MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Nitrospira defluvii

Total Repeats: 1352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014355	ATTA	2	8	149	156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014355	GACC	2	8	1513	1520	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014355	CTGA	2	8	9707	9714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014355	CTTC	2	8	9729	9736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014355	GCGG	2	8	9831	9838	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014355	CCGC	2	8	15709	15716	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_014355	TCGC	2	8	15772	15779	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014355	GAGC	2	8	15900	15907	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014355	ATGT	2	8	15945	15952	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014355	GCGG	2	8	15955	15962	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014355	GGAA	2	8	24558	24565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014355	CGAT	2	8	32902	32909	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014355	CCGA	2	8	32926	32933	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014355	CCCT	2	8	33027	33034	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_014355	TTCG	2	8	40387	40394	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014355	GCCA	2	8	44111	44118	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014355	GAAG	2	8	48645	48652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014355	CGTT	2	8	49749	49756	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014355	AGGG	2	8	52513	52520	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014355	GGAG	2	8	52546	52553	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014355	CCGA	2	8	53840	53847	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014355	CCAA	2	8	53939	53946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014355	GCCG	2	8	54092	54099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014355	GCCT	2	8	60371	60378	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014355	TCGG	2	8	70345	70352	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014355	TGGC	2	8	70394	70401	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014355	ACCA	2	8	71190	71197	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014355	CAAC	2	8	95948	95955	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014355	CGAC	2	8	99074	99081	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014355	GCTC	2	8	109266	109273	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014355	GCTC	2	8	109401	109408	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014355	ATGA	2	8	110768	110775	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014355	AGGA	2	8	118162	118169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014355	TCGC	2	8	124486	124493	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014355	GCAG	2	8	124505	124512	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014355	GGAG	2	8	124559	124566	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014355	CGAA	2	8	125521	125528	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014355	TCGG	2	8	127381	127388	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014355	TTCC	2	8	128415	128422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014355	TTCA	2	8	129191	129198	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014355	AGGG	2	8	129855	129862	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014355	CTTT	2	8	129864	129871	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014355	CGAC	2	8	130634	130641	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014355	GTGC	2	8	133828	133835	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014355	CGGC	2	8	133900	133907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014355	GCGG	2	8	135552	135559	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014355	CGTT	2	8	141275	141282	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014355	GTGC	2	8	141309	141316	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014355	GCGG	2	8	143309	143316	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014355	GAAG	2	8	145421	145428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014355	GAAG	2	8	145868	145875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014355	GTCT	2	8	146057	146064	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014355	TCAT	2	8	146365	146372	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014355	TGCA	2	8	146737	146744	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014355	GCTT	2	8	150012	150019	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014355	CTTC	2	8	150099	150106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014355	CTGG	2	8	152345	152352	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014355	TACG	2	8	152407	152414	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014355	GAGG	2	8	152741	152748	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014355	GGAT	2	8	157603	157610	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014355	GAGT	2	8	157668	157675	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014355	GGCC	2	8	161770	161777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014355	GGAC	2	8	163795	163802	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014355	GTCC	2	8	166258	166265	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014355	CGAA	2	8	169224	169231	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014355	TCCG	2	8	170938	170945	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014355	CGGC	2	8	184345	184352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014355	AACA	2	8	184385	184392	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014355	CTCC	2	8	185423	185430	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_014355	TTGA	2	8	190792	190799	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014355	CGAG	2	8	199019	199026	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014355	GAAT	2	8	201777	201784	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014355	TGCC	2	8	204941	204948	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014355	GCCG	2	8	206674	206681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014355	TCTT	2	8	209631	209638	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014355	GTAT	2	8	209639	209646	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014355	CTGG	2	8	212101	212108	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014355	CGTG	2	8	212310	212317	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014355	TCAA	2	8	212468	212475	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014355	TCCT	2	8	212523	212530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014355	CTGC	2	8	215585	215592	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014355	GAAA	2	8	221292	221299	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014355	AATG	2	8	221300	221307	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014355	AGGA	2	8	223287	223294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014355	TCTG	2	8	224336	224343	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014355	TCGA	2	8	230078	230085	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014355	GTCG	2	8	230131	230138	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014355	TTCA	2	8	230279	230286	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014355	TTCT	2	8	231424	231431	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014355	CTCC	2	8	236538	236545	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
91	NC_014355	AGGA	2	8	242691	242698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014355	GGGC	2	8	246902	246909	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014355	AGCT	2	8	246970	246977	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014355	GGAA	2	8	247077	247084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014355	GTTC	2	8	247098	247105	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014355	GGCA	2	8	251949	251956	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014355	GCTG	2	8	252408	252415	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014355	CGAA	2	8	253568	253575	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014355	CTCA	2	8	253802	253809	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014355	CTAC	2	8	256513	256520	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014355	GAGG	2	8	257302	257309	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014355	CTGC	2	8	262028	262035	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014355	GCCG	2	8	264447	264454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014355	ATGA	2	8	283855	283862	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014355	GTCG	2	8	283932	283939	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014355	GTCT	2	8	287694	287701	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014355	TCAT	2	8	288219	288226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014355	ATCG	2	8	292695	292702	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014355	GTGA	2	8	293869	293876	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014355	CCCT	2	8	294294	294301	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
111	NC_014355	TCTG	2	8	294640	294647	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014355	TGCC	2	8	294783	294790	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_014355	ACTC	2	8	295924	295931	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014355	CGGT	2	8	296036	296043	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014355	TCAA	2	8	300564	300571	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014355	TTTC	2	8	300812	300819	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014355	GTGC	2	8	306753	306760	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014355	CGGT	2	8	308943	308950	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_014355	CGGC	2	8	313550	313557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014355	TCGT	2	8	320684	320691	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014355	TTGA	2	8	322381	322388	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014355	CAGG	2	8	322761	322768	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014355	CTGT	2	8	323181	323188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014355	CTTG	2	8	328543	328550	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014355	TGTT	2	8	333341	333348	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014355	CGCA	2	8	333439	333446	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014355	TGGA	2	8	342448	342455	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014355	CGCT	2	8	343623	343630	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014355	TGAG	2	8	345950	345957	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014355	GGAT	2	8	346174	346181	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014355	ACAG	2	8	350591	350598	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014355	CAGT	2	8	350734	350741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_014355	GAAG	2	8	351623	351630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014355	GTGC	2	8	352590	352597	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014355	ATTC	2	8	354814	354821	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014355	GGTT	2	8	355140	355147	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014355	TTCC	2	8	362416	362423	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014355	ATGC	2	8	375872	375879	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014355	GCCT	2	8	376743	376750	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014355	GGAG	2	8	391125	391132	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014355	GGGC	2	8	397063	397070	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014355	CGGT	2	8	397075	397082	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014355	TCGA	2	8	397413	397420	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014355	ACAG	2	8	407073	407080	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014355	GGAC	2	8	409004	409011	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014355	TTTC	2	8	411011	411018	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_014355	GGCA	2	8	411083	411090	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_014355	GGGA	2	8	416761	416768	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014355	CAGG	2	8	416770	416777	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014355	TTCC	2	8	419801	419808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_014355	TTCC	2	8	420029	420036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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272	NC_014355	GAAC	2	8	847644	847651	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
273	NC_014355	TTGG	2	8	851574	851581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
274	NC_014355	ATGG	2	8	851639	851646	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_014355	CGAT	2	8	886276	886283	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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284	NC_014355	CTTT	2	8	898854	898861	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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288	NC_014355	TGGG	2	8	908300	908307	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
289	NC_014355	TCCT	2	8	914403	914410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
290	NC_014355	CATC	2	8	924898	924905	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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293	NC_014355	TCGT	2	8	939449	939456	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
294	NC_014355	GAGC	2	8	939484	939491	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
295	NC_014355	AGAC	2	8	947220	947227	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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451	NC_014355	GCGA	2	8	1386925	1386932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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456	NC_014355	CGGT	2	8	1395624	1395631	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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463	NC_014355	CATG	2	8	1412346	1412353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
464	NC_014355	GGCT	2	8	1414584	1414591	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
465	NC_014355	GTCC	2	8	1417812	1417819	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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474	NC_014355	CCTG	2	8	1429477	1429484	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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477	NC_014355	GTCG	2	8	1453881	1453888	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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481	NC_014355	GGGA	2	8	1460453	1460460	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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484	NC_014355	CGCC	2	8	1476080	1476087	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
485	NC_014355	CGTG	2	8	1476640	1476647	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
486	NC_014355	ACCG	2	8	1476854	1476861	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
487	NC_014355	GCGT	2	8	1477626	1477633	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
488	NC_014355	CTGC	2	8	1478485	1478492	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
489	NC_014355	CGGC	2	8	1478569	1478576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
490	NC_014355	ATTC	2	8	1480590	1480597	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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492	NC_014355	TCGC	2	8	1481951	1481958	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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494	NC_014355	GCCG	2	8	1485930	1485937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
495	NC_014355	ACGA	2	8	1485962	1485969	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
496	NC_014355	ACGA	2	8	1485975	1485982	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
497	NC_014355	GTGG	2	8	1488323	1488330	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
498	NC_014355	CGCT	2	8	1488542	1488549	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
499	NC_014355	CGCT	2	8	1491561	1491568	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
500	NC_014355	GAGG	2	8	1500902	1500909	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding

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