MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfarculus baarsii DSM 2075 chromosome

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014365	CGCTGG	2	12	22541	22552	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014365	GCCACG	2	12	88324	88335	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014365	CGGCCA	2	12	127022	127033	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014365	GTCACC	2	12	167356	167367	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014365	CGTGAG	2	12	211385	211396	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014365	GCTTTT	2	12	261836	261847	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014365	GTTTTC	2	12	290992	291003	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014365	GCCGGG	2	12	300315	300326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014365	ATCGGG	2	12	338113	338124	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014365	ATGAAA	2	12	373080	373091	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014365	CGTATC	2	12	377834	377845	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014365	TTCTTT	2	12	391478	391489	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014365	CGCCTT	2	12	391554	391565	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014365	GGCAAA	2	12	409817	409828	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014365	TGACCA	2	12	476704	476715	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014365	CCGCGC	2	12	488152	488163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_014365	AAATAG	2	12	548194	548205	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014365	GTGGCG	2	12	570097	570108	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014365	CCGGGC	2	12	580031	580042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014365	GCCAAC	2	12	636017	636028	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014365	ATTATA	2	12	637169	637180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014365	CGGCAA	2	12	663320	663331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014365	GCCCCG	2	12	663610	663621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_014365	CATGCC	2	12	737337	737348	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014365	CGTGGT	2	12	740185	740196	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014365	CCGGTT	2	12	753545	753556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014365	CGGCCC	2	12	764048	764059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_014365	GGCCGG	2	12	852606	852617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014365	GGCCAG	2	12	956514	956525	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014365	CGTGGC	2	12	963836	963847	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014365	TCGTGG	2	12	963859	963870	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014365	CGCCCA	2	12	984828	984839	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_014365	GCCGGG	2	12	987648	987659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014365	GGGAAA	2	12	990026	990037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014365	GGGTTT	2	12	1038747	1038758	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014365	GCAAGG	2	12	1060755	1060766	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014365	GCTTTT	2	12	1086514	1086525	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014365	ATTCTT	2	12	1086556	1086567	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014365	TCTTGA	2	12	1086571	1086582	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014365	TCTCGA	2	12	1086583	1086594	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014365	ACCCCT	4	24	1086604	1086627	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_014365	GCCGCG	2	12	1091700	1091711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014365	CAAAAA	2	12	1121064	1121075	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014365	GGCGCG	2	12	1127272	1127283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014365	CCTGGC	2	12	1128072	1128083	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014365	CTGCCC	2	12	1134043	1134054	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_014365	GCCTGG	2	12	1134386	1134397	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014365	GCAACG	2	12	1134530	1134541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014365	GGGCGC	2	12	1171400	1171411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014365	GCTTTT	2	12	1186137	1186148	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014365	GACGGC	2	12	1216642	1216653	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014365	GCCGGG	2	12	1276301	1276312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014365	CGGGGG	2	12	1311516	1311527	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014365	GTCATT	2	12	1341397	1341408	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014365	TCGGCG	2	12	1345491	1345502	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014365	CCGACG	2	12	1402964	1402975	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014365	CGGGGC	2	12	1403553	1403564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014365	AAGGTC	2	12	1421832	1421843	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014365	AAGGTT	2	12	1421844	1421855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014365	CGGCCG	2	12	1452564	1452575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014365	TTTTCA	2	12	1491929	1491940	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014365	CCATGG	2	12	1525047	1525058	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014365	TATCGA	2	12	1567480	1567491	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014365	CGTGGC	2	12	1592221	1592232	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014365	TTTTGG	2	12	1657298	1657309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014365	GGCGCG	2	12	1664114	1664125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014365	CGCGCC	2	12	1664146	1664157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_014365	CGCCAA	2	12	1693820	1693831	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014365	TTTGCC	2	12	1812175	1812186	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014365	AACGCA	2	12	1826928	1826939	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014365	GAAAAT	2	12	1849588	1849599	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014365	TGAAGA	3	18	1849647	1849664	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014365	TCGTGT	2	12	1849999	1850010	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014365	GCCTCT	2	12	1850846	1850857	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014365	GGTCAG	2	12	1851105	1851116	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014365	TGAATA	2	12	1852711	1852722	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014365	TCGTTG	2	12	1852786	1852797	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014365	TTGCGG	2	12	1853830	1853841	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014365	GTGGTC	2	12	1854841	1854852	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014365	AATGAA	2	12	1854902	1854913	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014365	ACGGTG	2	12	1856312	1856323	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_014365	AATCCG	2	12	1862144	1862155	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014365	ACATGG	2	12	1863469	1863480	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_014365	GATCAA	2	12	1891434	1891445	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014365	CGGCTG	2	12	1929808	1929819	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014365	GGCCCG	2	12	1949883	1949894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014365	CTTTGC	2	12	1953663	1953674	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014365	GCTTTG	2	12	1978314	1978325	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014365	CTTTTT	2	12	1980036	1980047	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014365	ACCGGA	2	12	2033256	2033267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014365	GTTCAG	2	12	2046131	2046142	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014365	CCGGAG	2	12	2046191	2046202	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014365	CGGTTC	2	12	2054245	2054256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014365	CGTCGC	2	12	2109783	2109794	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_014365	AGGCGC	2	12	2184035	2184046	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014365	CGGCCG	2	12	2184236	2184247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014365	TTGCCC	2	12	2247126	2247137	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014365	GCGTCA	2	12	2248926	2248937	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014365	CAGCCG	2	12	2252150	2252161	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014365	GGCGCT	2	12	2432422	2432433	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014365	GCGTTT	2	12	2459886	2459897	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014365	TTTGCG	2	12	2461737	2461748	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_014365	GGCCAA	2	12	2470295	2470306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014365	TGGTCC	2	12	2490687	2490698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014365	TCACGC	2	12	2499715	2499726	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014365	GGTTCA	2	12	2518813	2518824	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014365	AATCTG	2	12	2525040	2525051	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_014365	CTTGCA	2	12	2528094	2528105	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014365	GGGTTT	2	12	2531098	2531109	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014365	CCAGGC	2	12	2643084	2643095	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014365	AGCCCG	2	12	2679913	2679924	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_014365	GCATGA	2	12	2680126	2680137	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014365	GCCCGC	2	12	2686359	2686370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_014365	GCCTGG	2	12	2721954	2721965	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014365	GCCGGG	2	12	2721978	2721989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014365	CCAGGC	2	12	2722143	2722154	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014365	CTTTCC	2	12	2734399	2734410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_014365	CCGCGA	2	12	2736658	2736669	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014365	GCCATG	3	18	2741886	2741903	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014365	CGCCTC	2	12	2775169	2775180	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_014365	AATGAC	2	12	2818374	2818385	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_014365	GCTTTT	2	12	2878162	2878173	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_014365	AGTTAC	2	12	2896769	2896780	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_014365	GCCGTG	2	12	3005314	3005325	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014365	GGGCCG	2	12	3081037	3081048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014365	GCGGCC	2	12	3126637	3126648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014365	GGGCCA	2	12	3127632	3127643	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014365	GCCGTT	2	12	3139739	3139750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014365	CCCGGC	2	12	3161272	3161283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_014365	CCCCAA	2	12	3175369	3175380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_014365	GTCGGC	2	12	3228707	3228718	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014365	GACGCC	2	12	3255503	3255514	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
133	NC_014365	CCAGCG	2	12	3255526	3255537	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014365	GGGGTG	2	12	3335457	3335468	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014365	GATCAA	2	12	3335481	3335492	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_014365	GATCAA	5	30	3335499	3335528	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_014365	AAGAAT	3	18	3335541	3335558	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014365	AAGAAA	2	12	3335559	3335570	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014365	TGGCCG	2	12	3342658	3342669	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_014365	TGTTTT	2	12	3369110	3369121	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014365	CGCGCC	2	12	3371748	3371759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_014365	CGGCCA	2	12	3384778	3384789	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014365	CCCCCA	2	12	3406906	3406917	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
144	NC_014365	CCATGG	2	12	3407353	3407364	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_014365	CGGCCT	2	12	3446923	3446934	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
146	NC_014365	AAGGCG	2	12	3456356	3456367	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_014365	ATTAAG	2	12	3456379	3456390	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014365	AGATTA	2	12	3456395	3456406	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014365	AAGAGA	2	12	3456418	3456429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014365	TAAGAA	3	18	3456447	3456464	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014365	TAAAAA	2	12	3478766	3478777	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014365	TGGCCG	2	12	3519493	3519504	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_014365	GTTAAC	2	12	3533460	3533471	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.