MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acidilobus saccharovorans 345-15 chromosome

Total Repeats: 684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014374	TGACAT	2	12	1111511	1111522	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302348913
502	NC_014374	TCCTTT	2	12	1121311	1121322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302348928
503	NC_014374	TCTAAC	2	12	1123867	1123878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302348930
504	NC_014374	CTTTTC	2	12	1127501	1127512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302348936
505	NC_014374	CTATAG	2	12	1129967	1129978	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302348939
506	NC_014374	ACAGGT	2	12	1133905	1133916	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302348943
507	NC_014374	TTTCCG	2	12	1136404	1136415	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	302348946
508	NC_014374	CGCTTA	2	12	1140834	1140845	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302348948
509	NC_014374	GCGAGG	2	12	1141330	1141341	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	302348949
510	NC_014374	CCTTTC	2	12	1143584	1143595	0 %	50 %	0 %	50 %	302348952
511	NC_014374	GTACTC	2	12	1147165	1147176	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302348955
512	NC_014374	ATATCG	2	12	1149157	1149168	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302348957
513	NC_014374	ATCTAT	2	12	1153228	1153239	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302348960
514	NC_014374	TGAGGT	2	12	1167313	1167324	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	302348973
515	NC_014374	ACTTCA	2	12	1170095	1170106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302348974
516	NC_014374	GTTAAG	2	12	1173083	1173094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302348977
517	NC_014374	TCAAGT	2	12	1173307	1173318	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302348978
518	NC_014374	CAAGAA	2	12	1173479	1173490	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	302348978
519	NC_014374	GCTTAT	2	12	1174058	1174069	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302348979
520	NC_014374	AGAGGG	2	12	1175437	1175448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302348981
521	NC_014374	CTGGGG	2	12	1184050	1184061	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	302348991
522	NC_014374	AAGCTT	2	12	1185265	1185276	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302348993
523	NC_014374	TATGTC	2	12	1189284	1189295	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302348999
524	NC_014374	GGCCGC	2	12	1190592	1190603	0 %	0 %	50 %	50 %	302349001
525	NC_014374	AGCTCA	2	12	1192371	1192382	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	302349002
526	NC_014374	ATTACT	2	12	1197763	1197774	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	302349008
527	NC_014374	GAGCAC	2	12	1198429	1198440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302349008
528	NC_014374	GCGAGA	2	12	1201012	1201023	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	302349009
529	NC_014374	GGCGAG	2	12	1204342	1204353	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	302349014
530	NC_014374	GAGGTC	2	12	1205266	1205277	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	302349014
531	NC_014374	AAGGGC	2	12	1206884	1206895	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	302349017
532	NC_014374	GAGGTC	2	12	1207136	1207147	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	302349018
533	NC_014374	GCTGAG	2	12	1209894	1209905	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	302349023
534	NC_014374	ACTTGG	2	12	1212947	1212958	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302349027
535	NC_014374	ACTTCA	2	12	1214964	1214975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302349030
536	NC_014374	GACAAG	2	12	1216211	1216222	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	302349032
537	NC_014374	AGCGGC	2	12	1218459	1218470	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	302349034
538	NC_014374	CCCTGG	2	12	1218478	1218489	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	302349034
539	NC_014374	AGCGGC	2	12	1219437	1219448	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	302349035
540	NC_014374	CAGAGG	2	12	1219773	1219784	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	302349035
541	NC_014374	AGGCTG	2	12	1220819	1220830	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	302349037
542	NC_014374	CCTCGC	2	12	1220845	1220856	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	302349037
543	NC_014374	GAGCAG	2	12	1228775	1228786	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	302349043
544	NC_014374	GCGCCC	2	12	1236134	1236145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302349050
545	NC_014374	CTCGGC	2	12	1236349	1236360	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	302349050
546	NC_014374	CAGCGG	2	12	1238002	1238013	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	302349051
547	NC_014374	TCGCTC	2	12	1239199	1239210	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	302349052
548	NC_014374	TTCTCC	2	12	1240549	1240560	0 %	50 %	0 %	50 %	302349054
549	NC_014374	TCCTGG	2	12	1242981	1242992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302349058
550	NC_014374	TGGCGG	2	12	1246431	1246442	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	302349060
551	NC_014374	GAGGTG	2	12	1247268	1247279	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	302349060
552	NC_014374	GCGAGG	2	12	1248477	1248488	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	302349063
553	NC_014374	AAGAGG	2	12	1250867	1250878	50 %	0 %	50 %	0 %	302349066
554	NC_014374	CCTCTT	2	12	1252431	1252442	0 %	50 %	0 %	50 %	302349068
555	NC_014374	CCTGGA	2	12	1259068	1259079	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302349074
556	NC_014374	TCGAGG	2	12	1261261	1261272	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	302349076
557	NC_014374	AAGGTT	2	12	1262035	1262046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302349077
558	NC_014374	GGCCTC	2	12	1263585	1263596	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	302349078
559	NC_014374	ACCTCC	2	12	1263850	1263861	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	302349078
560	NC_014374	TTCCCT	2	12	1263924	1263935	0 %	50 %	0 %	50 %	302349078
561	NC_014374	GGCCAG	2	12	1268041	1268052	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	302349082
562	NC_014374	AGGTTG	2	12	1268795	1268806	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	302349083
563	NC_014374	TAAGGT	2	12	1274721	1274732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302349089
564	NC_014374	CCTCAA	2	12	1278198	1278209	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	302349093
565	NC_014374	CGTCAA	2	12	1279585	1279596	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	302349093
566	NC_014374	CAGCCT	2	12	1280681	1280692	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	302349095
567	NC_014374	CTTGTC	2	12	1284030	1284041	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	302349098
568	NC_014374	TCAAGG	2	12	1292387	1292398	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302349107
569	NC_014374	GTTGCT	2	12	1292401	1292412	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	302349107
570	NC_014374	CGGCCT	2	12	1292816	1292827	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	302349108
571	NC_014374	CAAAGT	2	12	1299465	1299476	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302349114
572	NC_014374	CCGACG	2	12	1302801	1302812	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	302349118
573	NC_014374	CCTGAG	2	12	1309171	1309182	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302349127
574	NC_014374	ATAGAC	2	12	1311181	1311192	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302349128
575	NC_014374	CCCTGG	2	12	1312729	1312740	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	302349129
576	NC_014374	ACCAGG	2	12	1313989	1314000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302349130
577	NC_014374	GTGGCC	2	12	1316351	1316362	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	302349133
578	NC_014374	GTGCCC	2	12	1320198	1320209	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	302349138
579	NC_014374	CTAGTC	2	12	1322035	1322046	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302349139
580	NC_014374	CGGGGG	2	12	1323161	1323172	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	302349141
581	NC_014374	GAGTCC	2	12	1323594	1323605	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302349141
582	NC_014374	CACCTA	2	12	1324853	1324864	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	302349142
583	NC_014374	AGGGCG	2	12	1329215	1329226	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	302349146
584	NC_014374	CTTCCA	2	12	1330419	1330430	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	302349149
585	NC_014374	AGGAGC	2	12	1331940	1331951	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	302349151
586	NC_014374	ACACCA	2	12	1332120	1332131	50 %	0 %	0 %	50 %	302349151
587	NC_014374	TCCACC	2	12	1333255	1333266	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	302349152
588	NC_014374	CTTGAC	2	12	1334394	1334405	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302349152
589	NC_014374	CAGGAG	2	12	1335204	1335215	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	302349152
590	NC_014374	GGCCTG	2	12	1338932	1338943	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	302349157
591	NC_014374	CATGGC	2	12	1339975	1339986	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302349158
592	NC_014374	AGGACG	2	12	1341522	1341533	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	302349161
593	NC_014374	CGAGGA	2	12	1341964	1341975	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	302349161
594	NC_014374	GCCCCA	2	12	1342260	1342271	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	302349162
595	NC_014374	ACGCTG	2	12	1344626	1344637	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302349164
596	NC_014374	CCGTCC	2	12	1345227	1345238	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	302349165
597	NC_014374	CCGAAG	2	12	1346778	1346789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302349165
598	NC_014374	CAGCGA	2	12	1347512	1347523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302349165
599	NC_014374	GGGGCA	2	12	1347742	1347753	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	302349165
600	NC_014374	TGCCGG	2	12	1348249	1348260	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	302349166
601	NC_014374	CGCGGC	2	12	1348824	1348835	0 %	0 %	50 %	50 %	302349167
602	NC_014374	CATGGC	2	12	1351260	1351271	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302349169
603	NC_014374	GACATA	2	12	1352749	1352760	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	302349170
604	NC_014374	ACCACG	2	12	1358253	1358264	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	302349175
605	NC_014374	GTGGTC	2	12	1361275	1361286	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	302349178
606	NC_014374	CTATTG	2	12	1364282	1364293	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302349181
607	NC_014374	CCCCAG	2	12	1364371	1364382	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	302349181
608	NC_014374	ACCCTG	2	12	1365155	1365166	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	302349182
609	NC_014374	GCCCTG	2	12	1372542	1372553	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	302349187
610	NC_014374	AGGGGC	2	12	1373871	1373882	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	302349188
611	NC_014374	ACCTGT	2	12	1374450	1374461	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302349189
612	NC_014374	GTGCCC	2	12	1378688	1378699	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	302349193
613	NC_014374	CAGGGG	2	12	1379681	1379692	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	302349194
614	NC_014374	CGGCCA	2	12	1380689	1380700	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	302349194
615	NC_014374	AACCCC	2	12	1382495	1382506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302349195
616	NC_014374	GGCGAC	2	12	1383221	1383232	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	302349195
617	NC_014374	GCCTCG	2	12	1385429	1385440	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	302349199
618	NC_014374	CATAGT	2	12	1386636	1386647	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302349200
619	NC_014374	GTAGTG	2	12	1390635	1390646	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	302349203
620	NC_014374	CTCAGG	2	12	1391653	1391664	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302349205
621	NC_014374	AGGAAG	2	12	1392157	1392168	50 %	0 %	50 %	0 %	302349205
622	NC_014374	CAGGGG	2	12	1392890	1392901	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	302349206
623	NC_014374	CAGCGA	2	12	1395536	1395547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302349208
624	NC_014374	CTCAAT	2	12	1395688	1395699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302349209
625	NC_014374	AGGCCA	2	12	1396125	1396136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302349210
626	NC_014374	GGCGCT	2	12	1398342	1398353	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	302349212
627	NC_014374	GCGAGG	2	12	1401329	1401340	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	302349214
628	NC_014374	GTGGCC	2	12	1405930	1405941	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	302349216
629	NC_014374	GAGCAC	2	12	1407284	1407295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302349217
630	NC_014374	TCCAGG	2	12	1412917	1412928	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302349219
631	NC_014374	TTGTAG	2	12	1416026	1416037	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	302349221
632	NC_014374	CAGCCT	2	12	1417138	1417149	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	302349221
633	NC_014374	GCTCAG	2	12	1417504	1417515	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302349221
634	NC_014374	GAGAGG	2	12	1417722	1417733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302349222
635	NC_014374	GCCCAT	2	12	1418345	1418356	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	302349223
636	NC_014374	GGCCTC	2	12	1418819	1418830	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	302349224
637	NC_014374	AGGTTC	2	12	1420272	1420283	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302349226
638	NC_014374	GTCCCT	2	12	1421639	1421650	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	302349228
639	NC_014374	TCGGCT	2	12	1423439	1423450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302349231
640	NC_014374	CTGAGC	2	12	1424356	1424367	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302349232
641	NC_014374	AGCTCC	2	12	1425787	1425798	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	302349234
642	NC_014374	TGGGCA	2	12	1426890	1426901	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	302349235
643	NC_014374	ACGTCA	2	12	1428615	1428626	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	302349236
644	NC_014374	CCCGGC	2	12	1429371	1429382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302349237
645	NC_014374	GCGGCA	2	12	1429861	1429872	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	302349238
646	NC_014374	CCTGAA	2	12	1429937	1429948	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	302349238
647	NC_014374	CCATTG	2	12	1430680	1430691	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302349238
648	NC_014374	GCCGAC	2	12	1431202	1431213	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	302349240
649	NC_014374	TTCTCC	2	12	1431527	1431538	0 %	50 %	0 %	50 %	302349240
650	NC_014374	GTTCTT	2	12	1432538	1432549	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	302349241
651	NC_014374	CAGGGT	2	12	1434226	1434237	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	302349244
652	NC_014374	GGCGGA	2	12	1434661	1434672	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	302349244
653	NC_014374	GCCCTG	2	12	1437214	1437225	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	302349247
654	NC_014374	CACGAA	2	12	1443412	1443423	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	302349251
655	NC_014374	GTAGAG	2	12	1443829	1443840	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	302349251
656	NC_014374	CAAGGC	2	12	1445379	1445390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302349253
657	NC_014374	CTGATA	2	12	1445706	1445717	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302349254
658	NC_014374	AGCACC	2	12	1447149	1447160	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	302349256
659	NC_014374	TGCCCC	2	12	1448266	1448277	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	302349256
660	NC_014374	CCCTCT	2	12	1449109	1449120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302349256
661	NC_014374	AGGCCC	2	12	1451245	1451256	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	302349260
662	NC_014374	CCTGAC	2	12	1452005	1452016	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	302349261
663	NC_014374	TCTTCG	2	12	1455893	1455904	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	302349264
664	NC_014374	TGGGCT	2	12	1458069	1458080	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	302349265
665	NC_014374	GAGGCC	2	12	1462828	1462839	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	302349271
666	NC_014374	CTCTAC	2	12	1466879	1466890	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	302349277
667	NC_014374	GGACAG	2	12	1468473	1468484	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	302349279
668	NC_014374	AGGCGT	2	12	1470084	1470095	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	302349282
669	NC_014374	CTATGC	2	12	1470192	1470203	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302349282
670	NC_014374	TCCCTC	2	12	1471979	1471990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302349284
671	NC_014374	GACCTT	2	12	1472044	1472055	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302349284
672	NC_014374	GGGCTC	2	12	1473656	1473667	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	302349285
673	NC_014374	CTCGAG	2	12	1473758	1473769	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302349285
674	NC_014374	GCCGAG	2	12	1475624	1475635	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	302349286
675	NC_014374	CTGCTA	2	12	1477553	1477564	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302349289
676	NC_014374	GGGGAG	2	12	1477566	1477577	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	302349289
677	NC_014374	CAGGGC	2	12	1481415	1481426	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	302349295
678	NC_014374	ATGCCG	2	12	1482274	1482285	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302349295
679	NC_014374	GTAGGT	2	12	1482396	1482407	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	302349295
680	NC_014374	GAAGGC	2	12	1482852	1482863	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	302349295
681	NC_014374	GTGAAG	2	12	1485721	1485732	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	302349297
682	NC_014374	CACGTC	2	12	1493440	1493451	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	302349300
683	NC_014374	CACGAG	2	12	1493473	1493484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302349300
684	NC_014374	TGGCGT	2	12	1494844	1494855	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	302349301

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.