MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidilobus saccharovorans 345-15 chromosome

Total Repeats: 356

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014374	GAAA	3	12	6214	6225	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014374	TTTC	2	8	16019	16026	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014374	ATCA	2	8	16116	16123	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014374	TCTT	2	8	16286	16293	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014374	TCCA	2	8	16375	16382	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014374	GAAA	2	8	16610	16617	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014374	GGTT	2	8	16962	16969	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014374	CTGG	2	8	17275	17282	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014374	GCCC	2	8	17413	17420	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_014374	TGGA	2	8	17735	17742	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014374	CCCT	2	8	19347	19354	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_014374	CCTC	2	8	22353	22360	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_014374	GGGC	2	8	29029	29036	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014374	TACT	2	8	29056	29063	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014374	CCTC	2	8	30013	30020	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_014374	AGGG	2	8	30361	30368	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014374	CACG	2	8	30552	30559	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014374	CACC	2	8	30639	30646	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_014374	CCTG	2	8	30804	30811	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014374	GGCC	2	8	31041	31048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014374	CGGC	2	8	33382	33389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014374	GCCT	2	8	48299	48306	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014374	GACC	2	8	49105	49112	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014374	TTAA	2	8	59288	59295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014374	TTAA	2	8	59298	59305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014374	CAGG	2	8	73773	73780	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014374	TAAA	2	8	76678	76685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014374	GCCC	2	8	80991	80998	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_014374	CGTC	2	8	88319	88326	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014374	CCTT	2	8	99760	99767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014374	GGGC	2	8	101540	101547	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014374	AACT	2	8	111012	111019	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014374	CTTA	2	8	120406	120413	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014374	CGAC	2	8	125521	125528	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014374	ACAA	2	8	133527	133534	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014374	ATTT	2	8	135570	135577	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014374	GCCT	2	8	138358	138365	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014374	CAGC	2	8	143620	143627	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014374	CTAA	2	8	145575	145582	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014374	AGCT	2	8	157166	157173	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014374	GGCT	2	8	162743	162750	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014374	CCTC	2	8	172376	172383	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_014374	GGGC	2	8	173373	173380	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014374	GGTG	2	8	173746	173753	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014374	CACC	2	8	173899	173906	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_014374	TCCT	2	8	174319	174326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014374	CGCC	2	8	174734	174741	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_014374	GATT	2	8	175870	175877	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014374	CTCC	2	8	176355	176362	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_014374	TCCT	2	8	176627	176634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014374	CGGG	2	8	176958	176965	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014374	CGCC	2	8	176972	176979	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_014374	CGCC	2	8	181664	181671	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_014374	TAGC	2	8	186139	186146	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014374	CCCG	2	8	186963	186970	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56	NC_014374	CTTT	2	8	192355	192362	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014374	AGTT	2	8	196290	196297	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014374	TAAT	2	8	205499	205506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014374	TCCC	2	8	205755	205762	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
60	NC_014374	CCCT	2	8	213131	213138	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
61	NC_014374	ACTT	2	8	213144	213151	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014374	TATT	2	8	215985	215992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014374	TCTA	2	8	229243	229250	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014374	GCAT	2	8	229291	229298	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014374	GCTG	2	8	232227	232234	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014374	GGAT	2	8	235623	235630	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014374	TTTC	2	8	239603	239610	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014374	TCCT	2	8	246699	246706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014374	AGGG	2	8	249761	249768	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014374	GCCC	2	8	252674	252681	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_014374	CTTT	2	8	254603	254610	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014374	TAAA	2	8	254629	254636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014374	GCTA	2	8	256920	256927	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014374	CAGG	2	8	258384	258391	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014374	ATTA	2	8	264458	264465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014374	CCGG	2	8	265166	265173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014374	GATA	2	8	265267	265274	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014374	TTTC	2	8	274602	274609	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014374	ACCC	2	8	277169	277176	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_014374	CCTG	2	8	279719	279726	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014374	GCTC	2	8	280094	280101	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014374	GTAG	2	8	280573	280580	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014374	TAAA	2	8	283308	283315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014374	AGCG	2	8	287309	287316	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014374	TGCC	2	8	294206	294213	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014374	TAAA	2	8	315133	315140	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014374	CGAG	2	8	315174	315181	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014374	TGCG	2	8	323821	323828	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014374	CAGG	2	8	326954	326961	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014374	GCTA	2	8	344482	344489	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014374	TGAG	2	8	359639	359646	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014374	ATAA	2	8	371896	371903	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014374	CAGG	2	8	387367	387374	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014374	TTAA	2	8	388958	388965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014374	CTTG	2	8	388983	388990	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014374	CAAG	2	8	395795	395802	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014374	AAAT	2	8	411197	411204	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014374	CCGG	2	8	416995	417002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014374	TTAA	2	8	418124	418131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014374	TAAC	2	8	419619	419626	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014374	GAAA	2	8	427392	427399	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014374	TTGT	2	8	431872	431879	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014374	CAGC	2	8	431959	431966	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014374	CAGG	2	8	435376	435383	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_014374	GCCT	2	8	435642	435649	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014374	AGCT	2	8	446819	446826	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014374	TACC	2	8	456833	456840	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014374	GCAG	2	8	464740	464747	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014374	AGTA	3	12	483405	483416	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014374	AGAA	2	8	495966	495973	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014374	TATT	2	8	496035	496042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014374	TTAC	2	8	503375	503382	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014374	CTTC	2	8	507113	507120	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014374	TATG	2	8	508893	508900	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014374	TCCT	2	8	513357	513364	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014374	GGTG	2	8	516045	516052	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014374	GGAC	2	8	524607	524614	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014374	AGTG	2	8	525816	525823	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014374	CGGG	2	8	525830	525837	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014374	TGCA	2	8	525968	525975	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014374	TTAA	2	8	527804	527811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014374	TAGG	2	8	537889	537896	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014374	ATAG	2	8	538024	538031	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014374	GCAA	2	8	545197	545204	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014374	GGCA	2	8	550673	550680	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014374	CTTC	2	8	563760	563767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014374	ATAG	2	8	573010	573017	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014374	TATC	2	8	575176	575183	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014374	GGGC	2	8	578705	578712	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014374	GTCT	2	8	594596	594603	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014374	GGGA	2	8	600660	600667	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014374	TAAA	2	8	603997	604004	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014374	ATTA	2	8	615614	615621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014374	AGAT	2	8	621083	621090	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014374	CAGA	2	8	626395	626402	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014374	GGCT	2	8	643990	643997	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014374	TATC	2	8	644234	644241	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014374	CACC	2	8	644690	644697	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
139	NC_014374	TTGG	2	8	644785	644792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014374	GGCA	2	8	652074	652081	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014374	AGGT	2	8	652234	652241	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014374	GCCC	2	8	653970	653977	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
143	NC_014374	CCGC	2	8	658162	658169	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
144	NC_014374	CCAC	2	8	658201	658208	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
145	NC_014374	GGCC	2	8	663383	663390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_014374	CGGT	2	8	663473	663480	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_014374	CAGC	2	8	664399	664406	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_014374	CCTG	2	8	666274	666281	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014374	TGCA	2	8	666506	666513	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014374	CCTA	2	8	666954	666961	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_014374	CATC	2	8	676956	676963	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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343	NC_014374	CTGG	2	8	1458204	1458211	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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348	NC_014374	ATAG	2	8	1479121	1479128	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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350	NC_014374	GGGC	2	8	1481133	1481140	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
351	NC_014374	GTCG	2	8	1483566	1483573	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
352	NC_014374	GCGG	2	8	1486615	1486622	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
353	NC_014374	ACTT	2	8	1486800	1486807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
354	NC_014374	CAGC	2	8	1492332	1492339	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
355	NC_014374	GGAG	2	8	1492968	1492975	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
356	NC_014374	TCAC	2	8	1495839	1495846	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.