MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium saccharolyticum WM1 chromosome

Total Repeats: 12274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014376	TGGT	2	8	464	471	0 %	50 %	50 %	0 %	302384445
2	NC_014376	CAAC	2	8	1025	1032	50 %	0 %	0 %	50 %	302384445
3	NC_014376	TGGG	2	8	2342	2349	0 %	25 %	75 %	0 %	302384446
4	NC_014376	ACCA	2	8	2383	2390	50 %	0 %	0 %	50 %	302384446
5	NC_014376	GAAA	2	8	3077	3084	75 %	0 %	25 %	0 %	302384447
6	NC_014376	CCAT	2	8	3221	3228	25 %	25 %	0 %	50 %	302384447
7	NC_014376	TCAG	2	8	3288	3295	25 %	25 %	25 %	25 %	302384448
8	NC_014376	CCGG	2	8	3736	3743	0 %	0 %	50 %	50 %	302384448
9	NC_014376	TGGA	2	8	3834	3841	25 %	25 %	50 %	0 %	302384448
10	NC_014376	ATCC	2	8	3850	3857	25 %	25 %	0 %	50 %	302384448
11	NC_014376	GCAG	2	8	3948	3955	25 %	0 %	50 %	25 %	302384448
12	NC_014376	TTGC	2	8	4184	4191	0 %	50 %	25 %	25 %	302384448
13	NC_014376	AATC	2	8	4195	4202	50 %	25 %	0 %	25 %	302384448
14	NC_014376	GTAT	2	8	4438	4445	25 %	50 %	25 %	0 %	302384449
15	NC_014376	ATCC	2	8	4551	4558	25 %	25 %	0 %	50 %	302384449
16	NC_014376	CGGG	2	8	4586	4593	0 %	0 %	75 %	25 %	302384449
17	NC_014376	GCGG	2	8	4662	4669	0 %	0 %	75 %	25 %	302384449
18	NC_014376	GGGT	2	8	4714	4721	0 %	25 %	75 %	0 %	302384449
19	NC_014376	AGAA	2	8	5262	5269	75 %	0 %	25 %	0 %	302384449
20	NC_014376	TCCT	2	8	5698	5705	0 %	50 %	0 %	50 %	302384449
21	NC_014376	TGAA	2	8	6160	6167	50 %	25 %	25 %	0 %	302384449
22	NC_014376	CCTG	2	8	6397	6404	0 %	25 %	25 %	50 %	302384450
23	NC_014376	TGGA	2	8	6633	6640	25 %	25 %	50 %	0 %	302384450
24	NC_014376	TAAG	2	8	6678	6685	50 %	25 %	25 %	0 %	302384450
25	NC_014376	TCCC	2	8	6843	6850	0 %	25 %	0 %	75 %	302384450
26	NC_014376	AGAA	2	8	7398	7405	75 %	0 %	25 %	0 %	302384450
27	NC_014376	ATCC	2	8	7690	7697	25 %	25 %	0 %	50 %	302384450
28	NC_014376	GGAA	2	8	8047	8054	50 %	0 %	50 %	0 %	302384450
29	NC_014376	TCAG	2	8	9059	9066	25 %	25 %	25 %	25 %	302384451
30	NC_014376	TGAA	2	8	9071	9078	50 %	25 %	25 %	0 %	302384451
31	NC_014376	GCAT	2	8	9275	9282	25 %	25 %	25 %	25 %	302384451
32	NC_014376	CTTT	2	8	9495	9502	0 %	75 %	0 %	25 %	302384451
33	NC_014376	TGAT	2	8	9704	9711	25 %	50 %	25 %	0 %	302384451
34	NC_014376	TGAC	2	8	10050	10057	25 %	25 %	25 %	25 %	302384451
35	NC_014376	AATG	2	8	11068	11075	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014376	TTTA	2	8	11178	11185	25 %	75 %	0 %	0 %	302384452
37	NC_014376	ATAA	2	8	11567	11574	75 %	25 %	0 %	0 %	302384453
38	NC_014376	ATTT	2	8	11623	11630	25 %	75 %	0 %	0 %	302384453
39	NC_014376	TTGT	2	8	11738	11745	0 %	75 %	25 %	0 %	302384453
40	NC_014376	CAAA	2	8	11791	11798	75 %	0 %	0 %	25 %	302384453
41	NC_014376	CAGG	2	8	11870	11877	25 %	0 %	50 %	25 %	302384453
42	NC_014376	TTAT	2	8	12113	12120	25 %	75 %	0 %	0 %	302384453
43	NC_014376	TTGT	2	8	12174	12181	0 %	75 %	25 %	0 %	302384453
44	NC_014376	CTGT	2	8	12672	12679	0 %	50 %	25 %	25 %	302384453
45	NC_014376	GAAG	2	8	12921	12928	50 %	0 %	50 %	0 %	302384454
46	NC_014376	CAGA	2	8	12961	12968	50 %	0 %	25 %	25 %	302384454
47	NC_014376	GAAG	2	8	14390	14397	50 %	0 %	50 %	0 %	302384455
48	NC_014376	TTTA	2	8	14493	14500	25 %	75 %	0 %	0 %	302384455
49	NC_014376	AAAG	2	8	14724	14731	75 %	0 %	25 %	0 %	302384456
50	NC_014376	AGAA	2	8	14862	14869	75 %	0 %	25 %	0 %	302384456
51	NC_014376	TTTA	2	8	15122	15129	25 %	75 %	0 %	0 %	302384457
52	NC_014376	AAGG	2	8	15135	15142	50 %	0 %	50 %	0 %	302384457
53	NC_014376	AAAT	2	8	15547	15554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014376	AAAT	2	8	15618	15625	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014376	CAAT	2	8	15997	16004	50 %	25 %	0 %	25 %	302384458
56	NC_014376	TCAT	2	8	16099	16106	25 %	50 %	0 %	25 %	302384458
57	NC_014376	GGAT	2	8	16202	16209	25 %	25 %	50 %	0 %	302384458
58	NC_014376	GAAG	2	8	16244	16251	50 %	0 %	50 %	0 %	302384458
59	NC_014376	ATCA	2	8	16410	16417	50 %	25 %	0 %	25 %	302384458
60	NC_014376	CCCA	2	8	16485	16492	25 %	0 %	0 %	75 %	302384458
61	NC_014376	CCAG	2	8	16784	16791	25 %	0 %	25 %	50 %	302384459
62	NC_014376	TTGA	2	8	17692	17699	25 %	50 %	25 %	0 %	302384460
63	NC_014376	AAGA	2	8	18202	18209	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014376	AAAT	2	8	18361	18368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014376	TAGT	2	8	18373	18380	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014376	AAGC	2	8	18500	18507	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014376	GTGA	2	8	18977	18984	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014376	AAGC	2	8	20256	20263	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014376	GGTG	2	8	20423	20430	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014376	CAAA	2	8	20799	20806	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014376	AAAG	2	8	21131	21138	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014376	ATGT	2	8	22115	22122	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014376	CTGG	2	8	23125	23132	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014376	GGTT	2	8	23805	23812	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014376	ATGG	2	8	24192	24199	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014376	TCAT	2	8	24694	24701	25 %	50 %	0 %	25 %	302384461
77	NC_014376	TTCC	2	8	24843	24850	0 %	50 %	0 %	50 %	302384461
78	NC_014376	ATGA	2	8	25089	25096	50 %	25 %	25 %	0 %	302384462
79	NC_014376	TCAA	2	8	25447	25454	50 %	25 %	0 %	25 %	302384462
80	NC_014376	CTGG	2	8	26093	26100	0 %	25 %	50 %	25 %	302384462
81	NC_014376	GATG	2	8	26327	26334	25 %	25 %	50 %	0 %	302384462
82	NC_014376	ATGA	2	8	26566	26573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014376	AGGA	2	8	26715	26722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014376	GCCT	2	8	27469	27476	0 %	25 %	25 %	50 %	302384463
85	NC_014376	ATGG	2	8	28218	28225	25 %	25 %	50 %	0 %	302384464
86	NC_014376	CTTC	2	8	28666	28673	0 %	50 %	0 %	50 %	302384465
87	NC_014376	CGGA	2	8	29035	29042	25 %	0 %	50 %	25 %	302384465
88	NC_014376	ACAA	2	8	29491	29498	75 %	0 %	0 %	25 %	302384465
89	NC_014376	AGGT	2	8	29573	29580	25 %	25 %	50 %	0 %	302384465
90	NC_014376	CTTT	2	8	29756	29763	0 %	75 %	0 %	25 %	302384465
91	NC_014376	TCAA	2	8	30067	30074	50 %	25 %	0 %	25 %	302384465
92	NC_014376	CCTG	2	8	30553	30560	0 %	25 %	25 %	50 %	302384466
93	NC_014376	AATG	2	8	31141	31148	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014376	TGTT	2	8	31154	31161	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014376	TTCC	2	8	31359	31366	0 %	50 %	0 %	50 %	302384467
96	NC_014376	GGAC	2	8	31508	31515	25 %	0 %	50 %	25 %	302384467
97	NC_014376	GGAA	2	8	31782	31789	50 %	0 %	50 %	0 %	302384467
98	NC_014376	GTCT	2	8	32501	32508	0 %	50 %	25 %	25 %	302384467
99	NC_014376	CCAT	2	8	32696	32703	25 %	25 %	0 %	50 %	302384467
100	NC_014376	ATCA	2	8	32991	32998	50 %	25 %	0 %	25 %	302384468
101	NC_014376	GATT	2	8	33380	33387	25 %	50 %	25 %	0 %	302384468
102	NC_014376	ATTC	2	8	33823	33830	25 %	50 %	0 %	25 %	302384469
103	NC_014376	AACC	2	8	33886	33893	50 %	0 %	0 %	50 %	302384469
104	NC_014376	TCAC	2	8	33906	33913	25 %	25 %	0 %	50 %	302384469
105	NC_014376	ATAG	2	8	34006	34013	50 %	25 %	25 %	0 %	302384469
106	NC_014376	CATG	2	8	34351	34358	25 %	25 %	25 %	25 %	302384469
107	NC_014376	CCAT	2	8	35229	35236	25 %	25 %	0 %	50 %	302384469
108	NC_014376	ACAG	2	8	35638	35645	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014376	AATT	2	8	36668	36675	50 %	50 %	0 %	0 %	302384470
110	NC_014376	CGTT	2	8	36694	36701	0 %	50 %	25 %	25 %	302384471
111	NC_014376	TGAT	2	8	36981	36988	25 %	50 %	25 %	0 %	302384471
112	NC_014376	CTTT	2	8	37235	37242	0 %	75 %	0 %	25 %	302384471
113	NC_014376	AGCC	2	8	37895	37902	25 %	0 %	25 %	50 %	302384472
114	NC_014376	ATGA	2	8	37953	37960	50 %	25 %	25 %	0 %	302384472
115	NC_014376	GGAA	2	8	39172	39179	50 %	0 %	50 %	0 %	302384473
116	NC_014376	GCAG	2	8	39675	39682	25 %	0 %	50 %	25 %	302384474
117	NC_014376	TAAG	2	8	39818	39825	50 %	25 %	25 %	0 %	302384474
118	NC_014376	GGAA	2	8	40272	40279	50 %	0 %	50 %	0 %	302384474
119	NC_014376	ATTT	2	8	40545	40552	25 %	75 %	0 %	0 %	302384475
120	NC_014376	TGAT	2	8	41549	41556	25 %	50 %	25 %	0 %	302384476
121	NC_014376	GCAG	2	8	41568	41575	25 %	0 %	50 %	25 %	302384476
122	NC_014376	ATTT	2	8	41626	41633	25 %	75 %	0 %	0 %	302384477
123	NC_014376	ACTT	2	8	41724	41731	25 %	50 %	0 %	25 %	302384477
124	NC_014376	GGAG	2	8	42058	42065	25 %	0 %	75 %	0 %	302384477
125	NC_014376	GAAA	2	8	42528	42535	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014376	TTCA	2	8	43180	43187	25 %	50 %	0 %	25 %	302384478
127	NC_014376	GCTG	2	8	43640	43647	0 %	25 %	50 %	25 %	302384479
128	NC_014376	TCCA	2	8	44022	44029	25 %	25 %	0 %	50 %	302384479
129	NC_014376	AAAG	2	8	44851	44858	75 %	0 %	25 %	0 %	302384480
130	NC_014376	AAAT	2	8	46064	46071	75 %	25 %	0 %	0 %	302384482
131	NC_014376	CAGC	2	8	47212	47219	25 %	0 %	25 %	50 %	302384483
132	NC_014376	CCGG	2	8	48082	48089	0 %	0 %	50 %	50 %	302384483
133	NC_014376	GCAG	2	8	49422	49429	25 %	0 %	50 %	25 %	302384484
134	NC_014376	GGAC	2	8	49837	49844	25 %	0 %	50 %	25 %	302384484
135	NC_014376	TGGT	2	8	49925	49932	0 %	50 %	50 %	0 %	302384484
136	NC_014376	TGAT	2	8	50588	50595	25 %	50 %	25 %	0 %	302384485
137	NC_014376	AGAT	2	8	52363	52370	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014376	GGAA	2	8	52551	52558	50 %	0 %	50 %	0 %	302384487
139	NC_014376	GAAT	2	8	52897	52904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014376	CAAC	2	8	53788	53795	50 %	0 %	0 %	50 %	302384488
141	NC_014376	GAAA	3	12	53847	53858	75 %	0 %	25 %	0 %	302384488
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143	NC_014376	GGCA	2	8	54177	54184	25 %	0 %	50 %	25 %	302384488
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