MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidilobus saccharovorans 345-15 chromosome

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014374	TTTTG	2	10	16314	16323	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014374	AGTTC	2	10	16804	16813	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014374	GCACG	2	10	17854	17863	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_014374	ACCCT	2	10	29019	29028	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_014374	TCGGC	2	10	59336	59345	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_014374	TAAAA	2	10	60530	60539	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014374	GCCCG	2	10	84163	84172	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8	NC_014374	GGCCA	2	10	108767	108776	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_014374	AGGCT	2	10	126746	126755	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014374	AGCCC	2	10	162820	162829	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_014374	GCTTT	2	10	165536	165545	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014374	GGAAA	2	10	172914	172923	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014374	GGGGT	2	10	173162	173171	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014374	CTACG	2	10	173808	173817	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_014374	CCTGG	2	10	174238	174247	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_014374	AGGCC	2	10	174488	174497	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_014374	CACGG	2	10	174522	174531	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_014374	CGCGG	2	10	175668	175677	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_014374	CGAGC	2	10	176047	176056	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_014374	GCGCC	2	10	177688	177697	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_014374	CGCCT	2	10	205584	205593	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_014374	GCCAC	2	10	206267	206276	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_014374	AGGCA	2	10	206328	206337	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014374	TAGTT	2	10	212545	212554	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014374	AGGCA	2	10	221103	221112	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014374	CTTTT	2	10	225241	225250	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014374	CTTCA	2	10	234032	234041	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_014374	CTATA	2	10	235971	235980	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014374	CTAAG	2	10	239507	239516	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014374	CTTAA	2	10	241903	241912	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014374	AAACG	2	10	250141	250150	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014374	TGATT	2	10	252625	252634	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014374	CTCTG	2	10	253528	253537	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_014374	TGGAA	2	10	258239	258248	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014374	AACTT	2	10	265232	265241	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014374	TTAGG	2	10	268780	268789	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014374	TAGAG	2	10	280608	280617	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014374	AAGGG	2	10	300659	300668	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014374	TAACT	2	10	314510	314519	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014374	ATGTA	2	10	320657	320666	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014374	TAAGG	2	10	353868	353877	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014374	TCCAT	2	10	361281	361290	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_014374	TTTCA	2	10	364384	364393	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014374	GCTTC	2	10	369110	369119	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_014374	GCTGA	2	10	398659	398668	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014374	TTACC	2	10	399336	399345	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_014374	GCCCT	2	10	407188	407197	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
48	NC_014374	TAAAA	3	15	421889	421903	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014374	CTTAA	2	10	429237	429246	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014374	GTAAG	2	10	431946	431955	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014374	GAAGG	2	10	444617	444626	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014374	TATAA	2	10	444685	444694	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014374	GGCCG	2	10	479905	479914	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
54	NC_014374	GCGGT	2	10	484365	484374	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014374	AGGAA	2	10	484386	484395	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014374	TAAAA	2	10	493427	493436	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014374	AATGC	2	10	501203	501212	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014374	CTTTT	2	10	543097	543106	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014374	CTTTA	2	10	599150	599159	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014374	GTGAG	2	10	604164	604173	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014374	TATTT	2	10	616893	616902	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014374	CCTTT	2	10	664349	664358	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_014374	AGTAG	2	10	664567	664576	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014374	CTTAA	2	10	667017	667026	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014374	AAAGC	2	10	678198	678207	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014374	TCATA	2	10	684945	684954	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014374	GTTGA	2	10	694424	694433	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014374	CCGCC	2	10	699182	699191	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
69	NC_014374	CCTGG	2	10	720803	720812	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_014374	AGTAT	2	10	740866	740875	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014374	AGCTT	2	10	748342	748351	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014374	AGAGA	2	10	751938	751947	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014374	GGCCA	2	10	753849	753858	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_014374	GCCCA	2	10	753882	753891	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_014374	CCCAG	2	10	755903	755912	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
76	NC_014374	GTTAA	2	10	761163	761172	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014374	CTGGC	2	10	763481	763490	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_014374	TTAGC	2	10	791181	791190	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_014374	AGCAA	2	10	811963	811972	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_014374	GAAAA	2	10	835004	835013	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014374	TTACA	2	10	852192	852201	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014374	ATTTT	2	10	865213	865222	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014374	TTATA	2	10	900057	900066	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014374	GCGCC	2	10	924235	924244	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
85	NC_014374	GGCCG	2	10	928225	928234	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
86	NC_014374	CTAAC	2	10	933770	933779	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_014374	CCGGG	2	10	939451	939460	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
88	NC_014374	CATAC	2	10	940559	940568	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_014374	AGCTA	2	10	956325	956334	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_014374	ATTTG	2	10	981301	981310	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014374	AGGGG	2	10	987394	987403	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014374	TAGCT	2	10	988025	988034	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_014374	CTATT	2	10	988110	988119	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014374	CTTTT	2	10	989867	989876	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014374	TCTTT	2	10	997977	997986	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014374	GCATT	2	10	1019368	1019377	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_014374	TCCTG	2	10	1044760	1044769	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_014374	CTATA	2	10	1065011	1065020	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_014374	GCCTT	2	10	1075973	1075982	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_014374	CGTAA	2	10	1076098	1076107	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_014374	CATAA	2	10	1084608	1084617	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014374	TAGGT	2	10	1093148	1093157	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014374	GTTAG	2	10	1095655	1095664	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014374	AAGAA	2	10	1103968	1103977	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014374	TCTAG	2	10	1106005	1106014	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_014374	GAGCT	2	10	1106916	1106925	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_014374	GACTG	2	10	1111057	1111066	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_014374	CGAGG	2	10	1121886	1121895	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
109	NC_014374	TTACA	2	10	1156614	1156623	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014374	TCTAC	2	10	1164218	1164227	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_014374	CCGCA	2	10	1212038	1212047	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_014374	AAGCT	2	10	1216635	1216644	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_014374	TCCTT	2	10	1220547	1220556	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_014374	AGAAA	2	10	1229693	1229702	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014374	TTAAG	2	10	1233564	1233573	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014374	TCAAA	2	10	1236791	1236800	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014374	TTTTA	2	10	1244866	1244875	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014374	AAGAA	2	10	1266948	1266957	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014374	TAGCT	2	10	1290039	1290048	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014374	AGCCA	2	10	1331523	1331532	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_014374	CCCCT	2	10	1332894	1332903	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
122	NC_014374	CGGCG	2	10	1356051	1356060	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
123	NC_014374	ATTTT	2	10	1404378	1404387	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014374	TATCT	2	10	1404400	1404409	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_014374	GCCCC	2	10	1404804	1404813	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
126	NC_014374	GAAAA	2	10	1429751	1429760	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014374	AGGCA	2	10	1456162	1456171	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_014374	CTTAG	2	10	1459448	1459457	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014374	AGAAA	2	10	1479964	1479973	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014374	AATGA	2	10	1480188	1480197	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014374	ACAAA	2	10	1481077	1481086	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014374	GGGCA	2	10	1483600	1483609	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014374	GCCCT	2	10	1486722	1486731	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
134	NC_014374	GCAAC	2	10	1496188	1496197	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.