MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Brevundimonas subvibrioides ATCC 15264 chromosome

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014375	TCTCCC	2	12	24338	24349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_014375	AGGGGG	2	12	37347	37358	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014375	GCTCCG	2	12	57447	57458	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014375	TCATCC	2	12	61060	61071	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014375	CAACAT	2	12	113097	113108	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014375	CGGGCG	2	12	118242	118253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014375	CGGCGT	2	12	166761	166772	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014375	GGGGGA	2	12	225337	225348	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014375	GACGGT	2	12	264275	264286	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014375	TCCCCC	2	12	284903	284914	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
11	NC_014375	CGTGAG	2	12	294920	294931	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014375	GGGAGG	2	12	340234	340245	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014375	GCCCCA	2	12	381268	381279	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_014375	CACGGC	2	12	384717	384728	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014375	CGGCTG	2	12	384730	384741	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014375	ACCCGA	2	12	399143	399154	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014375	GGGGGA	2	12	465227	465238	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014375	CGGCCG	2	12	540708	540719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014375	CCGGGT	2	12	570568	570579	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014375	TTGACG	2	12	613224	613235	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014375	CCTTGA	2	12	621422	621433	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014375	CCCCGT	2	12	622549	622560	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_014375	GGGGGA	2	12	626905	626916	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014375	GGGGGA	2	12	628651	628662	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014375	TCCCCC	2	12	628752	628763	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
26	NC_014375	GCGCAG	2	12	695530	695541	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014375	CCCGGT	2	12	695563	695574	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014375	GGGGGA	2	12	714357	714368	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014375	TCCCCC	2	12	714462	714473	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
30	NC_014375	GCTGGT	2	12	720754	720765	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014375	CGGCGA	2	12	749259	749270	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014375	CGTTTT	2	12	768170	768181	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014375	CGCCAG	2	12	834586	834597	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014375	GGGACG	2	12	834728	834739	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014375	AGCATC	2	12	853229	853240	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014375	ACCGCC	2	12	861441	861452	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_014375	GAAGGG	2	12	903045	903056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014375	AGGAGC	2	12	903407	903418	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014375	CGAGGG	2	12	939575	939586	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014375	GGGGGA	2	12	947576	947587	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014375	GGGGGA	2	12	952999	953010	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014375	TCCCCC	2	12	953089	953100	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
43	NC_014375	CTCCGG	2	12	985959	985970	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014375	GGGCGT	2	12	989269	989280	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014375	TGAGAA	2	12	1019860	1019871	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014375	GAAGGG	2	12	1027729	1027740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014375	GGGGGA	2	12	1040481	1040492	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014375	TCCCCC	2	12	1040571	1040582	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
49	NC_014375	CCTTCG	2	12	1051215	1051226	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014375	CCGTTC	2	12	1055649	1055660	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014375	GGGGGA	2	12	1064264	1064275	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014375	GCCGGA	2	12	1172303	1172314	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014375	CACGCG	2	12	1172372	1172383	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014375	GGGGGA	2	12	1185950	1185961	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014375	TCCCCC	2	12	1186040	1186051	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
56	NC_014375	GGGGGA	2	12	1209325	1209336	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014375	TCCCCC	2	12	1209415	1209426	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
58	NC_014375	GGGGGA	2	12	1232269	1232280	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014375	TCCCCC	2	12	1232746	1232757	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
60	NC_014375	GGGGGA	2	12	1264903	1264914	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014375	CCCCCG	2	12	1264998	1265009	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
62	NC_014375	TCCCCC	2	12	1268521	1268532	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
63	NC_014375	GGCGGG	2	12	1355454	1355465	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014375	TCGGCC	2	12	1361120	1361131	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014375	CCAGCC	2	12	1368715	1368726	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_014375	CGTGGC	2	12	1507038	1507049	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014375	AGGGGG	2	12	1522462	1522473	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014375	CGAGGG	2	12	1551919	1551930	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_014375	GGCGCC	2	12	1562976	1562987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014375	TGGCCG	2	12	1641868	1641879	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014375	GTTCCG	2	12	1660117	1660128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014375	GTTCCT	2	12	1710647	1710658	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014375	ACCAGA	2	12	1727315	1727326	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014375	CGCCCG	2	12	1778952	1778963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_014375	GGCTCC	2	12	1790383	1790394	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014375	GCGTGC	2	12	1888453	1888464	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014375	GCCAAG	2	12	1977536	1977547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014375	GACATC	2	12	1986607	1986618	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014375	AGGTCG	2	12	1993373	1993384	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014375	TCCCGA	2	12	2026266	2026277	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014375	AGAACC	2	12	2069080	2069091	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014375	TGGTTG	2	12	2085337	2085348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014375	ATCCGA	2	12	2222218	2222229	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014375	GGGGGA	2	12	2235959	2235970	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014375	GACGGC	2	12	2280692	2280703	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014375	TCCCCC	2	12	2332589	2332600	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
87	NC_014375	TCAGGA	2	12	2360141	2360152	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014375	CGCGAC	2	12	2439510	2439521	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014375	AGAGGG	2	12	2473608	2473619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014375	CCCTCT	2	12	2473751	2473762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_014375	CGATCT	2	12	2525351	2525362	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014375	TCGGCC	2	12	2557333	2557344	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014375	GCATCG	2	12	2558181	2558192	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014375	AAGTTA	2	12	2579704	2579715	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014375	CGGGCG	2	12	2651577	2651588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014375	GTATCC	2	12	2669488	2669499	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014375	CCCGGG	2	12	2676605	2676616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014375	CCGAGG	2	12	2688156	2688167	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014375	GGGGGA	2	12	2707200	2707211	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014375	TCCCCC	2	12	2707305	2707316	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
101	NC_014375	CCTTCG	2	12	2709485	2709496	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014375	CGGTGC	2	12	2719643	2719654	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014375	GCCTCG	2	12	2734235	2734246	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014375	AGTGTC	2	12	2755816	2755827	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014375	TCCCCC	2	12	2807494	2807505	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
106	NC_014375	ACGGGG	2	12	2812015	2812026	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014375	GTTGAC	2	12	2955750	2955761	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_014375	TGACGT	2	12	2956130	2956141	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_014375	AGTGTC	2	12	2982104	2982115	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_014375	GGGGGA	2	12	3102166	3102177	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014375	GGGGGA	2	12	3109321	3109332	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014375	GGGGGA	2	12	3122912	3122923	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014375	GAGTAC	2	12	3175618	3175629	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_014375	CGGCCG	2	12	3235625	3235636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014375	GCCGGT	2	12	3235816	3235827	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014375	GGGGGA	2	12	3306287	3306298	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014375	CCCTCT	2	12	3312016	3312027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_014375	CGGAAG	2	12	3377795	3377806	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_014375	CCGATC	2	12	3391427	3391438	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014375	GGACGG	2	12	3435088	3435099	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.