MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 4987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014334	GTT	3	9	1424	1432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014334	AGG	2	6	1512	1517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014334	GGT	2	6	2744	2749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014334	GTA	2	6	2768	2773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014334	TGA	2	6	2833	2838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014334	AAG	2	6	2861	2866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014334	CAA	2	6	2903	2908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014334	TAC	2	6	2921	2926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014334	TAG	2	6	3089	3094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014334	CCG	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_014334	GGT	2	6	4568	4573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014334	CCT	2	6	4605	4610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_014334	AGC	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014334	TGA	2	6	4758	4763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014334	TTG	2	6	4777	4782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014334	AAT	2	6	4893	4898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014334	AGT	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014334	GAC	2	6	5078	5083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014334	TGA	2	6	6505	6510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014334	AGG	2	6	6703	6708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014334	GAG	2	6	8721	8726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014334	TAA	2	6	11363	11368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014334	TCC	2	6	12176	12181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_014334	AGA	2	6	12274	12279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014334	AGG	2	6	12462	12467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014334	CGC	2	6	12918	12923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_014334	AGG	2	6	13020	13025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014334	GGA	2	6	14033	14038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014334	GTA	2	6	14354	14359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014334	TGA	2	6	14385	14390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014334	ATG	2	6	14453	14458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014334	AGA	2	6	14500	14505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014334	ATT	2	6	14697	14702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014334	GCG	3	9	17214	17222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014334	GAA	2	6	18209	18214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014334	CAT	2	6	18298	18303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014334	TTG	2	6	18304	18309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014334	TAA	2	6	18370	18375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014334	AAC	2	6	18432	18437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014334	ATT	2	6	18491	18496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014334	TCA	2	6	18589	18594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014334	TCA	2	6	18660	18665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014334	TAA	2	6	18679	18684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014334	CCG	2	6	18750	18755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_014334	ACC	2	6	18773	18778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_014334	AGC	2	6	18834	18839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014334	CAA	2	6	19482	19487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014334	TAC	2	6	19510	19515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014334	AGC	2	6	19562	19567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014334	TTC	2	6	20594	20599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014334	CGC	2	6	20945	20950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_014334	CCT	2	6	21042	21047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_014334	ACG	2	6	21225	21230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014334	CTT	2	6	21448	21453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014334	TGA	2	6	22904	22909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014334	GAC	2	6	22936	22941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014334	CCT	2	6	26256	26261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_014334	ATG	2	6	26510	26515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014334	GGA	2	6	26519	26524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014334	ATA	2	6	27106	27111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014334	AGA	2	6	28336	28341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014334	GTT	2	6	28401	28406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014334	AAC	2	6	29588	29593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014334	CCT	2	6	29606	29611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_014334	TAT	2	6	31783	31788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014334	GGA	2	6	31888	31893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014334	TCA	2	6	31983	31988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014334	CTC	2	6	32891	32896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_014334	GAA	2	6	33051	33056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014334	ATT	2	6	33826	33831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014334	ACT	2	6	33908	33913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014334	TGT	2	6	33966	33971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014334	GGA	2	6	33998	34003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014334	TCT	2	6	34234	34239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014334	ATA	2	6	35086	35091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014334	GTA	2	6	35126	35131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014334	TTG	2	6	35146	35151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014334	ATG	2	6	35157	35162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014334	CAA	2	6	36855	36860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014334	TCA	2	6	38499	38504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014334	CAA	2	6	39517	39522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014334	CAT	2	6	39605	39610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014334	AAG	2	6	41137	41142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014334	TCA	2	6	41186	41191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014334	AGC	2	6	41964	41969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014334	TAG	2	6	42313	42318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014334	TAA	2	6	42342	42347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014334	TAA	2	6	42365	42370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014334	TGG	2	6	42444	42449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014334	ATT	2	6	42455	42460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014334	AAG	2	6	42672	42677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014334	CTT	2	6	42709	42714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014334	TGA	2	6	42760	42765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014334	TAT	2	6	43423	43428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014334	CAA	2	6	43622	43627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014334	AGA	2	6	43718	43723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014334	ACC	2	6	44334	44339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_014334	ATG	2	6	44965	44970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014334	TAA	2	6	44988	44993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014334	TGA	2	6	45245	45250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014334	GTG	2	6	45317	45322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014334	TCC	2	6	47177	47182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_014334	TTG	2	6	47191	47196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014334	ATT	2	6	47242	47247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014334	TAT	2	6	49020	49025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014334	CAA	2	6	49048	49053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014334	ACC	2	6	49612	49617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_014334	AAC	2	6	49636	49641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014334	CGT	2	6	49708	49713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014334	GAT	2	6	49734	49739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014334	TTA	2	6	50866	50871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014334	CTG	2	6	51835	51840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014334	CAA	2	6	51947	51952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014334	GCT	2	6	53988	53993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014334	ATT	2	6	53994	53999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014334	GAG	2	6	54009	54014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014334	TTG	2	6	56707	56712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014334	ATT	2	6	56755	56760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014334	CAT	2	6	56883	56888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014334	CAT	2	6	58349	58354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014334	GCA	2	6	58355	58360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014334	CTG	2	6	58369	58374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014334	GCT	2	6	58446	58451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014334	TAA	2	6	58452	58457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014334	CTG	2	6	58846	58851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014334	ATC	2	6	58898	58903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014334	CTG	2	6	59014	59019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014334	GAA	2	6	59067	59072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014334	ATT	2	6	59094	59099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014334	CAA	2	6	59141	59146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014334	TTA	2	6	59224	59229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014334	TTC	2	6	59281	59286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014334	ATT	3	9	59320	59328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014334	CTG	2	6	59473	59478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014334	GAG	3	9	61311	61319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014334	AAG	2	6	61331	61336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014334	CTT	2	6	61488	61493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014334	CTC	2	6	65420	65425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_014334	TGT	2	6	65511	65516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014334	AAG	2	6	65537	65542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_014334	TTA	2	6	142055	142060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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