	132334	132343	20 %	60 %	20 %	0 %	302384558
90	NC_014376	CCATT	2	10	133611	133620	20 %	40 %	0 %	40 %	302384559
91	NC_014376	CAATC	2	10	133831	133840	40 %	20 %	0 %	40 %	302384559
92	NC_014376	GTTTT	2	10	136214	136223	0 %	80 %	20 %	0 %	302384561
93	NC_014376	GTCCA	2	10	136824	136833	20 %	20 %	20 %	40 %	302384561
94	NC_014376	GAGAT	2	10	137171	137180	40 %	20 %	40 %	0 %	302384561
95	NC_014376	AAGGT	2	10	137743	137752	40 %	20 %	40 %	0 %	302384561
96	NC_014376	ATTGT	2	10	142908	142917	20 %	60 %	20 %	0 %	302384565
97	NC_014376	TCCGG	2	10	144234	144243	0 %	20 %	40 %	40 %	302384567
98	NC_014376	ATCTT	2	10	145408	145417	20 %	60 %	0 %	20 %	302384569
99	NC_014376	CCCAT	2	10	145957	145966	20 %	20 %	0 %	60 %	302384570
100	NC_014376	ACGGA	2	10	145976	145985	40 %	0 %	40 %	20 %	302384570
101	NC_014376	CTGAC	2	10	147632	147641	20 %	20 %	20 %	40 %	302384570
102	NC_014376	TTTCA	2	10	149386	149395	20 %	60 %	0 %	20 %	302384572
103	NC_014376	GATAT	2	10	152789	152798	40 %	40 %	20 %	0 %	302384576
104	NC_014376	ACAGA	2	10	154220	154229	60 %	0 %	20 %	20 %	302384578
105	NC_014376	GAAGG	2	10	154904	154913	40 %	0 %	60 %	0 %	302384578
106	NC_014376	TGGAT	2	10	155193	155202	20 %	40 %	40 %	0 %	302384579
107	NC_014376	AGATC	2	10	155206	155215	40 %	20 %	20 %	20 %	302384579
108	NC_014376	AATGA	2	10	159037	159046	60 %	20 %	20 %	0 %	302384583
109	NC_014376	CATAT	2	10	160922	160931	40 %	40 %	0 %	20 %	302384585
110	NC_014376	TCCCG	2	10	161942	161951	0 %	20 %	20 %	60 %	302384587
111	NC_014376	CTTTT	2	10	164128	164137	0 %	80 %	0 %	20 %	302384590
112	NC_014376	AAAAT	2	10	168436	168445	80 %	20 %	0 %	0 %	302384596
113	NC_014376	ATCCC	2	10	170574	170583	20 %	20 %	0 %	60 %	302384600
114	NC_014376	AGGAG	2	10	170738	170747	40 %	0 %	60 %	0 %	302384600
115	NC_014376	TGAAA	2	10	171884	171893	60 %	20 %	20 %	0 %	302384600
116	NC_014376	GTCGG	2	10	176991	177000	0 %	20 %	60 %	20 %	302384604
117	NC_014376	GGAGA	2	10	179662	179671	40 %	0 %	60 %	0 %	302384607
118	NC_014376	GCCGG	2	10	181563	181572	0 %	0 %	60 %	40 %	302384608
119	NC_014376	TCCGT	2	10	184165	184174	0 %	40 %	20 %	40 %	302384613
120	NC_014376	CAGGA	2	10	185657	185666	40 %	0 %	40 %	20 %	302384614
121	NC_014376	AAGAT	2	10	187293	187302	60 %	20 %	20 %	0 %	302384616
122	NC_014376	CCAGG	2	10	187468	187477	20 %	0 %	40 %	40 %	302384616
123	NC_014376	GGCGG	2	10	188802	188811	0 %	0 %	80 %	20 %	302384617
124	NC_014376	CATTT	2	10	194293	194302	20 %	60 %	0 %	20 %	302384621
125	NC_014376	ACCAG	2	10	194728	194737	40 %	0 %	20 %	40 %	302384622
126	NC_014376	TTTAT	2	10	206124	206133	20 %	80 %	0 %	0 %	302384627
127	NC_014376	GTTCT	2	10	206318	206327	0 %	60 %	20 %	20 %	302384627
128	NC_014376	TAAAA	2	10	208299	208308	80 %	20 %	0 %	0 %	302384630
129	NC_014376	GATAA	2	10	209357	209366	60 %	20 %	20 %	0 %	302384632
130	NC_014376	GAAAT	2	10	209893	209902	60 %	20 %	20 %	0 %	302384633
131	NC_014376	CAATC	2	10	210323	210332	40 %	20 %	0 %	40 %	302384633
132	NC_014376	TAAGC	2	10	213304	213313	40 %	20 %	20 %	20 %	302384635
133	NC_014376	TTAAA	2	10	213669	213678	60 %	40 %	0 %	0 %	302384635
134	NC_014376	GATAC	2	10	214575	214584	40 %	20 %	20 %	20 %	302384636
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