MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Prevotella melaninogenica ATCC 25845 chromosome II

Total Repeats: 317

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014371	ACAAA	2	10	1736	1745	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014371	TTTTA	2	10	8982	8991	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014371	GAATT	2	10	10558	10567	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014371	TTTTA	2	10	11184	11193	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014371	TATAT	2	10	11333	11342	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014371	TATTT	2	10	13295	13304	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014371	TTATT	2	10	13412	13421	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014371	TTATT	2	10	13472	13481	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014371	TCCCC	2	10	14297	14306	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
10	NC_014371	ATACA	2	10	14524	14533	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014371	GGGGA	2	10	14553	14562	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014371	AGTTT	2	10	17613	17622	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014371	CATTA	2	10	39505	39514	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014371	CTTAG	2	10	39956	39965	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014371	TATAA	2	10	46550	46559	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014371	ATTAT	2	10	48243	48252	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014371	GGAGT	2	10	66595	66604	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014371	TTTGC	2	10	70132	70141	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_014371	AACTT	2	10	75119	75128	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014371	TAACA	2	10	75163	75172	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014371	GTGTA	2	10	76962	76971	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014371	GGGGA	2	10	93290	93299	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014371	TTTCT	2	10	94823	94832	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014371	TAATT	2	10	98875	98884	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014371	AATTC	2	10	115432	115441	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014371	TTCGT	2	10	120478	120487	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014371	TGTTT	2	10	128402	128411	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014371	TTCTT	2	10	128478	128487	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014371	CTTTT	2	10	133331	133340	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014371	ACAAA	2	10	135575	135584	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014371	ATTAA	2	10	135593	135602	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014371	AATCA	2	10	140818	140827	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014371	AACAC	2	10	143334	143343	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_014371	AAAGA	2	10	147678	147687	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014371	TTTAT	2	10	150305	150314	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014371	TATGA	2	10	150842	150851	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014371	TTGTT	2	10	167076	167085	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014371	AATAA	2	10	196883	196892	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014371	TTTTA	2	10	197198	197207	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014371	CTCCC	2	10	202851	202860	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
41	NC_014371	ATTAA	2	10	204932	204941	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014371	CGAAG	2	10	208100	208109	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014371	CTCCC	2	10	212787	212796	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
44	NC_014371	TAAAC	2	10	217975	217984	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014371	AAGAA	2	10	219562	219571	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014371	ATTAA	2	10	221361	221370	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014371	CCTCC	2	10	226723	226732	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
48	NC_014371	TTCGG	2	10	226757	226766	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_014371	ATTTT	2	10	238976	238985	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014371	ATGTA	2	10	239153	239162	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014371	AGGTT	2	10	239264	239273	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014371	CATAC	2	10	239943	239952	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_014371	CATTT	2	10	242910	242919	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014371	TAAAA	2	10	243055	243064	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014371	TCTTT	2	10	259702	259711	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014371	ATAGG	2	10	262150	262159	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014371	ATAAA	2	10	266107	266116	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014371	AGTTT	2	10	270441	270450	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014371	TGTTA	2	10	272205	272214	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014371	TTTGT	2	10	288143	288152	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014371	AAAAG	2	10	297087	297096	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014371	TGTTT	2	10	308505	308514	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014371	TTATC	2	10	309731	309740	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014371	CAATA	2	10	322601	322610	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014371	TGAGG	2	10	322691	322700	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014371	GTTGT	2	10	323372	323381	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014371	TTTAA	2	10	324166	324175	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014371	TTCAG	2	10	326680	326689	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014371	TTACT	2	10	332168	332177	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014371	TGCAA	2	10	336250	336259	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014371	TTTTA	2	10	342207	342216	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014371	TTTGT	2	10	355376	355385	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014371	ATTGC	2	10	375632	375641	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014371	GAATA	2	10	377142	377151	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014371	TAAAA	2	10	386206	386215	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014371	ATCGA	2	10	387374	387383	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_014371	AAAAT	2	10	393737	393746	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014371	CTTTT	2	10	399438	399447	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_014371	ATTTT	2	10	401262	401271	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014371	TATCT	2	10	401308	401317	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014371	TATAA	2	10	406584	406593	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014371	CTTTT	2	10	412501	412510	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014371	TGATT	2	10	416875	416884	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014371	TAAAG	2	10	421470	421479	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014371	CTTAT	2	10	422564	422573	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014371	ATAAA	2	10	426760	426769	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014371	AGAAA	2	10	428933	428942	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014371	GAATA	2	10	431071	431080	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014371	TCCTT	2	10	450596	450605	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_014371	TAAAA	2	10	451508	451517	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014371	AAAGG	2	10	464436	464445	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014371	TTGAG	2	10	466837	466846	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014371	GTTTT	2	10	470223	470232	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014371	TTCTA	2	10	473357	473366	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014371	AAGGT	2	10	475937	475946	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014371	TTTGT	2	10	476690	476699	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014371	ACAAA	2	10	479382	479391	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_014371	AATAC	2	10	484319	484328	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_014371	ACTTT	2	10	485238	485247	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_014371	TAAAA	2	10	491122	491131	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014371	GCTTT	2	10	494538	494547	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014371	TATCT	2	10	494717	494726	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014371	TGAAG	2	10	494762	494771	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014371	TATAA	2	10	495315	495324	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014371	GAAAG	2	10	500007	500016	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014371	AATAG	2	10	504760	504769	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014371	TAAAG	2	10	521409	521418	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014371	GTTTA	2	10	525763	525772	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014371	ATATA	2	10	537017	537026	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014371	ATGAT	2	10	556139	556148	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014371	ATGTA	2	10	557751	557760	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014371	TATAA	2	10	560959	560968	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014371	TAATA	2	10	563918	563927	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014371	CAAAA	2	10	566503	566512	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014371	AACCT	2	10	569803	569812	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_014371	TAGAT	2	10	575511	575520	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014371	TCATC	2	10	581188	581197	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_014371	GCAAA	2	10	581468	581477	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014371	ATTAT	2	10	592740	592749	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014371	TAAAT	2	10	593246	593255	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014371	GTATT	2	10	598098	598107	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014371	TTTAA	2	10	606197	606206	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014371	CTTTT	2	10	606334	606343	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014371	CAATT	2	10	612730	612739	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_014371	CCTTA	2	10	615516	615525	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_014371	AAAGA	2	10	619598	619607	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014371	ATAAC	2	10	622460	622469	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_014371	CTTTT	2	10	624943	624952	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014371	ACTTT	2	10	633777	633786	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_014371	TAAAA	2	10	635878	635887	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014371	TTTTA	2	10	644115	644124	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014371	TTTTA	2	10	646175	646184	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014371	AGAAA	2	10	651485	651494	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014371	AGAAA	2	10	651501	651510	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014371	GTCTT	2	10	651732	651741	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_014371	TTAAT	2	10	660923	660932	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014371	ATATT	2	10	660975	660984	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014371	TTTTA	2	10	674409	674418	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014371	AATAA	2	10	674679	674688	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014371	TTTTA	2	10	683970	683979	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014371	TAAGT	2	10	684026	684035	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014371	CTTTA	2	10	703244	703253	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_014371	CAAAA	2	10	705944	705953	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_014371	AAAAC	2	10	705995	706004	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_014371	CTCTT	2	10	717258	717267	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_014371	TCAAC	2	10	717313	717322	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
147	NC_014371	AATAA	2	10	728568	728577	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014371	GATAG	2	10	745066	745075	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014371	AATAC	2	10	747728	747737	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_014371	AAACA	2	10	747748	747757	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_014371	CTAAA	2	10	768965	768974	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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186	NC_014371	AGTAA	2	10	886068	886077	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_014371	TGGGG	2	10	1252398	1252407	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_014371	GACAA	2	10	1257470	1257479	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
286	NC_014371	GAAGG	2	10	1257652	1257661	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
287	NC_014371	CTTTT	3	15	1257673	1257687	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
288	NC_014371	CACGA	2	10	1265039	1265048	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
289	NC_014371	TCTTT	2	10	1268562	1268571	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
290	NC_014371	CTCCC	2	10	1269353	1269362	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
291	NC_014371	GGGGA	2	10	1271051	1271060	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
292	NC_014371	GGTAA	2	10	1273839	1273848	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
293	NC_014371	TATGA	2	10	1275500	1275509	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
294	NC_014371	ATTAC	2	10	1279289	1279298	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
295	NC_014371	TCATA	2	10	1279343	1279352	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
296	NC_014371	GTTTT	2	10	1303818	1303827	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
297	NC_014371	TTTTC	2	10	1310037	1310046	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
298	NC_014371	AAGAA	2	10	1311506	1311515	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
299	NC_014371	AGACA	2	10	1314078	1314087	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
300	NC_014371	TCAAA	2	10	1315212	1315221	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
301	NC_014371	TTCAC	2	10	1315283	1315292	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
302	NC_014371	AATAA	2	10	1316222	1316231	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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304	NC_014371	CTTTG	2	10	1327947	1327956	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
305	NC_014371	TCCCC	2	10	1338820	1338829	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
306	NC_014371	AGTTT	2	10	1339989	1339998	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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309	NC_014371	CTCCC	2	10	1347769	1347778	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
310	NC_014371	CTCCC	2	10	1347828	1347837	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
311	NC_014371	ATTTT	2	10	1353703	1353712	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_014371	CTCTG	2	10	1355893	1355902	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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314	NC_014371	TTAAT	2	10	1361402	1361411	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
315	NC_014371	TTTTA	2	10	1361632	1361641	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
316	NC_014371	TACAG	2	10	1362124	1362133	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
317	NC_014371	CTCCC	2	10	1365297	1365306	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.