MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 1857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014334	CAAAC	2	10	580	589	60 %	0 %	0 %	40 %	301065126
2	NC_014334	TATAT	2	10	1487	1496	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014334	CAACG	2	10	1693	1702	40 %	0 %	20 %	40 %	301065127
4	NC_014334	ATGAA	2	10	4632	4641	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014334	GAAGA	2	10	6740	6749	60 %	0 %	40 %	0 %	301065132
6	NC_014334	GGCAC	2	10	7226	7235	20 %	0 %	40 %	40 %	301065132
7	NC_014334	GACAA	2	10	7500	7509	60 %	0 %	20 %	20 %	301065132
8	NC_014334	GAAAA	2	10	9585	9594	80 %	0 %	20 %	0 %	301065133
9	NC_014334	CATTT	2	10	11825	11834	20 %	60 %	0 %	20 %	301065134
10	NC_014334	ATTGA	2	10	19388	19397	40 %	40 %	20 %	0 %	301065144
11	NC_014334	CAACC	2	10	20721	20730	40 %	0 %	0 %	60 %	301065146
12	NC_014334	GTGAT	2	10	21485	21494	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014334	TGGCT	2	10	22309	22318	0 %	40 %	40 %	20 %	301065149
14	NC_014334	GCTTT	2	10	23861	23870	0 %	60 %	20 %	20 %	301065150
15	NC_014334	CAGCG	2	10	24508	24517	20 %	0 %	40 %	40 %	301065150
16	NC_014334	GTTTT	2	10	26480	26489	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014334	TCCTG	2	10	27433	27442	0 %	40 %	20 %	40 %	301065153
18	NC_014334	TTGTT	2	10	28222	28231	0 %	80 %	20 %	0 %	301065154
19	NC_014334	AAGCC	2	10	32808	32817	40 %	0 %	20 %	40 %	301065158
20	NC_014334	CAAAG	2	10	33652	33661	60 %	0 %	20 %	20 %	301065159
21	NC_014334	CGGCA	2	10	35199	35208	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_014334	AGCGA	2	10	41914	41923	40 %	0 %	40 %	20 %	301065168
23	NC_014334	TTTCT	2	10	42161	42170	0 %	80 %	0 %	20 %	301065169
24	NC_014334	TTCGG	2	10	45188	45197	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014334	GTTTG	2	10	47806	47815	0 %	60 %	40 %	0 %	301065177
26	NC_014334	TGGAT	2	10	47871	47880	20 %	40 %	40 %	0 %	301065177
27	NC_014334	ATAAA	2	10	48552	48561	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014334	GAAAA	2	10	50164	50173	80 %	0 %	20 %	0 %	301065182
29	NC_014334	TTGAA	2	10	50589	50598	40 %	40 %	20 %	0 %	301065182
30	NC_014334	ATAAA	2	10	50735	50744	80 %	20 %	0 %	0 %	301065182
31	NC_014334	AATAA	2	10	50981	50990	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014334	TCAAT	2	10	51600	51609	40 %	40 %	0 %	20 %	301065183
33	NC_014334	AACGC	2	10	51916	51925	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_014334	ATGAA	2	10	52350	52359	60 %	20 %	20 %	0 %	301065184
35	NC_014334	TTGCT	2	10	53461	53470	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014334	ACAAA	2	10	53878	53887	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014334	TTTCT	2	10	54512	54521	0 %	80 %	0 %	20 %	301065187
38	NC_014334	TCGTT	2	10	54909	54918	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014334	TTCTT	2	10	55460	55469	0 %	80 %	0 %	20 %	301065188
40	NC_014334	TGTTT	2	10	58622	58631	0 %	80 %	20 %	0 %	301065190
41	NC_014334	TGATC	2	10	62613	62622	20 %	40 %	20 %	20 %	301065194
42	NC_014334	CAGTT	2	10	65112	65121	20 %	40 %	20 %	20 %	301065195
43	NC_014334	TTGAT	2	10	72136	72145	20 %	60 %	20 %	0 %	301065204
44	NC_014334	TTGCT	2	10	72229	72238	0 %	60 %	20 %	20 %	301065204
45	NC_014334	CGTTT	2	10	74129	74138	0 %	60 %	20 %	20 %	301065206
46	NC_014334	TAAGT	2	10	77987	77996	40 %	40 %	20 %	0 %	301065211
47	NC_014334	TCATC	2	10	79536	79545	20 %	40 %	0 %	40 %	301065213
48	NC_014334	TGGCA	2	10	83193	83202	20 %	20 %	40 %	20 %	301065216
49	NC_014334	GTTTC	2	10	85974	85983	0 %	60 %	20 %	20 %	301065219
50	NC_014334	TGTGC	2	10	87100	87109	0 %	40 %	40 %	20 %	301065220
51	NC_014334	AAATA	2	10	87554	87563	80 %	20 %	0 %	0 %	301065221
52	NC_014334	TGCTT	2	10	88171	88180	0 %	60 %	20 %	20 %	301065221
53	NC_014334	ATCCA	2	10	88634	88643	40 %	20 %	0 %	40 %	301065222
54	NC_014334	AACCA	2	10	89009	89018	60 %	0 %	0 %	40 %	301065222
55	NC_014334	TCTTT	2	10	89213	89222	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014334	GTTAA	2	10	89606	89615	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014334	TACTC	2	10	91304	91313	20 %	40 %	0 %	40 %	301065227
58	NC_014334	TCAAA	2	10	91795	91804	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014334	GGAAC	2	10	92659	92668	40 %	0 %	40 %	20 %	301065228
60	NC_014334	GGTTG	2	10	92844	92853	0 %	40 %	60 %	0 %	301065228
61	NC_014334	AGCAT	2	10	93206	93215	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014334	TAGCA	2	10	93566	93575	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014334	CCAAC	2	10	93659	93668	40 %	0 %	0 %	60 %	301065229
64	NC_014334	TCCCA	2	10	94706	94715	20 %	20 %	0 %	60 %	301065230
65	NC_014334	CCCAG	2	10	95339	95348	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
66	NC_014334	GCTTT	2	10	98347	98356	0 %	60 %	20 %	20 %	301065233
67	NC_014334	ATTGA	2	10	101601	101610	40 %	40 %	20 %	0 %	301065235
68	NC_014334	CAAAA	2	10	104275	104284	80 %	0 %	0 %	20 %	301065240
69	NC_014334	ATTTC	2	10	104801	104810	20 %	60 %	0 %	20 %	301065240
70	NC_014334	ATGGC	2	10	108781	108790	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014334	GAAGA	2	10	111127	111136	60 %	0 %	40 %	0 %	301065245
72	NC_014334	GAAAA	2	10	111145	111154	80 %	0 %	20 %	0 %	301065245
73	NC_014334	CAAAG	2	10	111211	111220	60 %	0 %	20 %	20 %	301065245
74	NC_014334	TGACA	2	10	118268	118277	40 %	20 %	20 %	20 %	301065250
75	NC_014334	GACTG	2	10	118826	118835	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014334	GTTTT	2	10	119851	119860	0 %	80 %	20 %	0 %	301065252
77	NC_014334	AGACC	2	10	123051	123060	40 %	0 %	20 %	40 %	301065253
78	NC_014334	GCTTC	2	10	123151	123160	0 %	40 %	20 %	40 %	301065253
79	NC_014334	CGGCC	2	10	125681	125690	0 %	0 %	40 %	60 %	301065255
80	NC_014334	CGTCA	2	10	125993	126002	20 %	20 %	20 %	40 %	301065255
81	NC_014334	CTCAA	2	10	126264	126273	40 %	20 %	0 %	40 %	301065255
82	NC_014334	ACCAA	2	10	126535	126544	60 %	0 %	0 %	40 %	301065255
83	NC_014334	CAAGT	2	10	127495	127504	40 %	20 %	20 %	20 %	301065256
84	NC_014334	GACCC	2	10	128943	128952	20 %	0 %	20 %	60 %	301065257
85	NC_014334	TTGGC	2	10	131047	131056	0 %	40 %	40 %	20 %	301065258
86	NC_014334	TGTGT	2	10	132584	132593	0 %	60 %	40 %	0 %	301065260
87	NC_014334	ATACT	2	10	139397	139406	40 %	40 %	0 %	20 %	301065267
88	NC_014334	TCAAA	2	10	140012	140021	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014334	AGCCA	2	10	142800	142809	40 %	0 %	20 %	40 %	301065270
90	NC_014334	ATTGC	2	10	143565	143574	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014334	TGATC	2	10	144395	144404	20 %	40 %	20 %	20 %	301065271
92	NC_014334	CATGC	2	10	145525	145534	20 %	20 %	20 %	40 %	301065272
93	NC_014334	CGATC	2	10	150708	150717	20 %	20 %	20 %	40 %	301065278
94	NC_014334	ATTTG	2	10	153488	153497	20 %	60 %	20 %	0 %	301065281
95	NC_014334	AAAGC	2	10	156772	156781	60 %	0 %	20 %	20 %	301065286
96	NC_014334	GGGAT	2	10	157934	157943	20 %	20 %	60 %	0 %	301065287
97	NC_014334	GCTCA	2	10	158269	158278	20 %	20 %	20 %	40 %	301065287
98	NC_014334	AGTCG	2	10	163122	163131	20 %	20 %	40 %	20 %	301065293
99	NC_014334	ATATT	2	10	163791	163800	40 %	60 %	0 %	0 %	301065293
100	NC_014334	TGAAC	2	10	163807	163816	40 %	20 %	20 %	20 %	301065293
101	NC_014334	ATTAC	2	10	166059	166068	40 %	40 %	0 %	20 %	301065295
102	NC_014334	GTCTT	2	10	166934	166943	0 %	60 %	20 %	20 %	301065296
103	NC_014334	TTGGC	2	10	166973	166982	0 %	40 %	40 %	20 %	301065296
104	NC_014334	TCTTT	2	10	168076	168085	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_014334	TTTTC	2	10	170504	170513	0 %	80 %	0 %	20 %	301065300
106	NC_014334	CAAGC	2	10	171894	171903	40 %	0 %	20 %	40 %	301065301
107	NC_014334	AATGA	2	10	173194	173203	60 %	20 %	20 %	0 %	301065302
108	NC_014334	CCAAC	2	10	173762	173771	40 %	0 %	0 %	60 %	301065303
109	NC_014334	GCCTT	2	10	175653	175662	0 %	40 %	20 %	40 %	301065305
110	NC_014334	GAGGC	2	10	178477	178486	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014334	GTAAG	2	10	179789	179798	40 %	20 %	40 %	0 %	301065309
112	NC_014334	CACAA	2	10	181223	181232	60 %	0 %	0 %	40 %	301065310
113	NC_014334	GACCA	2	10	183338	183347	40 %	0 %	20 %	40 %	301065312
114	NC_014334	TGGTC	2	10	183792	183801	0 %	40 %	40 %	20 %	301065313
115	NC_014334	AAAAG	2	10	185276	185285	80 %	0 %	20 %	0 %	301065314
116	NC_014334	TGAAT	2	10	188187	188196	40 %	40 %	20 %	0 %	301065316
117	NC_014334	ATCAA	2	10	189640	189649	60 %	20 %	0 %	20 %	301065318
118	NC_014334	CCGTC	2	10	190409	190418	0 %	20 %	20 %	60 %	301065319
119	NC_014334	AGTTG	2	10	191422	191431	20 %	40 %	40 %	0 %	301065319
120	NC_014334	CCGTT	2	10	193688	193697	0 %	40 %	20 %	40 %	301065321
121	NC_014334	CCAAC	2	10	196097	196106	40 %	0 %	0 %	60 %	301065323
122	NC_014334	GAACC	2	10	197348	197357	40 %	0 %	20 %	40 %	301065323
123	NC_014334	TGGCG	2	10	197910	197919	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014334	TGAAG	2	10	198746	198755	40 %	20 %	40 %	0 %	301065324
125	NC_014334	CAGCC	2	10	199658	199667	20 %	0 %	20 %	60 %	301065324
126	NC_014334	GTTCA	2	10	199738	199747	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014334	CAATG	2	10	200025	200034	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_014334	GCGGT	2	10	200791	200800	0 %	20 %	60 %	20 %	301065327
129	NC_014334	TGAAA	2	10	202420	202429	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014334	TCCTT	2	10	203530	203539	0 %	60 %	0 %	40 %	301065330
131	NC_014334	GTTGA	2	10	208292	208301	20 %	40 %	40 %	0 %	301065333
132	NC_014334	TCGAT	2	10	209819	209828	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014334	CGTTG	2	10	210517	210526	0 %	40 %	40 %	20 %	301065335
134	NC_014334	AGATG	2	10	211493	211502	40 %	20 %	40 %	0 %	301065336
135	NC_014334	AAGGT	2	10	213705	213714	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014334	TTCAT	2	10	213980	213989	20 %	60 %	0 %	20 %	301065340
137	NC_014334	TGAGG	2	10	214181	214190	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014334	AAATG	2	10	215145	215154	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014334	GGCAT	2	10	216884	216893	20 %	20 %	40 %	20 %	301065345
140	NC_014334	TCGTT	2	10	217301	217310	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_014334	CGGCA	2	10	217488	217497	20 %	0 %	40 %	40 %	301065346
142	NC_014334	GCCAA	2	10	222474	222483	40 %	0 %	20 %	40 %	301065354
143	NC_014334	CTGGG	2	10	225241	225250	0 %	20 %	60 %	20 %	301065358
144	NC_014334	ACTTC	2	10	227403	227412	20 %	40 %	0 %	40 %	301065360
145	NC_014334	GTAGA	2	10	227849	227858	40 %	20 %	40 %	0 %	301065361
146	NC_014334	ATCAA	2	10	232494	232503	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_014334	CGTCA	2	10	233618	233627	20 %	20 %	20 %	40 %	301065367
148	NC_014334	TCAAT	2	10	233742	233751	40 %	40 %	0 %	20 %	301065367
149	NC_014334	AAATC	2	10	240622	240631	60 %	20 %	0 %	20 %	301065373
150	NC_014334	TGGAA	2	10	241687	241696	40 %	20 %	40 %	0 %	301065374
151	NC_014334	CAGAA	2	10	242191	242200	60 %	0 %	20 %	20 %	301065374
152	NC_014334	ATTTG	2	10	245416	245425	20 %	60 %	20 %	0 %	301065377
153	NC_014334	AAATG	2	10	248845	248854	60 %	20 %	20 %	0 %	301065379
154	NC_014334	CAAAA	2	10	249365	249374	80 %	0 %	0 %	20 %	301065379
155	NC_014334	ACTGG	2	10	249557	249566	20 %	20 %	40 %	20 %	301065380
156	NC_014334	CCATG	2	10	250761	250770	20 %	20 %	20 %	40 %	301065381
157	NC_014334	GAGTC	2	10	252527	252536	20 %	20 %	40 %	20 %	301065383
158	NC_014334	ACTCA	2	10	253500	253509	40 %	20 %	0 %	40 %	301065384
159	NC_014334	ATTTG	2	10	254146	254155	20 %	60 %	20 %	0 %	301065385
160	NC_014334	TTTGA	2	10	258039	258048	20 %	60 %	20 %	0 %	301065387
161	NC_014334	GTTGT	2	10	260365	260374	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014334	AGTTG	2	10	260805	260814	20 %	40 %	40 %	0 %	301065391
163	NC_014334	TGATT	2	10	261584	261593	20 %	60 %	20 %	0 %	301065392
164	NC_014334	TGTCA	2	10	261828	261837	20 %	40 %	20 %	20 %	301065392
165	NC_014334	TGATC	2	10	265632	265641	20 %	40 %	20 %	20 %	301065395
166	NC_014334	AAAAG	2	10	266750	266759	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
167	NC_014334	AACTT	2	10	267651	267660	40 %	40 %	0 %	20 %	301065396
168	NC_014334	TAATT	2	10	268135	268144	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_014334	CAAAC	2	10	271318	271327	60 %	0 %	0 %	40 %	301065400
170	NC_014334	CAAGC	2	10	271483	271492	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
171	NC_014334	GATCG	2	10	272582	272591	20 %	20 %	40 %	20 %	301065402
172	NC_014334	GTCGT	2	10	273299	273308	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
173	NC_014334	AGATC	2	10	274688	274697	40 %	20 %	20 %	20 %	301065403
174	NC_014334	GCACT	2	10	274921	274930	20 %	20 %	20 %	40 %	301065403
175	NC_014334	GTCTG	2	10	277182	277191	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
176	NC_014334	TCGTG	2	10	277516	277525	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
177	NC_014334	TCGCA	2	10	278176	278185	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
178	NC_014334	GAGAT	2	10	281003	281012	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
179	NC_014334	ATTCG	2	10	282444	282453	20 %	40 %	20 %	20 %	301065406
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181	NC_014334	ATGGC	2	10	284529	284538	20 %	20 %	40 %	20 %	301065409
182	NC_014334	GATCG	2	10	285648	285657	20 %	20 %	40 %	20 %	301065410
183	NC_014334	TTGCT	2	10	286545	286554	0 %	60 %	20 %	20 %	301065411
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186	NC_014334	AGCCA	2	10	288297	288306	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
187	NC_014334	AATCG	2	10	289969	289978	40 %	20 %	20 %	20 %	301065415
188	NC_014334	ACCAT	2	10	291716	291725	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
189	NC_014334	AGATA	2	10	291783	291792	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
190	NC_014334	ATTGG	2	10	292660	292669	20 %	40 %	40 %	0 %	301065418
191	NC_014334	CGTCA	2	10	295736	295745	20 %	20 %	20 %	40 %	301065420
192	NC_014334	AAATT	2	10	296123	296132	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_014334	TTTCT	2	10	297263	297272	0 %	80 %	0 %	20 %	301065423
194	NC_014334	CGCGG	2	10	299890	299899	0 %	0 %	60 %	40 %	301065426
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196	NC_014334	TGCTT	2	10	303017	303026	0 %	60 %	20 %	20 %	301065428
197	NC_014334	GATTG	2	10	303699	303708	20 %	40 %	40 %	0 %	301065428
198	NC_014334	TGTTT	2	10	305007	305016	0 %	80 %	20 %	0 %	301065429
199	NC_014334	TTGAA	2	10	306353	306362	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
200	NC_014334	TGCCG	2	10	307620	307629	0 %	20 %	40 %	40 %	301065431
201	NC_014334	TCTGA	2	10	308544	308553	20 %	40 %	20 %	20 %	301065432
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203	NC_014334	GGTTG	2	10	310639	310648	0 %	40 %	60 %	0 %	301065433
204	NC_014334	AGCAT	2	10	311001	311010	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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211	NC_014334	TTTTG	2	10	320195	320204	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
212	NC_014334	TCCAG	2	10	320577	320586	20 %	20 %	20 %	40 %	301065444
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214	NC_014334	GTTTA	2	10	323668	323677	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
215	NC_014334	AGGCA	2	10	328408	328417	40 %	0 %	40 %	20 %	301065451
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233	NC_014334	GTTGT	2	10	345776	345785	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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235	NC_014334	ATTGC	2	10	348917	348926	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
236	NC_014334	AGTTA	2	10	354679	354688	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
237	NC_014334	TTGAA	2	10	357175	357184	40 %	40 %	20 %	0 %	301065480
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249	NC_014334	AGAGG	2	10	375230	375239	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
250	NC_014334	AGCAT	2	10	377860	377869	40 %	20 %	20 %	20 %	301065503
251	NC_014334	CTTAC	2	10	378219	378228	20 %	40 %	0 %	40 %	301065504
252	NC_014334	TATAA	2	10	379347	379356	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_014334	AGCCA	2	10	384143	384152	40 %	0 %	20 %	40 %	301065509
254	NC_014334	TGAAT	2	10	386260	386269	40 %	40 %	20 %	0 %	301065511
255	NC_014334	CTTCA	2	10	386358	386367	20 %	40 %	0 %	40 %	301065511
256	NC_014334	TACTT	2	10	386438	386447	20 %	60 %	0 %	20 %	301065511
257	NC_014334	CCCAG	2	10	386516	386525	20 %	0 %	20 %	60 %	301065511
258	NC_014334	AGTTG	2	10	387660	387669	20 %	40 %	40 %	0 %	301065512
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269	NC_014334	AAAGC	2	10	398748	398757	60 %	0 %	20 %	20 %	301065520
270	NC_014334	TTGAT	2	10	399677	399686	20 %	60 %	20 %	0 %	301065520
271	NC_014334	TTGAT	2	10	400499	400508	20 %	60 %	20 %	0 %	301065520
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289	NC_014334	GGATT	2	10	422394	422403	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
290	NC_014334	TGGCA	2	10	422611	422620	20 %	20 %	40 %	20 %	301065541
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391	NC_014334	GCTGA	2	10	580131	580140	20 %	20 %	40 %	20 %	301065681
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397	NC_014334	TGCTA	2	10	585695	585704	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
398	NC_014334	AGAAT	2	10	585787	585796	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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