MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidilobus saccharovorans 345-15 chromosome

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014374	AGAAAA	2	12	6562	6573	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014374	AGTGGT	2	12	83953	83964	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014374	GTGGTT	2	12	84014	84025	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014374	GTAGTC	2	12	84104	84115	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014374	AGACCT	2	12	138252	138263	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014374	GCTCCC	2	12	177461	177472	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_014374	GCAAAT	2	12	235899	235910	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014374	AGCCTT	2	12	249163	249174	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014374	ATTAAT	2	12	249498	249509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014374	TAAGCT	2	12	269166	269177	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014374	GCGAAC	2	12	315081	315092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014374	GCCCTA	2	12	357482	357493	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014374	CCTTTA	2	12	371858	371869	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014374	CCCGGC	2	12	374998	375009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_014374	TTAAGG	2	12	408845	408856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014374	TAAAAA	2	12	411176	411187	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014374	TCAGCC	2	12	426854	426865	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014374	AAGGTT	2	12	435884	435895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014374	TAAGCC	2	12	513386	513397	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014374	GCAGAG	2	12	644561	644572	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014374	CCTTAA	2	12	664337	664348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014374	AGGCTT	2	12	673477	673488	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014374	CGTCAT	2	12	678939	678950	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014374	ATAATT	2	12	698139	698150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014374	GCGCCT	2	12	698584	698595	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014374	ACTGGG	2	12	730871	730882	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014374	AGCTTA	2	12	740712	740723	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014374	ATTTTT	2	12	761087	761098	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014374	AGCCTT	2	12	888760	888771	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014374	AGCTTA	2	12	987564	987575	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014374	TAGGGC	2	12	1022908	1022919	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014374	GTTAAC	2	12	1031966	1031977	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014374	GTTAAA	2	12	1070687	1070698	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014374	CCGCAC	2	12	1130879	1130890	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_014374	TTAATA	2	12	1146734	1146745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014374	GGAAAG	2	12	1229706	1229717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014374	TGCGTG	2	12	1252120	1252131	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014374	GGTACT	2	12	1270079	1270090	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014374	GAAAAA	2	12	1273362	1273373	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014374	TTTAAT	2	12	1276335	1276346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014374	TAACTT	2	12	1303575	1303586	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014374	ATTTTA	2	12	1323784	1323795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014374	CCTGGG	2	12	1390959	1390970	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014374	CTTAAA	2	12	1404553	1404564	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014374	AGCTAG	2	12	1429708	1429719	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014374	AAGCTT	2	12	1472992	1473003	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014374	AAAAAT	2	12	1483377	1483388	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.