MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium saccharolyticum WM1 chromosome

Total Repeats: 1867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014376	AATG	2	8	11068	11075	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014376	AAAT	2	8	15547	15554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014376	AAAT	2	8	15618	15625	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014376	AAGA	2	8	18202	18209	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014376	AAAT	2	8	18361	18368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014376	TAGT	2	8	18373	18380	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014376	AAGC	2	8	18500	18507	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014376	GTGA	2	8	18977	18984	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014376	AAGC	2	8	20256	20263	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014376	GGTG	2	8	20423	20430	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014376	CAAA	2	8	20799	20806	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014376	AAAG	2	8	21131	21138	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014376	ATGT	2	8	22115	22122	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014376	CTGG	2	8	23125	23132	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014376	GGTT	2	8	23805	23812	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014376	ATGG	2	8	24192	24199	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014376	ATGA	2	8	26566	26573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014376	AGGA	2	8	26715	26722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014376	AATG	2	8	31141	31148	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014376	TGTT	2	8	31154	31161	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014376	ACAG	2	8	35638	35645	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014376	GAAA	2	8	42528	42535	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014376	AGAT	2	8	52363	52370	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014376	GAAT	2	8	52897	52904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014376	ATTT	2	8	55701	55708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014376	GGGA	2	8	57860	57867	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014376	ACGA	2	8	62958	62965	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014376	AGAA	2	8	64012	64019	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014376	GCAG	2	8	64124	64131	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014376	TCCT	2	8	66686	66693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014376	TTTG	2	8	70144	70151	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014376	CAGC	2	8	77065	77072	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014376	AGGA	2	8	77150	77157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014376	GAAA	2	8	86624	86631	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014376	TTTC	2	8	93465	93472	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014376	CTTT	2	8	95500	95507	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014376	AAAG	2	8	99326	99333	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014376	GCTT	2	8	104163	104170	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014376	TTAA	2	8	109060	109067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014376	AGGA	2	8	123910	123917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014376	ACTT	2	8	124078	124085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014376	AAAG	2	8	124144	124151	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014376	GAAG	2	8	127080	127087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014376	GTGA	2	8	128852	128859	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014376	TTTG	2	8	131060	131067	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014376	GCAG	2	8	143340	143347	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014376	TCCA	2	8	145771	145778	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014376	AAAG	2	8	168013	168020	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014376	TGAA	2	8	168509	168516	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014376	TAAA	2	8	172604	172611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014376	TGAA	2	8	174631	174638	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014376	ATTT	2	8	178099	178106	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014376	AAAG	2	8	180114	180121	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014376	GGAC	2	8	180189	180196	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014376	AGTA	2	8	182623	182630	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014376	CCTT	2	8	183070	183077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014376	GCAA	2	8	196014	196021	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014376	CAAT	2	8	196210	196217	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014376	AAAT	2	8	196455	196462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014376	TAGT	2	8	196467	196474	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014376	AAGC	2	8	196594	196601	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014376	GTGA	2	8	197071	197078	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014376	AAGC	2	8	198350	198357	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014376	GGTG	2	8	198517	198524	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014376	AATA	3	12	198640	198651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014376	CAAA	2	8	199026	199033	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014376	AAAG	2	8	199358	199365	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014376	ATGT	2	8	200342	200349	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014376	CTGG	2	8	201352	201359	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014376	GGTT	2	8	202032	202039	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014376	GTTA	2	8	202313	202320	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014376	AATT	2	8	202322	202329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014376	TTAG	2	8	203798	203805	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014376	GTTT	2	8	203811	203818	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014376	CTTT	2	8	207348	207355	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014376	TATT	2	8	207448	207455	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014376	AAAT	2	8	210862	210869	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014376	TAAA	2	8	212128	212135	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014376	ATTT	2	8	212160	212167	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014376	TTAA	2	8	212192	212199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014376	ATTT	2	8	212276	212283	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014376	ATAA	2	8	212300	212307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014376	TTTA	2	8	212337	212344	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014376	TAAA	2	8	212567	212574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014376	TATT	2	8	217592	217599	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014376	GCTG	2	8	218008	218015	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014376	TATG	2	8	218525	218532	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014376	TAAT	2	8	219176	219183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014376	CAAG	2	8	220047	220054	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014376	GATG	2	8	220058	220065	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014376	TAAT	2	8	220564	220571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014376	TAAA	2	8	220572	220579	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014376	ATAA	2	8	221488	221495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014376	TTTA	2	8	227779	227786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014376	CTTA	2	8	231748	231755	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014376	GAAA	2	8	232070	232077	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014376	TTAT	2	8	232476	232483	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014376	ATCT	2	8	232623	232630	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014376	AATT	2	8	235725	235732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014376	AGGA	2	8	236590	236597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014376	GAAT	2	8	241894	241901	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014376	ACCA	2	8	242844	242851	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014376	TGTA	2	8	244974	244981	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014376	GAAT	2	8	249005	249012	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014376	AAAG	2	8	250708	250715	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014376	TAAA	2	8	251505	251512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014376	TATT	2	8	251709	251716	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014376	TTAA	2	8	254217	254224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014376	TCTT	2	8	254953	254960	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014376	TGCT	2	8	255971	255978	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014376	TTTG	2	8	263398	263405	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014376	TTTA	2	8	267201	267208	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014376	TCCT	2	8	271819	271826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014376	GGAC	2	8	272027	272034	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014376	CCTG	2	8	287433	287440	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014376	GATT	3	12	294122	294133	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014376	CCAT	2	8	296472	296479	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_014376	ATCA	2	8	300724	300731	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_014376	TTGA	2	8	300857	300864	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014376	ATTC	2	8	304673	304680	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014376	TAGT	2	8	304736	304743	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014376	ATGA	2	8	304763	304770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014376	CCTA	2	8	307577	307584	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_014376	TCCT	2	8	307968	307975	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_014376	GCAA	2	8	316685	316692	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014376	ACTT	2	8	318579	318586	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014376	TTTC	2	8	318884	318891	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014376	AGAA	2	8	320260	320267	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014376	TAAA	2	8	327749	327756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014376	GATG	2	8	329270	329277	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014376	AAGA	2	8	329306	329313	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014376	AGTA	2	8	339881	339888	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014376	TGTC	2	8	341670	341677	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014376	TGTT	2	8	341720	341727	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014376	GGAG	2	8	341753	341760	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014376	TACC	2	8	342581	342588	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_014376	GGAA	2	8	343016	343023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014376	TTTG	2	8	343599	343606	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014376	AAAT	2	8	343669	343676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014376	ATTT	2	8	343689	343696	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014376	AAGG	2	8	343707	343714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014376	TGAA	2	8	350300	350307	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014376	AGGG	2	8	353835	353842	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_014376	TTTC	2	8	366066	366073	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014376	TTTA	2	8	367557	367564	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014376	TTTC	2	8	368671	368678	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_014376	TGCC	2	8	368698	368705	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014376	GAAT	2	8	373782	373789	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014376	TTAT	2	8	382925	382932	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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