MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 1202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014334	AAAC	2	8	1373	1380	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014334	GAAG	2	8	2823	2830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014334	CGTA	2	8	4559	4566	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014334	TCGA	2	8	4613	4620	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014334	TAAT	2	8	5059	5066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014334	TTTG	2	8	11444	11451	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014334	GCAA	2	8	12260	12267	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014334	AAAT	2	8	14550	14557	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014334	AAGG	2	8	17224	17231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014334	AAGC	2	8	18225	18232	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014334	GACT	2	8	18523	18530	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014334	AAAC	2	8	18609	18616	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014334	TAAT	2	8	18992	18999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014334	CGTT	2	8	19652	19659	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014334	AGCT	2	8	21091	21098	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014334	GGTA	2	8	21512	21519	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014334	GGTT	2	8	28276	28283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014334	CATA	2	8	28322	28329	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014334	AGTG	2	8	28468	28475	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014334	ATAA	2	8	32085	32092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014334	AAGC	2	8	36919	36926	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014334	AGCA	2	8	38425	38432	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014334	ATTT	2	8	38473	38480	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014334	AGAA	2	8	41243	41250	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014334	AATC	2	8	49246	49253	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014334	CAAA	2	8	50996	51003	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014334	GGAG	2	8	54980	54987	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014334	TGAA	2	8	56794	56801	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014334	TGAA	2	8	56836	56843	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014334	AAAG	2	8	59539	59546	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014334	TTCA	2	8	69734	69741	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014334	ACAA	2	8	70086	70093	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014334	TTGT	2	8	70124	70131	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014334	GACT	2	8	70198	70205	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014334	TACT	2	8	75741	75748	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014334	ATGA	2	8	80762	80769	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014334	ACAG	2	8	86116	86123	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014334	ATTA	2	8	86149	86156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014334	TCCC	2	8	90570	90577	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_014334	AGTA	2	8	90605	90612	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014334	GCTT	2	8	93180	93187	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014334	TTTG	2	8	98730	98737	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014334	CAAA	2	8	98747	98754	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014334	GTTG	2	8	98932	98939	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014334	AAAT	2	8	98989	98996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014334	GTCT	2	8	99136	99143	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014334	GTGA	2	8	103608	103615	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014334	TCAT	2	8	105148	105155	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014334	AAAT	2	8	105267	105274	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014334	GCTT	2	8	107609	107616	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014334	ATCA	2	8	108251	108258	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014334	TTGT	2	8	111551	111558	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014334	AAGA	2	8	113064	113071	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014334	TATC	2	8	114585	114592	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014334	GCAA	2	8	114616	114623	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014334	CTTT	2	8	117651	117658	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014334	TCGT	2	8	125149	125156	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014334	AAAT	2	8	132856	132863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014334	CCGG	2	8	133030	133037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014334	AAAC	2	8	135424	135431	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014334	GGTG	2	8	141424	141431	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014334	ATTA	2	8	141650	141657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014334	TTAG	2	8	141699	141706	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014334	TCAA	2	8	142014	142021	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014334	ACAA	2	8	143503	143510	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014334	GAAG	2	8	143676	143683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014334	TGTA	2	8	143848	143855	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014334	TCAT	2	8	144003	144010	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014334	TGAC	2	8	144180	144187	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014334	TGGT	2	8	146676	146683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014334	TGTT	2	8	146888	146895	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014334	CAGA	2	8	146972	146979	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014334	AAAT	2	8	148082	148089	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014334	ATTA	2	8	150430	150437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014334	TTAA	2	8	150570	150577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014334	GATT	2	8	153906	153913	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014334	TTTC	2	8	156422	156429	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014334	TTTC	2	8	167906	167913	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014334	TTTA	2	8	167954	167961	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014334	TTCC	2	8	168229	168236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014334	AGCA	2	8	168290	168297	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014334	AGTA	2	8	169494	169501	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014334	ACAT	2	8	175279	175286	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014334	GAAT	2	8	176518	176525	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014334	AAAT	2	8	183542	183549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014334	TAAC	2	8	194852	194859	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014334	GCAG	2	8	194887	194894	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014334	CAGA	2	8	199799	199806	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014334	TGAA	2	8	199998	200005	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014334	AGTG	2	8	205263	205270	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014334	AAGG	2	8	207660	207667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014334	AAAC	2	8	212922	212929	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014334	AGAA	2	8	216356	216363	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014334	AGTA	2	8	216700	216707	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014334	TTAA	2	8	217184	217191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014334	AAAG	2	8	217342	217349	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014334	TGCT	2	8	221994	222001	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014334	GTTT	2	8	223453	223460	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014334	GAAA	2	8	223497	223504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014334	CAGC	2	8	224072	224079	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014334	TGTT	2	8	224218	224225	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014334	AGGC	2	8	224252	224259	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_014334	CTTT	2	8	230103	230110	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014334	AAGA	2	8	238937	238944	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014334	TCAA	2	8	239007	239014	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014334	TACT	2	8	239016	239023	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014334	TAAA	2	8	239996	240003	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014334	CCTT	2	8	240928	240935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014334	TATT	2	8	241013	241020	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014334	TGAA	2	8	241072	241079	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014334	ATGA	2	8	253903	253910	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014334	TACA	2	8	253963	253970	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014334	GTTT	2	8	254007	254014	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014334	ATAA	2	8	256738	256745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014334	GGAT	2	8	258202	258209	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014334	CAAA	2	8	267364	267371	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014334	ATCA	2	8	271517	271524	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014334	TATG	2	8	271548	271555	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014334	AGCA	2	8	273471	273478	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014334	GTGC	2	8	276103	276110	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014334	TGAG	2	8	276152	276159	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014334	GTCA	2	8	276185	276192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014334	TGGA	2	8	276670	276677	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014334	GTGA	2	8	276849	276856	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014334	AGCG	2	8	277019	277026	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014334	ATGG	2	8	277684	277691	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014334	GAGC	2	8	277903	277910	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014334	TAAG	2	8	278298	278305	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014334	AGAA	2	8	278428	278435	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014334	GCGA	2	8	278457	278464	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014334	GCTT	2	8	278489	278496	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014334	TTGC	2	8	278843	278850	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_014334	ATGT	2	8	278991	278998	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014334	GAGC	2	8	279900	279907	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014334	TAGG	2	8	280346	280353	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014334	CTGC	2	8	281339	281346	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_014334	TAAG	2	8	281413	281420	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014334	AACC	2	8	283448	283455	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_014334	CCGA	2	8	283563	283570	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014334	AAAG	2	8	290760	290767	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014334	ATGG	2	8	296318	296325	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014334	TAGA	2	8	296529	296536	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014334	CTTG	2	8	303782	303789	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014334	GTTA	2	8	303795	303802	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014334	ACAT	2	8	303813	303820	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014334	CCGG	2	8	303891	303898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_014334	TTTA	2	8	305366	305373	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014334	TTGC	2	8	305397	305404	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_014334	TGCT	2	8	305431	305438	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014334	ATGA	2	8	308489	308496	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014334	GCTT	2	8	310975	310982	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_014334	TGGT	2	8	311359	311366	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014334	ATGA	2	8	314646	314653	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_014334	TGTT	2	8	1073577	1073584	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

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