MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 33664

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014334	GAA	2	6	49	54	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065126
2	NC_014334	CTT	2	6	140	145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065126
3	NC_014334	TCA	2	6	230	235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065126
4	NC_014334	GCT	2	6	394	399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065126
5	NC_014334	ACA	2	6	424	429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065126
6	NC_014334	TGG	2	6	450	455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065126
7	NC_014334	TAA	2	6	510	515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065126
8	NC_014334	CAG	2	6	518	523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065126
9	NC_014334	CTG	2	6	628	633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065126
10	NC_014334	GAT	2	6	640	645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065126
11	NC_014334	GAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065126
12	NC_014334	TAA	2	6	795	800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065126
13	NC_014334	TGA	2	6	1041	1046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065126
14	NC_014334	CGG	2	6	1227	1232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065126
15	NC_014334	TGA	2	6	1290	1295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065126
16	NC_014334	ATG	2	6	1566	1571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065127
17	NC_014334	ACC	2	6	1595	1600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065127
18	NC_014334	AAT	2	6	1709	1714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065127
19	NC_014334	TCA	2	6	1833	1838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065127
20	NC_014334	CAT	2	6	2119	2124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065127
21	NC_014334	CAA	2	6	2377	2382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065127
22	NC_014334	GAA	2	6	2459	2464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065127
23	NC_014334	CAA	2	6	2476	2481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065127
24	NC_014334	GCG	2	6	2487	2492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065127
25	NC_014334	AGA	2	6	2611	2616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065127
26	NC_014334	TCA	2	6	2637	2642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065127
27	NC_014334	GGA	2	6	3191	3196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301065128
28	NC_014334	GTA	2	6	3230	3235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065128
29	NC_014334	ACA	2	6	3251	3256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065128
30	NC_014334	TGA	2	6	3369	3374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065128
31	NC_014334	GAA	2	6	3403	3408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065128
32	NC_014334	TGG	2	6	3480	3485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065128
33	NC_014334	ACA	2	6	3528	3533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065128
34	NC_014334	CAA	2	6	3579	3584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065128
35	NC_014334	AAG	2	6	3816	3821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065128
36	NC_014334	CGA	2	6	3933	3938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065128
37	NC_014334	CGG	2	6	3961	3966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065128
38	NC_014334	GAA	2	6	4332	4337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065128
39	NC_014334	TCA	2	6	4490	4495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065128
40	NC_014334	ACA	2	6	5142	5147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065129
41	NC_014334	GAG	2	6	5271	5276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301065129
42	NC_014334	GAT	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065129
43	NC_014334	TGC	2	6	5389	5394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065130
44	NC_014334	ACA	2	6	5402	5407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065130
45	NC_014334	CAA	2	6	5509	5514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065130
46	NC_014334	TCA	2	6	5611	5616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065130
47	NC_014334	AAC	2	6	5646	5651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065130
48	NC_014334	GCG	2	6	5737	5742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065130
49	NC_014334	AGC	2	6	5820	5825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065130
50	NC_014334	AGC	2	6	5841	5846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065130
51	NC_014334	ATC	2	6	5853	5858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065130
52	NC_014334	GTT	2	6	5941	5946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065130
53	NC_014334	TGC	2	6	5965	5970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065130
54	NC_014334	AGC	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065130
55	NC_014334	GAT	2	6	6149	6154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065130
56	NC_014334	GTT	2	6	6157	6162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065130
57	NC_014334	CAA	2	6	6206	6211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065130
58	NC_014334	CAC	2	6	6214	6219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065130
59	NC_014334	TGT	2	6	6300	6305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065130
60	NC_014334	ACC	2	6	6374	6379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065130
61	NC_014334	ATC	2	6	6407	6412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065130
62	NC_014334	TGA	2	6	6436	6441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065130
63	NC_014334	GGC	2	6	6760	6765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065132
64	NC_014334	ATG	2	6	6771	6776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065132
65	NC_014334	AGC	2	6	6848	6853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065132
66	NC_014334	CAT	2	6	6863	6868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065132
67	NC_014334	ATA	2	6	6951	6956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065132
68	NC_014334	GGT	2	6	7055	7060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065132
69	NC_014334	CGG	4	12	7066	7077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065132
70	NC_014334	GTG	2	6	7161	7166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065132
71	NC_014334	TAC	2	6	7175	7180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065132
72	NC_014334	GAT	2	6	7307	7312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065132
73	NC_014334	ACC	2	6	7322	7327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065132
74	NC_014334	GGC	2	6	7424	7429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065132
75	NC_014334	TTG	2	6	7562	7567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065132
76	NC_014334	CAA	2	6	7576	7581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065132
77	NC_014334	GAT	2	6	7685	7690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065132
78	NC_014334	GAT	2	6	7703	7708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065132
79	NC_014334	CGG	2	6	7725	7730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065132
80	NC_014334	GGT	2	6	7807	7812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065132
81	NC_014334	ACA	2	6	7992	7997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065132
82	NC_014334	ATT	2	6	8023	8028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065132
83	NC_014334	TCG	2	6	8031	8036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065132
84	NC_014334	TGG	2	6	8050	8055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065132
85	NC_014334	GAA	2	6	8159	8164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065132
86	NC_014334	TTG	2	6	8288	8293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065132
87	NC_014334	GCC	2	6	8356	8361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065132
88	NC_014334	GAA	2	6	8411	8416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065132
89	NC_014334	GCC	2	6	8440	8445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065132
90	NC_014334	GAC	2	6	8512	8517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065132
91	NC_014334	AAC	2	6	8660	8665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065132
92	NC_014334	GAT	2	6	8742	8747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065133
93	NC_014334	CGG	2	6	8877	8882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065133
94	NC_014334	AAG	2	6	8931	8936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065133
95	NC_014334	TTG	2	6	8947	8952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065133
96	NC_014334	TGC	2	6	9142	9147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065133
97	NC_014334	CAA	2	6	9155	9160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065133
98	NC_014334	ATG	2	6	9187	9192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065133
99	NC_014334	GTT	2	6	9210	9215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065133
100	NC_014334	GAC	2	6	9275	9280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065133
101	NC_014334	CCG	2	6	9288	9293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065133
102	NC_014334	CGG	2	6	9398	9403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065133
103	NC_014334	TGG	2	6	9739	9744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065133
104	NC_014334	ATC	2	6	9805	9810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065133
105	NC_014334	TCG	2	6	9824	9829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065133
106	NC_014334	TGA	2	6	9908	9913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065133
107	NC_014334	ATC	2	6	9915	9920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065133
108	NC_014334	AGC	2	6	10082	10087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065133
109	NC_014334	TCA	2	6	10130	10135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065133
110	NC_014334	ATC	2	6	10137	10142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065133
111	NC_014334	AGA	2	6	10165	10170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065133
112	NC_014334	AAG	2	6	10246	10251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065133
113	NC_014334	TCA	2	6	10258	10263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065133
114	NC_014334	ATG	2	6	10357	10362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065133
115	NC_014334	ATG	2	6	10399	10404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065133
116	NC_014334	CTT	2	6	10412	10417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065133
117	NC_014334	CAA	2	6	10421	10426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065133
118	NC_014334	GCA	2	6	10441	10446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065133
119	NC_014334	ATG	2	6	10564	10569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065133
120	NC_014334	TCT	2	6	10579	10584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065133
121	NC_014334	GTT	2	6	10602	10607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065133
122	NC_014334	GCA	2	6	10642	10647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065133
123	NC_014334	AAT	2	6	10689	10694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065133
124	NC_014334	ATA	2	6	10717	10722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065133
125	NC_014334	GAC	2	6	11124	11129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065133
126	NC_014334	CGA	2	6	11171	11176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065133
127	NC_014334	GCA	2	6	11188	11193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065133
128	NC_014334	GCA	2	6	11243	11248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065133
129	NC_014334	AAT	2	6	11356	11361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065133
130	NC_014334	GAT	2	6	11513	11518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065134
131	NC_014334	CGC	2	6	11524	11529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065134
132	NC_014334	TAA	2	6	11695	11700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065134
133	NC_014334	GCG	2	6	11973	11978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065134
134	NC_014334	GTT	2	6	12004	12009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065134
135	NC_014334	CCA	2	6	12043	12048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065134
136	NC_014334	TGC	2	6	12314	12319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065135
137	NC_014334	TGA	2	6	12391	12396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065135
138	NC_014334	TGC	2	6	12438	12443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065135
139	NC_014334	TTG	2	6	12683	12688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065136
140	NC_014334	GGC	2	6	12699	12704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065136
141	NC_014334	TAA	2	6	12709	12714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065136
142	NC_014334	GTC	2	6	12758	12763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065136
143	NC_014334	ACG	2	6	12797	12802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065136
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145	NC_014334	GAC	2	6	12842	12847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065136
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149	NC_014334	TGC	2	6	13088	13093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065137
150	NC_014334	CAT	2	6	13148	13153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065137
151	NC_014334	CAA	2	6	13196	13201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065137
152	NC_014334	AGA	2	6	13241	13246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065137
153	NC_014334	CAA	2	6	13286	13291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065137
154	NC_014334	TCA	2	6	13504	13509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065138
155	NC_014334	GTC	2	6	13644	13649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065138
156	NC_014334	GGC	2	6	13743	13748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065138
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159	NC_014334	GCA	2	6	13848	13853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065138
160	NC_014334	AGG	2	6	13865	13870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301065138
161	NC_014334	TAA	2	6	13910	13915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065138
162	NC_014334	GAT	3	9	13938	13946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065138
163	NC_014334	CAA	2	6	14051	14056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065139
164	NC_014334	GTG	2	6	14061	14066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065139
165	NC_014334	CGT	4	12	14069	14080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065139
166	NC_014334	CGC	2	6	14095	14100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065139
167	NC_014334	TTG	2	6	14138	14143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065139
168	NC_014334	TCT	2	6	14254	14259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065139
169	NC_014334	AGA	2	6	14272	14277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065139
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173	NC_014334	GAT	2	6	14845	14850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065140
174	NC_014334	TTC	2	6	14912	14917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065140
175	NC_014334	TCT	2	6	14928	14933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065140
176	NC_014334	GTT	2	6	14951	14956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065140
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189	NC_014334	GTT	2	6	15823	15828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065140
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203	NC_014334	CCA	2	6	16581	16586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065141
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219	NC_014334	GTC	2	6	17279	17284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065142
220	NC_014334	ATT	2	6	17314	17319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065142
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222	NC_014334	TGC	2	6	17368	17373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065142
223	NC_014334	GAT	2	6	17552	17557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065143
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226	NC_014334	ATA	2	6	17991	17996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065143
227	NC_014334	TAC	2	6	18160	18165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065143
228	NC_014334	CTG	2	6	19133	19138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065144
229	NC_014334	GCC	3	9	19172	19180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065144
230	NC_014334	GCC	2	6	19258	19263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065144
231	NC_014334	TAG	2	6	19345	19350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065144
232	NC_014334	CAG	2	6	19357	19362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065144
233	NC_014334	CAA	2	6	19363	19368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065144
234	NC_014334	TTG	2	6	19695	19700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065145
235	NC_014334	GAT	2	6	19715	19720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065145
236	NC_014334	ATA	2	6	19744	19749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065145
237	NC_014334	ATT	2	6	19765	19770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065145
238	NC_014334	CGC	2	6	19799	19804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065145
239	NC_014334	GAC	2	6	19872	19877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065145
240	NC_014334	TGC	2	6	19911	19916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065145
241	NC_014334	GCA	2	6	19999	20004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065145
242	NC_014334	ACA	2	6	20074	20079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065145
243	NC_014334	TTC	2	6	20127	20132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065145
244	NC_014334	ACC	2	6	20217	20222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065145
245	NC_014334	TGA	2	6	20231	20236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065145
246	NC_014334	GAT	2	6	20643	20648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065146
247	NC_014334	ATC	2	6	20674	20679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065146
248	NC_014334	CTT	2	6	20694	20699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065146
249	NC_014334	TGC	2	6	20739	20744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065146
250	NC_014334	ATG	2	6	20796	20801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065146
251	NC_014334	CTG	2	6	20909	20914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065147
252	NC_014334	AGA	2	6	21264	21269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065148
253	NC_014334	AGT	2	6	21281	21286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065148
254	NC_014334	CAA	2	6	21318	21323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065148
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260	NC_014334	GCT	2	6	21759	21764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065149
261	NC_014334	TGT	2	6	21910	21915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065149
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265	NC_014334	TGT	2	6	21955	21960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065149
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373	NC_014334	CAA	2	6	30944	30949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065157
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376	NC_014334	CGC	2	6	31333	31338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065157
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379	NC_014334	ATT	2	6	31469	31474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065157
380	NC_014334	TTG	2	6	31660	31665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065157
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496	NC_014334	AGA	2	6	40957	40962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065167
497	NC_014334	ATG	2	6	40977	40982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065167
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499	NC_014334	TTG	2	6	41339	41344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065168
500	NC_014334	CGG	2	6	41369	41374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065168

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